COURS 06 - PHYSIOLOGIE BACTÉRIENNE Flashcards
classer les bactéries selon leur source d’énergie (2)
- phototrophes : lumière
- chimiotrophes : composé chimique
classer les bactéries selon leur source de C
- autotrophe : CO2
- hétérotrophes : composés organiques
classer les bactéries selon leur source d’électrons (2)
- lithotrophes : composés inorganiques
- organotrophes : composés organiques (avec carbone)
bactéries lithotrophes : nommer des sources possibles d’é- (6)
- NO2-
- S
- H2S
- H2
- NH3
- ions ferreux
bactéries organotrophes : nommer des sources possibles d’électrons (3)
- sucres
- alcools
- acides
définir “milieu de culture défini”
- dont la composition chimique est connue et précise
- ex : milieu minimal
quel est le but d’un milieu de culture défini
étudier le role d’un composé sur la croissance
définir “milieu de culture complexe” (2)
- dont la composition chimique n’est pas rigoureusement déterminée
- ex : contient extraits de viande, de soya, de levures, hydrolysats de prots…
milieu de culture complexe : quel est son but?
- favoriser la croissance de tout organisme pouvant enre présent dans un échantillon ou encore ayant des exigences nut spécifiques
milieu de culture complexe : donner des exemples (5)
- gélose nutritive
- gélose sang
- gélose MacConkey
- bouillon coeur-cervelle
- BCYE
milieux de culture - nommer les formes possibles (2)
- liquide (bouillon)
- solide (gélose)
milieux de culture - comment est préparée la gélose
- en ajoutant de l’agar au bouillon
milieux de culture - qu’est-ce que de l’agar (2)
- extrait d’algue gélifiant
- solide jusqu’à 45 C
milieux de culture - que permet la culture sur gélose
- l’obtention de colonies isolées et de cultures pures
temps de croissance des bact sur gélose - de quoi depend-t-il (3)
- des espèces
- des cond de culture
- de la source d’isolement
temps de croissance des bact sur gélose - en microbiologie medicale, la plupart des espèces peuvent prod des colonies visibles après ____ à ____ heures d’incubation à ____ degrés C
- 18 à 24h
- à 35 C
temps de croissance des bact sur gélose - nommer quelques bactéries qui peuvent prod des colonies visibles après 18-24h (3 catégories, 7 en tout)
- entérobact : E. Coli, Salmonella spp, Klebsiella spp
- Cocci Gram+ : staphy et streptocoques
- bact non fermentaires : Acinetobacter spp, pseudomonas
temps de croissance des bact sur gélose - certaines espèces plus fastidieuses requièrent des incubations de quelques jours à semaines : nommez-en (2)
- legionnella pneumophilia (2-3 jours, mais jusqu’à 7 jours)
- M. Tuberculosis (2-6 semaines)
comment obtient-on des colonies isolées par la méthode d’épuisement
- on fait des stries parallèles dans le premier quadrant à l’aide d’un écouvillon imbibé de l’échantillon
- on fait la même chose dans le 2e quadrant, mais en prélevant l’échantillon du 1er quadrant avec un écouvillon stérile
- on répète avec les 3e et 4e quadrants
milieux de culture - définir “milieu enrichi”
additionné de produits (sang, prots, viramines) qui favorisent la croissance de microbes ayant des besoins nutritifs complexes ou particuliers
milieux de culture - définir “milieu de culture sélectif”
- additionnés d’inhibiteurs de croissance (Ab, sels, composés chimiques) pour inhiber la croissance de MO indésirables et fav ceux recherchés
milieux de culture - définir “milieu de croissance différentiel”
- additionnés d’éléments (sucres, indicateurs de pH) permettant de distinguer des espèces apparentées
milieux de culture - peuvent-ils etre a la fois enrichis, sélectifs et différentiels?
