Cours 2 LES PROTÉINES 1.2 Flashcards
Les cofacteurs inorganiques sont des __ __
ions métalliques
Les ions métalliques (cofacteurs inorganiques) influencent __ du substrat et la compensation de ___
l’orientation
de charge
Nommer des exemples de cofacteurs inorganiques (ions métalliques)
Fer
Cuivre
Zinc
Magnésium
Selon l’équation de Michaelis-Menten, quelle est la conséquence sur la Vmax d’une augmentation du Km ?
La Vmax augmente mais on atteint éventuellement un plateau
QSJ ? Dans l’équation de Michaelis-Menten, je réflète l’affinité de l’enzyme pour son substrat
Constante de Michaelis (Km)
Quel est l’effet d’un Km petit sur l’affinité d’une enzyme pour son substrat ?
l’enzyme à une grande affinité pour son substrat
Quel est l’effet d’un Km grand sur l’affinité d’une enzyme pour son substrat ?
l’enzyme à une faible affinité pour son substrat
VF ? le Km est égal à la concentration de l’enzyme à la moitié de la Vmax
FAUX
concentration du substrat
VF ? La vitesse de réaction est directement proportionnelle à la concentration d’enzyme
VRAI
QSJ ? Je suis une réprensentation en double inverse de l’équation de Michaeal-Meten
Représentation de Lineweaver-
Qu’Est-ce que la cinétique enzymatique ne permet pas d’identifier ?
Mécanisme réactionnel
VF ? La plupart des réactions enzymatiques nécessitent l’interaction d’un seul substrat
FAUX
plusieurs substrats
VF ? La plupart des réactions enzymatiques génèrent plusieurs produits
VRAI
Plusieurs des réactions enzymatiques sont des réactions de ___ de ___ __ d’une molécule à l’autre
transfert
groupement fonctionnel
Nommer les 2 grands mécanismes des réactions enzymatiques à 2 substrats
- Réactions séquentielles
- Réactions ping pong
Nommer les 2 types de mécanismes de réactions séquentielles
- Ordonnées
* Aléatoires
QSJ ? Mécanisme de réaction enzymatique à 2 substrats pour lequel la liaison du 1er substrat (leading) est requise pour la liaison du 2e substrat (following)
Réaction séquentielle ordonnée
Dans une réaction séquentielle ordonnée, comment appelle-t-on
> 1er substrat :
> 2e substrat :
> 1er substrat : Leading
> 2e substrat : Following
Décrire la réaction séquentielle ordonnée
Le Following (2e substrat) va pouvoir entrer dans l’enzyme seulement après que le leader soit entré.
Décrire la réaction séquentielle aléatoire
Les 2 sites de liaisons pour les substrats sont disponibles simultanément sur l’enzyme . Peu importe quel substrat se fixe en premier
QSJ ? Mécanisme de réaction enzymatique impliquant une modification de l’enzyme
Réaction ping pong
Décrire la réaction ping pong
Les 2 substrats ne se rencontrenent jamais à la surface de l’enzyme
QSJ ? Molécule qui se fixe à une enzyme et diminue son activité
Inhibiteur enzymatique
De quelles façons les inhibiteurs enzymatiques peuvent diminuer une activité ? (2)
- Empêche la formation du complexe ES
* Empêche la séparation de l’enzyme et du produit (E+P)
Nommer deux provenances des inhibiteurs enzymatiques. Donner des exemples
- Naturels (poisons, venins)
* Chimiques (drogues, médicaments)
Nommer les 2 types d’inhibition enzymatique
- Inhibition compétitive
* Inhibition non-compétitive
Qu’est-ce que le site actif d’une enzyme ?
Site de liaison avec son substrat
L’inhibiteur compétitif entre en compétition avec le ___ ___ de l’enzyme
substrat naturel
Comment l’inhibiteur compétitif entre en compétition avec le substrat ?
- L’inhibiteur présente une ressemblance structurale avec le substrat
- Bloque le site actif de l’enzyme
VF ? Dans l’inhibition compétitive, la liaison entre l’inhibiteur et l’enzyme est covalente
FAUX
Liaison réversible
Quel est l’effet de l’ajout d’un inhibiteur compétitive sur la Vmax ? Expliquer.
Aucun effet sur la Vmax
VF ? Plus il y aura du bon substrat, plus l’enzyme aura de chance de se fixer avec lui plutôt qu’avec l’inhibiteur compétitif
VRAI
Quel est l’effet de l’ajout d’un inhibiteur compétitif sur la Km d’un substrat ?
Augmentation de la Km
Quel est l’effet de l’ajout d’un inhibiteur compétitif sur le graphique de Lineweaver-Burk ?
LEs 2 droites se croisent sur l’axe de Y (Vmax identique)
Les deux droites n’ont pas le même X (Km différent0
Que représente l’Axe des X sur le graphique de Lineweaver-Burk ?
1/Km
Que représente l’Axe des Y sur le graphique de Lineweaver-Burk ?
