Cours 1 Partie 2 Flashcards
C’est quoi la pathogénicité?
Capacité d’un microorganisme à causer une maladie (notion QUALITATIVE)
Un pathogène …… induit une maladie chez les sujets sains (ex: Mycobacterium tuberculosis)
PRIMAIRE
Un pathogène ….. induit des infections chez les personnes immunodéficients/immunosupprimées (ex: Pseudomonas aeruginosa)
OPPORTUNISTES
C’est quoi la virulence?
C’est le degré de pathogénicité, une notion qualitative pour laquelle on peut calculer:
- le taux de morbidité
- taux de mortalité/léthalité
- la dose léthale
- la dose infectueuse
Définition: incidence dans une population donnée pour une période donnée
Taux de morbidité
Définition: nombre de décès par rapport au nombre de personnes infectés dans une période donnée
Taux de mortalité/léthalité
Définition: Dose qui entraine la mort de 50% des individus d’une population donnée
Dose Létale 50 (DL50)
Définition: quantité de microorganismes nécessaires pour causer une infection
Dose infectieuse
(Variable: L. Monocytogene 1 million de bactéries, M. tuberculosis 1 bactérie)
V/F: la virulence est variable selon différents facteurs de l’hôte
Vrai
Nommez 6 facteurs de risques de l’hôte:
- les traits génétiques (ex: mutation dans un récepteur antimicrobien)
- Âge
- Mode de vie (ex: alimentation, activité physique)
- Maladies chroniques (ex: diabète)
- Prise de médicaments (modulation du microbiote)
- Environnement
Nommez 3 portes d’entrée des microbes dans l’hôte:
- Muqueuse (respiratoire, digestives, génitales)
- Peau (plaies)
- Voies parentérales (piqure, coupure, morsure)
Le virus de la grippe aviaire (H5N1) est de quelle type d’infection?
Une infection respiratoire
Quelles sont les facteurs de risques du virus de la grippe aviaire (H5N1)?
- Environnement: la proximité avec les animaux (élevage, abattoirs, marchés)
- Âge:
- âge médian 18 ans (90% des cas moins de 40 ans)
- la mortalité est plus élevée de 10-18 ans
Quelle est le type d’entrée le plus fréquent du virus de la grippe aviaire (H5N1)?
Les muqueuses respiratoires
Truc de soleil (modifié par Max ) pour le H5N1: chez les ados qui respirent la bouse de cochon 🐷🦆
Comment les pathogènes adhérent aux cellules de l’hôte (étape 2)
À l’aide des flagelles
Quelles sont les 4 caractéristiques des flagelles
- Correspond à l’antigène H
- Composées de flageline
- Forme hélicoïdale
- Déplacement par chiomiotactisme
Comment la flagelle adhère à la surface de l’hôte?
Par l’interaction entre l’adhésine (pilus ou fimbriae sur bactérie) et un récepteur (sur hôte ex: hydrate de carbone)
À quoi servent les pilis?
Permettent la mobilité
Dans le cas du virus de la grippe aviaire (H5N1), qu’est-ce qui permet de reconnaitre l’hemagglutinin protein?
Acide sialic
V/F: il y a plus de micro-organismes dans e corps humains que de cellules humaines.
