Aula 5 - Classificação de Proteínas e Folding

Question 1

Como se podem classificar as proteínas?

Answer 1

globulares (maioria) e fibrosas

Question 2

Dê exemplos de proteínas fibrosas

Answer 2

colagénio, queratina e fibroína

Question 3

Como são constituídas as proteínas globulares?

Answer 3

por diferentes domínios (hidrofóbico e hidrofílico)

Question 4

Quais as características das proteínas globulares?

Answer 4

folhas beta e hélices alfa são ligadas entre si por voltas ou loops

exterior hidrófilo
interior hidrófobo

podemos traçar um círculo à volta, tem raio hidrodinâmico

Question 5

Quais as proteínas de exceção que têm o interior hidrofílico e um exterior hidrófobo?

Answer 5

as proteínas da membrana para não serem excluídas da membrana

Question 6

Quais as características das proteínas fibrosas?

Answer 6

não apresentam domínios

estruturas repetidas da mesma estrutura secundária

hidrofóbicos pois formam agregados (cabelo, unhas)

Question 7

Quais as ligações estabilizadoras presentes nas queratinas?

Answer 7

ligações covalentes dissulfureto

Question 8

Como se sintetizam as queratinas?

Answer 8

hélice alfa associam-se e formam protofilamentos e de seguida protofibrilas

Question 9

Quais as principais características do colagénio?

Answer 9

NÃO É hélice alfa (porque não tem 2,6 resíduos por volta)

enrolamento para a esquerda

3 resíduos por volta (glicina, prolina e hidroxiprolina)

existe nos tendões e na cartilagem

Question 10

Quais as principais características da fibroína?

Answer 10

folha beta

empacotamento das folhas formando camadas

estrutura forte, com ligações de H e van der walls

existe na sede e nas teias de aranha

Question 11

As modificações pós tarducionais são efetuadas por enzimas específicas em resíduos específicos. Que PTM existem?

Answer 11

acetilação
glisolição
hidroxilação
metilação
fosforilação
ubuiquitação
sumoilação

Question 12

O que ocorre na glicosilação? Qual a vantagem?

Answer 12

adição de açucares

estabiliza e permite solubilidade

Question 13

O que ocorre na lipoilação? Qual a vantagem?

Answer 13

adição ácidos gordos

ancoragem de proteínas globulares à membrana

Question 14

O que entende por folding proteico?

Answer 14

processo espontâneo através do qual uma cadeia linear adquire estrutura tridimensional. fica no estado nativo

Question 15

Qual a vantagem do folding?

Answer 15

mais estabilidade termodinâmica

Question 16

O folding só ocorre se:

Answer 16

a energia livre de gibbs for negativa

Question 17

Quais os fatores contra o folding?

Answer 17

aumento da ordenação da cadeia logo entropia negativa

ligações covalentes e não covalentes no interior da proteína que a estabilizam

Question 18

Qual o fator maioritário a favor do folding?

Answer 18

o nível de ordenação da água diminui e a entropia é negativa

Question 19

As proteínas são estáveis?

Answer 19

a estabilidade conformacional das proteínas é muito baixa

qualquer alteração ao meio ambiente quebra estabilidade e no tubo de ensaio passa do estado nativo para o desnaturado

Question 20

Quais as teorias que existem em relação ao folding?

Answer 20

Hipótese termodinâmica
Paradoxo de Levinthal
Teoria Cinética
Paisagem de Energia

Question 21

O que diz a hipótese termodinâmica?

Answer 21

o estado nativo corresponde ao estado termodinamicamente mais estável

Question 22

O que diz o Paradoxo de Levinthal?

Answer 22

é um processo termodinâmico porque adquire a estrutura termodinamicamente mais estável e cinético porque não é aleatório, segue várias vias

corresponde ao estado de energia mínima

Question 23

O que diz a teoria cinética?

Answer 23

O estado nativo não é adquirido de forma aleatória. Mais do que um processo termodinâmico é um processo cinético

Question 24

O que diz a Paisagem de Energia?

Answer 24

O folding ocorre através de um número de passos ou vias definidos pois uma proteína não experimentará todas as possibilidades conformacionais até encontrar a via adequada