Virologie Flashcards
Première cause infectieuse de mortalité et de morbidité au niveau mondial
Virus
Nommer quelques exemples d’infections virales.
Grippe espagnole, Grippe porcine (AH1N1, 2009) – Variole – Rage – Poliomyélite – VIH/SIDA – EBOLA – Zika – COVID-19 – Grippe aviaire – Variole simienne
Nommer deux méthodes pour détecter les virus.
Microscopie électronique
Biologie moléculaire
Infection faisant 50-100millions de décès. Plusieurs déclinaisons au fil du temps
Grippe
Nommer des épidémies virales récentes.
-SRAS (2002 et 2012)
- AH1N1 (2009)
-Rougole (2011)
- Ébola mars 2014
-virus Zika 2016
- Covid 19
30% de mortalité, éradiquée 1979, mais nouvelle souche
Variole
Paralysie flasque septembre 2022, couvertures vaccinales basses
Poliomyélite
IMP: V ou F: Le virus est capable de se répliquer sans une cellule-hôte.
FAUX
Comment décrire relation virus-hôte.
Parasite intracellulaire obligatoire
Utilise les constituants cellulaires pour se répliquer
Peut introduire du matériel génétique viral dans les cellules et les transformer
Taille des virus
Entre 40 et 400 nm
Organisation très simple
Comment s’appelle la forme libre du virus?
Virion / particule virale
V ou F: Les virus peuvent infecter toutes formes de vie.
Vrai
Virus infectant les bactéries
Bactériophage
Classification classique: Les premières classifications virologiques ont été basées sur des caractéristiques primaires et faciles à étudier:
-tropisme pour organe/tissu
-vecteur
Comment se fait la classification moderne?
-type d’acide nucléique
-stratégie de réplication
-type de capside
-absence ou présence d’une enveloppe lipidique
Structure protéique qui entoure l’acide nucléique.
Capside
Comment se nomme l’ensemble du capside
Nucléocapside
V ou F: La capside contribue à la forme du virus
Vrai
V ou F: Tous les virus ont une capside.
Faux, certains oui, certains nus
De quoi est constituée l’enveloppe du virus? (2)
-D’éléments de la cellule hôte
-de protéines virales
V ou F: Les virus nus sont plus fragiles que les virus enveloppés.
Faux!
Entre le virus nu et enveloppé, lequel Ne résistent pas beaucoup aux détergents et aux
conditions extérieures (température, humidité, etc..)
Virus enveloppés
Lequel entre virus nu et enveloppé est préférentiellement transmis par contact direct et
intime (comme le virus de l’herpès ou du VIH).
Enveloppé
Entre virus enveloppé et nu, lequel est habituellement plus résistant, ex: diarhée (norovirus, rotavirus)
Virus nus
V ou F: les virus peuvent contenir à la fois de l’ADN et de l’ARN.
Faux! Jamais les deux, un ou l’autre
V ou F: les virus peuvent avoir un ADN simple brin ou double brin
Vrai! ADN Peut aussi être linéaire ou circulaire, +/-
IMP: quelles sont les 7 étapes du cycle viral des virus?
- Attachement (récepteurs)
- Pénétration cellulaire
- Décapsidation (libère acide nucléique)
- Réplication du génome viral
- Synthèse des protéines virales
- Assemblage et encapsidation des particules virales produites
- Libération des virions
Quand on a le VIH, on meurt de quoi?
Infections opportunistes quand CD4 était bas
Nommer les étapes du cycle du VIH. (Voir p.36)
- Attachement
- Pénétration
- Décapsidation
- Transcription réverse et intégration
- Traduction
- Assemblage
- Bourgeonnement
- Libération
VIH virus à ADN ou ARN?
ARN
Lors de l’attachement du VIH, il y a liaison d’une … à son récepteur cellulaire spécifique.
Protéine de surfsce virale
L’assemblage et l’encapsidation sont généralement limité dans une portion de la cellule.
Inclusion virale
Que permet l’inclusion virale?
• Permet d’obtenir une concentration très élevée localisée
– Protéines virales pour la capside
– Acides nucléiques virales
• Protège les composantes virales du système immunitaire
Lors de la libération des virions, quels sont 3 mécanismes utilisés?
-mort cellulaire
-bourgeonnement à partir de la membrane
-exocytose
Nommer des cibles thérapeutiques dans le cycle viral (3).
Polymérases, protéases, neuraminidases
Nommer des mécanismes pour traiter moins spécifiques.