Vrai: 10 microbes pour 1 cellule humaine
V/F: les bactéries symbiotiques sont aussi efficaces si elles se retrouvent dans un autre organe
F: elle sont pathogènes si elles se retrouvent dans un autre organe
Déf: communauté de microorganismes qui vivent sur et dans un individu
Microbiote
Déf: regroupe l’ensemble des génomes du microbiote + environnement dans lequel il vit
Microbiome
Déf: espèces microbiennes communes partagées entre les individus dans des endroits
spécifiques du corps
Core microbiome
Déf: nombre d’espèces qui composent le microbiote
Diversité
Quelles sont les 2 types de diversité:
Alpha: diversité dans un seul échantillon (nb d’espèces composant un microbiote)
Beta: diversité entre deux échantillons (nb d’espèces communes entre 2 microbiotes)
Déf: microorganismes vivant qui a une action bénéfique sur l’hôte
Probiotique
Déf: déséquilibre ou perturbation du microbiote
Dysbiose
Nommez 5 fonctions du microbiote:
- Rôle sur le système immunitaire (développement, maturation, fct des cellules inées et adaptives)
- Protection contre les pathogènes (effet barrière)
- Fonctions tissulaires (maturation du tube digestif, production de mucus)
- Fonctions neurologiques (douleur, humeur, satiété)
- Fonctions métaboliques (digestion, synthèse de métabolites)
V/F: la diversité des bactéries dépend de la région où elles se trouvent (peau sèche ou grasse)
Vrai diapo 74 (comprendre en général)
Nommez 5 types de microbiote sur le corps:
- La peau
- Buccal
- Urogénital
- Tractus digestif
- Voies respiratoires
3 caractéristques de la microbiote de la peau:
- Localisation = épiderme, glandes sudoripares, follicules pilleux
- Maintien homéostasie immunitaire
- Maintien les défenses immunitaires
Staphylococcus epidermis et Proprionibacterium acnes sont des bactéries de la microbiote …. ?
De la peau
- epidermis = flore normale
- acnes = acné
Causes (3) d’une dysbiose (déséquilibre) du microbiote de la peau
- Infections chroniques des plaies
- Acné
- Dermatite atopique
V/F: Le microbiote de la peau est le 2ème microbiote le plus diversifié et plus important en nb de bactéries
FAUUXXXX c’est la microbiote buccal
Rôle de la microbiote buccal
Fonctions protectrices (effet de barrière)
Streptococcus, Fusobacterium et Actinomyce sont des bactéries de quel microbiote?
Buccal
Exemples de dysbiose du microbiote buccal (6):
- Alcoolisme
- Tabagisme
- Maladies chroniques
- Cancers
- Régime alimentaire
- Antibiotiques
MATRAC
Comment sont les bactéries présentes dans les reins et la vessie?
NORMALEMENT stérile
Quelles sont les bactéries présentes dans l’urètre?
- Staphylocoques
- Streptocoques
- Entérocoques
- Bacilles anaérobies
Quelle est l’importance de la flore complexe évolutive du vagin?
Elle a un effet sur le pH:
- av puberté et après ménopause = Alcalin (7 et plus)
- adulte: Acide (3.8-4.5)
V/F: La flore normale peut contenir des levures comme Candida albicans qui prolifèrent lors d’une dysbiose et peuvent causer des infections urinaires
Vrai
Une des bactéries les plus importantes du microbiote urogénital pour réguler le pH
Lactobacillus
Comment la bactérie Lactobacillus régule le pH du système urogénital?
Av la puberté et après la ménopause: pH alcalin (7 et +)
Vie adulte: pH acide (3.8 - 4.5)
Que pourrait altérer la composition du microbiote du sys uro-génital? (Et diminuer la qut des lactobacilles)
- Augmentation du pH
- Perte des défenses immunitaires (peptides antimicrobiens)
- Environnement inflammatoire
Causes de dysbiose du microbiote du sys uro-génital
- Âge
- Stress
- Manque d’hygiène
- Antibiotiques
Conséquences de dysbiose du microbiote du sys uro-génital:
- Prolifération des microorganismes opportunistes (Candida albicans)
- Infection par des microorganismes pathogènes
- Augmente le risque de naissances prématurées
- Augmente le risque de dommages aux trompes et d’infertilité
- Augmente le risque d’IST (VIH)
2 types de bactéries qui causent des infections du système urogénital
- Gardnerella vaginalis = vaginose
- Trichromonas vaginalis = trichomonase
Quel est le microbiote le plus étudié, le plus diversifié et le plus peuplé?
