2.1 - Microbio 7 (Virus - Biologie et Classification) Flashcards
Quelles sont les 5 grosses caractéristiques des virus?
1) Ils ne sont pas considérés vivants.
2) Ils sont des parasites intracellulaires obligatoires.
3) Ils sont incapables de synthétiser des protéines ou produire de l’énergie par eux-mêmes (en dehors d’une ¢) (besoin de la machinerie des ¢).
4) Les virus ont une taille beaucoup plus petite que les bacétries : 18 à 300 nanomètres (non visibles au microscope optique).
5) Ils peuvent infecter les insectes, les poissons, les plantes, les reptiles, les mammifères et les bactéries (bactériophages).
Comment nomme-t-on la particule virale d’un virus?
Virion.
De quoi est composé un virion?
D’un génome viral entouré d’une capside et parfois d’une enveloppe.
De quoi est composé le génome viral?
Soit d’ADN ou d’ARN.
MAIS PAS LES DEUX.
Qu’est-ce que les virus entourés d’une enveloppe ont en particulier?
- Composante interne (protéines virales).
- Composante externe (composante lipidique).
- +/- des spikes (glycoprotéines).
Qu’est-ce qu’un virus nu?
Un virion sans enveloppe.
(Mais quand même une capside et un génome)
Quelle forme peut prendre le génome des virus?
Linéaire.
Circulaire.
Segmenté. (La grippe)
Simple ou double brin.
Quelle forme peut prendre le virus?
Icosaèdre.
Sphérique.
Filamenteuse.
Balle de fusil.
Bal de fusil en haut à droite.
Comment se fait la réplication virale?
6 étapes
1) **Attachement** : protéine d'attachement sur le virus + récepteur sur la ¢.
2) **Pénétration du virus dans la ¢**.
3) **Décapsidation** : on enlève la capside pour libérer le contenu intérieur du virus qui est celui pouvant agir.
4) **Transcripton et réplication** : on fait une copie du génome.
5) **Assemblage** : on reprend les morceaux, on refait la capside, et après le virus peut sortir de la ¢ une fois qu'il est reconstruit.
6) **Libération** : une fois qu'il sort de la ¢, la ¢ n,est plus en forme et souvent les dommages ne surviennet pas jusqu'à la sortie.
*N.B. : Pour s'attacher, il faut que le virus ait une clé qui va s’adapter à une serrure. La serrure est au niveau de la ¢ qu’il va infecter. Ça fait en sorte que si le virus a une clé qui ne lui permet que de rentrer dans une ¢ épithéliale, c’est le seul endroit où on va pouvoir attraper le virus. Cette clé qui permet de rentrer dans une ¢ peuvent varier d’un virus à l’autre. *
Où se répliquent les virus ARN?
Dans le cytoplasme.
Où se répliquent les virus ADN?
Dans le noyau.
Qu’est-ce qu’un rétrovirus?
- Ce sont des virus ARN.
- Ils possèdent une transcriptase inverse qui permet de produire un brin d’ADN à partir de l’ARN viral.
- Cet ADN viral peut être intégré à l’ADN de la ¢ ce qui met le virus à l’abri du système immunitaire.
*En gros, permet au virus de faire un copie d’ADN à partir de l’ADN viral. Cette ADN peut ensuite être intégrée dans le génome de la ¢ humain qu’il infecte. C’est une des raisons pour laquelle on est pas prêt de trouver un traitement de guérison pour le VIH. Quand on a un virus qui s’intègre dans le génome humain, c’est beaucoup plus compliqué. *
Exemples de rétrovirus
VIH, HTLV-I, HTLV-II
Quels sont les hôtes possibles des virus?
- Animal (humain, souris, oiseau).
- Plantes.
- Bactéries.
Oui, une bactérie peut être hôte d’un virus.
Classer les virus suivant en fonction de nu/enveloppé et ADN/ARN : Virus hépatite C, Herpesviridae, Virus de la rougeole, Hépatite B, Adénovirus, Virus de l’hépatite A, Parvovirus B19, Virus de l’influenza, Astrovirus, Virus des oreillons, Coronavirus, Entérovirus, Virus respiratoire syncytial, Rhinovirus, Virus papillome humain, Rotavirus, Virus de la rubéole, Calicivirus, VIH.
Ce virus est-il nu ou enveloppé?
Nu.
Ce virus est-il nu ou enveloppé?
Enveloppé.
On voit un peu des spikes/délimitation plus claire pour l’enveloppe.
Quelles sont les 4 caractéristiques des virus nus? (fragile ou résistant, libéré quand, transmission et survie où?)
- Résistants : - température. - à des détergents. - à la sécheresse. - à l’acide. (SAUF RHINOVIRUS)
- Sont libérés de la cellule lors de la lyse cellulaire.
- Transmission par contact direct et indirect, gouttelettes.
- Bonne survie dans l’environnement et dans le tractus digestif.
Bref, quand t’es capable d’être nu c’est pcq t’es fait fort.
Quelles sont les caractéristiques des virus enveloppés?
- Fragiles aux conditions adverses de l’environnement.
- Facilement détruits par l’acidité gastrique.
- Transmission surtout par contact direct ou par gouttelettes.
- Libérés de la cellule hôte soit par bourgeonnement ou lors de la lyse cellulaire.
Enveloppé = robe = princesse = fragiles.
V ou F : certains virus sont cultivables en laboratoire, d’autres non? on les cultives où?
VRAI.
On les cultive dans des ¢ et non des géloses
Mais certains sont un peu des deux (à cause de leurs différents sérotypes).
Quel est le nom pour les virus transmis par les arthropodes?
ARBOVIRUS (arthropod-borne virus).
Exemples de symptômes de virus exanthémateux.
Un patient se pointe à l’urgence avec une éruption de type rougeur, quels pourraient êtres les virus dont il est atteint?
HHV-6 = human herpes virus 6.
Quelles sont les 4 outils diagnostiques disponibles pour les infections virales? Laquelle de ces 4 n’est plus utilisées depuis la pandémie de la COVID-19 dans les laboratoires hospitaliers?
1) La culture virale.
2) La détection d’antigènes viraux.
3) Les tests d’amplification d’acides nucléiques (TAAN).
4) La sérologie virale.
C’est la culture virale qui n’est plus utilisée.
Comment fonctionne un antigène viral?
Dans ce cas-ci, le patient aurait l’influenza A.
Pour quel virus allons-nous prendre un échantillon du nez/nasopharynx/gorge en recherche d’antigène?
SRAS-CoV-2 (COVID-19).
Quels sont les avantages et désavantages de TAAN?
Avantages :
- Applicable à beaucoup de virus (mais pas tous).
- Rapide (< 24h).
Désavantages :
- $$$.
- Personnel spécialisé (technicien, biologiste moléculaire).
- Pas disponibles dans tous les labos hospitaliers.
OVERALL, TECHNIQUE EST DE + EN + UTILISÉE.
Qu’est-ce que la sérologie virale?
Recherche d’anticorps (ou d’antigène) dans le sérum des patients.
Quels anticorps apparaissent les premiers face à un agent viral et combien de temps restent-ils dans le système? Quels apparaissent les derniers et combien de temps restent-ils dans le système?
IgM apparaissent les premiers mais sont présents de façon transitoire.
IgG apparaissent un peu plus tardivement mais persistent après la guérison.
Quels sont les virus pour lesquels une sérologie IgM est dispo dans les laboratoires hospitaliers?
IgM = infection récente
