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Chapitre 1: introduction Flashcards

1
Q

Expliquez brièvement les postulats de Kock.

A
  • les même micro-organisme sont présents dans chaque cas de maladie
  • ils sont isolés depuis les tissus d’un animal mort et une culture purifiée est préparée
  • cette culture est inoculée dans l’animal vivant
  • la maladie se reproduit
  • on retrouve les mêmes micro-organismes
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Q

Vrai/faux

Les bactéries datent d’il y a 3,5 milliards d’années.

A

Vrai

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3
Q

Où les retrouve-t-on?

A
  • 60% biomasse terretre
  • ubiquitaires
  • flore humaine (10 fois plus que nos cellules! 1-3% masse totale du corps)
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4
Q

Vrai/Faux
Il existe plus de 4000 espèces de bactéries décrites dont plus d’un milliers commensales humaines, ayant une diversité moléculaire supérieure à celle des eucaryotes.

A

Vrai

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5
Q

De combien de gènes le génome bactérien est-il constitué?

A

1000 à 5000 gènes/bactérie

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6
Q

Quelle est la fréquence de mutation dans une bactérie?

A

1 cellule par 10^6x temps de doublement (20 min)

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7
Q

Quelle proportion d’échange génétique y a-t-il chez les bactéries?

A

15 à 30% des gènes sont étrangers (empruntés à d’autres espèces)

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8
Q

Qu’est-ce que la métagénomique?

A

Science qui étudie le contenu génétique d’un échantillon issu d’un environnement naturel complexe

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9
Q

Qu’est-ce que la microbiote?

A

Ensemble micro-organismes vivant dans un environnement spécifique

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10
Q

Qu’est-ce que le microbiome?

A

Ensemble de l’environnement en tant qu’habitat fonctionnel qui inclut les microorganismes, génomes..

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11
Q

Qu’est-ce que le métagénome?

A

Somme du matériel génétique encodé par l’ensemble des organismes présent dans cet environnement

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12
Q

Comment fait-on le microbiome humain?

A
  • séquençage des microbiotes (oral, cutané, vaginal..)

- 300 personnes saines

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13
Q

Vrai/faux

On recense environ 5000 espèces au total qui constitue le microbiome humain.

A

Faux, 10 000 espèces

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14
Q

Comment les bactéries perçoivent le monde qui l’entoure?

A

Système de transduction de signaux à 2 composants = antennes sensibles aux changement du milieu

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15
Q

Comment les bactéries communiquent?

A
  • Via des phéromones
  • lactones
  • perception de la densité de population
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16
Q

Comment les bactéries réagissent?

A
  • mobilité (flagelle)
  • protection: biofilm
  • adaptation rapide (stress): hypermutation
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17
Q

Quelles sont les caractéristiques principales des bactéries?

A
  • 1/10 um
  • nucléoïde: pas de véritable noyau
  • ADN circulaire avec des protéines HU pour eubactéries
  • pas de mtc
  • pas de chloroplastes
  • organisation en cellules isolées
  • division simple
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18
Q

De quoi est composée la paroi cellulaire?

A
  • peptidoglycanes (chaînes glucidiques)

- N acétyl-glucosamine (NAG) et N acétyl-muramique (NAM) lié à un tetra-peptide

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19
Q

Qu’est-ce que le super méga-génome?

A

Totalise la somme de tous les gènes et de toutes les infos génétiques connues

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20
Q

De quoi est composé la classe des procaryotes?

A
  • archées

- bactéries

21
Q

Comment se fait la synthèse de la paroi?

A
  • dans le cytoplasme: une enzyme passe N-acétyl et penta-peptide de l’autre côté de la membrane en faisant un flap
  • à l’extérieur (ou périplasme si gram-): transglycosylation, lien glucide glucide

-transpeptidation par PBP (cibles antibiotiques): lien
=>direct chez gram -
=>penta-glycine chez gram+

22
Q

De quoi est composée l’enveloppe des bactéries Gram+ ?

A
  • mb plasmique
  • peptidoglycane (90% masse)
  • ac.téichoïque: régulent entretien peptidoglycane
  • ac.lipoteichoÏque (ancre paroi dans mb, facteur virulence ++, active complément)
  • protéines de surface (dans muréine)
23
Q

De quoi est composée l’enveloppe des bactéries Gram- ?

A
  • mb plasmique
  • peptidoglycane (5/20% enveloppe)
  • espace périplasmique
  • mb externe
  • lipopolysaccharide
  • lipoprotéines de Braun (ancre mb externe)
  • OMP
  • systèmes de sécrétion transpariétal
24
Q

Qu’est-ce que le lipopolysaccharide (LPS)?