Microbiote du tractus digestif
- effets locaux et systémiques par les liens avec de nombreux organes
- différents pH, concentrations d’O2
Composition du microbiote du tractus digestif:
Bactéries, virus et levures
Bactéries à retenir du tractus digestif
- Bacteroides
- Prevotella
- Streptococcus
- Candida
- Saccharomyces
V/F: Le microbiote du tractus digestif est le même à la naissance qu’à l’âge adulte.
FAUX: il évolue avec l’âge, très lié à l’immunité (voir image diapo 84 pp1)
Facteurs affectants la composition du tractus digestif
- Type d’accouchement
- Alimentation
- Hygiène
- Traitements antibiotiques
Nommez 9 mécanismes du tractus digestifs:
- Production d’acides gras à courte chaine (SCFA: butyrate, propionate)
- Libération de molécules bactérienne
- Métabolisme des acides biliaires
- Métabolisme du tryptophane
- Production de médiateurs immunomodulateurs
- Maintien de la tolérance immunitaire
- Production de peptides antimicrobiens
- Maintien de l’intégrité barrière intestinale
- Activation des lymphocytes B et production d’IgA
Avec quoi le tractus digestif maintien la tolérance immunitaire (2)
- Cellules dentritiques tolérogéniqus
- Lymphocytes T régulateurs
Comment le tractus digestif maintien l’intégrité de la barrière intestinale? (2)
- Renforcement des jonctions cellulaires
- Activation des lymphocytes innés 3 (IL3) = produisent des IL22
Liens entre le microbiote du tractus digestif et les autres organes (j’ai copié collé le pp)
Cerveau: stress, anxiété, dépression, autisme, etc.
Système endocrinien: désordres hormonaux
Cœur: maladies cardiovasculaires, hypertension, athérosclérose
Poumon: MPOC, fibrose pulmonaire
Foie: Carcinomes, inflammation hépatique, NASH
Pancréas: diabète, inflammation pancréatique
Muscle: sarcopénie, faiblesse musculaire
Peau: acné, psoriasis, rides, etc
Rein: pathologies rénales aigues et chroniques, néphropathie
Vessie: infections urinaires
Système reproductif: infertilité, cancer, ostéoporose
Quels sont les effets des antibiotiques sur l’infection par Clostridium difficile sur le tractus digestif?
- Cause des diarrhées
- Les infections sont difficiles à traiter
Quels sont les traitements possibles pour réduire les effets des antibiotiques sur l’infection par Clostridium difficile sur le tractus digestif?
Traitement de 1ère ligne: antibiothérapie, probiotiques
Traitement de 2ème ligne: transplantation de matériel fécal
Pour résister à la réponse immunitaire, certains microbes peuvent:
1. Se protéger de la _________
2. Survivre à l’intérieur des ______________
3. Sécréter des ___________ qui détruisent les leucocytes
4. Interférer avec les ___________ et le ___________
- Phagocytose
- Leucocytes
- Enzymes
- Anticorps/complément
Caractéristiques d’une capsule
- Définit l’antigène K
- Peut être présent chez les Gram- et Gram+
- Composé de polysaccharides ou protéines
- Essentielle pour la survie dans l’hôte (pas nécessaire pour la croissance bactérienne)
Rôle de la capsule (3)
- Barrière physique contre les molécules hydrophobiques (détergents)
- favorise l’adhérence aux surfaces/tissus
- Empêche la phagocytose
Définition d’un biofilm
Communauté microbactérienne adhérant à une surface (généralement plusieurs organismes)
Rôles d’un biofilm
- Production d’une matrice protectrice = Glycocalyx (ADN, polysaccharides)
- Augmente la résistance des microorganismes aux antibiotiques et au système immunitaire
4 étapes de la formation d’un biofilm
- Attachement réversible
- Attachement irréversible, Formation de la matrice polysaccharidique
- Maturation, formation de microcolonies, colonisation par d’autres espèces bactériennes
