CM16 - Microbiologie Flashcards

1
Q

Parties de la structure d’une bactérie

A
  • Paroi cellulaire (WE LOVE THIS, because human wells do not have this!)
  • Membrane cytoplasmique
    Chromosome (ADN)
  • Ribosomes (synthèse de protéines à partir de l’ARN. les ribosomes sont
    composés de 2 sous-unités: 30S, 50S);
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2
Q

Différence entre Gram + et -

A

Positif: Membrane cell, paroi cell, THICK layer of peptidoglycan (which gives darker colour in the lab)

neg: membrane cell, espace périplasmatique, peptidoglycane THIN, membrane externe

  • Affinité tinctoriale (Coloration de Gram)
    Gram + (bleu/violet) ou Gram – (rouge/rose)
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3
Q

Cocci gram + et - (morphologie)

A

Cocci gram +: amas, paires/diplocoques, chaines

Cocci gram -: paires ou diplocoques

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4
Q

3 bactéries cocci gram +

A
  1. Staphylococcus (amas)
  2. Streptococcus (paires)
  3. Enterococcus (chainettes)
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5
Q

Bactéries cocci gram -

A

Diplocoques:

  • Neisseria (meningitidis, gonorrhoea, spp)
  • Moraxella catarrhalis

Il existe plusieurs espèces de Neisseria non pathogènes. On les retrouve le plus souvent sur les muqueuses.

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6
Q

Bactéries batonnets Gram +

A

Sporulés: bacillus, clostridium
Lettre chinoises: corynebacterium
Longs & minces: LISTERIA monocytogenes, lactobacillus, erysipelothrix
Embranchés: nocardia, actinomyces

***When you get lab results positive for BG+ , think to yourself: Could my patient have Listeria? (can be the first finding accompanied with fever and no other symptoms) VERY IMPORTANT TO CHECK IN PREGNANT WOMEN

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7
Q

Batonnets Gram + sporulés

A

Clostridium spp. dont C. difficile
Bacillus spp.

La spore permet une survie prolongée dans l’environnement.
Les spores sont détruites par la stérilisation, l’eau de javel et le peroxyde
d’hydrogène).

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8
Q

BGN (don’t memorize, just familiarize)

A

Entérobactéries:
Escherichia coli
Klebsiella pneumoniae
Proteus mirabilis
Salmonella spp.
Shigella spp
Yersinia enterocolitica
Enterobacter spp

Autres;
Haemophilus influenzae
Pseudomonas aeruginosa
Stenotrophomonas maltophilia
Acinetobacter baumanii
Shigella spp.
Pasteurella multocida
Bacteroides fragilis

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9
Q

Anaérobies strictes vs facultatives

A
  • Les bactéries anaérobies strictes sont tuées par l’oxygène. Il faut les mettre dans un lieu où l’on aura remplacé l’oxygène par de l’azote pour leur croissance.
  • Les bactéries anaérobies facultatives peuvent croître en présence ou en l’absence d’oxygène.

Strictes:
Clostridium
Bacteroides fragilis
Streptococcus anaerobius

Anaérobies facultatives:
Entérobactéries
Step b-hémolytiques (gr A, B, C, G)
Streptococcus viridans
Bacillus anthracis
Enterococcus spp
Staphylococcus spp

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10
Q

4 principaux mécanismes d’action des antibiotiques

A
  • Interférence avec la synthèse de la paroi cellulaire (au niveau peptidoglycans, etc)
  • Interférence avec la synthèse de protéines (can sometimes give a bit more side effects)
  • Interférence avec la synthèse d’ADN
  • Inhibition de la synthèse de métabolites essentiels
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11
Q

Quels ATB attaquent la paroi cellulaire

A

ß-lactamines
* Pénicillines, céphalosporines, monobactam, carbapénems, +/- inhibiteurs

Glycopeptides et autres
* Vancomycine
* Daptomycine

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12
Q

Quel est le mécanisme d’action des beta lactamines

A

Inhibe la synthèse de la paroi cellulaire
* Attachement covalent avec PBP
* Empêche attachement des chaînes de peptigoglycans entre-elles
* Bactéricide. Ultimement cause la lyse de la cellule.

