Week 5 (ADN Mitochondrial)

Question 1

Que sont de mitochondries et que font-elles ?

Answer 1

Se sont des organelles dans une cellules qui éffectuent les réactions biochimiques productrices de l’énergie, apoptose, synthèse de l’hème, l’homéostasie du calcium.
Il y en a 100-1000 par cellule et chaqu’une contient une dizaine de copies d’ADN

Question 2

Combien de copies d’ADN mitochondrial sont dans chaque cellule ?

Answer 2

entre 1000 à 10000 copies d’ADN par cellule

Question 3

Qu’est la structure et les caractéristiques de l’ADNmt ?

Answer 3

• l’ADNmt est circulaire (moins sensible aux dégradations)
• Contient peu d’ADN non codant
• Pas de séquences répétitives
• Contient un polymorphisme de séquence “D-Loop”/ région de contrôle de 1100 nucléotides de long
• Un taux de mutations 10 fois plus haut que les STR autosomaux
• Longueur totale de 16569pb

Question 4

Que sont les deux parties de la région de contrôle de l’ADNmt ?

Answer 4

• HV1 longueur: 342pb (16,023-16365)
• HV2 longueur: 268pb (73-340)

Question 5

Qu’est la théorie endosymbiotique de la mitochondrie ?

Answer 5

C’est la théorie que la mitochondrie serait une cellule procaryote capturée par les cellules eucaryotes primitives il y a 1.5 milliards d’années

Question 6

Comment se reproduisent les mitochondrie ?

Answer 6

À partir d’une mitochondrie déjà existante, en doublant sa masse et en se scindant en deux avant la division cellulaire

Question 7

D’ou vient l’ADN mitochondrial ?

Answer 7

De la mère

Question 8

Comment ce fait l’analyse de l’ADNmt ?

Answer 8

En séquençant la région HV1 et HV2. Chaque nucléotide à un numéro.

Question 9

Comment se fait le séquençage de l’ADNmt ? Et quelle est le nom de la méthode de séquençage ?

Answer 9

Lors de la PCR on utilise des didésoxyribonucléotides colorés qui terminent la synthèse des gènes à des nucléotides spécifiques. Ces bouts sont ensuite séparés par électrophorèse capillaire puis identifier par la diffraction que produit le marker lumineu. On peu ensuite regarder sur le chromatograph.

Le séquençage de Sanger

Question 10

Comment peut-on comparer l’ADNmt séquencer ?

Answer 10

Avec la séquence standard / d’Anderson. La Cambridge Reference Sequence (CRS)

Question 11

Que sont les types de polymorphysmes de séquences retrouvés dans l’ADNmt et comment sont-ils désignés ?

Answer 11

• SNP, ex: 16311C [position][nucléotide différent]
• Insertions, ex: 16311.C [position].[nucléotide insérée]
• Délétions , ex: 16311D [position]D pour délétion

Le nucléotide inséré ne compte pas dans les numéros de position

Question 12

Qu’est qu’un Haplotype ?

Answer 12

c’est un seul chromosome qui ne recombine pas

Question 13

Quel pourcentage de séquences n’ont que été observé une seule fois parmi des milliers de personnes ?

Answer 13

80%

Question 14

Quand on compare la séquence de deux individus on trouves en moyenne combien de différences ?

Answer 14

en moyenne 8 nucléotides de différences soit 4 différences pour chacune des zones HV1 et HV2

Question 15

Dans quelle population y’a-t-il plus de différences dans l’ADNmt?

Answer 15

la population noire

Question 16

Est-ce que les profils d’ADNmt sont contenus dans les bases de données de la police ?

Answer 16

NON

Question 17

Qu’est la hétéroplasmie ?

Answer 17

C’est la présence de plusieurs types de génome d’ADNmt dans une cellule ou un individu

Question 18

Dans combien d’individus est-ce que l’hétéroplasmie présent ?

Answer 18

environ 6% des individus

Question 19

L’hétéroplasmie dans un échantillon peux augmenter quoi ?

Answer 19

la valeur probante

Question 20

Quand on voit deux nucléotides confondues dans un chromatograph à quoi doit-on penser ?

Answer 20

Un mélange/ contamination
l’hétérosplasmie est très rare.

Question 21

Que sont les cas d’utilisation de l’ADNmt ?

Answer 21

Cas ou les échantillion sont vieux, en mauvais état ou dégradés

Question 22

Que sont des traces biologiques utiliser pour l’analyse de l’ADNmt ?

Answer 22

• Les os
• Les dents
• les cheveux ou poils