Chapitre 5- nucléotides et acides nucléiques Flashcards
Différence entre nucléoside et nucléotide ?
NucléoSides : composés d’une base azotée liée à un sucre.
NucléoTides:
* Contient groupes phosphate.
* Jouent un rôle crucial dans la formation des acides nucléiques et dans les processus énergétiques, tandis que les nucléosides servent de précurseurs.
Qui travaillait sur la structure de l’ADN? (indice : 2 personnes)
Wilkins et Franklin
Qui furent les modélisateurs du modèle qu’on connait de l’ADN en regardant/analysant travaux faits ?
Watson et Crick
Comment différencier purine et pyrimidines?
Grosse molécule = petit nom.
- Les PURINES on 2 cycles et pas de y dans leur noms.
- Les PYRIMIDINES on juste 1 cycle et un y dans leur noms (sauf uracile)
Positions des éléments dans les purines et les pyrimidines ?
Purines : on pars d’en haut, antihoraire, puis au 2e cycle, pars d’en haut puis sens horaire.
Pyrimidines : on pars d’en bas et on compte dans sens horaire.
Le lien entre le sucre et
la base azotée permet
deux conformations :
syn et anti. Expliquer ces conformations.
Syn : tourne dans sens horaire.
Anti : tourne dans sens antihoraire.
Expliquer comment se fait l’élongation des nucléotides (colonne vertébrale, positions et sens)
Le phosphate α qu’on trouve sur le
carbone 5’ du nucléotide se colle au
-OH en 3’ du nucléotide précédent.
Élongation : 5’ vers 3’
Colonne vertébrale de l’ARN = alternance sucre et acide phosphorique.
Liens formés par pyrimides et purines?
Les purines font chacune
des ponts hydrogènes avec
l’une des pyrimidines.
A forme 2 ponts H avec T ou U
G forme 3 ponts H avec C
Expliquer la complémentarité de l’ADN.
Il y a toujours autant de A que de T, autant de G que de C.
Les deux brins de l’ADN sont antiparallèles ou parallèles ?
antiparallèles
Les deux brins forment une hélice de…?
Pas droit.
Les formes possibles d’hélices d’ADN?
Forme A : Compressé. Quand ADN est précipité (déshydrater).
Forme B : normal.
Forme Z : Irrégulières.
Mesurer l’ADN en longueur et en masse ?
Longueur : paire de bases (pb). Par exemple, une pb peut être A-T ou C-G.
Masse : on compte, par paire de base, 660 g / mol. Donc si un bout fait 123 pb : 123 x 660 = 81 800 g/mol.
Comment peut-on séparer les deux brins d’ADN?
En brisant les ponts
hydrogènes. Par exemple, en chauffant. L’ADN se dénature dans ce cas (il faut le refroidir pour se renaturer, c’est une hybridation).
Plus l’ADN est long, ou plus il est riche en GC, et plus le Tm est
bas ou élevé?
Élevé.
Équation du Tm (temperature of melting)
Tm = (nrb de G ou C x 4°C) + (nrb de A ou T x 2°C)
L’ADN peut absorber la lumière. Expliquer comment cette absorbance permet d’évaluer la concentration de l’ADN dans une
solution.
Absorbance mesuré en DO (densité optique).
1 DO = 50 ng/µL.
Donc, si par exemple, une solution donne une DO de 1,5, on peut faire une règle de trois pour trouver une concentration d’ADN de 75 ng/μL.
Quel est le Tm (temperature of melting) ?
La température à laquelle 50% des
molécules d’ADN présentes sont dénaturées.
Quelle subtance est essentiel pour la synthèse du dTMP à partir de dUMP ?
L’acide folique.
Expliquer comment du dUMP se rend à de la dTMP.
Grâce à de la Thymidylate synthase, un ion H s’ajoute au CH2 initiale de la molécule, se qui créer du dTMP.
La FdUMP cause quoi lors de la production de dTMP?
De l’inhibition compétitive. Le Thymidylate synthase se concentre sur le FdUMP et donc, la production de dTMP cesse.
L’ADN a combien de paires de bases par tour?
Environ 10.
Expliquer la synthèse naturelle et artificielle (chimique) de l’ADN
Naturelle : avec enzyme ADN polymérases, utilise ancien brin d’ADN comme modèle.
Artificielle (chimique) : pompes commandées par ordi, synthèse se fait par colonne et bouteilles contiennent produits chimiques nécessaires. Ajout de nucléotïdes un par un, synthèse se fait à l’envers (de 3’ à 5’) premier nucléotïde est déja accroché à colonne.
Amorce définition?
Cours fragment d’ADN, ARN ou extrémité d’un très long brin, comme un chromosome
