Chapitre 7

Question 1

À quoi sert la régulation des gènes?

Answer 1

À fabriquer les protéines au moment où on en a besoin et répondre aux conditions changeantes de leur environnement

Question 2

Quels sont les trois type de protéines pouvant réguler a transcription ?

Answer 2

Les protéines spécifiques qui se lient à l’ADN à proximité de gènes qu’ils contrôlent, les activateurs et les répresseurs

Question 3

Qu’est ce qui distingue un promoteur fort d’un promoteur faible ?

Answer 3

Un promoteur fort a une forte affinité avec l’ARN polymérase. Il est proche du concenssus. On l’appelle souvent constitutif. Un promoteur faible n’a pas une bonne affinité pour l’ARNpol

Question 4

Quel est le moyen le plus simple de réguler la transcription et comment fonctionne-t-il ?

Answer 4

L’interférence avec l’ARN polymérase. Pour les répresseurs, ils empêchent simplement la liaison avec l’ADN. Pour les activateurs, ils se lient à l’ARNpol ou à l’ADN et augmentent l’affinité

Question 5

Comment fonctionne la régulation par allostérie ?

Answer 5

L’ARN pol se fixe normalement au promoteur, mais elle a besoin d’un activateur pour changer en conformation ouverte

Question 6

Qu’est ce qui a permis de déduire que l’expression des protéines est régulée?

Answer 6

Les expériences avec les bactéries et le glucose qu’on changeait en lactose. Apres un certain temps, les bactériesqui étaient capables de traiter le glucose étaient capables de traiter le lactose.

Question 7

Quels sont les composantes de l’opéron lactose?

Answer 7

3 gènes nécessitant la dégradation du lactose (lacZ, lacY et lacA). Un opérateur qui sert à recruter le répresseur. Un activateur CAP

Question 8

Est-ce que lacI fait partie de l’opéron lactose?

Answer 8

Non, il fait partie d’un gène constitutif

Question 9

Qu’arrive-t-il en absence de lactose?

Answer 9

Le gène lacI s’exprime et produit le répresseur. Il reconnait et bloque l’opérateur. L’ARNpol ne peut pas se lier et n’exprime pas l’opéron

Question 10

Qu’arrive-t-il en présence de lactose et de glucose ?

Answer 10

Le lactose est un inducteur et change la conformation de lacI. Il ne peut pas se lier et ne cause donc pas de répression.

Question 11

Comment le lactose induit-il un changement de conformation de lacI?

Answer 11

LacI est un tétramère avec deux sous unités. Le lactose écarte les domaines l’un de l’autre ce qui fait qu’il sne peuvent pas se lier en même temps sur l’opérateur.

Question 12

Quelle est l’organisation particulière de l’opérateur de l’opéron lactose?

Answer 12

Un est en répétition inverse

Question 13

Comment se fait l’activation de l’opéron lactose?

Answer 13

1. Lorsque le glucose est épuisé, le taux d’AMPc augmente
2. L’AMPc se fixe sur la protéine CAP
3. CAP se fixe sur le promoteur
4. Le CAP se lie au domaine CTD de la sous unité alpha de l’ARNpol

Question 14

Comment peut-on déterminer où sont situées les séquences spécifiques aux protéines ?

Answer 14

Par l’expérience de l’empreinte sur l’ADN.

Question 15

Est- ce que la plupart des activateurs et répresseurs se lient à l’ADN de la même façon? Si oui, comment ?

Answer 15

Oui. Ils sont généralement des homodimères dont chaque monomère se lie à un demi site des séquences spécifiques. C’est leur domaine hélice de la structure “hélice coude hélice” qui entre ne contact avec le sillon majeur de l’ADN.

Question 16

Qu’est ce que le contrôle combinatoire ?

Answer 16

C’est le fait que plusieurs gènes soient sous le contrôle d’un même facteur

Question 17

Qu’est ce que l’intégration du signal ?

Answer 17

le fait que deux conditions soient nécessaires pour obtenir la pleine expression des opérons

Question 18

Qu’est ce qu’on permis d’apporter les expériences de Jacques et Monod?