Interferon alpha, imiquimod
- Ac monoclonaux: interfère avec la signalisation et récepteurs de replication
Interaction entre le virus et l’hôte dans une série d’étapes pour conduire à la maladie
Pathogénèse
De quoi (2) dépend le tropisme viral?
• Récepteur qui permet l’attachement • Élément génétique qui favorise l’expression des gènes viraux qui
peuvent être spécifiques à certains tissus
Au niveau de la pathogenèse, quels sont 3 facteurs de l’hôte?
-statut immunitaire
-infection peut-être banale pour un patient, mais mortelle
pour un autre
-femme enceinte et foetus
Pourquoi il faut prendre au serieux une fievre si enceinte?
Car 50% du SI pas toi donc dangereux quand fievre
Quelles sont les étapes de la pathogenèse?
-Entrée
-réplication locale
-dissémination
- tropisme tissulaire
-2e réplication tissulaire
-dommage cellulaire
-réponse immunitaire
Comment peut se faire l’exposition d’un hôte susceptible au virus?
-aérosols
-gouttelettes
-percutanée
-verticale (mère-foetus)
Nommer quelques virus transmis par voie aérienne
Variole, Covid, rougeole
Nommer quelques virus transmis par gouttelettes
Influenza, covid, variole simienne, adénovirus
Nommer quelques virus transmis par voie fécale-orale
Norovirus, rotavirus, hepatites A,E
Nommer quelques virus transmis par voie percutanee (seringue, sang) (pas par contact peau a peau)
VIH, hépatite B, C
Nommer quelques virus transmis par les muqueuses
VPH, hépatite B, variole simienne, VIH
Nommer quelques virus transmis par voie trans-plancentaire.
CMV, parvovirus, rubéole, Zika
Nommer quelques virus transmis par arbovirus
Dengue, zika, occidental, virus du Nil, etc
Pourquoi la détection des virus au lab est compliquée?
Microorganismes excessivement petits – Impossible de les cultiver dans des milieux
artificiels – Nécessitent des cellules vivantes: expertise, coûts,
risque de transmission – Certains virus ne se cultivent pas (ex: hépatite C)
ou sont trop virulents (SARS-CoV), Ébola)
À quel moment le prélèvement doit être fait?
Le plus tôt possible au début de la maladie
Technique de référence permettant identification sommaire, moins utilisé
Microscopie électronique
Quels sont les avantages et désavantages de la détection antigénique avec enzyme immunoassay? (Test covid, influenza, etc)
Avantages:
– Rapide et facile d’utilisation
– Peu coûteux
• Désavantages:
– Moins sensible, et moins
spécifique
Détection antigénique nécessitant expertise supérieure à EIA? Pour herpes, et autres virus respiratoires
Immunofluorescence
était la pierre angulaire dans les laboratoires de
virologie
Culture cellulaire
Technique Maintenant proscrit dans les laboratoires cliniques
à cause du SARS-Co-V-2
Culture cellulaire
Techniques d’amplification d’acides nucléiques (TAAN): ex:
PCR (polymerase chain reaction)
Biologie moléculaire
Quels sont les avantages de la technique de biologie cellulaire?
– Diagnostic viral plus rapide
– Méthodes spécifiques
– Multiplex : Possibilité de détecter plusieurs virus dans un
même prélèvement et une même réaction
• Quantitatif: lorsque la charge virale est requise pour le suivi du
traitement Ex: charge virale VIH, VHB, VHC, CMV, EBV • Qualitatif: Ex: Influenza, SARS-CoV-2, RSV
Pourquoi le quantitatif en bio mol est essentiel pour VIH?
Si certains nombre de copies et moins, patient peut avoir des relations sexuelles non protégées
Qu’est-ce que la technique PCR?
Cycle de chauffage pour amplifier jusqu’à l’atteinte d’un plateau
Courbe p.65
Quels sont les principaux désavantages de la biologie cellulaire?
• Très sensible à la contamination
– Exemple: un technicien avec une grippe pourrait
sortir de nombreux tests positifs pour la grippe si il contamine les réactifs
– Peut demeurer positif après un traitement
efficace: détection de matériel génétique viable ou non (Chlamydia et gonorrhée…)
• Personnel avec expertise
• Coûteux
Détecte la réponse immunitaire suite à une infection
Sérologie
consistent à identifier les
anticorps du patient dirigés contre des virus connus
Tests sérologiques
Les IgM et les IgG permettent habituellement de
différencier entre une infection récente (?..) vs
ancienne (?..)
