Aula 4 - Estrutura Proteínas

Question 1

Quais os níveis de organização estrutural de uma cadeia polipéptídica?

Answer 1

estrutura primária, secundária, terciária e quaternária

Question 2

Como se dispõe a estrutura primária?

Answer 2

sequência de aminoácidos

Question 3

Como se dispõe a estrutura secundária?

Answer 3

arranjos específicos em pequenas regiões (localmente) devido a angulos de torção favoráveis

Question 4

Como se dispõe a estrutura terciária?

Answer 4

arranjo organizado dos elementos da estrutura secundária

Question 5

Como se dispõe a estrutura quaternária?

Answer 5

arranjo espacial das diferentes estruturas terciárias

Question 6

Quais os arranjos específicos da estrutura secundária?

Answer 6

hélice alfa, cadeia beta e voltas ou loops

Question 7

O que é um random coil?

Answer 7

é algo que se forma na estrutura secundária aleatoriamente e que não tem uma forma específica

Question 8

Quando se forma a hélice alfa?

Answer 8

quando resíduos de aminoácidos consecutivos têm angulos phi e psi de -60 e -50 e há zonas alternadas rigidas da ligação peptídica e zonas de mobilidade

Question 9

Quais as características da hélice alfa?

Answer 9

os grupos R estão orientados para fora da hélice (de modo a grupos R possam interagir com grupos R de outra hélice)

enrolamento para a direita

3,6 resíduos por volta

extremidades polares

resíduos hidrófilos orientados para o exterior

Question 10

Existem mais hélices sem ser alfa?

Answer 10

Sim. Hélice pi (+ condensada) e hélice 3.10 (+ larga)

Question 11

Quando se formam cadeias beta?

Answer 11

quando resíduos de aminoácidos consecutivos têm angulos phi e psi de -140 e 130

Question 12

Quais as características das cadeias beta?

Answer 12

grupos R orientados para fora da cadeia em direções opostas (não há interações)

cada cadeia tem 5-10 aminoácidos

Question 13

Como se formam folhas beta?

Answer 13

Quando cadeias beta se encontram perto uma da outra e têm tendência a associar-se com pontes de hidrogénio

Question 14

Qual a diferença entre cadeia beta anti-paralela e paralela?

Answer 14

antiparalela - as cadeias beta associam-se anti paralellamente e as pontes de hidrogénio mais curtas e paralelas entre si

paralela- associam-se de forma paralela, as pontes de hidrogénio estão mais longas. É mais instável

Question 15

Quais as características das voltas ou loops?

Answer 15

alteram a direção da cadeia polipéptidica

aminoácidos preferenciais (glicina por ser pequena e prolina por estar em cis)

Question 16

Como é baseada a classificação das voltas?

Answer 16

número de aminoácidos que constituem as voltas, podendo ser mais apertadas ou mais largas

Question 17

Quais as voltas ou loops mais comuns?

Answer 17

voltas beta (4 aminoácidos) e voltas gama

Question 18

Como resulta a estrutura terciária?

Answer 18

arranjo dos elementos da estrutura secundária

Question 19

O que são motivos/estrutura suprasecundária?

Answer 19

combinações de 2 a 4 estruturas secundárias sucessivas que contactam entre si com um arranjo geométrico específico e que estão normalmente associados a uma função

Question 20

Dê exemplos de estruturas supra-secundárias

Answer 20

zinc finger (liga-se ao DNA) ou hélice hoop hélice

Question 21

O que são domínios?

Answer 21

são semelhantes às estruturas suprasecundárias só que em vez de terem apenas 2-4 estruturas secundárias têm muito mais e estão associados a uma função específica

Question 22

Quais os domínios que existem?

Answer 22

alfa e beta e todas as combinações que podem haver com alfa e beta

Question 23

Todas as proteínas têm estrutura:

Answer 23

primária, secundária e terciária

Question 24

Como se forma a estrutura quaternária?

Answer 24

quando se associam 2 ou mais cadeias polipeptídicas/subunidades

Question 25

O que é uma proteína monomérica?

Answer 25

Proteína que tem 1 subunidade/cadeia polipeptídica, logo não apresenta estrutura quaternária

Question 26

O que é uma proteína multimérica?

Answer 26

Proteína que tem 2 ou mais subunidades/cadeias polipeptídicas, logo apresenta estrutura quaternária

Question 27

Dentro das proteínas multiméricas, o que é uma proteína homomérica?

Answer 27

subunidades iguais entre si

Question 28

Dentro das proteínas multiméricas, o que é uma proteína heteromérica?

Answer 28

subunidades diferentes entre si

Question 29

As proteínas homoméricas e heteroméricas podem ainda ser classificadas de acordo:

Answer 29

com os eixos de simetria

Question 30

Quais as forças que estabilizam a estrutura das proteínas?

Answer 30

ligações não covalentes (interações iónicas ou pontes salinas, pontes H, forças de van der walls e interações hidrófobas) e ligações covalente (pontes de enxofre)

Question 31

Quando se formam pontes salinas?

Answer 31

estabelcem-se quando um resíduo carregado positivamente (base) está perto de um aminoácido carregado negativamente (ácido)

Question 32

O que significa uma ligação ser intracaternária?

Answer 32

ligação dentro da cadeia polipeptídica

Question 33

Como ocorre a formação de pontes de enxofre?

Answer 33

oxidação cisteína forma ponte dissulfureto

Question 34

As pontes de enxofre são ligações fortes?

Answer 34

Não é muito forte, se estiver num ambiente redutor facilmente é reduzida