COURS 03 - GRANDS GROUPES DE MOs Flashcards

1
Q

nommer les 3 domaines de la vie

A
  • bactéries
  • archées
  • eucaryotes
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2
Q

à quels 2 domaines peuvent appartenir les procaryotes

A
  • bactéries
  • archées
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3
Q

quelle est la principale différence entre les procaryotes et les eucaryotes

A
  • les procaryotes n’ont pas de noyau alors que les eucaryotes oui
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4
Q

nommer les règnes possibles des procaryotes

A
  • aucun, les bactéries et les archées n’ont pas de règne défini
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Q

nommer les règnes possibles des eucaryotes (4)

A
  • protistes (eucaryotes unicell)
  • fungi (mycètes)
  • plantes
  • animaux
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6
Q

les plantes peuvent-elles infecter l’H?

A

oui :

une seule algue unicellulaire non photosynthétique peut infecter l’humain ; elle ressemble a une levure

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7
Q

ou se situent les virus et les prions dans le domaine du vivant (4)

A
  • agents infectieux acelllulaires
  • ne font pas partie du domaine du vivant
  • on en retrouve cependant associées à pls branches du vivant
  • leur spectre d’hote est en général restreint a certaines rangs taxonomiques, souvent même limité a une espèce
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8
Q

comment se repliquent les virus (3)

A
  • réplicons semi-autonomes grace a leur acide nucléique
  • ils doivent infecter une cellule pour se faire répliquer par la machinerie cellulaire de leur hote
  • une fois répliqués, ils peuvent migrer hors de la cellule hote initiale et aller en infecter une autre
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9
Q

que sont les prions (2)

A
  • pas des réplicons
  • ce sont des agents patho de nature protéique dépourvus d’acide nucléique
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10
Q

comment les prions causent-il des dommages a l’organisme hote?

A
  • un prion infectieux va entrainer une cascade de changements conformationels chez des prots apparentées saines et ainsi provoquer des dommages aux cellules infectées
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11
Q

quels organismes sont désignés par le terme “microbe”? (4)

A
  • bactéries
  • fungi
  • protozoaires
  • virus
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12
Q

caract des microbes (7)

A
  • très petite taille
  • omniprésents et abondants dans la nature
  • unicellulaires (exception : les fungi incluent des uni- et pluricell et les virus sont acellulaires)
  • organisation simple
  • inclut des procaryotes et des eucaryotes
  • disposent d’un potentiel métabolique (sauf les virus)
  • capables de se reprod (sauf les virus)
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13
Q

définir la classification bactérienne

A

taxonomie des microbes

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14
Q

définir l’identification bactérienne

A

nécessité de savoir a quel microbe on a affaire (Dx + Tx)

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15
Q

définir génotype

A

connaissance des gènes microbiens

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16
Q

définir phénotype (2)

A
  • caract observables
  • résultat de l’expression des genes
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17
Q

nommer des outils de classification et d’identification (6)

A
  • morphologiques
  • biochimiques
  • physico-chimiques
  • sérologiques
  • protéonomiques (ex : MALDI-TOF)
  • génétiques
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18
Q

de quelle taille peuvent etre les eucaryotes

A

10-5 à 10-3 m

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19
Q

de quelle taille peuvent etre les procaryotes

A

10-7 à 10-4 m

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20
Q

de quelle taille peuvent etre les virus

A

10-8 à 〜10-6

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21
Q

de quelle taille peuvent etre les protéines

A

10-9 à 〜10-7

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22
Q

qu’est-ce que la nomenclature binomiale en latin

A
  • genre + espèce
  • ex : Staphylococcus aureus
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23
Q

nommer 3 exemples de racines de noms des bactéries

A
  • suivant la racine latine
  • suivant la racine grecque
  • en l’honneur de personnalités
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24
Q

que signifie bacillus

A

petit batonnet

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25
Q

que signifie lactobacillus

A

petit batonnet du lait

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26
Q

que signifie sarcina

A

en paquet

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27
Q

que signifie micrococcus

A

petit grain

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28
Q

que signifie clostridium

A

fuselé

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29
Q

que signifie corynebacterium

A

batonnet en forme de massue

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30
Q

nommer les tailles et formes possibles des bact et leurs nomenclature (4)

