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MED H2022 - SF3 PARTIE 1 > COURS 06 - PHYSIOLOGIE BACTÉRIENNE > Flashcards

COURS 06 - PHYSIOLOGIE BACTÉRIENNE Flashcards

1
Q

classer les bactéries selon leur source d’énergie (2)

A
  • phototrophes : lumière
  • chimiotrophes : composé chimique
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2
Q

classer les bactéries selon leur source de C

A
  • autotrophe : CO2
  • hétérotrophes : composés organiques
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3
Q

classer les bactéries selon leur source d’électrons (2)

A
  • lithotrophes : composés inorganiques
  • organotrophes : composés organiques (avec carbone)
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4
Q

bactéries lithotrophes : nommer des sources possibles d’é- (6)

A
  • NO2-
  • S
  • H2S
  • H2
  • NH3
  • ions ferreux
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5
Q

bactéries organotrophes : nommer des sources possibles d’électrons (3)

A
  • sucres
  • alcools
  • acides
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6
Q

définir “milieu de culture défini”

A
  • dont la composition chimique est connue et précise
  • ex : milieu minimal
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7
Q

quel est le but d’un milieu de culture défini

A

étudier le role d’un composé sur la croissance

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8
Q

définir “milieu de culture complexe” (2)

A
  • dont la composition chimique n’est pas rigoureusement déterminée
  • ex : contient extraits de viande, de soya, de levures, hydrolysats de prots…
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9
Q

milieu de culture complexe : quel est son but?

A
  • favoriser la croissance de tout organisme pouvant enre présent dans un échantillon ou encore ayant des exigences nut spécifiques
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10
Q

milieu de culture complexe : donner des exemples (5)

A
  • gélose nutritive
  • gélose sang
  • gélose MacConkey
  • bouillon coeur-cervelle
  • BCYE
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11
Q

milieux de culture - nommer les formes possibles (2)

A
  • liquide (bouillon)
  • solide (gélose)
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12
Q

milieux de culture - comment est préparée la gélose

A
  • en ajoutant de l’agar au bouillon
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13
Q

milieux de culture - qu’est-ce que de l’agar (2)

A
  • extrait d’algue gélifiant
  • solide jusqu’à 45 C
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14
Q

milieux de culture - que permet la culture sur gélose

A
  • l’obtention de colonies isolées et de cultures pures
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15
Q

temps de croissance des bact sur gélose - de quoi depend-t-il (3)

A
  • des espèces
  • des cond de culture
  • de la source d’isolement
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16
Q

temps de croissance des bact sur gélose - en microbiologie medicale, la plupart des espèces peuvent prod des colonies visibles après ____ à ____ heures d’incubation à ____ degrés C

A
  • 18 à 24h
  • à 35 C
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17
Q

temps de croissance des bact sur gélose - nommer quelques bactéries qui peuvent prod des colonies visibles après 18-24h (3 catégories, 7 en tout)

A
  • entérobact : E. Coli, Salmonella spp, Klebsiella spp
  • Cocci Gram+ : staphy et streptocoques
  • bact non fermentaires : Acinetobacter spp, pseudomonas
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18
Q

temps de croissance des bact sur gélose - certaines espèces plus fastidieuses requièrent des incubations de quelques jours à semaines : nommez-en (2)

A
  • legionnella pneumophilia (2-3 jours, mais jusqu’à 7 jours)
  • M. Tuberculosis (2-6 semaines)
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19
Q

comment obtient-on des colonies isolées par la méthode d’épuisement

A
  1. on fait des stries parallèles dans le premier quadrant à l’aide d’un écouvillon imbibé de l’échantillon
  2. on fait la même chose dans le 2e quadrant, mais en prélevant l’échantillon du 1er quadrant avec un écouvillon stérile
  3. on répète avec les 3e et 4e quadrants
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20
Q

milieux de culture - définir “milieu enrichi”

A

additionné de produits (sang, prots, viramines) qui favorisent la croissance de microbes ayant des besoins nutritifs complexes ou particuliers

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21
Q

milieux de culture - définir “milieu de culture sélectif”

A
  • additionnés d’inhibiteurs de croissance (Ab, sels, composés chimiques) pour inhiber la croissance de MO indésirables et fav ceux recherchés
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22
Q

milieux de culture - définir “milieu de croissance différentiel”

A
  • additionnés d’éléments (sucres, indicateurs de pH) permettant de distinguer des espèces apparentées
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23
Q

milieux de culture - peuvent-ils etre a la fois enrichis, sélectifs et différentiels?