OUI
milieux de culture - nommer 2 exemples de milieu enrichis
- gelose sang
- gelose chocolat
milieux de culture - nommer un exemple de milieu sélectif pour les staph, et différentiel entre les souches de staph et décrivez le
- gélose chapman (mannitol, sel, indicateur pH)
- inhibe les bact ne tolérant pas le sel
- différencie celles fermentant ou non le mannitol → la fermentation prod de l’acide, ce qui modifie le pH et donc la couleur
milieux de culture - nommer les types d’hémolyses sur gelose sang (3)
- hémolyse alpha
- hémolyse beta
- hemolyse gamma
milieux de culture - définir l’hémolyse alpha sur gélose sang
- hémolyse partielle
- l’Hb ets oxydée par le eroxyde en provenance des bact, ce qui fait en sorte que la gélose prend une couleur verte (méthémoglobine)
milieux de culture - définir l’hémolyse beta sur gelose sang
- hémolyse complète
milieux de culture - définir l’hémolyse gamma sur gélose sang
aucune hémolyse
milieux de culture - gélose macconkey : décrire sa sélectivité et son pouvoir différentiel
- sélectif pour fav la croissance des gram - et inhiber les gram +
- différentiel selon la capacité de fermentation du lactose
milieux de culture - gélose MacConkey : comment se comporte E. Coli sur cette gélose
- présence de colonies (car sélectif pour Gram-)
- colonies roses-rouges (car elles peuvent fermenter abondemment le lactose)
milieux de culture - gélose MacConkey : comment se comporte Shigella flexneri sur cette gélose
- présence de colonie (car gram-)
- aucune coloration (car ne fermente pas le lactose)
milieux de culture - gélose MacConkey : comment se comporte enterobacter aerogenes sur cette gélose
- présence de colonies (car gram-)
- colonies roses pâles (car fermentation faible du lactose)
milieux de culture - gélose MacConkey : comment se comporte staph aureus sur cette gélose
- aucune croissance (car gram+)
milieux de culture - gélose éosine-bleu de méthylène : décrire son pouvoir différentiel (2)
- permet de distinguer la fermentation du lactose
- permet de distinguer les entérobact gram- par leur apparence métallique
milieux de transport des prélèvements - quels caract doivent-ils avoir (2)
- pas permettre la croissance
- préserver la viabilité lors du transfert
conditions physico-chimiques de croissance - quelle T préfèrent les bact psychrophiles
-10 - 25 C
conditions physico-chimiques de croissance - quelle T préfèrent les bact mésophiles
20-50C
conditions physico-chimiques de croissance - quelle T préfèrent les bact thermophiles
50-100C
conditions physico-chimiques de croissance - dans quelle plage de T prolifèrent le + les bact patho de l’H
30 - 42 C
conditions physico-chimiques de croissance - a quelles T se fait la pasteurisation
66 - 71 C
conditions physico-chimiques de croissance - besoins en oxygène : décrire les bact aérobies strictes (2)
- présence O2 nécessaire a la croissance
- possèdent des enzymes (catalase et SOD) qui permettent la neutralisation des dérivés réactifs de l’oxygène
conditions physico-chimiques de croissance - besoins en oxygène : décrire les bact anaérobies facultatives (2)
- croissance avec ou sans O2, mais optimale en présence d’O2
- possèdent les enzymes (catalase et SOD) nécessaire a la neutralisation des prod dérivés de l’O
conditions physico-chimiques de croissance - besoins en oxygène : décrire les bact anaérobies strictes (2)
- croissance seulement en absence d’O2
- ne possèdent pas les enzymes permettant la neutralisation des DRO : l’O n’est pas toléré
conditions physico-chimiques de croissance - besoins en oxygène : décrire les bact anaérobies aérotolérantes (2)
- croissance anaérobies seulement, mais elle peut se poursuivre meme en présence d’O2
- possèdent uniquement la SOD’ qui permet la neutralisation partielle des DRO → l’O2 est tolérée, mais ne fav pas la croissance
conditions physico-chimiques de croissance - besoins en oxygène : décrire les bact microaérophiles (2)
- croissance aérobie seulement, mais l’O2 doit etre en faible []
- des quantité létales de DRO sont produites si la [O2] se rapproche de la cocnentration atmosphérique
conditions physico-chimiques de croissance - besoins en oxygène : de quel type de bact s’agit-il? expliquer le phénomène
- anaérobies strictes
- la croissance a lieu seulement là ou il n’y a pas d’O2, c’est-à-dire dans le FOND du tube contenant un milieu de culture solide
conditions physico-chimiques de croissance - besoins en oxygène : de quel type de bact s’agit-il? expliquer le phénomène
- aérobie stricte
- la croissance a lieu seulement ou une forte quantité d’O2 a diffusé dans le milieu solide