A
  • facteur de virulence important
  • composé de lipide A qui est une endotoxine très puissante et active le complément
  • antigène O: chaîne polysaccharidique
25
Qu'est-ce que l'OMP (outer membrane protein)?
- OmpA: ancre mb externe - protéines de surface - porines (OmpF ou OmpC)f
26
Comment se fait la sécrétion chez les gram+?
- ABC transport - sortase couplée à des ATPases - reconnaissance des protéines : Sec (pas encore de structure 3D) et PAT
27
Comment se fait la sécrétion chez les gram- ?
- ABC transporteurs lié à OMP (porines) avec un canal appelé MPF - Sec et PAT couplés avec des sécrétines
28
Décrire les pompes de types I et II chez les gram -
- sécrétions extra-cellulaire | - transports de petites molécules: ions, médicaments.., protéines de petites tailles
29
Décrire les pompes de types III et IV appelés injectosomes. | Donnez un exemple.
-molécules effectrices injectées directement dans les cellules cibles - complexes "aiguilles" - interaction entre molécule sensorielle et récepteur de cellules cibles -ouverture d'un canal sécrétoire avec formation d'un pore dans une cellule cible -transfert de molécules directement dans cytosol de la cellule cible => type III salmonella, shigella, yersinia => type IV helicobacter pylori
30
Citez quelques structures facultatives chez les bactéries.
- flagelle (antigène H) - capsule (antigène K) - pili/fimbriae
31
De quoi est composé le flagelle?
- cylindre creux+crochet - anneaux fixé au LPS - moteur à hélice actionné par une pompe à ions, tourne dans les 2 sens - ressemble à sécrétion type 3 à 4 anneaux)
32
Quelle est la vitesse du flagelle?
60x longueur propre de la bactérie/sec
33
Qu'est-ce qu'une bactérie monotriche?antitriche?
- monotriche: un flagelle | - antitriche: 2 flagelles
34
Qu'est-ce qu'un lophotriche (spirochètes)?
- flagelle dans espace périplasique | - structure spiralée
35
Quelles sont les caractéristiques du pili?
- nature protéique - pas de rotation - surtout gram - - ancré dans la mb externe ou dans les 2 mb - adhésion à la cellule hôte - facteurs de virulence très importants - mouvement de glissement => différent du pilus sexuel!
36
Quelles sont les caractéristiques du glycocalyx ou capsule ?
- nature polysaccharidique - gram - et + - considéré comme un facteur de virulence - protection de la phagocytose, desiccation, phages et détergents - antigénique - impliquée dans l'adhésion - très dense, difficile à colorer (halo autour)
37
Qu'est-ce qu'un spore?
- formes persistante d'une cellule végétative - paroi épaisse - faible teneur en H20 - résistance élevée aux agents chimiques et physiques - végétatif en milieu favorable => bacillus, clostridium
38
Comment est formé le spore?
- division cellulaire asymétrique - septum entre spore et soeur - pré-spore: spore englobé dans la bicouche - couche de peptidoglycane autour pré-spore - puis couche peptique débarrassée de son eau - sporange entre en apoptose et libère le spore
39
Comment fait-on la coloration des grams?
- échantillon fixé à l'alcool - 1ère coloration - décoloration - recoloration - cristal violet dans le gram (+ et -) - traitement à l'iodine, complexe avec cristal => piégé dans cellule - décoloration avec l'alcool
40
Comment différencie-t-on les gram + et - dans la coloration?
-décoloration ne marche pas chez gram + car très grosse paroi -gram - seront décolorés car petite couche => recoloration avec safarin => gram - de couleur différente
41
Quelles sont les bactéries qui font exceptions au Gram?
- clamydias - mollicutes - mycobactéries
42
Pourquoi les clamydias sont une exception?
- pas de peptidoglycanes - ne prennent pas le gram - limite bactérie/virus
43
Pourquoi les mollicutes sont une exception ?
- pas de paroi - déformables - ne prennent pas le gram
44
Pourquoi les mycobactéries sont une exception?
- paroi épaisse et résistance - ne se colore pas à la coloration avec le cristal violet - coloration à chaud avec fuchsine, puis acide fort puis éthanol puis bleu deMeth - apparaît rose sur fond bleu
45
Quelles sont les différentes morphologies des bactéries?
-coques (amas, chaînettes) =>staphylocoque -bacilles droites => streptocoque -bacilles incurvés (gram- seulement)
46
Vrai/faux | Les actinomycètes sont des bactéries.
Vrai
47
Quelles sont les 4 types de croissance selon l'atmosphère?
- aérobie strict - aéro-anaérobie (peuvent choisir) - anaérobie strict: s'éloignent de l'oxygène - micro-aérobie: un peu d'O2 mais pas trop
48
Comment mettre en évidence des streptocoques?
Type d'hémolyse - B hémolytiques: digère tout - A hémolytique : digestion partielle - G: absence d'hémolyse
49
Comment différencier le streptocoque doré et blanc?
Chercher la présence de coagulase

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