A
  • batonnets : bacilles, coccobacilles
  • spères : cocci
  • spirales : vibrio, spirochètes
  • difformes : pleïomorphes
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31
Q

nommer les arrangements spatiaux possibles des bact et leur nomenclature (4)

A
  • individuelles
  • paires : diplo-
  • chainettes : strepto-
  • amas : organisés ou non
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32
Q

nommer la forme #1

A

coque (cocci)

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33
Q

nommer la forme #2

A

diplocoque

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34
Q

nommer la forme #3

A

diplocoque encapsulé

(pneumocoque)

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35
Q

nommer la forme #4

A

staphylocoque

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36
Q

nommer la forme #5

A

streptocoque

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37
Q

nommer la forme #6

A

sarcina

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38
Q

nommer la forme #7

A

tétrade

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39
Q

nommer la forme #1

A

coccobacille

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40
Q

nommer la forme #2

A

bacille

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41
Q

nommer la forme #3

A

diplobacille

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42
Q

nommer la forme #4

A

palisade

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43
Q

nommer la forme #5

A

streptobacille

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44
Q

nommer la structure 1

A

hyphe

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45
Q

nommer la structure 2

A

queue

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46
Q

nommer la forme #1

A

extrémités effilées - fusobacterium

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47
Q

nommer la forme #2

A

vibrion

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48
Q

nommer la forme #3

A

en virgule (vibrio)

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49
Q

nommer la forme #4

A

en massue

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50
Q

nommer la forme #5

A

hélicoïdale

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51
Q

nommer la forme #6

A

en tire-bouchon

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52
Q

nommer la forme #7

A

filamenteuse

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53
Q

nommer la forme #8

A

spirochète

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54
Q

nommer les différentes formes possibles des colonies sur gélose (6)

A
  • punctiforme
  • circulaire
  • filamenteuse
  • irreg
  • rhizoïde
  • fusidforme
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55
Q

nommer les différentes élévations possibles des colonies sur gélose (5)

A
  • plane
  • élevée
  • convexe
  • bombée
  • bossue
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56
Q

nommer les différents bords possibles des colonies sur gélose (6)

A
  • regulier
  • ondulé
  • lobé
  • dentelé
  • filamenteux
  • bouclé
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57
Q

nommer toutes les caract des colonies sur gelose pouvant contribuer à l’identification de la bact (6)

A
  • forme
  • élévation
  • bord
  • couleur
  • transparence
  • surface
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58
Q

nommer la structure #1

A

pili

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59
Q

nommer la structure #2

A

cytoplasme

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60
Q

nommer la structure #3

A

ribosomes

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61
Q

nommer la structure #4

A

nucléoide (ADN)

62
Q

nommer la structure #5

A

memb cytoplasmique

63
Q

nommer la structure #6

A

parois

64
Q

nommer la structure #7

A

capsule

65
Q

nommer la structure #8

A

flagelle

66
Q

composantes structurales et fonctionnelles des bact - définir “enveloppes”

A

différentes structures qui entourent les bact

67
Q

composantes structurales et fonctionnelles des bact - nommer les 3 types d’enveloppes

A
  • matériel extracell (capsule, glycocalyx, couches-s)
  • paroi cell
  • memb cytoplasmique
68
Q

composantes structurales et fonctionnelles des bact - caractéristiques de la capsule (5)

A
  • seules certaines bact en possèdent une
  • procure un pouvoir patho en empechant la phagocytose
  • constituée de polysaccharides
  • = antigène K
  • il en existe 83 variantes (déterminent le sérotype) pour les pneumocoques
69
Q

composantes structurales et fonctionnelles des bact - qu’est-ce que le glycocalyx (3)

A
  • sorte de “”capsule”” intercellulaire formant des biofilms agglutinants
  • favorise l’adhésion aux matériaux (prothèses, tuyaux)
  • ex : streptococcus mutans → carie dentaire
70
Q

composantes structurales et fonctionnelles des bact - qu’est-ce que la paroi cellulaire

A

paroi rigide qui assure la forme de la bact

71
Q

composantes structurales et fonctionnelles des bact - quels sont les 2 structures possibles de paroi cell

A
  • gram +
  • gram -
72
Q

comparer gram + et gram - en ce qui a trait aux peptidoglycans et aux lipopolysaccharides

A
  • PG : couche épaisse chez les gram+, mince chez les gram-
  • LPS : couche supplémentaire que l’on retrouve chez les gram-
73
Q

quel est le pouvoir pathogène de la couche de LPS des gram- (2)

