življenski cikel proteinov Flashcards
translacija
smer ribosoma
bralni okvir
ribosom potuje po mRNA v smeri 5’→3’
vsako zaporedje 3 bralne okvirje
odprt bralni okvir ORF
začne se z Mat, konča z STOP
aminokislina + ATO + tRNA + H2O → aminocil-tRNA + AMP + 2P
potek translacije
INICIACIJA
ribosom prepozna začetno mesto na mRNA
vezava mRNA s 30s podenoto→ kompleks z IF-1 in IF-3
hidroliza GTP: sprostitev IF, sestava s 50s → 70s
ELONGACIJA, 3 stopnje, hidroliza 2GTP
1. vezava aminocil-tRNA, pozicionira na mesto A, hidroliza GTP
2. tvorba peptidne vezi
3. translokacija: t-RNA premakne na mesto P (hidroliza GTP), ribosom premakne proti 3’, mesto A prosto
TERMINACIJA
stop kodon→ veže se sprostitveni faktor RF
RF hidrolizira cepitev esterske vezi med COOH na proteinu in tRNA
usmerjanje proteinov prokarionti
signalno zaporedje na N koncu
usmerjanje proteinov evkarionti
v jedro
v mitohondrij
v membrane
v ER
usmerjanje transmembranskih
-v jedro:
preko jedrnih por, proteini amportin alfa in beta, signal (Arg, Lys se ne odstrani)
-v mitohondrij:
N končni signal: amfifilna alfa vijačnica, receptorji na membrani mitohondrija
kompleks TOM za vnos proteinov, SAM: pravilno zvitje, TIM: vnos v matriks
signalno zap. po vstopu v matriks odcepi
-v membrane:
sintetizirajo na ER, N-končen signalni peptid
ob prehodu skozi membrano se peptid odcepi
-v ER
SRP delci, z eno enoto veže na signalno zaporedje z drugo na ribosom
SRP receptor protein usmeri skozi translokacijski kompleks
-transmembranski proteini
poleg signala še dodatna stop-signalna zaporedja
topni proteini vsebujejo le N končen signal, se v celoti prenesejo v lumen
razgradnja proteinov
endocitirani: razgradnja v liposomih
zunajcelični proteini: razgradnja v proteasomu (predhodno označeni z ubikvitinom)
ubikvitin= protein s 7Lys, povezuje se s tarčnimi proteini
proteasom: 26 podenot, osrednji del v obliki sodčka
izražanje genov E. coli
tri tipi regulatornih elementov:
-sigma enote RNA polimeraze
prepozna promotor
-represorji: proteini, ki se vežejo na specifična zaporedja znotraj promotorskih regij, te regije so operoni
-aktivatorji: vežejo v bližino promotorske regije
regulatorni proteini
prileganje z velikim žlebom (ugodne H vezi)
motivi za vezavo na DNA:
-vijačnica-zavoj-vijačnica, represoe lac, veliki žleb
-motiv cinkovega prsta Cys in His vezavno mesto za Zn, veliki žleb
-motiv levcinske zadrge Lys in Arg, alfa vujačnica