- Dispersion
Les microbes sécrètent des enzymes extracellulaires, décrire leurs fonctions:
Cytolysine
Hémolysine
Cogulases et fibrinolysines
Leucocidines
- Cytolysines: détruisent les composantes cellulaires des cellules de l’hôte (ex. phospholipases, collagénases)
- Hémolysines: lysent les érythrocytes (globules rouges)
- Coagulases et fibrinolysines: agissent sur la coagulation du sang (favorisent ou empêchent)
- Leucocidines: forment des pores dans les membranes des leucocytes et induisent leur lyse
Exemple: Virus de la grippe aviaire (H5N1)
Rôles des différentes protéines du virus qui vont agir sur la réponse immunitaire
NS1
PB1-F2
M2
NS1
1- Supprime l’immunité antivirale (action sur les interférons de type I)
2- Induit l’apoptose des cellules infectées
PB1-F2
1- Supprime l’immunité antivirale (action sur les interférons de type I)
2- Induit l’apoptose des cellules infectées
M2
Inhibe l’autophagie en bloquant la fusion entre le phagosome et le lysozome
Décrire le mécanisme Zipper
- Interactions entre les adhésines de la bactérie et celles des récepteurs de l’hôte
- Modulation du cytosquelette
- La bactérie est entourée par la membrane qui forme un endosome pour permettre l’invasion
Exemple du mécanisme Zipper: Listeria monocytogenes
Quels sont les adhésines et les récepteurs correspondant?
Adhésines: InlA et InlB
Récepteurs: E-cadhérine
Décrire les étapes du mécanisme Trigger
1- Bactérie injecte (par une seringue SST3) des protéines effectrices directement dans le cytoplasme de la cellule hôte
2- Modulation du cytosquelette d’actine par les effecteurs bactériens
3- La bactérie est entourée par la membrane qui forme un endosome pour permettre l’invasion
Exemple d’un mécanisme Trigger
Salmonella, Shigella
Effecteurs: SipA, SipC, SopB, SopE, SopE2
Déf: toxine
Protéine d’un microorganisme qui lui permet de provoquer une maladie
Déf: Exotoxine
Toxine présente dans le cytoplasme es microorganisme qui est ensuite sécrétées dans le milieu extracellulaire ou directement dans la cellule hôte
Déf: Endotoxine
Portion lipidique (lipide A) du lipopolysaccharide (seulement chez les bactéries à Gram - ) qui est libérée lors de la lyse ou de la croissance
Déf: Anatoxine
Toxine qui a perdu son pouvoir toxique mais reste immunogène et peut être utilisée comme vaccin
Rôle du lipide A dans les endotoxines
Ancre les LPS dans la membrane externe, responsable du pouvoir immunogénique
Que peut causer comme symptôme les endotoxines
réponse inflammatoire
Fièvre
Choc septique
Caractéristiques des exotoxines (3):
- Poisons violents
- Efficaces à faible dose
- Effets neurotoxiques, cytotoxiques, entérotoxiques
Décrire les exotoxines de classe 1
Classe 1:
Agissent à la surface de la cellule
- récepteur de l’hôte
- formation de pore
Exemples d’exotoxines de classe 1
- Superantigènes SEA/SSA/SPEA (S. aureus, S. pyogenes)
- Listeriolysine (L.monocytogenes)
- Pneumolysine (S.pneumoniae)
- Toxine PA (B. anthracis)
Décrire les exotoxines de classe 2:
Classe 2:
Agissent sur des cibles intracellulaires
- endocytées
- à sous-unités A/B
Agissent sur les voies de signalisation de l’hôte, cytosquelette, synthèse protéique
Exemples d’exotoxines de classe 2
- Toxine tétanique (C. tetani)
- Toxine botulique (C. botulinum)
- Facteur léthal (B. anthracis)
- Toxine diphtérique (C. diphteriae)
Décrire les exotoxines de classe 3:
Classe 3:
Agissent sur des cibles intracellulaires INJECTÉES
Agissent sur les voies de signalisation de l’hôte, cytosquelette, synthèse protéique
Exemples d’exotoxine de classe 3
- Toxines Sip/Sop (Salmonella)
- Toxine IpaB (Shigella)
- Toxines ExoS/U (Pseudomonas)
