Chapitre 8

Question 1

Quels sont les deux moyens principaux d’activation?

Answer 1

Le recrutement de la polymérase à un promoteur faible (liaison coopérative) et le changement conformationnel de la polymérase ou de l’ADN (allostérie)

Question 2

Pourquoi la régulation est-elle plus compliquée chez les eucaryotes ?

Answer 2

Car l’accès aux gènes est plus compliqué et les gènes possèdent plusieurs séquences régulatrices controlées par plusieurs protéines régulatrices

Question 3

Qu’est ce qu’un gène rapporteur?

Answer 3

C’est une manière de voir l’effet d’une séquence régulatrice en la fusionnant avec un gène dont on peut facilement mesurer l’expression de la protéine

Question 4

Quelles sont les deux portions qui forment un activateur?

Answer 4

La région activatrice et le domaine de liaison

Question 5

Si on fusionne à un autre domaine de liaison, une certaine région activatrice, peut-on activer un gène?

Answer 5

Oui

Question 6

Quels sont les quatre domaines de liaison à l’ADN chez les eucaryotes?

Answer 6

L’homéodomaine, le doigt de Zinc, l’agraphe à leucine et l’hélice boucle hélice

Question 7

L’homéodomaine est similaire à quel domaine de liaison ?

Answer 7

Celui de l’hélice coude hélice retrouvé dans les bactéries

Question 8

Comment fonctionne le motif doigt de zinc?

Answer 8

Il utilise un atome de zinc pour stabiliser l’hélice alpha qui s’insère dans le sillon majeur de l’ADN.

Question 9

Comment fonctionne l’agrafe à leucine ?

Answer 9

Elle est formée de deux hélices alpha qui viennent sous une forme de pince se lier au sillon majeur de l’ADN. La partie du haut sert à renforcer la structure

Question 10

Comment fonctionne le domaine hélice-boucle-hélice?

Answer 10

Comme celui de l’agraphe à leucine , mais avec une boucle qui relie les deux hélices

Question 11

Qu’est ce qu’un hétérodimère?

Answer 11

C’est une combinaison entre deux dimères de types différents. C’est exclusif aux eucaryotes. Ça permet de pouvoir se lier à plus de séquences

Question 12

Est ce que les activateurs de la transcription agissent directement sur la polymérase?

Answer 12

Non

Question 13

Quels facteurs sont fréquemment appelés par les activateurs?

Answer 13

Les facteurs généraux de transcription, les modificateurs d’histone

Question 14

Quels sont les deux types d’enzyme qui peuvent modifier la chromatine ?

Answer 14

Les histones acétyltransférases et les complexes remodeleurs de chromatine

Question 15

Quelle partie des histones est exposée à la modification ?

Answer 15

Les queues N terminales

Question 16

Quelles sont les 2 types de modification qui peuvent être apportées aux histones?

Answer 16

La méthylation et l’acétylation

Question 17

Comment fonctionne l’acétylation des histones?

Answer 17

L’activateur vient se lier sur une partie exposée. Cela altère la charge des histones en les neutralisant et provoque le déroulement de la chromatine rendant le gène accessible pour la transcription

Question 18

À quoi peut servir l’acétylation des histones autrement que de dérouler l’ADN?

Answer 18

À attirer le recrutement de facteurs spécifiques qui contiennent un bromodomaine

Question 19

Quelles sont les types d’actions que peuvent faire les remodeleurs de chromatine?

Answer 19

Glisser, changement conformationnel pour qu’un autre facteur puisse se liver, dériver l’ADN pour qu’il rejoigne d’autres histones, dissocier l’ADN de son histones

Question 20

À quoi sert LCR?

Answer 20

C’est une région de contrôle qui contrôle plusieurs gènes avec des éléments inhibiteurs, activateurs et isolateurs.

Question 21

Quel est le déroulement global de la régulation de la transcription chez les eucaryotes ?

Answer 21

On peut seulement transcrire si on est dans l’eucromatine. Ensuite, on utilise des enhancers pour ouvrir la chromatine à l’aide de plusieurs facteurs. On recrute des facteurs spécifiques. On initie la transcritpion

Question 22

Quel est le rôle des gènes Hox ?

Answer 22

Ils codent pour des facteurs de transcription qui déterminent la morphologie des animaux

Question 23

Comment déterminer si un domaine est transcriptionnellement actif ou non ?

Answer 23

Ce sont le rassemblement des différents activateurs qui vont s’installer sur les enhancers qui permettent de recruter des remodeleurs de chromatines et autres facteurs et rendre le domaine actif

Question 24

Qu’est ce qu’un isolateur ?

Answer 24

C’est une protéine qui se lie entre un promoteur et son activateur et qui peut empêcher l’activateur d’agir sans toutefois inhiber. Il peut agir en amont ou en aval

Question 25

Quelles sont les différentes manières de réguler avec le contrôle combinatoire ?

Answer 25

Par liaison coopérative. Le facteur A peut aider le recrutement d’autre facteurs qui permettent le remodelage de l’ADN. Le facteur A peut directement modifier la chromatine pour rendre le site de B accessible

Question 26

Expliquer l’exemple du gène HO et de l’inégration du signal

Answer 26

Le gène est exprimé lorsque la levure bourgeonne et seulement chez la mère. Il est sous contrôle de deux protéines, sW15 et SBF. Quand SW15 de lie à ses sites de liaison, il recrute un complexe de remodelage de la chromatine, ce qui découvre les sites de liaison de SBF

Question 27

Expliquer l’exemple du gène beta interféron

Answer 27

Il ne s’exprime que lors d’une infection virale. L’infection active des protéines qui se lient coopérativement à l’ADN formant l’enhancéosome. Ensuite, une autre protéine se lie au complexe et aide à l’activation de la transcription en rapprochant les éléments du complexe

Question 28

Qu’est ce qu’une voie de signalisation ?