A
  • endotoxine
  • = antigène O
74
Q

composantes structurales et fonctionnelles des bact - définir membrane cytoplasmique

A

bicouche de phospholipides avec prots transmembranaires

75
Q

composantes structurales et fonctionnelles des bact - roles de la memb cytoplasmique (3)

A
  • barrière osmotique : controle les taux ioniques
  • transport : régulation des échanges interne/externe
  • enzymes : role dans le métabolisme énergétique
76
Q

composantes structurales et fonctionnelles des bact - nommer les constituants internes (3)

A
  • cytoplasme
  • plasmides
  • appareil nucléaire
77
Q

composantes structurales et fonctionnelles des bact - que contient le cytoplasme (2)

A

l’appareil nucléaire et les ribosomes

78
Q

composantes structurales et fonctionnelles des bact - décrire l’appareil nucléaire

A

ADN double brin sans memb nucléaire

79
Q

composantes structurales et fonctionnelles des bact - qu’est-ce qu’un plasmide (3)

A
  • ADN extra-chromosomique circulaire
  • se réplique de manière autonome
  • code pour des propriétés facilitant la survie, dont des gènes de résistance
80
Q

composantes structurales et fonctionnelles des bact - role des flagelles (2)

A
  • appendice de mobilité → pouvoir pathogène accru
  • = antigène H
81
Q

composantes structurales et fonctionnelles des bact - combien de flagelle y a-t-il? (2)

A
  • nb et disposition varient selon les genes
  • pas une structure obligatoire : peut en avoir 0
82
Q

nommer la bactérie selon son nb de flagelle(s) - #1

A

monotriche

83
Q

nommer la bactérie selon son nb de flagelle(s) - #2

A

lophotriche

84
Q

nommer la bactérie selon son nb de flagelle(s) - #3

A

péritriche

85
Q

nommer la bactérie selon son nb de flagelle(s) - #4

A

amphitriche

86
Q

composantes structurales et fonctionnelles des bact - role des pilus sexuels (1)

A

transfert de plasmide et ADN lors de la conjugaison

87
Q

composantes structurales et fonctionnelles des bact - role des pili et des fimbriae (1)

A

attachement

88
Q

quels genres de bact font des endospores (2)

A

bacillus et clostridium

89
Q

endospores - fonction (1)

A

survie dans les conditions défavorables

fonction très différentes des spores des mycètes

90
Q

endospores - décrire le volume et la position des endospore pour une espèce donnée

A

caractères constants

91
Q

endospores - nommer 4 maladies causées par des bactéries sporulées

A
  • gangrène
  • tétanos
  • botulisme
  • anthrax
92
Q

endospores - décrire les étapes du cycle de sporulation et de germination (9 étapes)

A
  1. croissance
  2. division cellulaire
  3. formation du filament axial
  4. formation su septum (si conditions sont difficiles)
  5. enkystement de la préspore
  6. formation du cortex et synthèse de la tunique
  7. lyse cellulaire et lib.ration de la spore
  8. spore libre
  9. germination
93
Q

nommer les différents antigènes bactériens (3)

A
  • H : flagelles
  • K : capsule
  • O : endotoxine dans la paroi des Gram- (LPS)
94
Q

composantes structurales et fonctionnelles des bact - nommer les composantes obligatoires (5)

A
  • paroi cell
  • memb plasmique
  • cytoplasme
  • chromosome
  • ribosomes
95
Q

composantes structurales et fonctionnelles des bact - nommer les composantes facultatives (7)

A
  • capsule (et autres matériaux extracell)
  • endotoxine (LPS)
  • plasmide
  • flagelle
  • pili
  • spore
  • corps d’inclusion/granule
96
Q

identification par tests colorimétriques - définir “coloration simple”

A

application d’un seul colorant

97
Q

identification par tests colorimétriques - nommer les étapes (5) de la coloration différentielle de gram ainsi que les résultats attendus

A
  1. fixation
  2. application de crystal violet (violet)
  3. application d’iode
  4. décoloration
  5. application de safranine (rouge)

gram + : mauve, gram - : rouges

98
Q

nommer les 3 différentes observations possibles en microscopie optique

A
  • champ clair
  • constraste de phase
  • fond noir
99
Q

quelle est l’observation régulière en microscopie optique

A

le champ clair

100
Q

que permettent la microscopie a fluorescence et confocale (1)

A

des phénomènes d’interactions vivantes peuvent etre filmés

101
Q

nommer 3 types de microscopie électronique

A
  • à transmission (2D)
  • a balayage (3D)
  • a l’aide d’un couteau diamant
102
Q

quel est le grossissement maximal du matériel inerte sur un microscope optique?