conditions physico-chimiques de croissance - besoins en oxygène : de quel type de bact s’agit-il? expliquer le phénomène
- anaérobies aérotolérants
- la croissance est uniforme, car l’O a aucun effet
conditions physico-chimiques de croissance - besoins en oxygène : de quel type de bact s’agit-il? expliquer le phénomène
- microaérophiles
- la croissance a lieu uniquement ou une faible quantité d’O2 a diffusé dans le milieu
conditions physico-chimiques de croissance - besoins en oxygène : de quel type de bact s’agit-il? expliquer le phénomène
- anaérobies facultatifs
- la croissance est optimale la ou la [O2] est la plus élevée, mais elle a lieu partout dans le tube
conditions physico-chimiques de croissance - besoins en oxygène : comment peut-on faire la culture des anaérobies en lab (2)
- chambre anaérobie
- jarre anaérobie
conditions physico-chimiques de croissance - pH : décrire la milieu de croissance idéal de la majorité des MO
- milieux tamponnés de pH 6,5 - 7,5
conditions physico-chimiques de croissance - pH : selon quoi est-ce que le pH optimal varie
les espèces
conditions physico-chimiques de croissance - pH : nommer les catégories de bact qu’il est possible de désigner selon leur pH préférentiel (5)
- extreme acidophiles
- acidophiles
- neutrophiles
- alkalophiles
- extreme alkalophiles
conditions physico-chimiques de croissance - pH : pH idéal pour bact extemes acidophiles
0 - 2
conditions physico-chimiques de croissance - pH : pH idéal pour bact acidophiles
2 - 5
conditions physico-chimiques de croissance - pH : pH idéal pour bact neutrophiles
6 - 8
conditions physico-chimiques de croissance - pH : pH idéal pour bact alkalophiles
9 - 12
conditions physico-chimiques de croissance - pH : pH idéal pour bact extremes alkalophiles
12 - 14
définir facteur de croissance (4)
- métabolite essentiel qui n’est pas synthétisé par le MO
- doit etre apporté par les aliments
- peut intervenir a tous les stades du métabolisme
- il s’agit de petites molécules (AA, base snucléiques, vitamines, hème, ion)
facteurs de croissances - de quoi dépendent-il
- relatifs a un MO donné pour un milieu spéficique
mesure de la croissance bact - décrire la méthode de dénombrement sur gélose après dilution en série (6 tapes)
- on comment avec une solution échantillon
- on en prend 1 mL, qu’on dilue dans 9 mL, pour un total de 10 mL
- on refait cette dilution plusieurs fois
- on prend les 3 dernières dilutions (les moins concentrées), et on en incube 0,1 mL sur une gélose
- on dénombre le nb de colonies visibles sur chacune de ses trois gélose
- on détermine le nombre de colony forming units (CFU) sur les géloses
mesure de la croissance bact - nommer les phases de la croissance bact (6)
- phase de latence
- phase d’accélération
- phase expoentielle
- phase de ralentissement
- phase stationnaire
- phase de décroissance
métabolisme microbien - selon quel principe fonctionne-t-il
- catbolisme → anabolisme
- décomposer en unités de base pour recomposer par la suite
métabolisme microbien - catabolisme des sucres : nommer les étapes de base (3)
- ingestion d’une source de C et d’énergie
- transport des H+ et des é-
- bactérie énergisée
métabolisme microbien - décrire les principes de base du métabolisme respiratoire chez les aérobies (3)
- le C ingéré fournit de l’énergie
- l’oxygène inspiré capte les p+ et les é- de la chaine resp
- de l,eau et du CO2 sont exhalés lors de la respiration aérobie
métabolisme microbien - décrire le processus du métabolisme resp chez les aérobies (5)
- le glucose passe par la glycolyse, devient pyruvate
- il passe ensuite dans le cycle de Krebs, produisant 2 CO2
- le bris des liens chimiques lors de cette transformation fournit de l’É qui est stockée en ATP
- le glucose fournit aussi des H+ et des é-, qui passent par la chaine resp et la phosphorylation oxydative our former 34 ATP
- les p+ et e- sont ensuite captés par l’O pour former de l’eau
métabolisme microbien - décrire les transporteurs d’É, de H+ et de e- chez les aérobies (4)
- les transports de H+ et de e- sont placés dans un ordre rigoureux et invariable, selon un potentiel de redox
- des NAD, des FAD et des quinones font partie de ves transporteurs, surtout pour les H+ et les e- de la glycolyse et de Krebs
- des cytocrhomes (b, c, a) transportent ensuite les e- jusqu’à l’accepteur final, O2
- ces transports sont comme un courant é- dont l’É est captée par l’ADP qui se joint à un groupement PO4 pour former de l’ATP (phosphorylation)
métabolisme microbien - transports des H+ et e- chez les aérobies : définir oxydation et réduction (2)
- se sont des échanges d’é-
- l’oxydation est une perte d’é-, et la réduction un gain d’é-