Answer 28

Une bactérie réagit à son environnement. Elle manque ou a trop de nutriment et cette information est distribuée par les voies de signalisation possédant des récepteur à activité kinase sensibles à un nutriment en particulier.

Question 29

Expliquer l’exemple des récepteurs TGFbeta

Answer 29

L’activation des récepteurs TGFbeta permet la transcription de gènes contenant des SBE.
Il a une partie intracellulaire qui s’autophosphoryle et une extracellulaire qui reconnait les nutriments. Sa phosphorylation provoque celle de d’autres protéines qui en s’associant révèlent un signal NLS. Le complexe est ainsi apporté au noyau.

Question 30

Comment se déroule l’activation de Ras par EGF?

Answer 30

1. La liaison d’une hormone au récepteur RTK induit sa dimérisation et l’activation de son activité kinase
2. La protéine GRB2 se lie au récepteur activé avec son domaine SH2
3. Son domaine SH3 lui permet de se lier à une GEF appelée Sos
4. Sos active Ras avec son activité GEF

Question 31

Nommer un effet de l’activation de Ras

Answer 31

L’activation de la voie MAPK

Question 32

Comment se déroule l’activation de MAPK?

Answer 32

1. Une fois que Ras est active, elle recrute RAF, une autre GTP ase
2. Elle hydrolyse de GTP en GDP et active la protéine suivante.
3. On est donc en présence d’une cascade protéique qui finit avec le dimère MAPK

Question 33

Comment MAPK active-t-elle la transcription ?

Answer 33

1. Lorsqu’elle est activée par phosphorylation, elle active p90
2. Elle et p90 entrent dans le noyau
3. p90 acive SRF
4. MAPK active TCF
5. SRF et TCF forment un complexequi reconnait et active la transcription de gènes portant un élément SRE

Question 34

Quels facteurs sont désignés par SRE?

Answer 34

Les facteurs de croissance

Question 35

Quelle est la particularité des hormones stéroidiennes?

Answer 35

Ce sont un groupe de composés liposulubles qui peuvent influencer directement l’activité des récepteurs nucléaires . Ils agissent par rapport aux gènes anti inflammatoires

Question 36

Quelle est la structure commune des récepteurs nucléaires ?

Answer 36

Un domaine variable, un domaine de liaison à l’ADN en motif à doigt de zinc et un domaine de liaison à l’hormone dépendant de la liaison du ligand . Il peut agir comme répresseur quand son hormone est absente

Question 37

Où sont situés les hétérodimères ?

Answer 37

Dans le noyau

Question 38

Qu’arrive-t-il aux hétérodimères quand ils ne sont pas liés avec leur hormone?

Answer 38

Ils se comportent comme des répresseurs. Quand l’hormone arrive, elle se lie à leur sous unité RAR du répresseur, qui recrute un coavtivateur, qui recrute une acétyltransférase, qui active l’hétérodimère.

Question 39

Où sont situés les homodimères ?

Answer 39

Ils sont situés dans le cytoplasme à cause de leur liaison avec un inhibiteur. Quand leur hormone arrive, cela libère un récepteur qui induit un signal SLN qui permet d’entrer dans le noyau .

Question 40

Quelles sont les trois facons dont les répresseurs peuvent inhiber chez les eucaryotes?

Answer 40

1. Ils peuvent interférer avec les activateurs
2. Ils peuvent intervenir avec le complexe d’initiation
3. Ils peuvent rendre les gènes inaccessibles en compactant la chromatine

Question 41

À quoi sert la méthylation de l’ADN?

Answer 41

À maintenir silencieux certains gènes, à cacher les parties non codantes de l’hétérochromatine. Elle peut servir aussi à l’empreinte génétique, c’est à dire quand un gène est exprimé en deux copies (un chez le père un chez la mère) mais une des deux doit rester silencieuse.

Question 42

Comment fonctionne la méthylation de l’ADN?

Answer 42

La méthylation est un code pour les protéines de reconnaissance des histones méthylées apportent d’autres histones et rendent la section impossible à transcrire

Question 43

Comment la méthylation se conserve-t-elle?

Answer 43

La méthylation est semi conservative et contenue dans des séquences CG, donc les méthylases reconnaissent les ADN mi méthylées et ajoutent un groupement méthyl au C complémentaire.

Question 44

Comment les ARNi sont ils produits?

Answer 44

Ils sont produits à partir d’ARN double brin et l’enzyme Dicer les digère et forme des petits fragments. Le complexe protéique Risc forme des petits ARN simple brin . Cela l’active et lui permet de cibler son activité vers les séquences complémentaires de l’ARNi

Question 45

Comment les ARNi interfèrent-t-ils?

Answer 45

Ils viennent par complémentarité des bases cibler de l’ADN et soit inhiber, soit dégrader la séquence

Question 46

Comment fonctionne Risc?

Answer 46

Il peut être recruté dans le cytoplasme ou le noyau. Elle va empêcher la production de protéines en se fixant à l’ARN pol et en recrutant des remodeleurs qui viennent rendre impobbiel la transcritpion

Question 47

Que sont les ARNmicro?

Answer 47

Ils sont une classe d’ARN qui ne codent aucune protéine, ils fonctionnent comme les ARNi