Aula 3 - Ligação Peptídica Flashcards
Cada grupo ionizável apresenta quantos pk?
1 pk
Cada aminoácido apresenta pelo menos quantos pk?
pelo menos 2 pk
aminoácidos com grupos R ionizáveis têm quantos pks?
3
aminoácidos com grupos R não ionizáveis têm quantos pks?
2
O que é a ligação peptídica?
É a reação entre o grupo carboxilo de um aminoácido e o grupo amina do aminoácido seguinte
Quais as características da ligação peptídica?
É covalente, tem carácter de dupla ligação, é co-planar (está sempre no mesmo plano), logo dá rígidez
Na ligação peptídica qual a configuração mais frequente (cis ou trans)?
trans (os carbonos alfa estão em lados opostos do plano)
Qual é o aminoácido exceção em que a configuração mais frequente não é em trans, mas sim em cis?
prolina
O angulo phi é entre que átomos/grupos?
carbono alfa e grupo amina
O angulo psi é entre que átomos/grupos?
carbono alfa e carbono grupo carboxílico
Os angulos phi e psi ou de torsão variam entre que valores?
180 a -180
Os angulos de torsão podem tomar qualquer valor dentro do intervalo de 180 a -180?
não é possível tomarem todos os valores, podem existir impedimentos estéricos, dependendo do tamanho do grupo R do aminoácido
O que são os gráficos ramachandran?
Gráficos que têm os valores permitidos para phi e psi
Como se lêm estes gráficos?
zonas escuras são permitidas, zonas claras é menos favorável
O que é a cadeia polipéptidica?
vários aminoácidos ligados entre si por ligações peptídicas
Como se inicia a cadeia polipeptídica?
Com um grupo alfa amina livre (N-terminal)
Como termina a cadeia polipéptídica?
Com um grupo carboxílico livre (C-terminal)
O que dá a conformação à proteína?
Zonas de mobilidade alternadas com zonas de rigidez (ligação peptídica no mesmo plano)
Qual a diferença entre péptido e proteína?
péptido- cadeia polipeptídica com 50-100 aminoácidos
proteína- cadeia polipeptídica com mais de 100 aminoácidos
A massa molecular é expressa em que unidade?
Daltons ou KD
Ao formar a ligação peptídica o que se perde?
1 molécula de água
As proteínas são constituídas por uma ou várias cadeias polipéptidicas. Estas cadeias são iguais ou diferentes?
As cadeias podem ser iguais ou diferentes entre si
Como se faz a nomenclatura de uma cadeia polipéptidica?
todos os resíduos de aminoácidos terminam em il exceto o último (C-terminal)
Dê exemplos de péptidos
oxitocina e insulina (hormonas)
A que comprimento de onda absorve a ligação peptídica?
Normalmente a 220 (mas pode estar entre 190-230 nm)
A que comprimento de onda asborvem os aminoácidos não polares aromáticos?
a fenilalanina, a tirosina e o triptofano absorvem a 280 nm
