Chapitre 2 : génétique des bactéries et santé publique Flashcards
Vrai/Faux
100 espèces de bactéries ont été séquencées en 10 ans.
Vrai
Quelles sont les caractéristiques du génome bactérien?
- 0.5/10 Bases
- 90% d’ADN codant
- 2 à 3000 gènes
- 70/90% gènes essentiels (indispensables à la survie)
- 15/30% de gènes accessoires pour virulence et résistance
Que sont les gènes accessoires?
- ilots génomiques
- plasmides
- transposons
- phages
Qu’est-ce qu’une mutation silencieuse?
- remplacement une base par une autre base sans changer le codon
- code pour un même acide aminé
Qu’est-ce qu’une mutation non sens?
- donne AA différent
- tronquée
Qu’induit un codon stop?
protéine tronquée
Vrai/faux
Pour la phylogénétique, on étudie généralement les mutations silencieuses.
Vrai
Qu’est-ce qu’un motif VNTR?
- répétition de la même base un nombre variable de fois
- au moment de la réplication de l’ADN, peut faire des boucles
- ajout ou retrait du contenu de la boucle
- insertions et délétions d’assez grosse portion => variation protéines
Qu’est-ce que l’hypermutation?
- réaction face à un stress métabolique, liaison Rec-A à ADN simple brin
- système SOS-box qui doit promouvoir synthèse protéines si erreurs dans ADN bactérien (réprimée en temps normal)
- utilisation polymérases
- Lex A pour mort de la cellule
Qu’est-ce que le transfert génétique horizontal?
- Acquisition matériel génétique venant d’un autre organisme sans en être le descendant
- induit une spécialisation de la bactérie
Qu’est-ce que la transformation?
- être compétant (intégrer fragments ADN nus présent de l’environnement)
- lors d’un stress
- pas toujours au sein de la même espèce
Quelle est l’expérience qui a permis de mettre en évidence le processus de transformation ?
expérience de Griffith (souches encapsulées)
=> info de la capsule portée par l’ADN et non pas par les protéines
Qu’est-ce que la transduction?
-bactériophage (virus qui s’attaque à une bactérie)
-lui injecte son ADN
-apoptose de la bactérie après cycle
=> relâche bactériophages
Qu’est-ce qu’un phage lytique?
Induit la lyse de la cellule
Qu’est-ce qu’un phage lysogénique?
Capables d’intégrer le matériel génétique dans l’ADN de la bactérie
Quand apparaît le cycle lytique du phage?
Situation de stress
=> tue la cellule
Qu’est-ce que la transduction généralisée?
- fait suite à un cycle lytique
- par erreur, ADN bactérien encapsidé à la place ADN du virus
- ADN bactérien va aller infecter une autre bactérie (recombinaison homologue)
Qu’est-ce que la transduction spécialisée?
-phage lysogénique resté dormant dans génome de l’hôte => propage
-pendant phase lytique, excision d’un bout de chromosome bactérien
-toujours le même gène emporté
-rajoute à un morceau de gène identique à une autre bactérie
=> pathogénicité de la bactérie
Qu’est-ce qu’un plasmide?
-élément génétique circulaire
-double brin
-pas essentiel à la survie
-réplication indépendante
-confère un avantage à la bactérie
-peuvent s’intégrer au niveau du chromosome bactérien
=> réplication et injection dans une autre bactérie
Qu’est-ce que la conjugaison?
- plasmide sous forme intégrée dans génome bactérien
- prend un petit morceau ADN en plus
- intégration dans une nouvelle bactérie
Vrai/Faux
Un plasmide peut tuer la bactérie qui n’a pas reçu de plasmide (perte de l’antitoxine).
Vrai, 1/2 vie de la toxine plus longue.
Qu’est-ce que le système de compatibilité?
Capacité de pouvoir exclure d’autres plasmides
Citez des éléments génétiques mobiles.
- séquences d’insertions
- transposons
- bougent au sein d’une même chromosome
Qu’est-ce qu’un transposon?
- séquence qui code pour une transposase
- code aussi pour séquences palindromiques
- reconnait les mêmes séquences palindromiques partout dans le génome
- bouge suivant le modèle coupé/collé