métabolisme microbien - transports des H+ et e- chez les aérobies : quels sont les donneurs d’é- les + importants
- les atomes d’H des composés organiques
métabolisme microbien - transports des H+ et e- chez les aérobies : quand se produit-il une déshydrogénation du produit initial
- quand le proton est transféré en même temps que l’électron (le produit initial s’oxyde)
métabolisme microbien - transports des H+ et e- chez les aérobies : quel est le principe permettant à la chaine resp de fonctionner en tant que syst redox (2)
- les composés organiques se comportent souvent a la fois comme des donneurs et des accepteurs d’é-
- souvent les susbtances intermédiaires reçoivent puis redonnent simultanément des é- et deviennent a leur tour réduites puis oxydés dans un syst de composés formant une chaine resp
métabolisme microbien - transports des H+ et e- chez les aérobies : quel est l’accepteur final d’é-
l’oxygène
métabolisme microbien - resp aérobie : résumer le processus de transport des é- et H+ du NADH (2)
- le NADH est réoxydé en cédant ses é- a la chaine de transporteurs que sont les cytochromes
- les H+ du NADH vont se fixer à l’O2 pour former de l’eau (lorsque les é- rejoindront aussi le O2)
métabolisme microbien - resp anaérobie : définir
- processus durant lequel des MO utilisent un composé inorganique comme accepteur final de p+ et d’é- (plutot que le O2)
métabolisme microbien - resp anaérobie : dans quels cycles du sol est-elle utile (3)
- N
- S
- C
métabolisme microbien - resp anaérobie : décrire le fonctionnement de Krebs et de la chaine d’é-
ils fonctionnent, mais ils sont réduits
métabolisme microbien - resp anaérobie : comparer sa prod d’ATP a la resp aérobie
elle est moindre (<28 ATP vs 34 ATP)
métabolisme microbien - resp anaérobie : décrire le processus (2)
- le glucose est transformé en pyruvate par la glycolyse, puis dégradé en CO2 dans Krebs
- les H+ et é- du glucose passent par la chaine d’électrons, mais celle-ci ne fonctionne que partiellement (= moins d’ATP) → ils sont ensuite captés par des composés inorganiques
métabolisme microbien - resp anaérobie : nommer ses produits (2)
- CO2
- composé inorganique réduit
métabolisme microbien - fermentation : décrire le fonctionnement de krebs et de la chaine respiratoire
ne fonctionnent PAS
métabolisme microbien - fermentation : comparer la quantité d’ATP formée aux resp aérobie et anaérobie
- il y en a moins (2 ATP vs 34 pour aérobie et < 26 pour anaérobie)
métabolisme microbien - fermentation : comment est formé l’ATP
a partir de la glycolyse uniquement
métabolisme microbien - fermentation : décrire le processus
- le glucose est transformée en pyruvate par le glycolyse, puis en CO2 par fermentation
métabolisme microbien - fermentation : nommer ses produits (2)
- CO2
- produits de fermentation (intermédiaires organiques de la dégradation du pyruvate)
métabolisme microbien - fermentation : résumer le sort du NADH
- il est réoxydé en cédant ses é- a un composé organique, qui devient un prod de la fermentation
métabolisme microbien - fermentation : nommer des exemples de produits de fermentation (10)
- acide propionique (fromages)
- éthanol (alcool)
- acide lactique (yogourts)
- H2O
- CO2
- butanol
- isopropanol
- 2,3-butanediol
- acide beta-hydroxy-butyrique
- acide acétique
métabolisme microbien - fermentation : utilité des prod de fermentation (2)
- facilitent l’identification du MO
- ont des utilités industrielles (nourriture, vitamine C, carburant…)
métabolisme microbien - resp aérobie, anaérobie et fermentation : comparer les conditions de croissance
- aérobie : aérobie
- anaérobie : anaérobie
- fermentation : un des deux
métabolisme microbien - resp aérobie, anaérobie et fermentation : comparer les accepteurs finaux d’é-
- aérobie : O2
- anaérobie : substances inorg
- fermentation : substance org (ex : acide pyruvique)
métabolisme microbien - resp aérobie, anaérobie et fermentation : comparer les types de phosphorylation employées pour prod de l’ATP
- aérobie : au niveau du substrat + oxydative
- anaérobie : au niveau du substrat + oxydative
- fermentation : au niveau du substrat
au niv du substrat = glycolyse
métabolisme microbien - resp aérobie, anaérobie et fermentation : comparer la quant de mol d’ATP produites/mol de glucose
- aérobies : 32 (procaryotes) ou 30 (eucaryotes)
- anaérobie : variable, entre 2 et 32
- fermentation : 2
métabolisme microbien - que permettent les bioréacteurs industriels (5)
- de controler les conditions d’aération (anaérobiose ou aérobiose)
- de faire des productions par lots
- de faire des prod en continue
- de controler le pH
- de controler la T