Cours 2: Génétique microbienne Flashcards

1
Q

Qu’est-ce que la réplication ?

A

mécanisme par lequel l’ADN ou l’ARN est dupliqué.

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Q

V/F

La transcription est un processus par lequel l’ARN polymérase synthétise un brin d’ARN.

A

vrai

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3
Q

V/F

La transduction est l’introduction d’ADN non étranger dans des bactéries par un phage

A

Faux. C’est l’introduction d’ADN étranger dans des bactéries par un phage.

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4
Q

Quels sont les différents mécanismes de résistance antibiotique?

A
  • Altération de la perméabilité/séquestration
  • Modification ou destruction de l’antibiotique
  • Modification ou remplacement de la cible
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5
Q

Décrire les chromosomes des bactéries.

A

Elles possèdent généralement un seul chromosome cirulaire.

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6
Q

Qu’est ce qui differencie un chromosome d’un plasmide?

A

Les plasmides sont plus petits que les chromosomes bactériens et leur taille varie entre 1 et 1000 kilo par paires. Ils peuvent encoder de l’information pouvant procurer un avantage unique à la bactérie hote. Ne code pas pour des fonctions essentielles à la cellule.

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7
Q

Quels avantages apportent les plasmides à la bactérie hôte ? (3)

A
  1. résistance aux antibiotiques
  2. capacité métabolique supplémentaire
  3. facteur favorisant l’infection
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8
Q

Donner des exemples dans lesquelles les plasmides donne un avantage à la bactérie.

A
  • Résistance bactérienne
  • Capacité métabolique supplémentaire
  • Facteur favorisant l’infection
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9
Q

Quel est le mécanisme de base de régulation des bactéries?

A

Pour minimiser les dépenses énergétiques les bactéries activent seulement les systèmes qu’elles ont de besoin.

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10
Q

Type de régulation

le changement dans la séquence d’ADN implique :

A

amplification de gène
réarrangement de gène (mutation)

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11
Q

Type de régulation

Changement ds le nbre de transcrits implique:

A

Activateurs (contrôle positif)
Répresseurs (contrôle négatif)

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12
Q

V/F

La régulation des gènes est un processus passif.

A

Faux. Un processus actif qui implique que la bactérie soit dans un état métabolique actif.

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13
Q

V/F

La régulation est aussi rapide dans la phase de croissance exponentielle des bactéries que dans les phases de latence et de plateau, car c’est un processus actif.

A

Faux, plus rapide en phase de croissance exponentielle qu’en phase de latence ou plateau.

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14
Q

V/F

La régulation est souvent un processus comprenant des boucles de contrôle

A

vrai

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15
Q

Explique les concepts de base reliés à l’hérédité et aux mutations

A
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16
Q

Qu’est ce qu’un promoteur?

A

Séquence de nucléotides de l’ADN requise pour amorcer la transcription de celui-ci par l’ARN.

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17
Q

Expliquer ce qu’est l’opérateur.

A

Est une séquence d’ADN adjacente à un gène procaryotique et permettant à une protéine de represseur de contrôler la transcription de ce gène (ou d’un gr. de gènes consécutifs).

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18
Q

Qu’est ce qu’un répresseur?

A

Protéine inhibant la transcription d’un gène en se liant è une séquence spécifique de nucléotides de l’ADN

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19
Q

QU’est ce qu’un activateur?

A

Protéine qui stimule la transcription d’un gène. Ils reconnaissent une séwuence spécifique sur l’ADN située près du promoteur

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20
Q

Quel est la différence entre une régulation simple et une régulation dans un opéron?

A

La simple est un promoteur pouor controler un seul gène. Alors que dans l’péron on retrouve un seul promoteur pour controler plusieurs gènes.

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21
Q

Qu’est ce qu’une régulation par un régulon?

A

IL s’agit d’une protéine régulatrice pour controler plusieurs gènes situés à différents endroits dans le génomes

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22
Q

Qu’est ce qu’une régulaion par un stimulon?