Go into receptors, block peptidoglycan chains from going into receptor

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13
Q

Mécanisme d’action des glycopeptides

A
  • Inhibe la synthèse de la paroi cellulaire par un mécanisme différent que les ß-lactamines

ie, VANCOMYCINE - prevents binding of sugars to form chains

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14
Q

Quels ATB attaquent les ribosomes?

A
  • Aminoglycosides
  • Amikacine, gentamicine, tobramycine
    - Micromonospora vs Streptomyces
  • Macrolides
  • Érythromycine, azithromycine, clarithromycine
  • Tétracyclines
  • Tétracycline, minocycline (DERMATO++), doxycycline (resistant staph skin infections)
  • Clindamycine
  • Linezolid
  • Inhibe la synthèse des protéines
  • Empêchent la traduction et/ou la transcription de l’ARN messager à divers endroits
  • Peu d’interférence avec ribosomes eucaryotes.
  • Souvent bactériostatiques, parfois bactéricides: doesn’t really matter. More of a theoretical concept. (maybe some exceptions in immunosuppressed patients)
    **Doesn’t kill our cells because it doesn’t attack human ribosomes.
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15
Q

Cible d’attaque ADN

A
  • Synthèse des acides nucléiques
  • Réplication de l’ADN
  • Génération de radicaux libres
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16
Q

ATB qui inhibent la réplication de l’ADN

A
  • DNAgyrase: structure hélicoïdiale de l’ADN nécessaire dans sa réplication
  • Topoisomérase IV: ségrégation de l’ADN
  • Quinolones (ending -floxacine): inhibent ces deux enzymes

Fluoroquinolones

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17
Q

ATB qui cible la synthèse des acides nucléiques

A
  • Les sulfonamides (blocks PABA to acide dyhydrofolique by DHPS) et le triméthoprime (blocks acide dyhydrofoloqie to acide tétrahydrofolique bby DHFR)

TMPSMX = septra: attaque les purines (A & G), prevents bacteria from producing these nucleic acids

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18
Q
A

Cible
Antibiotiques
Paroi cellulaire
ß-lactamines Vancomycine
Synthèse de protéines
Macrolides (50s) Clindamycine (50s) Aminoglycosides (30s)
Réplication ou réparation du DNA
Fluoroquinolones
Inhibition de la synthèse des folates
TMP/SMX

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19
Q

En quoi consiste les beta lactamines

A
  • Les pénicillines
  • Les pénicillines avec inhibiteurs de ß-lactamases * Les céphalosporines
  • Les monobactams
  • Les carbapénèmes
  • Toutes les ß-lactamines agissent en interférant avec la synthèse de la paroi cellulaire.
  • Les Staphylococcus aureus résistants à la méthicilline i.e. les SARM (R méthi = R oxacilline) sont résistants à (presque) TOUTES les ß-lactamines.

***NOT GOOD FOR SARM. Meropenem does NOT cover SARM

20
Q

Quel est le spectre d’action de la pénicilline, cloxacilline, ampi/amoxi

A

Pénicilline: SBH (strep throat), S.pneumoniae, Neisseria meningitidis, Anaérobies (ORL, like OMI caused by moraxella or h.influenzae), T.pallidum (SYPHILIS)

Cloxacilline: SASO (ie, abcès neck and back). Good for infections SNC

Ampi/amox: Idem à peni +
- Entérocoques
- H. influenzae (70%)
- Quelques E.coli & P.mirabilis
- Salmonella spp. + Shigella spp.
PAS S.aureus

21
Q

Couverture du clavulin (amoxicilline-acide clavulanique)

A
  • Couverture de la pénicilline
  • Couverture de la cloxacilline
  • Couverture de l’amoxicilline
  • +Moraxella catarrhalis
  • +Haemophilus influenzae (> 95%)
  • PAS DE COUVERTURE DE P. AERUGINOSA

augmente spectre ATB, prevents substance
that mange ATB from manger ATB
One of biggest spectres we have

Un des antibiotiques oraux avec le plus large spectre

22
Q

Couverture Piptazo

A

Idem à amoxicilline-acide clavulanique
* + La plupart des entérobactéries
* + Beaucoup d’autres BGN tel que P. aeruginosa
* + Beaucoup de bactéries anaérobies