A

OUI

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24
Q

milieux de culture - nommer 2 exemples de milieu enrichis

A
  • gelose sang
  • gelose chocolat
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25
Q

milieux de culture - nommer un exemple de milieu sélectif pour les staph, et différentiel entre les souches de staph et décrivez le

A
  • gélose chapman (mannitol, sel, indicateur pH)
  • inhibe les bact ne tolérant pas le sel
  • différencie celles fermentant ou non le mannitol → la fermentation prod de l’acide, ce qui modifie le pH et donc la couleur
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26
Q

milieux de culture - nommer les types d’hémolyses sur gelose sang (3)

A
  • hémolyse alpha
  • hémolyse beta
  • hemolyse gamma
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27
Q

milieux de culture - définir l’hémolyse alpha sur gélose sang

A
  • hémolyse partielle
  • l’Hb ets oxydée par le eroxyde en provenance des bact, ce qui fait en sorte que la gélose prend une couleur verte (méthémoglobine)
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28
Q

milieux de culture - définir l’hémolyse beta sur gelose sang

A
  • hémolyse complète
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29
Q

milieux de culture - définir l’hémolyse gamma sur gélose sang

A

aucune hémolyse

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30
Q

milieux de culture - gélose macconkey : décrire sa sélectivité et son pouvoir différentiel

A
  • sélectif pour fav la croissance des gram - et inhiber les gram +
  • différentiel selon la capacité de fermentation du lactose
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31
Q

milieux de culture - gélose MacConkey : comment se comporte E. Coli sur cette gélose

A
  • présence de colonies (car sélectif pour Gram-)
  • colonies roses-rouges (car elles peuvent fermenter abondemment le lactose)
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32
Q

milieux de culture - gélose MacConkey : comment se comporte Shigella flexneri sur cette gélose

A
  • présence de colonie (car gram-)
  • aucune coloration (car ne fermente pas le lactose)
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33
Q

milieux de culture - gélose MacConkey : comment se comporte enterobacter aerogenes sur cette gélose

A
  • présence de colonies (car gram-)
  • colonies roses pâles (car fermentation faible du lactose)
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34
Q

milieux de culture - gélose MacConkey : comment se comporte staph aureus sur cette gélose

A
  • aucune croissance (car gram+)
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35
Q

milieux de culture - gélose éosine-bleu de méthylène : décrire son pouvoir différentiel (2)

A
  • permet de distinguer la fermentation du lactose
  • permet de distinguer les entérobact gram- par leur apparence métallique
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36
Q

milieux de transport des prélèvements - quels caract doivent-ils avoir (2)

A
  • pas permettre la croissance
  • préserver la viabilité lors du transfert
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37
Q

conditions physico-chimiques de croissance - quelle T préfèrent les bact psychrophiles

A

-10 - 25 C

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38
Q

conditions physico-chimiques de croissance - quelle T préfèrent les bact mésophiles

A

20-50C

39
Q

conditions physico-chimiques de croissance - quelle T préfèrent les bact thermophiles

A

50-100C

40
Q

conditions physico-chimiques de croissance - dans quelle plage de T prolifèrent le + les bact patho de l’H

A

30 - 42 C

41
Q

conditions physico-chimiques de croissance - a quelles T se fait la pasteurisation

A

66 - 71 C

42
Q

conditions physico-chimiques de croissance - besoins en oxygène : décrire les bact aérobies strictes (2)

A
  • présence O2 nécessaire a la croissance
  • possèdent des enzymes (catalase et SOD) qui permettent la neutralisation des dérivés réactifs de l’oxygène
43
Q

conditions physico-chimiques de croissance - besoins en oxygène : décrire les bact anaérobies facultatives (2)

