Chapitre 3- acides aminés Flashcards
Quels sont les molécules les plus versatiles des organismes vivants?
protéines
Caractéristiques protéines
- polymères qui se replient
- formées en assemblant bout à bout les maillons d’une chaîne d’acides aminés, qui sont au nombre de 20.
Définition alpha-carbone
alpha pour premier carbone, de base
Définition Zwitterion
Même catégorie que anion et cation ; Composé de pH neutre possédant en nombre égal des charges électriques formelles d’une unité et de signes opposés.
Définition isomères
molécules qui ont la
même formule chimique mais des formes différentes.
Différents types :
- Stéréoisomères : agencement spatial différent de leurs atomes
- Énantiomères : miroir
- Diastéréoisomères : stéréoisomères qui ne sont pas superposables mais qui ne sont pas non plus énantiomères. Par exemple, des isomères cis ou trans d’un même acide aminé dans un polypeptide.
- Épimères : des diastéréoisomères où un seul centre asymétrique est différent.
- Anomères : générés quand une molécule linéaire se referme en un cycle, orientant alors un substituant de manière différente.
Définition d’une molécule chirale?
Une molécule est chirale dès lors qu’elle ne présente aucune symétrie intrinsèque.
Si NH3+ est à droite du R : forme ? et si à gauche du R : forme ?
À gauche (left) : forme L (laevus)
À droite : forme D (dexter)
Quels acides aminés doivent être présents dans l’alimentation humaine ?
- Histidine
- Thréonine
- Méthionine
- Isoleucine
- Leucine
- Lysine
- Phénylalanine
- Valine
- Tryptophane.
Dans une réaction, la phosphorylation est …?
L’ajout d’un groupement phosphate
(PO4).
Le donneur est très souvent de l’ATP.
Nombre d’acides aminés par hélice alpha ?
3,6
1 résidus = combien d’acide aminés
1, Sont des synonymes.
Acides aminés à caractère acide ?
l’acide glutamique et l’acide aspartique.
Acides aminés à caractère basique ?
L’histidine, l’arginine et la lysine
la cystéine oxydée forme
une molécule dimérique qu’on appelle… ?
cystine
Comment trouver pI (point isoélectrique) d’une acide aminé ?
En faisant la moyenne des deux pKa de part et
d’autre de la forme neutre de l’acide (aux flèches).
Pour un acide aminé dont la chaîne latérale ne se charge pas: faire la moyenne du pKa et du pKb.
Comment la cystéine permet la formation de ponts disulfures ?
Par l’oxydation de deux groupes sulfhydryles (-SH), créant une liaison covalente S−S (soufre).
Point isoélectrique définition ?
C’est le pH auquel toutes les charges présentes s’équilibrent les unes les autres pour donner une charge globale
égale à zéro.
Qu’est-ce qu’un codon ?
Une séquence de trois nucléotides consécutifs dans l’ARN messager (ARNm) qui code pour un acide aminé spécifique.
Qu’est-ce qu’un cadre de lecture ?
Manière d’interpréter la séquence de nucléotides d’un acide nucléique (comme l’ARNm) par groupes de trois codons.
Qu’est-ce qu’une mutation non-sens ?
Une mutation qui interrompt le cadre de lecture (qui est la manière d’interpréter la séquence, fait de trois codons) en y introduisant un codon stop.
Comment les acides aminés sont-ils associés par leur bout carboxylique?
C-terminal aux ARN de
transfert.
Expliquer la disposition en cis et en trans dans un lien peptidique (Liaison covalente entre le groupe carboxyle (-COOH) d’un acide aminé et le groupe amine (-NH₂) d’un autre, formant une structure plane en raison de la résonance)
EN TRANS :
les chaînes sont pas dans même sens. Pense à un z.
EN CIS :
Même sens.
(Pense à un U, où les chaines sont les branches du u, vers le haut.)
Expliquer un plan amide.
- Comprend groupe carbonyle (C=O), groupe amine (-NH) et deux carbones alpha.
- La résonance entre le groupe carbonyle (C=O) et le groupe amine (N-H) offre une certaine rigidité.
Les quatre niveaux de structure des protéines ?
Structure primaire : liens peptiques.
Structure secondaire : hélice aplha et fdeuillet beta.
Structure trertiaire : les hélice et feuillet s’agencent ensemblent pour former forme 3D de la protéine.
Structure quaternaire : Associations de plusieurs protéines.