A

jusqu’a environ 100 000 x

103
Q

identification par test biochimiques - nommer les différentes technologies phénotypiques (4)

A
  • tubes éprouvettes
  • plaquettes de cupules
  • plaque 96 puits (micro-scan)
  • micropuits
  • etc
104
Q

identification par test biochimiques - que recherche-t-on? (5)

A
  • sources de C
  • aérobiose vs anaérobiose
  • potentiel de fermentation
  • produits terminaux du métabolisme
  • tolérance aux inhibiteurs métaboliques et antibiotiques
105
Q

identification par test biochimiques - comment fonctionne le pointage dans la technologie micro-scan (2)

A
  • selon les rxn positives : rangée 1 = 4 pts, rangée 2 = 2 pts et rangée 3 = 1 pt
  • le nb final correspond a un genre et espèce de bactérie
106
Q

identification par test biochimiques - comment le micro-scan permet-il de vérifier la résistance aux Ab?

A
  • certaines rangées permettent de le vérifier
  • si ++ : résistant
  • si - - : sensible
  • si - + : intermédiaire
107
Q

détection immunologique : que permet-elle de détecter (2)

A

des Ag microbiens ou des Ac par réponse sérologique

108
Q

détection immunologique : nommer deux tests utilisés

A
  • test ELISA
    test immunochromatographique rapide
109
Q

détection immunologique : décrire le fonctionnement du test ELISA

A
  • on met un réactif coloré flurorescent ou enzymatique en contact avec un Ac de détection, lequel se fixera sur la protéine cible
  • la protéine cible doit aussi se fixer sur l’Ac de capture pour que le test soit +
110
Q

détection immunologique : nommer les avantages du test ELISA (2)

A
  • spécifique +++ car double reconnaissance de la prot cible/Ag : Ac de détection et Ac de capture
  • sensible +++ car le réactif coloré fluo ou enzymatique amplifie le signal (augmente la coloration rouge)
111
Q

détection immunologique : décrire les désavantages du test immunochromatographique rapide (2)

A
  • pas d’amplification de signal = peu sensible
  • pas de lavages = moins spécifique
112
Q

détection immunologique : décrire les étapes du test immunochromatographique rapide (2)

A
  • on met l’analyte sur une plaque
  • si l’analyte est compatible avec les Ac marqués, le complexe se liera aux Ac de capture (test line)
113
Q

nommer deux méthodes de test Dx microbien par détection d’ADN

A
  • trousses de détection d’un seul microbe spécifique soupçonné présent dans un échantillon clinique
  • détection simultanée potentielle de plusieurs espèces de microbe
114
Q

nommer des exemples de microbes pour lesquelles on utilise souvent les trousses de détection pour le test Dx par détection d’ADN (5)

A
  • S. aureus résistant a la méticilline
  • staphylocoques sensibles ou résistants
  • entérocoques résistants a la vancomycine
  • clostridium difficile
  • streptocoques B lors de l’accouchement
115
Q

nommer l’appareil utilité pour les tests de détection simultanée potentielle de plusieurs espèces de microbes

A

appareil revogene de GenePOC

116
Q

comment fait-on l’identification phénotypiques de microbes (2)

A
  • batterie de tests
  • base de donnée (+ ou -) biochimiques ou microbiologiques
117
Q

comment fait-on l’identification génotypique de microbes (2)

A
  • ADN/ARN
  • base de données des séquences (ACGT)
118
Q

comment fait-on l’identification MALDI-TOF des microbes (2)

A
  • ratios masse/charge (physicochimie)
  • base de données (m/z) via séquençage de l’ADN et des prots
119
Q

qu’est-ce qui distingue les virus des autres organismes? (10)