A

Gènes non contigus par un même stimulus.

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23
Q

Nommer des types de modifications de la séquence de l’ADN.

A
  • Substitution
  • Délétion
  • Réarangement
  • Insertion
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24
Q

Qu’est ce qu’une mutation spontanée?

A

C’est une erreur aléatoire lors de la de réplication. C’est une mutation qui est peu fréquente.

25
Q

Décrire les mutations induites.

A

Celle-ci sont causé par des agents mutagènes chimique, biologique ou physique. Il sont beaucoup plus fréquente.

26
Q

Décrire les types de mutation.

A

Silensieuse: La mutation ne change pas l’acide aminée

Mauvais sens: La mutation met une mauvaise azotée

Non sens: La mutation met un codont stop à la place de l’acide aminé

27
Q

Que permet le fait qu’un phénotype puissent être sélectionable?

A

Ils permet au mutant sélectionnable d’avoir un avantage sur les autres bactéries dans un environnement ayant des condition sélectives. Comme la pression de sélection envers les bactéries résistantes

28
Q

Vrai ou faux:

Une concentration suboptimal des antibiotique durant le traitement peut sélectionner les mutant résistant.

A

vrai

29
Q

Nommer 5 groupes distincts de systèmes de réparation de l’ADN chez les bactéries.

A
  • LA réparation directe de l’ADN
  • La réparation par excision
  • La réparation par recombinaison
  • La réponse SOS (peut stimuler le transfert horizontal de gène)
  • La réparation sujette à erreur
30
Q

Vrai ou faux

Certains antibiotiques peuvent activer les systèmes de réparation

A

Vrai, comme les Bêtalactamines ou les quinolones

31
Q

Comment se divise les bactéries?

A

PAr fission binaire

32
Q

Quel sont les trois mécanisme d’échange génétique entre les bactéries?

A
  • Transformation
  • Conjugaison
  • Transduction
33
Q

Expliquer la transformation.

A

Il s’agit de la transmission d’information génétique d’une cellule morte vers une cellule vivante. Des résidus de celle-ci pénètre la bactérie vivante et permettre à cette dernière d’en tirer des avantages comme la résistance à certain antibiotique.

34
Q

Expliquer la conjugaison.

A

La conjugaison est l’échange de matériel génétique qui ressemble le plus à un échange sexuel étant donner que celle-ci requiert un contact cellule à cellule. L’échange est toujours unidirectionnelle. Elle se fait par l’intermédiaire de gros plasmide nommé plasmide conjugatif.

35
Q

Qu’est ce que la compétence pour une bactérie?

A

Il s’agit de la compétence à être modifier par un ADN externe. La bactérie réceptrice est compétente grâce à une machinerie protéique lui permettant de faire entrer l’ADN externe dans sa cellule et de l’intégrer dans son génome par recombinaison homologue.

36
Q

Vrai ou Faux

L’échange de gène est beaucoup plus efficace entre bactérie d’espèce différente.

A

Faux, elle est plus efficace entre bactérie de la même espèce ou d’espèce proche “cousine”

37
Q

Comment les antibiotiques peuvent-ils favoriser la transformation?

A
  • En imposant une pression sélective aux bactéries transformées par des gènes de résistance
  • En agissant comme stimulus externe induisant ou augmentant la compétence
  • En favorisant la lyse de cellules, libérant ainsi l’ADN servant à la transformation
38
Q

Qu’est ce que la transduction?

A

La transduction est le transfert de gène médié par les bactériophages. Les phages utilisent la machinerie de la cellule hôte pour faire reproduire tant leur enveloppe protéique que leur matériel génétique.

39
Q

Qu’est ce qu’un bactériophage?

A

Virus qui parasitent uniquement les bactéries

40
Q

Quels sont les 3 cycles de vie des phages?

A
  • Lytique
  • Lysogéniques
  • Chronique
41
Q

Expliquer le cycle lysogénique d’un bactériophage.