Récente = IgM
Ancienne = IgG
Quels sont les avantages de la sérologie?
– Seule méthode pour diagnostiquer certaines infections
– Assez simple à instaurer
– Trace les infections antérieures du patient et permet un traitement prophylactique dans certains cas (VZV, CMV…)
Quels sont les désavantages de la sérologie?
– Expertise nécessaire
– Diagnostic tardif (patient souvent traité avant l’obtention
du résultat) – Interférence possible avec d’autres infections (flavivirus:
VNO, Dengue…) – Demeure positive même si le patient a été traité
En pratique comment le diagnostic et le traitement se déroulent?
- Diagnostic clinique
- Si nécessaire et si traitement antiviral requis:
confirmation du diagnostic
o Test rapide en cabinet
o Laboratoire milieu hospitalier: biologie
moléculaire, culture virale (cessée x 2020), sérologie - Début/modification du traitement
(si nécessaire)
IMP! P.73 Quelles sont les différentes manifestations cliniques quand virus?
• Asymptomatique
• Syndrome viral (non spécifique)
– Fièvre ± prolongée
– Diminution de l’état général
• Atteintes d’organes
- SNC, voies respiratoires, foie, gastro-intestinaux, peau
• Syndrome de l’immunodéficience humaine acquise (SIDA) – Effet indirect causé par l’atteinte du système immunitaire
(lymphocyte CD4): infections opportunistes
Quels sont les 3 types de persommes ayant asymptomatique ou syndrome viral?
-hôte immunocompétent
-hôte immunosupprimés
-femmes enceintes
Quand consulter?
Dépend de l’ÉTAT GÉNÉRAL (tjrs écrire dans une note) du patient
-caractéristiques de l’hôte infecté
-symptomes
-risques de transmission
Fièvre combien de degrés
38,3 degrés
Quelle est la famille de l’influenza A, B, C
Orthomyxoviridae
Quelles sous types d’influenza sont retrouvé chez l’humain?
H1, H2, H3,
N1, N2
Comment se transmet l’influenza?
Gouttelettes (toux, éternuements, parole), aérosols, contacts humains
et surfaces inanimées – Taux d’attaque variable (10-40%)
• Réplication muqueuses respiratoires
supérieures – Incubation: 1-4j
Quand est la période de contagiosité de l’influenza?
24h avant les symptômes➝ durant la période symptomatique➝24h
après le dernier jour de fièvre ou 7j total
Prolonger chez les enfants immunosupprimés
Comment l’influenza se présente en clinique?
Syndrome d’allure grippale (SAG): Début abrupt,
fièvre+ toux + 1 de:
– Mal de gorge – Arthralgie/myalgie – ou prostration/fatigue extrême
• Difficilement distinguable des autres infections virales
– Toux : jusqu’à 2 semaines – Fatigue : jusqu’à 1 mois
(VRS, COVID-19) • Présentations atypiques: Personnes âgées et jeunes
enfants • Durée des symptômes: 5 à 7 jours
Quelles sont les possibles complications de l’influenza?
• Pneumonie virale • Surinfection bactérienne • Complications cardiaques • Myocardite, péricardite • Myosite • Atteinte SNC
– SGB, encéphalopathie • Décès
Donner des exemples de traitements pour l’influenza.
Oseltamivir (Tamiflu©): PO – Zanamivir (Relenza©): inhalations (5mg/dose), IV (Rx de
compassion) – Peramivir IV (Rapivab©)
Quelle est l’efficacité d’un traitement contre l’influenza?
Administré dans les <36h suivant le début des
symptômes:
– 30-40% réduction de la durée, sévérité et toux
prolongée
Réduit fréquence des complications et de
l’utilisation des antibiotiques et des
hospitalisations
Qui devrait être traité contre l’influenza?
• Infection nécessitant hospitalisation • Maladie progressive, sévère, ou compliquée
sans égard à la condition de santé sous-
jacente • Patients à risque de complication
– Femme enceinte et ad 2 sem post partum • <48h suivant le début des symptômes
idéalement
Pourquoi vacciner contre l’influenza?
Fardeau associé à l’influenza
l’influenza au Québec, CIQ 2018)
• Variations dans les sous types d’influenza
circulant • Variations antigéniques HA et NA (Influenza A) • Faible durée de l’immunité vaccinale (diminution
de 7%/mois post vaccination)
– hospitalisations attribuables dont 80% chez des
personnes avec maladie chronique (enquête sur le fardeau de – décès (90% chez ≥75 ans)
-variations dans les sous types d’influenza à chaque année
-variations antigéniques HA et NA
-faible durée de l’immunité vaccinale
Qu’est-ce qu’un vaccin en sous-unités?
