Biologie molécuaire 1 (examen 2) Flashcards
Vrai ou Faux: à l’exception de quelques virus, l’ADN est le support de l’info génétique
Vrai, il renferme toutes les infos héréditaire d’un individu
Qu’est-ce qu’un gène?
Segment d’ADN contenant l’info génétique nécessaire à la fabrication d’une protéine ou d’un ARN
Chaque espèce vivant a son propre ensemble de gènes
Qu’est-ce qu’un génome?
C’est l’ensemble du matériel génétique chez un individu
Contient tous les gènes codant pour des protéines correspondant à des ARN de structure
Comment se nomme la science qui étudie le génome?
La génomique
Vrai ou Faux: la taille du génome augmente avec la compléxité des organismes
Vrai, les organismes pluricellulaires ont un génome de taille plus grande
Combien de paires de bases contient le génome humaine?
Plus de 3,4 milliards de paires
Définir ce qu’est un chromosome?
Forme compacte de l’ADN
Vrai ou Faux: pour pouvoir contenir toute l’information génétique, l’ADN doit être +++ compacté
Vrai
Vrai ou Faux: le nombre de chromosome est le même pour tous les individus d’une même espèce?
Vrai, mais ce nombre peut varier d’une espèce à l’autre
Comment sont les chromosomes des eucaryotes?
Linéaires
Comment sont les chromosomes des procaryotes?
Circulaires
Vrai ou Faux: les humains sont des organismes haploïdes et les bactéries sont des organismes diploïdes
Faux, c’est le contraire
Décrivez le génome bactérien
les bactéries ont un seul chromosome qui contient tous les gènes essentiels à la survie de la bactérie
Vrai ou Faux: certaines bactéries peuvent aussi avoir de l’ADN extrachromosomique
Vrai, ce sont des plasmides
Décrire les plasmides en 3 points
1) extrêmement plus petits que les chromosomes
2) transportent des gènes non essentiels à la bactérie mais qui lui apporte un certain avantage (résistance aux antibio)
3) les plasmides peuvent être transférés d’une bactérie à l’autre
Vrai ou Faux: puisque les bactéries sont asexuées, elles n’ont pas de manière d’échanger leur matériel génétique
Faux, les plasmides permettent l’échange de matériel chez les organismes asexués
Définir: génotype
Ensemble des gènes qui concernent le développement d’un attribut observé chez un système biologique
ex: brun/bleu pour la couleur des yeux
Définir: phénotype
Un trait observable chez un individu
ex: j’ai les yeux bruns
De quoi est constitué l’ADN
de nucléotide
De quoi sont formés les nucléotides?
ils sont formés par la liaison d’un sucre, d’une base azotée et d’1 à 3 groupements phosphate
Quel sucre forme l’ADN ?
désoxyribonucléotides qui vont ensuite former les acides désoxyribonucléiques
Quel sucre forme l’ARN?
ribonucléotides qui vont former les acides ribonucléiques
Quels sont les 4 bases azotées qu’on retrouve dans l’ADN
Adénine
Guanine
Thymine
Cytosine
Quels sont les 4 bases azotées qu’on retrouve dans l’ARN
Adénine
Guanine
Uracile
Cytosine
Quels sont les 2 types de bases azotées?
Les pyrimidines : cytosine, thymine, uracile
Les purines : adénine et guanine
Vrai ou Faux: on retrouve principalement l’uracile dans l’ARN
Vrai
A-U
C-G
Vrai ou Faux: on retrouve principalement la thymine dans l’ADN
Vrai
A-T
C-G
Sur quoi repose la diversité génétique, si les bases azotées sont les mêmes pour toutes les espèces?
Sur l’odre /la séquence des nucléotides dans la chaine polynucléotidique
Décrire l’ADN
- bicaténaire
- formé de 2 brins antiparallèles, complémentaires et différents
Vrai ou Faux: dans l’ADN ou l’ARN, les bases azotées de deux chaines sont associées entre elles par des liaisons covalentes
Faux, c’est par des liens H
Vrai ou Faux: dans l’ADN, chaque adénine d’un brin est liée à une thymine par 2 liens H
Vrai
Vrai ou Faux: dans l’ADN, chaque guanine d’un brin est lié à une cytosine via 3 liens H
Vrai
Qu’est-ce que les règles de Chargaff?
Dans l’ADN:
chaque adénine va se lier à une thymine et chaque cytosine va se lier à une guanine
Dans l’ARN:
chaque adéninde va se lier à un uracile
chaque cytosine va se lier à une guanine
Est-il vrai de dire que la liaison C-G est plus forte que la liaison A-T dans l’ADN?
Oui, car la liaison C-G est retenue par 3 liens H, alors que la liaison A-T est reliée seulement que par 2 liens H
L’appariement est plus fort pour les C-G
Vrai ou Faux: la complémentarité des bases azotées facilite la réplication
Vrai
Le clonage décrit 2 phénomènes distincts quels sont-ils?
1) c’est la multiplication identique d’un être vivant
2) c’est l’inversion d’un fragment d’ADN dans une cellule (clonage moléculaire)
Qu’est-ce que le clonage moléculaire?
C’est lorsqu’on va inverser un fragment d’ADN dans une molécule d’ADN “porteuse” pour ensuite l’introduire dans une cellule hôte
Quelles sont les utilités du clonage moléculaire?
En recherche: pour étudier la fonction des gènes et des protéines. On peut aussi surproduire une protéine en clonant le gène codant
Qu’est-ce que la biologie synthétique?
C’est lorsqu’on utilise le clonage moléculaire pour obtenir de nouvelles protéines ou de nouvelles molécules qui n’existent pas dans la nature
Qu’est-ce qu’une expression homologue?
