Brainscape's Knowledge GenomeTM

Browse over 1 million classes created by top students, professors, publishers, and experts.


See full index

{P2} UE2.2 > Chimie orga : Chimie AA et peptides > Flashcards

Chimie orga : Chimie AA et peptides Flashcards

1
Q

Avantage de la synthèse des peptides/utilisation des peptides en thérapeutique ?

A
  • Mimétisme de molécules de signalisation endogène
  • Haute sélectivité → toxicité réduite
  • Large diversité chimique
  • Compatibilité avec la technologie de l’ADN recombinant
  • Taille < au AC → peuvent traverser les membrane et agir en Intracellulaire
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Quels sont les inconvénients de la synthèse des peptides/utilisation des peptides en thérapeutiques ?

A
  • Biodisponibilité réduites
  • Structures secondaires déstabilisées
  • Structures tertiaires des protéines non conservées
  • Coût de production élevés
    → Amélioration en cours
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Pourquoi la biodisponibilité des peptides est réduite (utilisation thérapeutique) ?

A

Les propriétés pharmacocinétiques sont défavorables à une administration par VO :
* Faible solubilité
* Dégradation enzymatique
* Elimination
* Mauvaise délivrance
* …

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Pour la nomenclature peptidiques, à quoi correspond le carbone alpha ?

A

Le C sur lequel est situé la fonction amine et le groupement carboxylique → α-amino-acide

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Caractéristiques de la représentation Fischer ?

A

Groupement le plus oxydé est représenté en haut et R est en bas

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Quelle peut être la nature de R ?

A

= Chaine carboné :
* Aliphatique
* Aromatique
* Acide
* Basique

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Conformation des AA ?

A

Conformation S sauf pour la cystéines qui porte un soufre pour le groupement R

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

pKa usuel COOH ?

A

4-5

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

pKa du COOH des AA ?

A

2-3

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Pourquoi le pKa du COOH des AA est plus bas que celui des COO libre ?

A

C’est dû à l’effet inductif attracteur du NH2

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Forme des AA en milieu pH < 1 ?

A

Forme acide prédominante :
* Ammonium
* Acide carboxylique

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Forme des AA en milieu 3 < pH < 8 ?

A

Zwitterion :
* Ammonium
* Carboxylate

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Forme des AA en milieu pH > 10 ?

A

Forme basique prédominante :
* Amine
* Carboxylate

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Sens de lecture des AA ?

A

N-ter → C-ter

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Pourquoi est-il nécessaire de protéger certains groupement des AA lors de la synthèse de peptides ?

A
  • Si excès de réactif et pas de protection → polymérisation à l’infini
  • Permet de choisir et positionner les réaction afin d’obtenir la séquence d’intérêt
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Protection de la fonction amine alpha ?

A

Conversion en groupement carbamate

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Dessine un carbamate

A

CM chimie des peptides 1 page 13

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Dessine un Boc

A

CM chimie des peptide 1 page 14

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Dessine un Fmoc

A

CM chimie des peptides 1 page 14

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Dessine un Cbz

A

CM chimie des peptide 1 page 14

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Comment réaliser la protection d’un groupement amide avec le Boc ?

A
  • Milieu basique
  • Utilisation de Boc2O
  • Décarboxylation du pyrocarbamate de tert-butyl
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

Mécanisme de la protection fu groupement amine des AA grâce au Boc ?

A

1) Addition nucléophile
2) Elimination → dégagement CO2 + tert-butanol

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

Réactif utilisé pour la protection Fmoc des amines ?

A

Fmoc-Osu ou Fmoc-Cl

24
Q

Caractéristiques du milieu de réaction pour la protection Fmoc des amines ?

A

Milieu basique

25
Q

Réactif utilisé pour protéger les amines avec Cbz ?

A

Chlorure de Cbz ou chlorocarbonate de benzyle

26
Q

Mécanisme de protection des amine par cbz ?

A
  • Attaque du carbonyle
  • Elimination d’un groupement partant : Cl
  • Milieu acide
27
Q

Quelle est la meilleur base à utiliser ?

A

DIPEA => pas de caractère nucléophile

28
Q

Elimination du groupement protecteur Boc ?

A
  • Milieu acide
  • Utilisation du TFA => pKa : 0,23
  • Libération ter-butyle
29
Q

Impact de la libération de ter-butyle ?

A

Risque d’alkylation → risque de polymérisation

30
Q

Comment éviter les réactions de polymérisation lors de la déprotection du groupe Boc ?