***NO NEED TO GIVE WITH FLAGYL!

23
Q

Cibles and ATB des différentes classes de céphalosporines

A

1ère: Céfazoline, céphalexin, céfadroxil

2e: RESPIRATOIRE: céfuroxime, céfaclor, cefprozil (pediatricians prescribe this one a lot because has a nice taste)
GI-GYNECO: céfoxitine

3e: PAS activité anti-pseudomonas: ceftriaxone, cefotaxime, céfixime
AVEC activité anti-pseudomonas: ceftazidime

4e génération: céfépime

5e: ceftobiprole
* Disponible au Canada
* Couverture des S. aureus résistants à la méthicilline (SARM)
- Seules ß-lactamines avec activité anti-SARM

24
Q

Couverture 1ère gen cephalosporines

A

Céfazoline/cefadroxil/cephalexin

  • Céphalosporine de 1ère génération
  • Streptocoques ß-hémolytiques/SASO**
  • Quelques E. coli, K. pneumoniae, P. mirabilis
  • Souvent utilisée pour les prophylaxies chirurgicales
  • Souvent utilisée pour les infections de la peau et des tissus mous*****
  • Peut être utiliser pour les infections urinaires basses (cystites**) quand on a l’id et l’antibiogramme
25
Q

Couverture céphalosporines 3e génération

A

Ceftriaxone (more hépatic) et céfotaxime (more renal, so give more to kids)
* Traverse la barrière hématoméningée
* Utilisées pour le traitement des méningites et des pneumonies acquises en communauté (hospitalisés)
* Céfotaxime chez nouveau né
* Ceftriaxone chez l’adulte
* Couverture large qui inclut plusieurs cocci Gram+ et plusieurs entérobactéries.
* Couverture aussi de H. influenzae et N. meningitidis

  • Ceftazidime
  • Excellente activité contre Pseudomonas aeruginosa
26
Q

Couverture des carbapénèmes?

A
  • Couverture de pipéracilline-tazobactam
      • certaines entérobactéries résistantes
      • certains P. aeruginosa
  • Perte de certains P. aeruginosa

Particularité
* Imipénème: couverture Enterococcus faecalis
* Méropénème: pas de couverture E. faecalis
* Ertapénème: pas de couverture E. faecalis/P. aeruginosa

***SO ERTAPENEM IS NOT GOOD FOR PSEUDOMONAS

27
Q

Effets secondaires des beta-lactamines?

A
  • Gastro-intestinaux
  • Diarrhée (surtout acide clavulanique)
  • Néphrite interstitielle (rare)
  • Neutropénie (pipéracilline-tazobactam) (rare)***BUT MORE FREQUENT than néphrite interstitielle
  • Allergie
  • Anaphylaxie (0.05%)
  • Toujours questionner le type de réaction

And of course, CLOSTRIDIUM DIFFICILE (le plus grave, avec allergie)

28
Q

Céphalosporine et allergie à la PNC?

A
  • <3% d’allergie croisée
  • Ne pas administrer de céphalosporine si l’allergie à la pénicilline est de type anaphylactique (angioedème)

bon outil: guide INESSS

29
Q

Nommez les 3 MACROLIDES

A
  • Érythromycine
  • Clarithromycine
  • Azithromycine
30
Q

Couvertures des 3 macrolides? (erythro, clarithro, azithro)

A

Azithro: good for community acquired pneumonia
- Strep (if patient is allergic to PNC, tell the lab so they can do antibiogramme to check for resistance in the strep strain****)
- Pneumo
- Atypiques
(Pneumonie atypique : causée par soit Legionnella, Mycoplasma ou Chlamydophila pneumoniae)
- H. influenzae
- Campylobacter
- Chlamydia

Clarithro:
- Streo
- Pneumo
- Atypiques
- Héinfluenzae

Erythromycine:
- Strep
- Pneumo
- Atypiques

31
Q

Effets secondaires des macrolides?