Cela implique l’expression d’un gène chez une espèce qui le possède déjà naturellement (endogène)
Le donneur et le receveur sont de la même espèce
Qu’est-ce qu’un expression hétérologue?
L’expression d’un gène chez un organisme qui ne le possède pas naturellement (exogène)
Vrai ou Faux: l’insuline comme on la connaissait autre fois est un exemple d’expression homologue?
Faux, l’insuline autrefois venait du porc, c’était donc une expression hétérologue
Qu’est-ce que des vecteurs de clonage?
Ce sont des outils précieux en biologie moléculaire. Ils dérivent des plasmides naturels
Quelles sont les portions essentielles à la réplication qui sont conservés dans un vecteur de clonage?
- origine de réplication
- marqueur de sélection
- sites reconnus par des enzymes de restriction
Qu’est-ce qu’une nucélase?
C’est une enzyme qui coupe l’ADN
Quels sont les 2 types de nucléase?
1) endonucléase : lorsque l’enzyme coupe à l’intérieur de la chaine
2) exonucléase: lorsque l’enzyme coupe à l’une des extrémités d’un ADN linéaire
Qu’est-ce qu’un palindrome?
Une séquence d’ADN qu’on peut lire dans les deux sens
ex: TTTT n’est pas un palindrome, sa complémentarité est AAAA
GAATTC est un palindrome car une fois lié aux bases complémentaire on le lit encore GAATTC
Qu’est-ce qu’un extrémité cohésive?
C’est une extrémité se terminant par une portion simple brin
Qu’est-ce qu’une extrémité franche?
Lorsque l’extrémité générée est double brin
Quelle est la fonction de la ligase?
C’est une enzyme qui catalyse la formation du lien phosphodiester
Quelles sont les limites du clonage conventionnel?
- il utilise plusieurs enzymes de restrictions et c’est parfois difficile de trouver une enzyme de restriction qui coupe le vecteur ET l’ADN au même endroit
- aucun site de restriction ne doit être présent dans le gène d’intérêt ou dans une région importante à la fonction du vecteur
Comment peut-on faire pour confirmer les clones?
On vérifie leur profil de restriction
Qu’est-ce que le profil de restriction?
C’est la taille des fragments obtenus lorsqu’on coupe le plasmide avec différents enzymes de restriction
Quels sont les différents facteurs qui affectent l’efficacité de la digestion?
- concentration de l’enzyme et du tampon
- température d’incubation
- présence d’impuretés dans la préparation de l’ADN
- concentration des différents sels
Qu’arrive-t-il si l’ADN est très concentré?
Cela donne un mélange visqueux
Apporte une diminution de la diffusion dans le mélange et cela rend les sites de restrictions moins accessibles
Pourquoi est-il important de ne pas vortexer les réacifs? (2 raisons)
Car le vortex entraine la formation de mousse puisque le tampon contient du SDS (un détergent)
Car, le vortex provoque le bris mécanique de l’ADN
Décrire le procédé de l’électrophorèse
C’est un procédé qui permet la séparation de molécules chargées présentes dans un mélange selon leur vitesse de migration dans un champ électrique
Quelles sont les 3 composantes principales de l’électrophoèse?
1) une chambre branchée à une source de courant
2) un support
3) un tampon
Si on veut séparer de l’ADN, quel support devons-nous utiliser?
de l’agarose
Quel support allons-nous utiliser si on désire séparer des molécules (autre que de l’ADN) par électrophorèse?
Le polyacrylamide
Quel est le rôle du tampon dans une électrophoèse?
- il maintient le pH des échantillons
- c’est une source d’électrolytes
De quoi dépend la migration lors d’une électrophorèse?
1) la charge
2) la masse moléculaire
3) la forme
Vrai ou Faux: la plupart du temps, lors d’une électrophorèse on veut faire migrer des molécules selon leur masse moléculaire, c’est pourquoi on uniformise la charge et la forme
Vrai
Une fois la charge et la forme uniformisées, qu’utilisons-nous pour séparer les molécules selon leur masse moléculaire
On utilise des gels (servent de tamis moléculaires)
Comment va être le passage de petites molécules VS les grosses molécules lors d’une électrophoèse?
Les petites molécules vont se faufiler plus rapidement
Les grosses molécules vont être contraintes à plus de résistance
De quoi est composé le gel d’agarose utilisé lors de l’électrophorèse de l’ADN?
agar-agar purifié qui lui est extrait des algues rouges
La vitesse de migration de l’ADN sur l’électrophorèse dépend de plusieurs facteurs mais pas le charge. Pourquoi?
Car pour une molécule d’ADN, le ratio charge/masse est toujours constant
Quelle est la charge de l’ADN à un pH plus grand que 7
Négatif
Pourquoi le tampon TAE est-il utilisé dans une électrophorèse d’ADN
Car il permet de maintenir le pH autour de 8
Comment va migrer un plasmide circulaire surencoulé lors d’une électrophorèse?
il va migrer rapidement
Comment va migrer un plasmide linéaire lors d’une électrophorèse?
il va prendre plus de place donc migrer lentement
Pourquoi est-il important de coloré l’ADN dans une électrophorèse sur gel?
pour qu’il puisse être visualisé
Quelle est la méthode la plus conventionnelle pour la coloration de l’ADN?
la coloration au bromure d’éthidium
Décrire le bromure d’éthidium
- c’est un agent intercalant (s’insère entre 2 bases azotées à l’intérieur de la double hélice de l’ADN)
- il est très toxique
Qu’est-ce qu’une carte de restriction?
C’est un schéma qui représente les sites de restriction présents sur le plasmide ou le fragment d’ADN
