Chapitre 6 Flashcards
Combien y’a-t-il d’acide aminés possibles
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Qu’est ce qui détermine la séquence d’acide aminé ?
La séquence d’ADN
Quelle est la structure des acides aminés?
Un carbone central appelé carbone alpha, un atome d’hydrogène, un groupe acide (COOH), un groupe amine (NH2) et une chaine latérale variable
Quel est le type de liaison dans la liaison peptidique?
liaison covalente
Qu’est ce que la liaison peptidique et par quoi est-ele catalysée?
C’est la liaison entre les aa d’une protéine et elle est catalysée par le ribosome
Entre quels membres de la structure des aa survient la liaison peptidique?
Entre le groupe carboxyle et le groupe amine du suivant.
Qu’est ce qui permet un pivot de la structure d’une chaine d’aa?
Le caractère double lien partiel qui peut se déplacer entre l’O et le N d’une liaison entre le groupement carboxyle et amine d’une liaison peptidique
Quels sont les 4 groupes d’aa?
Neutres non polaires, neutres polaires, chargés acides et chargés basiques
Qu’est ce qui détermine à quel groupe sera associé un aa?
La structure de la chaine latérale et la nature de l’AA
Qu’est ce qui caractérise les aa neutre non polaires?
Des chaines simple composées de carbone ou de cycles aromatiques (ou des hydrogènes). Forment des contacts hydrophobes, donc ont tendance à se retrouver au centre des protéines
Est-ce que les catégories de aa sont absolues? Sinon nommer un exemple
La cystéine possède un souffre qui est polaire et qui peut faire changer sa nature hydrophobe. Mais statistiquement, il est plus souvent hydrophobe donc non polaire
Quest-ce qui caractérise les aa neutre polaires ?
Possèdent des groupements propices à former des liens hydrogènes, comme le OH. Ils sont hydrophiles donc souvent retrouvés en périphérie ou dans les sites actifs des enzymes
Qu’est ce qui caractérise les aa chargés ?
Ils sont souvent ceux qui sont modifiés, ils sont hydrophiles
Quels sont les trois acides aminés spéciaux?
La cystéine, la glycine et la proline
Qu’est ce qui est particulier à propos de la cystéine?
Elles peuvent fomer des ponts disulfure (attacher les deux cystéines par leur souffre) entre elles ce qui joue un rôle important dans le maintien de la matrice extracellulaire
Qu’est ce qui est particulier à propos de la glycine?
C’est le plus petit aa et peut occuper des très petits espaces
Qu’est ce qui est particulier à propos de la proline ?
Elle est très rigide à cause d’un cycle formé par son groupe amine relié à son groupe R. Elle donne donc un angle fixe à la chaîne polypeptidique.
Quels sont les 4 niveaux de structure des protéines ?
Primaire, secondaire, tertiaire, quaternaire
Qu’est ce que la structure primaire?
C’est la séquence d’aa qui forme la protéine. On l’écrit de l’extrémité NH2 terminale vers le COOH terminal
Qu’est ce qui compose la structure secondaire ?
Les hélices alpha et les feuillets beta . Ils sont formés par les interactions entre les atomes de l’ossature constante. Les groupements amine sont des accepteurs d’électrons et les acides des donneurs, ce qui forme des ponts hydrogène
Qu’est ce qui caractérise l’hélice alpha ?
C’est l’arrangement le plus stable de l’ossature protéique. Il y a beaucoup de liens H. Les chaines latérales sont toutes orientées vers l’extérieur, ce qui permet de réagir avec d’autres molécules comme l’ADN ou une autre protéine.
Sous quel forme sont les facteurs de transcription et pourquoi ?
Sous la forme d’hélice alpha car c’est sous cette forme qu’ils peuvent le mieux interagir avec le sillon majeur de l’ADN
Quelle est le seul aa qui ne peut pas entrer en hélice alpha et pourquoi ?
La proline car le lien qui lie sa chaine latérale et son groupement amine rend un pont hydrogène impossible, ce qui brise l’hélice
Qu’est ce qui caractérise les feuillets beta?
C’est une conformation très étendue. Les liens hydrogène se font entre deux brins adjacents. Les aa adjacents sont à 180 degrés, donc les chaines latérales sont de chaque côté du plan du feuillet