A
  • croissance avec ou sans O2, mais optimale en présence d’O2
  • possèdent les enzymes (catalase et SOD) nécessaire a la neutralisation des prod dérivés de l’O
44
Q

conditions physico-chimiques de croissance - besoins en oxygène : décrire les bact anaérobies strictes (2)

A
  • croissance seulement en absence d’O2
  • ne possèdent pas les enzymes permettant la neutralisation des DRO : l’O n’est pas toléré
45
Q

conditions physico-chimiques de croissance - besoins en oxygène : décrire les bact anaérobies aérotolérantes (2)

A
  • croissance anaérobies seulement, mais elle peut se poursuivre meme en présence d’O2
  • possèdent uniquement la SOD’ qui permet la neutralisation partielle des DRO → l’O2 est tolérée, mais ne fav pas la croissance
46
Q

conditions physico-chimiques de croissance - besoins en oxygène : décrire les bact microaérophiles (2)

A
  • croissance aérobie seulement, mais l’O2 doit etre en faible []
  • des quantité létales de DRO sont produites si la [O2] se rapproche de la cocnentration atmosphérique
47
Q

conditions physico-chimiques de croissance - besoins en oxygène : de quel type de bact s’agit-il? expliquer le phénomène

A
  • anaérobies strictes
  • la croissance a lieu seulement là ou il n’y a pas d’O2, c’est-à-dire dans le FOND du tube contenant un milieu de culture solide
48
Q

conditions physico-chimiques de croissance - besoins en oxygène : de quel type de bact s’agit-il? expliquer le phénomène

A
  • aérobie stricte
  • la croissance a lieu seulement ou une forte quantité d’O2 a diffusé dans le milieu solide
49
Q

conditions physico-chimiques de croissance - besoins en oxygène : de quel type de bact s’agit-il? expliquer le phénomène

A
  • anaérobies aérotolérants
  • la croissance est uniforme, car l’O a aucun effet
50
Q

conditions physico-chimiques de croissance - besoins en oxygène : de quel type de bact s’agit-il? expliquer le phénomène

A
  • microaérophiles
  • la croissance a lieu uniquement ou une faible quantité d’O2 a diffusé dans le milieu
51
Q

conditions physico-chimiques de croissance - besoins en oxygène : de quel type de bact s’agit-il? expliquer le phénomène

A
  • anaérobies facultatifs
  • la croissance est optimale la ou la [O2] est la plus élevée, mais elle a lieu partout dans le tube
52
Q

conditions physico-chimiques de croissance - besoins en oxygène : comment peut-on faire la culture des anaérobies en lab (2)

A
  • chambre anaérobie
  • jarre anaérobie
53
Q

conditions physico-chimiques de croissance - pH : décrire la milieu de croissance idéal de la majorité des MO

A
  • milieux tamponnés de pH 6,5 - 7,5
54
Q

conditions physico-chimiques de croissance - pH : selon quoi est-ce que le pH optimal varie

A

les espèces

55
Q

conditions physico-chimiques de croissance - pH : nommer les catégories de bact qu’il est possible de désigner selon leur pH préférentiel (5)

A
  • extreme acidophiles
  • acidophiles
  • neutrophiles
  • alkalophiles
  • extreme alkalophiles
56
Q

conditions physico-chimiques de croissance - pH : pH idéal pour bact extemes acidophiles

A

0 - 2

57
Q

conditions physico-chimiques de croissance - pH : pH idéal pour bact acidophiles

A

2 - 5

58
Q

conditions physico-chimiques de croissance - pH : pH idéal pour bact neutrophiles

A

6 - 8

59
Q

conditions physico-chimiques de croissance - pH : pH idéal pour bact alkalophiles

A

9 - 12

60
Q

conditions physico-chimiques de croissance - pH : pH idéal pour bact extremes alkalophiles

A

12 - 14

61
Q

définir facteur de croissance (4)

A
  • métabolite essentiel qui n’est pas synthétisé par le MO
  • doit etre apporté par les aliments
  • peut intervenir a tous les stades du métabolisme
  • il s’agit de petites molécules (AA, base snucléiques, vitamines, hème, ion)
62
Q

facteurs de croissances - de quoi dépendent-il

A
  • relatifs a un MO donné pour un milieu spéficique
63
Q

mesure de la croissance bact - décrire la méthode de dénombrement sur gélose après dilution en série (6 tapes)