A

Le matériel génétique du phage s'intègre dans le chromosome de la bactérie et y est répliqué en même temps que le chromosome sans affecter l'hôte. En A un évènement vient rompre le cycle en permettant à l'ADN du phage de s'exciser du chromosome de l'hôte. Ensuite en B, de nouvelle particule de phages sont produites et libérée entrainant la lyse cellulaire puis la mort de la bactérie.

42
Q

Comment se nomme un phage uniquement capable d’un cycle de croissance lytique?

A

Phage virulent ou phage strictement lytique

43
Q

Qu’est ce qu’un phage tempérées ou lysogène?

A

Ils sont capable de lysogénies, ce qui veut dire qu’il peuvent entrer dans la cellule sans la détruire et intégrer leur matériel génétique dans le génome de la bactérie où il sera répliquer comme une partie intégrante du chromosome.

44
Q

Comment sont appeler les phage capable de sortir de la cellule sans la lyser?

A

Phage chronique

45
Q

Qu’est ce que la transduction?

A

Transfert d’ADN bactérien d’une cellule à une autre par l’intermédiaire d’une infection par bactériophages.

46
Q

Qu’est ce que la transduction spécialisée?

A

Un génome hybride phage-bactérie est créé quand le génome du prophage est improprement excisé du génome de l’hôte bactérien puis empaqueté à l’intérieur d’une capside.

47
Q

Qu’est ce que la transduction généralisée?

A

C’est le résultat de l’empaquetage accidentel uniquement de fragment de l’ADN de l’hôte bactérien à l’intérieur d’une capside de phage.

48
Q

Nommer des exemple de gènes qui sont transférés par transduction.

A
  • La toxine de Corynebacterium diphteriae
  • L’entérotoxine de certaine souche E. Coli
  • La toxine du streptocoque responsable de la scarlatine
  • Certaines toxines de clostridium botulinum
  • Certain gènes de résistance aux beta-lactamines chez les pseudomonas
49
Q

Qu’est ce que la transposition?

A

Mouvement de segments d’ADN à l’intérieur d’une même cellule. Requiert une proximité intracellulaire entre les endroits de transfert.

50
Q

Donner des exemples de transposition.

A
51
Q

Quel sont les quatre classes de transposon?

A
  • Séquence d’insertion (simple)
  • Transport complexe
  • Phage transposable
  • Rétrotransposons
52
Q

Pourquoi les transposon complexe ont une importance médicale?

A

Parce qu’ils peuvent encoder à l’intérieur de leu région centrale, des gènes de toxine ou de résistance aux antibiotique.

53
Q

Qu’est ce que des intégrons?

A

Éléments génétique qui recrutent des gène de résistance et les intègrent les uns à la suite de autres devant des promoteur forts assurant l’expression multiple gène simultanément.

54
Q

Quel sont les système utilisé pour la protection des bactéries contre l’invasion d’ADN étranger?

A
  • Système de restriction-modification de classe II
  • CRISPR/Cas
55
Q

Qu’est ce que le microbiote?

A

Ensemble de microbe, bactéries, fungi, archée, protiste, virus vivants dans un environnement spécifique comme par exemple chez l’hôte comme l’humain

56
Q

Qu’est ce que le microbiome?

A

Ensemble des génomes microbiens colonisant un environnement/composition et théâtre d’activité de ces micro-organismes dans leur écosystème.

57
Q

Comment se fait le développements de résistance?

A

Il y a toujours des bactéries résistante dans l’environnement. En présence d’antibiotique, les bactéries résistante vont être sélectionnées et donc survivre pour éventuellement dominer dans la population, rendant ainsi l’antibiotique inefficace.

58
Q

Qu’est ce qu’un phage tempérées ou lysogène?

A

Ils sont capable de lysogénies, ce qui veut dire qu’il peuvent entrer dans la cellule sans la détruire et intégrer leur matériel génétique dans le génome de la bactérie où il sera répliquer comme une partie intégrante du chromosome.