Chap 7 - Noyau & organisation génomique Flashcards
Connaître les principales structures du noyau et leurs fonctions
- Enveloppe nucléaire:
- -bicouche lipidique
- -en continuité avec le RER
- -composé de filaments intermédiaires de lamine qui tapisse l’intérieur; lame nucléaire (forme un treillis rigide, par filament intermédiaire lamine A,B,C, donne la forme ronde du noyau)
- Pore nucléaire: transport cytoplasme-noyau
- -import: protéine résidente noyau grâce peptide signal (NLS)
- -transport dépend importine (karyophérine) qui se lie au cargo et intéragie aek filament du pore
- -dissociation du cargo de la karyophérine et le retour de la karyophérine au cytoplasme requiert prot-G monomérique (ran GTPase)
- Nucléole: fabrication ribosome
- Régions denses (hétérochromatine; empacté, non codante) et claires (euchromatine; comprend gène)
- Nucléoplasme: partie soluble
- Matrice nucléaire: réseau fibrillaire qui structure chromatine
Comprendre le rôle des pores nucléaires.
Pore nucléaire: transport cytoplasme-noyau
- -import: protéine résidente noyau grâce peptide signal (NLS)
- -transport dépend importine (karyophérine) qui se lie au cargo et intéragie aek filament du pore
- -dissociation du cargo de la karyophérine et le retour de la karyophérine au cytoplasme requiert prot-G monomérique (ran GTPase)
Expliquer la structure d’une molécule monocaténaire d’ADN (base, sucre, phosphate et orientation 5’-phosphate et 3’-OH.
Polymère de phosphate, sucre et base azoté (adénine, thymine, guanine, cytosine)
De 5’ vers 3’
Phosphate en 5’
OH en 3’
lien phosphodiester entre les nucléotides
Pouvoir schématiser et expliquer la structure d’une molécule d’ADN bicaténaire (deux brins).
Appariement complémentaire des bases A:T C:G par lien hydrogène (non-covalent) A:T 2 lien C:G 3 lien
sillon mineur et majeur
Brin antiparallèle
Connaître le dogme central de la biologie moléculaire.
ADN –> transcription –> ARN –> traduction –> protéine
Connaître les caractéristiques du code génétique
5’ vers 2’
Base lu en triplet
Codon d’initiation et d’arrêt
64 codons, 20 acides aminés
Code dégénéré= plusieurs codon codent pour le même acide aminé
le code est universel
Traduit par le ribosome à partir de l’ARNm en utilisant l’ARNt
Quel sont les codons d’initiation et d’arrêt?
Initiation : ATG; methionine
Stop: TAA, TAG, TGA
Qu’est-ce qu’une séquence codante?
La partie de séquence qui encode la protéine, commence par codon start, continue avec une série de codon et fini par un codon stop
Facile à trouver lorsque nous avons l’ARNm et savons quel protéine est encodé
Possible de prédire les séquence codantes à partir de l’ARNm (cadre de lecture ouvert ORF; voit pas de met ni de fin)
Sur ADN 6 possibilité de cadre de lecture, car ORF peuvent être sur un des deux brins toujours en 5’ vers 3’
Connaître la structure générale des gènes procaryotes.
Structure simple: promoteur, séquence codante, terminateur
gène ayant fonction similaire (ou même voie métabolique) assemblé en opéron
ADN circulaire double brin
Connaître la structure générale des gènes eucaryotes et la fonction des différents éléments.
Séquence codante divisé en plusieurs sections: exon séparé par des régions non-codante: intron
Élément régulateur: Promoteur, élément proximaux et distaux (enhancer)
Élément régulateur distaux peuvent se trouver en amont ou en aval
ARN subi une maturation où les introns sont retirés, les exons collés ensemble (épissage ; alternatif quand pour un gène plusieurs ARN et protéine différente)
(Ajout d’un cap P en 5’ et d’un queue poly-A en 3’)
ARNm contient la séquence codante pour la protéine
Élément régulateur détermine quand le gène devient actif (transcrit en ARN) et détermine l’intensité d’activation, reconnus par des facteurs de transcription
Comprendre la structure du génome eucaryote et connaître les différents éléments qui le composent.
ADN double brin linéaire
23 paires de chromosomes donc 46 molec d’ADN
Promoteur pour chaque gène; pas en opéron
1.5% ADN encode pour protéine seulement
(26% intron, 8-20% élément régulateur, 40-50% séquence répété)
Séquence répété non-codante:
-En tandem:
–Satellite: répétitions de taille 60pb à 2-3 kpb (exemple centromère)
–Minisatellite: 6-60pb (exemple télomère)
–Microsatellite: 2-5 pb partout dans génome
-Dispersée:
–élément transposable (transposon)
–LINE (long interspersed nuclear element) 6000pb contient gène codant pour transposase
–SINE (short interspersed nuclear element) 500pb des milion dans génome
Comprendre le fonctionnement des transposons et les
mécanismes de transposition
Élément transposable ont la capacité de se repliquer dans le génome <> génomique
- Couper/coller: excision du transposon, et entre dans une autre section du gène
- Copier/coller: rétrotransposon, transcription par RNA polymérase, renverse la transcription pour donner ADN simple brin et converti en ADN double brin. La réplique vient rentrer dans une autre section du gène
Connaître les niveaux d’empaquetage de l’ADN dans la chromatine. ADN nu, octamères d’histones, fibres de 30 nm, chromosomes.
ADN embobiné dans une structure avec des histones.
Assemblage d’ADN avec 8 histones (octamère) forme le nucléosome(unité de base) compaction successive de la chromatine donne les chromosome
(bouge dans un espace restreint)
Euchromatine: moins dense, contient ADN avec beaucoup de gène actif
Hétérochromatine: plus dense, contient moins de gène, en périphérie du noyau
Connaître la structure d’un nucléosome.
4 histones de base essentielles à la structure: H2A, H2B, H3, H4 en paire donc 8 au total
Extrémité des histones non-structuré et débordent de la structure (plateforme d’interaction modifiable)
Histone accessoire: H1, servant à la contraction, s’associe au point d’entré/sortie de l’ADN et stabilise les brin
Connaître la structure du chromosome métaphasique (après réplication de l’ADN et entrée en mitose).
État de compaction ultime, arrive seulement lors division
Chromatine forme des boucles ancrées à un échafaudage protéique
Chromosome sont une structure compact, qui facilitent la ségrégation lors de la division
46 chromosomes en 23 paires dont 22 autosomes et 1 sexuel XY mâle, XX femelle
Structure:
-2 chromatides soeurs identiques
-donc 2 molec d’ADN
-Attaché ensemble par le centromère
-Extrémité protégé par des télomères