A

Utilisation d’un scavenger type TIS → piège le cation tert-butyle

31
Q

Elimination du groupement protecteur Fmoc des amines ?

A
  • Milieu basique
  • Pipéridine
32
Q

Elimination du groupement Cbz protecteur des amines ?

A
  • Réduction hydrogénée
  • Clivage en présence de H2/Pd/C
  • Décarboxylation → libération de toluène + CO2
33
Q

Dessine le groupement protecteur amide des acides carboxylique ?

A

Chimie peptide AA 1 page 17

34
Q

Dessine le groupement protecteur ester méthylique des COOH ?

A

Chimie peptide 1 page 1è

35
Q

Dessine groupement protecteur exster benzylique des COOH ?

A

Chimie peptides 1 page 17

36
Q

Dessine groupement protecteur ester ter-butylique des COOH ?

A

Chimie peptide 1 page 17

37
Q

Comment obtient on la protection des groupes COOH ?

A

Par estérification avec en amont une activation de l’acide (pour éviter les équilibres)

38
Q

Schéma de la protection l’acide par un ester ?

A

Chimie peptide 1 page 17

39
Q

Déprotéger un ester méthylique ?

A
  • Condition basique → saponification
40
Q

Déprotéger d’un ester benzylique ?

A

hydrogénation catalytique

41
Q

Déprotéger un ester ter-butylique ?

A
  • TFA et scavernger : pieger les éventuelles molécules générées
42
Q

Quels sont les AA qui possèdent des ac carboxylique sur leur chaines latérales ?

A
  • Acide glutamique → GLU
  • Acide aspartique → ASP
    → Protection par ester ter-butylique ou benzylique
43
Q

Quels sont les AA nécessitant une protection d’un amine sur leur chaine latérale ?

A
  • Lysine → protection via carbamate : Boc ou Cbz
44
Q

Qu’est ce que le principe d’orthogonalité ?

A

La fonction acide C-ter + les groupes fonctionnels des chaines latérales doivent être protégées par des groupes protecteur stables aux conditions de déprotection de l’amine alpha en N-ter

45
Q

Que sont les groupe protecteurs temporaires ?

A

Maintenus jusqu’à prochaine élongation → ajout d’une nouveau résidu

46
Q

Que sont les groupements protecteurs permanents ?

A

Protection des fonction non impliqués dans la liaison peptidique et maintenus jusqu’à la fin de création du peptides

47
Q

Quelle est la deuxième étapes de synthèse des peptide après protection des groupement d’intérêt ?

A

Activation de l’acide carboxylique pour former la liaison peptidique

48
Q

Quelles sont les méthodes d’activation des acides carboxyliques ?

A
  • Formation d’un chlorure d’acyle
  • Activation par un chloroformate
  • Agent de couplages à base de sel de phosphonium
  • Agent de couplage à bases de sels d’uronium
  • Activation par carbodiimide et formation d’un ester benzotriazole
49
Q

Mécanisme d’activation du COOH par formation d’un chlorure d’acyle ?

A
  • Utilisation d’agent de chloration
  • Remplacement du groupement OH du COOH par Cl
  • Incompatible avec tBu et Boc
50
Q

Quel est le moteur de la réaction qui conduit à la formation du chlorure d’acyle ?

A

formation d’un gaz → déplacement des e- entre O et S + départ du chlore

51
Q

Mécanisme d’activation des COOH par chloroformate ?

A
  • Formation anydride mixte (IBCF, ECF)
  • Facilité par une base → amine tertiaire non nucléophile
52
Q

Mécanisme d’activation des COOH par utilisation des sels de phosphonium

A
  • Formation d’un ester benzotriazole Intermédiaire
  • Réactifs : BOP et PyBOP
  • Privilégier en chimie solide
53
Q

Mécanisme d’activation des COOH par couplage à base de sels d’uronium ?

A
  • Formation d’un ester benzotriazole intermédiaire
  • Elimination d’urée
  • Privilégié en solution
  • Incompatible Boc et t-Bu
54
Q

Reconnaitre un carbodiimide ?

A

N≡C≡N

55
Q

Mécanisme d’activation des COOH par les carboiimide ?

A

Réaction sur support solide

{P2} UE2.2 (12 decks)

Brainscape helps you reach your goals faster, through stronger study habits.
© 2024 Bold Learning Solutions. Terms and Conditions