Corona Flashcards
Il y a combien de type de coronavirus ?
7 types
V/F: au microscope, on peut différencier quel type de corona s’est
Faux
Coronavirus
famille ?
Aspect?
Génome ?
Type de virus ?
- Coronaviridae
- Aspect ‘‘courone’’
- 27-32 kb = très long pour un virus (p-e l’un des plus gros)
- Virus ARN enveloppé
Les coronavirus font parti de quel ordre ?
Nidovirales
coronavirus est une famille?
Non. un genre.
Nidovirales a 4 familles, c’est quoi?
Arterviridae
CoronaViridae
Roniviridae
Tornidoviridae
C’est quoi les deux genre des coronaviridae ?
Coronavirus
Torovirus
Les coronavirus ont 4 espèces. Lesquels ?
Alphacoronavirus (1)
Betacoronavirus (2)
Gammacoronavirus (3)
Deltacoronavirus (4)
Les torovirus ont 2 espèces, lesquels ?
BEV
BRV
V/F: le groupe 3 et 4 du corona virus infecte les hommes
Faux.
-> volaille
c’Est quoi un ORF ? il y en a combien de différente ?
code pour protéine régulatrice
2: ORF 1a et ORF 1b
différence entre le code de protéine de structure des Corona virus et des torovirus ?
Plus grand chez coronavirus
À quoi sert la polarité positive de l’ARN ?
sert de ARNm directement.
-> pas besoin d’intermédiaire pour traduction des acide aminés au ribosome
différence entre les virus saisonniers et épidémique ?
degrés de sévérité
autre virus épidémique des coronavirus autre que SARS-Cov 2?
SARS (2002)
MERS (2012)
Le SARS serait transmis de l’animal à l’homme par quel animal ?
Chauve-souris et civette
Le MERS serait transmis à l’homme par quel animal
Chauve-souris et dromadaire
Le SARS-Cov-2 serait transmis par quel aniaml
On pense chauve souris, mais pas certain des autres
On pense que l’origine de la pandémie covid serait de ou?
Hong Kong
c’Est quoi le tableau clinique du SARS-Cov-1
Syndrome grippale, diarrhée (20%)
infiltrat pulmonaire (pneumonie)
entre infection et développement symptome =10 jours
Comment se passe la transmission de SARS-Cov ?
gouttelette (toussent, éternuement…),
contact main/bpuche ou matière contaminés
aérienne
c’est quoi les cas super spreaders pour le SARS-Cov ?
5% des cas vont générer trois,7 cas
Source du SARS-Cov
Civette masquée (alimentation en Asie)
Paguma Iarvata
-> homologue 99,8%
Mesure de contrôle des civettes?
Abattage de 10 000 civette en 2003
= moins d’infections
Que veux dire SARS
Syndrome respiratoire sévère
% decu du MERS-CoV ?
34% de décès = très élevé
Symptome de MERS-CoV ?
pneumonie sévères
Le MERS-Cov attaque quoi spécialement ?
Homme (86%) agé 56 ans (age médian)
Tableau clinique du MERS?
Syndrome grippale
-> sévérité pulmonaire variable
-> incubation 14 jours
Transmission du MERS ?
goutelette et contact
-> 1 cas = 1 cas (pour ca pas de pandémie)
grosse différence entre MERS et SARS
MERS :
- moins de cas, mais plus de mortalité
- incubation prend 4 jours de plus
- contagiosité 2x plus grande
SARS:
- plus % travailleur de la santé qui l’attrape
Endroit que deuxieme Covid a débuté?
Hubei, Wuhan
V/F: tout les vaccins visent la protéine spike
Vrai
À quoi sert les NSP5 ?
Protéase nécessaire pour cliver les protéines spike qui initie le cycle de réplication
à quoi servent les spike
spicule retrouvé surface enveloppe du virus et se lient au récepteur ACE2 humain
À quoi sert les NSP12 ?
Utile dans la replication du genome virale
C’est quoi des NSP?
Non structural protéine
comment fonctionne la réplication du SARS-Cov 2 (simplifier) ?