Le vaccin est constitué de morceaux du microbe ou de ses toxines
Qu’est-ce qu’un vaccin vivant atténué?
Le microne est très magané mais juste assez fort pour que le vaccin soit efficace
Quelle est la différence entre rhume et la grippe?
Rhume moins grave et pas de vaccin
Grippe plus grave état général très moche et dangereux pour personnes a risque
Quelle est la famille et le genre de la covid
Famille: coronaviridae
Genre: coronavirus et torovirus
Quel est le mode de transmission de la covid?
Contact-gouttelettes:
Macro-gouttelettes (Toux, parole, rire..) dans un périmètre
de < 2 mètres (contact rapproché) – Contact direct
• Des sécrétions biologiques (sécrétions oro- et naso-pharyngées >
trachéales ) • Avec éclaboussures avec nos muqueuses (Yeux, nez bouche)
Contact indirect avec surfaces inanimées avec nos
MAINS qui touchent ensuite nos muqueuses , mais pas
directement par la peau
Quelle était la présentation clinique de la covid?
Période d’incubation: moyenne 5 jours ad 14 jours • Toux et fièvre plus fréquent • Anosmie, mal de gorge, myalgies • Diarrhées
Mortalité selon l’âge et comorbidité
Comment faire le diagnostic de la covid?
TAAN sur spécimen nasopharyngé, gorge,
(salive, gargarisme)
– Analyses moléculaires conventionnelles – Analyses rapides POC
• Tests antigéniques
– Moins sensible • Culture virale: LSPQ • Sérologie
Quels sont les traitements contre la COVID?
Dépend de la sévérité, des facteurs de risque de progression,
du stade de l’infection et du statut vaccinal
• ♀51 consulte son pharmacien pour des
conseils
– Fièvre T38, 5°C x 72h, toux et myalgies. Test pour
le Coronavirus nég à 2 reprises
• Infectieux/non infectieux? • Bactérien?/Viral? • Traitement/conseils?
Rien ! Va se résorbé par soi meme
♀51 consulte son pharmacien pour des
conseils
– Fièvre T38, 5°C x 72h, toux et myalgies – ATCD leucémie myéloide aigue, greffé il y a 6 mois
• Infectieux/non infectieux?
• Bactérien?/Viral?
• Traitement/conseils?
Envoyer directement à l’urgence
Famille du norovirus
Caliciviridae
Comment les norovirus sont transmis?
Personne-à-personne (fécale-orale), possiblement aérosols lors de
vomissements
Traitement du norovirus?
Hydratation, rien a faire
Un ami vous demande conseil:
– Sensation de brûlures depuis
4 jours – Rash apparu il y a 48 hrs – Aucun autre symptôme – 1ier épisode du genre
Fond rouge avec picots
Zona
Herpesviridiae combien d’espèce?
– 1: Herpes labial
– 2: Herpes génital
– 3: Varicelle et zona
– 4: EBV, mononucléose infectieuse
– 5: CMV
– 6 et 7: Roséole
– 8: Sarcome de Kaposi
Virus à ADN ou ARN herpesviridae?
ADN: entrer en latence s’intègre au matériel dans cellules nerveuses et impossible de s’en débarrasser
Virus enveloppés ou nu herpesviridae
Enveloppé
Quels sont les 2 types d’herpes simplex?
VHS-1 et VHS-2
Traitement herpes simplex
Valacyclovir PO
Quel est le taux de mortalité de la Pétéchies sec à méningococcémie
100%
Varicella zoster virus transmission?
90% cas de varicelle surviennent <13 ans et 10% des >15 ans
sont susceptibles
• Transmission aérienne et infection via la muqueuse
respiratoire suivie d’une virémie
Quelle est la présentation clinique de la varicelle?
Fièvre, diminution de l’état général (DEG), anorexie – Rash maculopapulaire, vésicules sur base érythémateuse
• Présence de lésions d’âges différents est caractéristique – Croûtes apparaissent en 2-4 jrs et se résorbent complètement en 1-2 sem
Quelle est la différence entre les vésicules de la varicelle et variole?
Varicelles: vésicules pas du même âge et plus rouge et petites et croutes
Varioles grosses pustules du même âge
Quelles sont les complications de la varicelle?
