Cours 3 - Transport Reticulum Endoplasmique Flashcards
Quel sont les deux types de reticulum endoplasmique?
RER : rugueux avec des ribosomes
REL : lisse
2 types de ribosomes
Libres dans le cytoplasme
Liés associés a la mb du RE
Comment séparer les diff Reticulum endoplasmique ?
Par centrifugation le rugeux va couler car plus lourd
Quel est le mécanisme clé dans la biosynthèse et la localisation des protéines dans le RE
Système co-traductionnel
Explique le processus du système co-traductionnel de ciblage des protéines au RE (6)
- Synthese d’une prot dans le cytosol avec un peptide signal (AA hydrophobe) en N-t (ciblage au RE)
- Reconnaissance par la SRP (Signal Recognition Particle) une ribonucléoprotéine qui se lie au signal et au ribosome = STOP TRADUCTION
- SRP guide le complexe vers son récepteur SR a cote d’un translocon sur la mb du RE
- Une fois lié le SRP se détache = TRADUCTION ON et TRANSLOCON OUVERT donc passage de la prot (sans ribosome)
- Clivage du peptide signal pour bon repliement de la prot
- Modif post traductionnel et confirmation finale
Quel est le nom du translocon dans le systeme co trad ?
Sec61
Decris la structure du SRP
Ribonucleoproteine = ARN + prot
Complexe a 2 domaines :
Domaine S = permet la liaison au recepteurs SR via sous unite SRP54 qui a un domaine N : liaison
Un domaine G : GTPase GTP->GDP
Domaine Alu = arrêt élongation
Composition de la séquence signal du peptide ?
Séquence AA hydrophobe 8-12 en hélice alpha plutôt divergente qui est reconnue par domaine N du SRP54 du SRP
Le translocon sec61 est ouvert a quel moment ?
Uniquement lorsque le ribosome s’y lie
Rôle principale de l’hydrolyse du GTP dans dans le système de cotrad ?
Permet la dissociation du SRP et son récepteur SR par changement conformationnel
Explique plus en détails le rôle du GTP dans le all process
Le SRP et SR lient tous les deux du GTP
Sauf que l’ouverture du canal avec l’arrivée du ribosome va nécessiter l’hydrolyse de ces 2 GTP en GDP pour favoriser l’entrée de la prot et la dissociation d’une SRP et SR
Est ce que y’a souvent formation de polysomes ?
Ouii
Qui va cliver le peptide signal une fois la prot transloquée ?
Une peptidase dans la mb ancrée près du translocon
Est ce que le canal est totalement fermé quand y’a pas de ribosome ?
Non mini ouverture mais bouchee par une helice d’AA qui permet l’imperméabilité de la membrane
Se deplace quand ribosome arrive
Décris un petit peu l’environnement intraluminal du RE lors de la co trad
Toutes les protéines nécessaires aux modifs post trad (glucosidase, oxidoreductase, chaperone, OST…) de la prot en cours de traduction sont toutes à proximité le processus se fait au fur a mesure pour qu’une fois dans le RE la protéine soit fonctionnelle et mature
Que se passe t il si des protéines sont mal repliées dans le RE ?
Activation de la voie ERAD
Comment fonctionne la voie ERAD ?
- Reconnaissance des prots mal repliées par chaperon/capteur proteique
- Retro translocation dans le cytosol en degagant le proteine BIP avec aide du complexe moteur p97/VCP
- Ubiquitination par ubiquitine ligase
- Degradation par proteasome (BIP refermé)
Que se passe t il si le RE est trop stressé ? Par exemple infection virale ?
Activation voir UPR = réponse adaptative visant a retablir l’homeostasie en augmentant les capacités de repliement et en activant ERAD pour dégrader les mauvaises ou apoptose si échec
Quels sont les 3 capteurs de stress dans la voie UPR du RE ?
IRE1
PERK
ATF6
(Normalement associés a BIP en conditions saines)
Donne la voie metabolique et le role de chaque capteurs :
IRE1 : epissage ARNm XBP1 = AUGMENTATION DE LA DÉGRADATION DES PROTEINES MAL REPLIEES (via chaperons)
ATP6 : clivé par une peptidase donne sa forme active qui regule les genes = AUGMENTE LE REPLIEMENT DES PROTS AVEC CHAPERONS
PERK : phosphoryle et inactive eIF2a = DIMINUE SYNTHESE GLOBALE DE PROTEINE
active ATF4 = MEILLEUR REPLIEMENT DES PROT
Donne un exemple d’une proteine avec des fonctions différentes selon sa localisation
P53 cytoplasme noyau et mitochondrie
Si il est pas a la bonne loc = cancerrrr
Comment est organisé le cytoplasme ?
En compartiment sans mb = condensat biomoléculaire
Quel est Le phénomène qui permet la formation de condensat biomoleculaire ? Explique le
Separation de phase liquide liquide
Lorsque la concentration de solutés depasse un certain seuil, appelé concentration de saturation la force intermoléculaire entre ces mol est superficiel a celle entre ces mol et l’environnement
C’est quoi la fonction flex de la séparation de phase ?
Permet a certaines proteines de se condenser en excluant des protéines indésirables en favorisant alors des réactions chimiques
Donne deux exemples typiques d’organites sans membrane
Granule P
Granule de stress
C’est quoi la multivalence ? Elle facilite quoi ?
C’est la capacité a former plusieurs types d’interactions en simultané
Interaction ARN prot / prot-prot /Arn-Arn
Ça facilite la séparation de phase et stabilise les granules
Quels sont comme les deux catégories de prot dans un condensat biomoleculaire ?
Proteine echaffaudage = indispensable
Clients qui interagissent avec
Difference entre un condensat et un agregat ?
Dans un aggregat les prots perdent leur conformation et donc leur activité biochimique
Dans les condensats c’est tout le contraire et en plus les organites s’échangent tres rapidement
A quoi sont dues les granules de stress ?
Inhibition traduction
Qu’est ce qui souvent adjacent au granule de stress
P body pour degrader ARN
Parfois que font les virus au granule de stress ?
Ils les inhibent et remette la traduction en route
Que se passe t il dans les maladies neurodegeneratives souvent ?
Gelification voire solidification des granules d’ARN
Qu’est ce qui influence bcp l’assemblage le demontage et la composition des granules de stress ?
Modifications post traductionnelles
C’est quoi les lipid rafts ?
Microdomaines sur la mb enrichi en cholestérol et en prot de signalisation c’est une partie rigide de la mb
A quoi servent les lipid raft ?
Enrichissement selectif quu permet de séquestrer certaines prot
Compartimentalisation subcellulaire qui augmente la spécificité et l’efficacité de la transduction du signal
(Une alteration vers TNFR1 = apoptose