A
  • Gastro-intestinaux
    • No, Vo, diarrhée
  • Allongement du QTc

and of course, CLOSTRIDIUM DIFFICILE

32
Q

Nommez les 3 aminoglycosides

A

◼Gentamicine ◼Tobramycine ◼Amikacine

33
Q

Spectre des aminoglycosides?

A
  • Bâtonnets Gram négatif aérobies
    • Entérobactéries
    • Pseudomonas aeruginosa
  • PAS DE COUVERTURE DE GRAM POSITIF NI DES ANAÉROBES
34
Q

Pharmacocinétique des aminoglycosides et suivi?

A
  • Élimination rénale
  • Ajustement de la dose en fonction de la clearance de créatinine
  • Dosage pré-dose (parfois post)
35
Q

Effets secondaires des aminoglycosides?

A
  • Néphrotoxicité = réversible
  • Ototoxicité = irréversible!
    • Surdité
    • Troubles d’équilibre (VERY BAD FOR QUALITY OF LIFE!!!)
  • Problème de jonction neuro-musculaire (ie, myasthénie grave: if patient has this, can aggravate it!)

**This class of ATB has the most side effects***

36
Q

Nommez les quinolones

A
  • Norfloxacine (urines)
  • Ofloxaxine (urines, ITS)
    Most used:
  • Ciprofloxacine
  • Lévofloxacine
  • Moxifloxacine

Excellente biodisponibilité (IV = PO)

37
Q

Spectre du ciprofloxacine (quinolone)?

A
  • Plusieurs entérobactéries (infections urinaires)
  • P. aeruginosa (seul ATB po pour cette bactérie)****
38
Q

Spectre of levofloxacine et moxifloxacine (quinolones)?

A
  • Plus de couverture Gram positif (S. pneumoniae, SBH, S. aureus).
  • Particularités:
  • Moxifloxcine: pas de couverture P. aeruginosa et pas d’excrétion dans l’urine. Meilleure couverture anaérobie

*****DO NOT USE FOR URINARY INFECTIONS

39
Q

Effets secondaires des quinolones?

A
  • Effets SNC (délirium?) (More delirium caused by cipro than actual bacteria in urine)
  • Tendinopathies (don’t give if your patient is an olympic athlete for example!)
  • Attention au calcium/magnésium/aluminium (prevents absorption of cipro if you take
    these supplements, esp if at the same time)
40
Q

Glycopeptides pharmacocinétique?

A

◼Vancomycine (I.V. , orale)
◼Aucune absorption de la forme orale

  • Besoin d’une dose de charge
  • Besoin de dosage
    • Pré 4e dose
    • Visons entre 15-20 mg/L pour les infections à SARM
41
Q

Spectre de la vancomycine (glycopeptide)?

A

KNOW

Bactéries Gram positif
* Staphylocoques (incluant SARM)
* Entérocoques (autres que ERV)
* Pneumocoques
* Streptocoques
* Clostridium difficile (po seulement)

42
Q

Quand utiliser vancomycine IV?

A

Utiliser lorsqu’on a pas le choix i.e. :
* Germe résistant
- Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline
- Staphylococcus coagagulase négative
- Entérocoque résistant à l’ampicilline
* Patient avec allergie majeure à la pénicilline

43
Q

Effets secondaires de la vancomycine (glycopeptides)?

A
  • Éruption cutanée relative à la vitesse de perfusion (not allergie IgE mediated, just mastocyte degranulation. Red man syndrome)
  • Néphrotoxicité
44
Q

Spectre pour septra? (TMP SMX)

A
  • Staphylococcus aureus
  • Streptococcus pneumoniae
  • (Pas?) Streptococcus pyogenes
  • Plusieurs entérobactéries
  • Stenotrophomonas maltophilia
  • Certains parasites (P. jirovecii)

Good for resistant lice too!

45
Q

Effets secondaires du septra?

A
  • Gastro-intestinal: no, vo
  • Rash
  • Atteinte moelle osseuse (GB, PLT)
  • Néphrotoxicité (hyperkaliémie)
  • Attention à la « fausse »’augmentation de la créatinine (10%)
46
Q

Nommez les antibiotiques EFFICACES dans l’urine

A
  • Clindamycine
  • Macrolides
  • Moxifloxacine