1/V de réaction
Dire il s'agit de quel type d'inhibition a) empoisonement au méthanol b) beta-lactamines (peniciline) c) Les statines Inhibition de la synthèse du cholestérol endogène d) transciptase inverse
a) compétitive
b) non-compet
c) compétitive
d) non-compet
Décrire le mécanisme d’inhibition non-compet
L’inhibiteur et le substrat se lient sur différents sites de l’enzyme
VF ? L’inhibiteur n-c ne peut que se lier à l’enzyme seule
FAUX
se lie soit à l’enzyme seule, ou au complexe ES
Quel est l’effet de l’ajout d’un inhibiteur non-compet sur la Vmax ? Expliquer.
Diminuer
Quoi qu’on fasse, si l’inhibiteur est dans la poche, le tout devient inactif.
VF ? L’augmentation de la [substrat] n’a aucun effet sur l’action de l’inhibiteur n-c
VRAI
Quel est l’effet de l’ajout d’un inhibiteur non compétitif sur la Km ?
Aucun changement
Quel est l’effet de l’ajout d’un inhibiteur non compétitif sur le graphique de Lineweaver-Burk ?
Axe Y : la droite inhibiée croise plus haut, car la Vmax est plus faible
Axe X : Deux droites croisent au même endroit
L’enzyme est régulée par un effecteur, c’est la régulation ___
allostérique
VF ? La liaison entre l’effecteur et l’enzyme est covalente
VRAI
La présence de l’effecteur allostérique peut modifier ___ de l’enzyme pour son substrat et/ou modifier ___ de l’enzyme elle-même
l’affinité
l’efficacité
Les enzymes allostériques vont souvent catalyser l’étape limitante d’une ___ ___
voie métabolique
Quel est le rôle de
- effecteur allostérique inhibiteur :
- effecteur allostérique activateur :
- effecteur allostérique inhibiteur : rend l’enzyme dans sa forme inactive
- effecteur allostérique activateur : rend l’enzyme dans sa forme active
QSJ ? Addition ou soustraction d’un groupement phosphate
Régulation par modification covalente (phosphorylation)
Où se fait la phosphorylation enzymatique ?
Sur un résidu d’acide aminé spécifique
La __ __ est l’une des régulations les plus importantes intervenant dans les processus biologiques
phosphorylation enzymatique
La ___ caractérise le retrait d’un phosphate de sur l’enzyme
déphosphorylation
QSJ ? Nous catalysons la réaction directe de phosphorylation (ajout d’un phosphate sur l’enzyme)
Protéines kinases
QSJ ? Lors de la réaction directe de phosphorylation, les kinases m’utilise comme donneur de phosphate
ATP
QSJ ? Nous catalysons la réaction de déphosphorylation
Protéines phosphatases
QSJ ? Nous hydrolysons la liaison phosphate lors de la la réaction de déphosphorylation
Protéines phosphatases
Énumérer les 6 grandes classifications des enzymes
1- Oxydoréductases 2- Transférases 3- Hydolases 4- Lyases 5- Isomérases 6- Ligases
Décrire le rôle des enzymes oxydoréductases
Catalysent le transfert d’électrons (charge négative) d’une molécule (donneur) vers une autre molécule (accepteur)
Décrire le rôle des enzymes transférases
Transfèrent des groupements fonctionnels spécifiques d’une molécule à une autre
Décrire le rôle des enzymes hydrolases
Catalysent l’hydrolyse de différents types de composés. ainsi, ils coupent en deux, grâce à une molécule d’eau, des molécules.
Décrire le rôle des enzymes lyases
Catalysent la rupture de liaisons chimiques autement qu’en hydrolysant ou en oxydant .
forment habituellement une nouvelle double liason
Décrire le rôle des enzymes isomérases
Catalysent des réarrangements de groupements fonctionnels à l’intérieur d’une molécule.
Donne l’isomère de A
Décrire le rôle des enzymes ligases
Catalysent la liaison de 2 molécules par de nouvelles liaisons covalentes
Que nécessite la catalyse par les enzymes ligases ?
L’hydrolyse de l’ATP (processus énergivore)
QSJ ? Processus par lequel les systèmes vivants vont utiliser l’énergie libre (ΔG) pour différentes fonctions biologiques
Métabolisme
Le métabolisme est une combinaison de réactions __ et ___
exergoniquees
endergoniques
QSJ ? Je suis la source d’énergie d’un organisme
Tropisme
Qu’est-ce qu’un phototrophe ?
Organisme utilisant l’énergie de la lumière
Qu’est-ce qu’un chimiotrophe ?
Organisme utilisant l’énergie chimique
Décrire le métabolisme humain
Chimiohétérotrophe aérobie
Quels sont les macronutriments permettant l’apport nutritionnel pour le métabolisme humain ? (3)
- Glucide
- Lipide
- Protéine
Qu’est-ce qu’un métabolite ?
Substrat, produits intermédiaires et produits finaux de voies métaboliques
QSJ ? Ensemble des voies métaboliques qui dégradent les molécules en petites unités simples pour former de l’énergie
Catabolisme
QSJ ? Ensemble des voies métaboliques qui servent à la synthèse de molécules (de stockage, de construction cellulaire)
Anabolisme