A
  • on comment avec une solution échantillon
  • on en prend 1 mL, qu’on dilue dans 9 mL, pour un total de 10 mL
  • on refait cette dilution plusieurs fois
  • on prend les 3 dernières dilutions (les moins concentrées), et on en incube 0,1 mL sur une gélose
  • on dénombre le nb de colonies visibles sur chacune de ses trois gélose
  • on détermine le nombre de colony forming units (CFU) sur les géloses
64
Q

mesure de la croissance bact - nommer les phases de la croissance bact (6)

A
  • phase de latence
  • phase d’accélération
  • phase expoentielle
  • phase de ralentissement
  • phase stationnaire
  • phase de décroissance
65
Q

métabolisme microbien - selon quel principe fonctionne-t-il

A
  • catbolisme → anabolisme
  • décomposer en unités de base pour recomposer par la suite
66
Q

métabolisme microbien - catabolisme des sucres : nommer les étapes de base (3)

A
  1. ingestion d’une source de C et d’énergie
  2. transport des H+ et des é-
  3. bactérie énergisée
67
Q

métabolisme microbien - décrire les principes de base du métabolisme respiratoire chez les aérobies (3)

A
  • le C ingéré fournit de l’énergie
  • l’oxygène inspiré capte les p+ et les é- de la chaine resp
  • de l,eau et du CO2 sont exhalés lors de la respiration aérobie
68
Q

métabolisme microbien - décrire le processus du métabolisme resp chez les aérobies (5)

A
  • le glucose passe par la glycolyse, devient pyruvate
  • il passe ensuite dans le cycle de Krebs, produisant 2 CO2
  • le bris des liens chimiques lors de cette transformation fournit de l’É qui est stockée en ATP
  • le glucose fournit aussi des H+ et des é-, qui passent par la chaine resp et la phosphorylation oxydative our former 34 ATP
  • les p+ et e- sont ensuite captés par l’O pour former de l’eau
69
Q

métabolisme microbien - décrire les transporteurs d’É, de H+ et de e- chez les aérobies (4)

A
  • les transports de H+ et de e- sont placés dans un ordre rigoureux et invariable, selon un potentiel de redox
  • des NAD, des FAD et des quinones font partie de ves transporteurs, surtout pour les H+ et les e- de la glycolyse et de Krebs
  • des cytocrhomes (b, c, a) transportent ensuite les e- jusqu’à l’accepteur final, O2
  • ces transports sont comme un courant é- dont l’É est captée par l’ADP qui se joint à un groupement PO4 pour former de l’ATP (phosphorylation)
70
Q

métabolisme microbien - transports des H+ et e- chez les aérobies : définir oxydation et réduction (2)

A
  • se sont des échanges d’é-
  • l’oxydation est une perte d’é-, et la réduction un gain d’é-
71
Q

métabolisme microbien - transports des H+ et e- chez les aérobies : quels sont les donneurs d’é- les + importants

A
  • les atomes d’H des composés organiques
72
Q

métabolisme microbien - transports des H+ et e- chez les aérobies : quand se produit-il une déshydrogénation du produit initial

A
  • quand le proton est transféré en même temps que l’électron (le produit initial s’oxyde)
73
Q

métabolisme microbien - transports des H+ et e- chez les aérobies : quel est le principe permettant à la chaine resp de fonctionner en tant que syst redox (2)

A
  • les composés organiques se comportent souvent a la fois comme des donneurs et des accepteurs d’é-
  • souvent les susbtances intermédiaires reçoivent puis redonnent simultanément des é- et deviennent a leur tour réduites puis oxydés dans un syst de composés formant une chaine resp
74
Q

métabolisme microbien - transports des H+ et e- chez les aérobies : quel est l’accepteur final d’é-

A

l’oxygène

75
Q

métabolisme microbien - resp aérobie : résumer le processus de transport des é- et H+ du NADH (2)