A
  • très petits (microscope électronique nécessaire)
  • acellulaires
  • structure simple : acide nucléique + emballage
  • ARN ou ADN seulement
  • aucun métabolisme, énergie
  • parasites intracellulaires obligatoires, pas de reprod autonome
  • cycle de réplication dans l’hote
  • culture sur cellule hote seulement
  • Tx = antiviraux
  • Ab = inefficaces
120
Q

taille approx du virus de la rage

A

150 nm

121
Q

taille approx du virus de l’influenza et VIH

A

100 nm

122
Q

taille approx du virus du rhinovirus

A

70 nm

123
Q

taille approx du virus de la polio

A

27 nm

124
Q

a partir de quelles caractéristiques procède-t-on a la classification virale? (7)

A
  • nature du génome (ADN/ARN)
  • configuration du génome
  • taille du génome (kbp/kb)
  • enveloppe (oui/non)
  • morphologie
  • taille du virion
  • hote
125
Q

décrire le génome viral (3)

A
  • ADN ou ARN, pas les deux
  • ADN : simple brin ou double brin
  • ARN : simple brin (positif ou négatif) ou double brin
126
Q

comment est-ce que le virus se fait répliquer par la cellule hote

A

en y injectant son matériel génétique

127
Q

décrire les virus enveloppées

A
  • entourés d’une bicouche lipidique acquise lors de leur sortir de l’hote par bourgeonnement
128
Q

décrire l’enveloppe des virus enveloppés (3)

A
  • bicouche lipidique
  • provient de la memb cellulaire des cellules hotes
  • le virus y “attache” des protéines membranaires
129
Q

comment appelle-t-on les virus sans enveloppes

A

virus nus

130
Q

nommer les différentes formes de capsides possibles (3)

A
  • hélicoïdale
  • icosaédrique
  • mixte ou complexe (icosaédrique + hélicoidale)
131
Q

distinguer capside et enveloppe

A
  • capside : emballage protéique
  • enveloppe : bicouche lipidique
132
Q

définir nucléocapside

A

nucléocapside = capside + acide nucléique

133
Q

nommer les enzymes virales des rétrovirus (3)

A
  • transcriptase inverse virale (TIV)
  • intégrase
  • protéase
134
Q

enzymes virales des rétrovirus - role de la TIV

A

rétro-transcrit l’ARN viral en ADN

135
Q

enzymes virales des rétrovirus - role de l’intégrase

A

intègre l’ADN viral au chromosome de l’hote

136
Q

enzymes virales des rétrovirus - role de la protéase

A

favorise la maturation des prots virales

137
Q

nommer une enzyme des virus influenza

A
  • neuraminidase
138
Q

enzymes virales de l’influenzavirus - décrire la neuraminidase (3)

A
  • contribue au relargage des virus hors des cellules
  • 9 possibilités
  • ex : H1N1 = neuraminidase #1
139
Q

enzymes virales des rétrovirus - combien de possibilité d’hémagglutinine y a-t-il?

A
  • 16
  • ex : H1N1 = hémagglutinine #1
140
Q

nommer un virus faisant partie de la classe des rétrovirus

A

VIH

141
Q

comment se reproduisent les levures?

A
  • peuvent produire des pseudohyphes (bourgeonnement)
142
Q

comment se reprduisent les moisissures?

A

par spores asexuées volatiles (la maj du temps)

143
Q

distinguer l’apparence des colonies de levures et de moisissures

A
  • levures : lisses et muqueuses
  • moisissures : chevelues et poudreuses
144
Q

nommer des levures d’interet alimentaire (3)

A
  • saccharomyces cerevisiae (alcool, pain)
  • penicillum roqueforti (fromages bleus)
  • penicillum camemberti (fromage)
145
Q

nommer des levures d’interet medical (1)

A

candida albicans

146
Q

nommer les embranchements des mycètes (3)

A
  • zygomycètes
  • ascomycètes
  • basidiomycètes
147
Q

décrire les zygomycètes (3 caract)

A
  • moisissure commune
  • saprophytes
  • ex : rhizopus
148
Q

décrire les ascomycètes (1 caract)

A
  • conidiospores
149
Q

décrire les basidiomycètes (2 caract)

A
  • 30 000 espèces
  • micro- ou macroscopiques
150
Q

définir protozoaires

A

protistes unicellulaires ayant des cycles de vie complexe pouvant affecter pls espèces d’hotes différents dans leur développement

151
Q

nommer 3 exemples de maladies causées par des protozoaires

A
  • toxoplasmose
  • giardiase
  • malaria