- attachement
- libération génome virale
- Un brin sert de replication
- maturation dans le Golgi ou RE
- assemblage virus
- sortie
Au début, il y avait combien de génopique circulant du covid ?
Deux génotypes circulants
c’est quoi le temps d’incubation du virus ?
5,2 jours
Ro c’est quoi?
c’Est quoi Ro du Covid-19?
ro = transmissibilité
2,5
= 1 cas en génère 2,5
Pourcentage de personne asymptomatique est de 10-80%, problème avec ça ?
Pas de symptome, mais contamine les autres !
% de décès covid ?
0,001% jeune
0,2 % 50 ans
plus de 80 ans = 8,3%
C’est quoi 6 variants apparu du covid ?
- D614G mutant
- B117 Alpha
- B1351 Beta
- P1 Gamma
- B16172 Delta
- B11529 Omicron
Caractéristique de D614G ?
Réplication rapide dans la cavité nasale
-> grande transmissibilité
Le virus mute ou le plus souvent ?
spike
-> pour ca vaccin doit tjs en avoir d’autre
Caractértistique de alpha B117?
13 mutations dans prot S
-> mutation N501Y et P681H augmente la transmissibilité
Caractéristique de beta B1351 ?
(pas Qc)
10 mutation prot S
-> mutation N501Y et K417N augmente transmissibilité
-> évasion immunitaire du à la mutation E484K
Caractéristique de P1 Gamma/
(pas qc)
-> mutation (10) prot S: N501Y et K417N et E484K
Caractéristique de B16172 Delta?
+ virulent, + maladie sévère
mutation L425R et E484Q = augmente liaison ACE2
-> transmission et évasion immunitaire
= + dans voies respiratoire inférieurs = + de pneumonie
Caractéristique de B11529 Omicron?
37 mutation prot S. 15 dans RBD
-> transmissibilité et évasion immunitaire augmenté
-> sévérité maladie diminué
1 personne en infecte 12
Pourquoi les enfants développent pas vraiment de maladie sévère au covid ?
parce que ont moins de récepteurs ACE2 (hypothese)
Manifestation clinique de la covid (hospitalisation)
Fievre
Toux
Dyspnée (50-80%)
Fatigue (40%)
Vomissement (15-44%)
Trouble olfactif/gout (60-80%) ** caractéristique qui le distingue (atteint nerf olfactif
Myalgie
Différence entre les anticorps lors d’une infection Covid ?
IgG persistent à vie, mais IgM vont revenir à 0
Limite du PCR pour la covid ?
la PCR détecte le matériel génétique du virus et ne permet pas de distinguer s’il s’agit de virus viables et infectieux ou simplement de matériel génétique viral résiduel.
À quoi sert les région RBD dans la covid ?
Région qui se réplique et mute constamment
-> région de la protéine pointe ( spike) qui se lie au récepteur ACE2
Pour que les protéine spike soit active, il faut quoi?
qu’elle soit clivé par une protéase
c’Est quoi les organes cible de covid ?
multisysteme
poumon
coeur
cerveau
yeux
nez
reins
intestin
Il arrive quoi s’il y a une disfonction de la réponse immunitaire de covid ?
Trop de monocyte et macrophage et leucocyte qui entre
tempete de cytokine
Oedeme dans les poumons et pneumonie
inflammation dans plusieurs organes
On administre quoi pour des cas sévère ?
anti IL-6
c’est quoi les 3 phases de progression de Covid ?
- Réplication virale du virus
- Phase II, réponse immunitiaire inflammative commence à augmenter
- Pas tout le monde se rend ici, stade ou patient n’ont plus de virus et juste inflammatoire
-> anti-inflammatoire = ARDS
Comment on diagnostique Covid ?
- Virologie: écouvillon naso-pharyngé RT-PCR (salive ou gargarisme aussi)
- Sérologie (sérum) comme ELISA et neutralisation à partir de 10 jrs après début symptôme
- Clinique (fièvre ou tous, ou dyspnée ou anosmie
Détecter les anticorps est autant sensible que les particules virales
faux
-> anticorps moins sensible, mais plus facile
Pourquoi desfoisn le virus se voit pas par naso-pharxnx
PArce que virus peut être rendu plus loin que le nez.