Answer 18

Que certains mutations peuvent être complémentées et ont permis de comprendre le système des facteurs de mutation

Question 19

Qu’est ce qu’un facteur de mutation trans?

Answer 19

C’est un facteur qui peut traverser l’espace

Question 20

Comment appelle-t-on une mutation qui affecte la séquence régulatrice elle-même?

Answer 20

Une mutation en cis

Question 21

À quoi servent les différentes sous unités sigma?

Answer 21

À reconnaitre des promoteurs spécifiques ?

Question 22

Comment peut-on utiliser les sous unités sigma pour contrôler l’expression d’un gène?

Answer 22

En ayant un unité spécifique pour chaque “période d’expression du gène”. Certains bactériophages vont utiliser des sous unités sigma spécifiques pour contrôler l’expression de gènes à leur avantage

Question 23

Donner un exemple d’activateur qui fonctionne par allostérie

Answer 23

NutC, qui contrôle l’expression des gènes impliqués dans le métabolisme de l’azote, Il se lie à l’ADN quand le taux d’azote est très bas.

Question 24

Comment fonctionne l’activation par MerR?

Answer 24

Le promoteur de MerR est de type sigma70. L’espace entre les boites -35 et -10 est par contre trop grand. Sigma 70 peut se lier au promoteur, mais pas initier la transcription. La liaison du Hg à MerR induit un changement conformationnel à la protéine. Le changement de conformation induit une distortion de l’ADN, ce qui donne une position favorable pour l’initation.

Question 25

Comment se fait la liaison au promoteur par l’ARN polymérase en général?

Answer 25

La sous unité sigma est divisée en 4 régions. :a région 4 se fait avec la boite -35 du promoteur. La région 2 se lie avec la boite -10, en plus de séparer les brins d’ADN. .La sous unité alpha se lie à l’élément UP, qui ressemble à l’élément CAP de l’opéron lactose.

Question 26

À quel gène est associé la beta galactosidase?

Answer 26

LacZ

Question 27

Quelle est la différence entre le répresseur de l’opéron lac et l’opéron gal?

Answer 27

Le répresseur de lac empêche la polymérase de se lier. Le répresseur de gal se lie à un site ajdacent au promoteur, mais n’empêche pas l’ARN pol de se lier, il l’empêche de faire la transition vers le complexe ouvert

Question 28

Comment fonctionne l’opéron arabinose ?

Answer 28

En présence d’arabinose, araC se lie sous forme de dimère à deux sites et active la transcription. Sans arabinose, la conformation du dimère change et se lie à un autre endroit . C’est ce qu’on appelle l’antiactivation..

Question 29

Qu’est-ce que la régulation par atténuation ?

Answer 29

C’est une régulation faite par un facteur intrinsèque.

Question 30

Comment fonctionne la régulation de l’opéron triptophane quand il n’y a pas de triptophane?

Answer 30

S’il n’y a pas de triptophane, le ribosome s’arrête. il permet aux régions 2 et 3 de former une tige boucle, ce qui empeche la région 3 et 4 de former la tige boucle terminatrice, la transcription continue. Ensuite, la région 2 forme une tige boucle avec la région 1, ce qui arrête l’ARN pol.

Question 31

Comment la présence de triptophane vient-elle arrêter la transcription de l’ARN?

Answer 31

Pendant que la polymérase est arrêtée, le peptide est produit cotranscriptionnellement. Le ribosome poursuit sa traduction jusq’au codon stop, où il se sépare.Cela mène aux régions 3 et 4 qui forment la tige boucle terminatrice.

Question 32

Quels sont les deux moyens de régulation des sARN?

Answer 32

1. Le sARN peut empêcher une tige boucle de se former sur la séquence RBS (stimulent la traduction)
2. Peut se complémenter avec la séquence RBS (inhibe la traduction)

Question 33

Qu’est ce que le riboswitch?

Answer 33

C’est une méthode de régulation qui fait que l’ARN change de conformation selon la présence ou l’absence d’un métabolite. Ca peut être pour empêcher le ribosome de se fixer ou encore d’induire la terminaison