• Infection du système nerveux central (SNC) • Encéphalite, ataxie cérébelleuse, accidents cérébraux vasculaires (ACV)
• Pneumonie
– 1/400 chez adultes – Ad 10-15% d’atteinte asymptomatique – Peut être mortelle en grossesse (2ième-3ième trimestre)
• Surinfection bactérienne
– Facteur de risque important d’infection à Streptocoque du groupe A
invasif avant la vaccination
• Syndrome de Reye
• Association Aspirine et varicelle • Encéphalite et insuffisance hépatique
Comment se nomme la réactivation de la varicelle?
Zona
Comment se manifeste le zona?
Latence au niveau des
ganglions sensitifs
– Réactivation le long du
nerf (unilatérale)
• Réactivation locale • Dissémination possible
• Vésicule sur base
érythémateuse sur le
trajet d’un nerf
Quelles sont les possibles complications du zona?
• Zona ophtalmique (atteinte de V1 )
• Urgence! Consultation ophtalmologie
• Kératite et nécrose rétinienne • Ramsay-Hunt
• Atteinte du ganglion géniculé du VIIe NC et extension au
VIIIe NC • Douleur et vésicules dans le canal auditif externe, perte du
goût 2/3 antérieur langue, paralysie faciale ipsilatérale
(possible tinnitus, hyperacousie)
• Atteinte branche mandibulaire du trijumeau
• Lésions palais, amygdales, plancher buccal, langue • Principale complication du zona
• Névralgie post-herpétique: 25-50% cas chez >50 ans
Comment se nomme le vaccin contre le zona?
Shingrix
Le Shingrix est quel type de vaccin?
Vaccin en sous-unités
Comment se présente la rougeole?
Toute la peau est atteinte, zone à côté des molaires hyper contagieux, la couverture vaccinale ne doit pas descendre sous 90%
Comment se présente le parvovirus (5e maladie)
Rash sur les joues, rash en dentelle rouge
Comment se présente le pied main bouche?
Pusules sur les mains, les pieds et la bouche
Virus transmis par l’intermédiaire d’arthropodes
(moustiques, tiques et phlébotomes)
Arboviroses
Quels sont les symptômes cliniques généraux des
Arboviroses?
Fièvre, myalgie, malaise, éruption
cutanée (Dengue, Chikungunya, Zika)
Encéphalite pour virus du Nil occidental
Atteinte néonatale : Zika
Arbovirose • Progression spectaculaire x 1980 • Récemment identifié aux USA (Floride, Hawaii)
Virus de la Dengue
Par quoi le virus de la Dengue est transmis?
Aedes aegypti : moustique
Quelle est la famille du virus de la Dengue
Flaviviridae
Quelles sont les manifestations cliniques de la Dengue classique?
Incubation 3-14 jours (5-8) • Asymptomatique ou • Fièvre Dengue classique:
– forte fièvre, pouvant (ad 41°C).
– myalgies et d’arthralgies intenses (breakbone fever), céphalées, de douleurs rétro-orbitaire
Quelles sont les manifestations de la Dengue hémorragique?
manifestation plus rare et plus sévère. Les facteurs de risques :l’âge, le
sérotype infectant, le statut immunitaire, ainsi qu’une prédisposition génétique.
– seconde infection avec un autre sérotype.
Comment diagnostic Dengue?
Détection de l’ARN viral dans le sérum ou LCR
– Détection IgM – Réaction croisée avec d’autres Flavivurs: ex:
Dengue
• Aucun traitement, vaccin disponible, mais pas
au Québec.
140
– Triplex: Zika, Dengue, Chikungunya – ≤ 10j après début des symptômes
• Sérologie
Famille des Poxviridae (variole humaine éradiquée x 1980 grâce à la
vaccination (30-50% mortalité et transmission aérienne) • Transmission: contact, gouttelettes, objets et surfaces contaminés • Période d’incubation: 5-21 jours
Variole simienne
Comment se présente la variole simienne cliniquement?
Clinique:
– Prodrome systémique: fièvre, céphalées, fatigue arthralgies et myalgies 1-
3j→Lésions cutanées (durée:1-4 semaines)
• Contagiosité: début symptômes jusqu’à la peau saine • Diagnostic: TAAN lésions cutanées, sang, sécrétions • Traitement:antiviral à l’étude (Tecovirimat, Cidofovir?)Vaccin
prophylactique post exposition et pour les personnes à risque