Est-ce que une approche préventive 7-10 jours avant d’avoir AC est suffisant pour se protéger du virus ?
Oui.
Les antiviraux sont utilisé quand ?
Mild to severe
Les modulateurs immunitaires sont utilisé quand ?
severe covid
Les neutralisant anticorps sont utilisé quand ?
Quand exposé et mild
Traitement aux anticorps, ca marche bien ?
fonctionne jusquau nouveau variant
On peut utiliser les immunomodulateur quand ?
2iem phase de la malaldie
-> inhibe très largement la réponse immunitaire
Vaccin atténué, marche bien pour covid ?
Non. surtout pas chez immunossuprimé
Comment on fait des vaccins protéique (sous-unitaire VLP)
coté positif?
Prot spike surface combiné adjuvant
= amène macrophage et dentritique localement.
-> bien femme enceinte et enfant
info sur vaccin a base d’acide nucléique ?
+ fréquent utilisé
-> ARN entre, penetrent cytoplasme, code prot = produit AC
Info vaccins à base de vecteurs viraux
Virus pas pathogene pour l’homme (singe oui) = réplique protéine exogène (prot S)
on utilise des vaccins inactivé pour la covid ?
pas vrm bon.
-> injecté intramuscle, mais peut avoir réversion
Pourquoi on utilise pas vraiment les vaccins à base d’acide nucléique ADn ?
Doit aller au noyau (dur)
-> possibilité qu’il s’integre au noyau
Comment on fait les vaccins à base de vecteurs viraux ou prot ?
prend capside, enlève contenu (juste capside)
ex. NLP
Pfizer, moderna, AstraZeneca et Johnson and Johnson , nuvaxovid, Medicago et Pfizer/moderna 1,5 visent quoi?
Pfizer et moderna: ARNm cible prot S
AstraZeneca: adénovirus et cible prot S (gros problème de thrombrose)
Johnson : Adenovirus vise prot S (juste US)
Nuvaxovid: pas ARNm, protéine S recombinante (injecte prot S + adjuvant Matrix)
Medicago: VLP-S + AS03 (pu dispo)
1,5: refait avec variant + récent
Avantage et désavantage des vaccins à base de virus inactivé ?
+ peuvent être injecté systeme affaibli (immunosupprimé)
- plusieurs dose necessaire, adjuvant.
- pas adaptée culture de masse
Avantage et désavantage des vaccins à base de virus atténué
+: rép immunitaire ressemble celle infection naturelle
+ protection long terme (1 dose psosible)
- pas pour immunosupprimé
- base température
- nécessite la culture de grande quantité de virus
Avantage et désavantage des vaccins sous- unitaire ?
+ production rapide que les atténué/inactivé
- réponse immunitaire faible (besoin adjuvant)
- production lente comparé ARN ou ADN
Avantage et désavantage des vaccins pseudoparticule virale (VLP) ?
+ rep immunitaire + fort que sous-unitaire
+ conception + vite
- fabrication difficile que sous-unitaire
- difficile produire grande quantité
Avantage et désavantage des vaccins de vecteur virale non replicatif?
+ bonne réponse immunitaire forte (que sous-unitaire)
+ pas besoin conserver basse T
- pas de rép immunitaire si exposition préalable au vecteur
- difficile à produire en grande quantité (culture vecteur viral)
- dose élevée injectée car pas de réplication
Avantage et désavantage des vaccins de vecteur virale réplicatif ?
+ rep immune forte avec faible dose
- besoin qu’on test plus
- basse T
- production difficile (culture de vecteur viral)
Avantage et désavantage des vaccins à base d’ARN ?
+ rapide production
+ pas d’insertion dans le génome
- pas stable
- basse T
Avantage et désavantage des vaccins à base d’ADN ?
+ prudction rapide et peu couteuse
+ conserver température ambiant
- doivent entrer dans le noyau (dur)
- peut entrer dans le génome