A
  • le NADH est réoxydé en cédant ses é- a la chaine de transporteurs que sont les cytochromes
  • les H+ du NADH vont se fixer à l’O2 pour former de l’eau (lorsque les é- rejoindront aussi le O2)
76
Q

métabolisme microbien - resp anaérobie : définir

A
  • processus durant lequel des MO utilisent un composé inorganique comme accepteur final de p+ et d’é- (plutot que le O2)
77
Q

métabolisme microbien - resp anaérobie : dans quels cycles du sol est-elle utile (3)

A
  • N
  • S
  • C
78
Q

métabolisme microbien - resp anaérobie : décrire le fonctionnement de Krebs et de la chaine d’é-

A

ils fonctionnent, mais ils sont réduits

79
Q

métabolisme microbien - resp anaérobie : comparer sa prod d’ATP a la resp aérobie

A

elle est moindre (<28 ATP vs 34 ATP)

80
Q

métabolisme microbien - resp anaérobie : décrire le processus (2)

A
  • le glucose est transformé en pyruvate par la glycolyse, puis dégradé en CO2 dans Krebs
  • les H+ et é- du glucose passent par la chaine d’électrons, mais celle-ci ne fonctionne que partiellement (= moins d’ATP) → ils sont ensuite captés par des composés inorganiques
81
Q

métabolisme microbien - resp anaérobie : nommer ses produits (2)

A
  • CO2
  • composé inorganique réduit
82
Q

métabolisme microbien - fermentation : décrire le fonctionnement de krebs et de la chaine respiratoire

A

ne fonctionnent PAS

83
Q

métabolisme microbien - fermentation : comparer la quantité d’ATP formée aux resp aérobie et anaérobie

A
  • il y en a moins (2 ATP vs 34 pour aérobie et < 26 pour anaérobie)
84
Q

métabolisme microbien - fermentation : comment est formé l’ATP

A

a partir de la glycolyse uniquement

85
Q

métabolisme microbien - fermentation : décrire le processus

A
  • le glucose est transformée en pyruvate par le glycolyse, puis en CO2 par fermentation
86
Q

métabolisme microbien - fermentation : nommer ses produits (2)

A
  • CO2
  • produits de fermentation (intermédiaires organiques de la dégradation du pyruvate)
87
Q

métabolisme microbien - fermentation : résumer le sort du NADH

A
  • il est réoxydé en cédant ses é- a un composé organique, qui devient un prod de la fermentation
88
Q

métabolisme microbien - fermentation : nommer des exemples de produits de fermentation (10)

A
  • acide propionique (fromages)
  • éthanol (alcool)
  • acide lactique (yogourts)
  • H2O
  • CO2
  • butanol
  • isopropanol
  • 2,3-butanediol
  • acide beta-hydroxy-butyrique
  • acide acétique
89
Q

métabolisme microbien - fermentation : utilité des prod de fermentation (2)

A
  • facilitent l’identification du MO
  • ont des utilités industrielles (nourriture, vitamine C, carburant…)
90
Q

métabolisme microbien - resp aérobie, anaérobie et fermentation : comparer les conditions de croissance

A
  • aérobie : aérobie
  • anaérobie : anaérobie
  • fermentation : un des deux
91
Q

métabolisme microbien - resp aérobie, anaérobie et fermentation : comparer les accepteurs finaux d’é-

A
  • aérobie : O2
  • anaérobie : substances inorg
  • fermentation : substance org (ex : acide pyruvique)
92
Q

métabolisme microbien - resp aérobie, anaérobie et fermentation : comparer les types de phosphorylation employées pour prod de l’ATP

A
  • aérobie : au niveau du substrat + oxydative
  • anaérobie : au niveau du substrat + oxydative
  • fermentation : au niveau du substrat

au niv du substrat = glycolyse

93
Q

métabolisme microbien - resp aérobie, anaérobie et fermentation : comparer la quant de mol d’ATP produites/mol de glucose

A
  • aérobies : 32 (procaryotes) ou 30 (eucaryotes)
  • anaérobie : variable, entre 2 et 32
  • fermentation : 2
94
Q

métabolisme microbien - que permettent les bioréacteurs industriels (5)

A
  • de controler les conditions d’aération (anaérobiose ou aérobiose)
  • de faire des productions par lots
  • de faire des prod en continue
  • de controler le pH
  • de controler la T

MED H2022 - SF3 PARTIE 1 (12 decks)

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