Van DNA naar RNA naar eiwit

Question 1

1. Wat zijn structurele verschillen tussen DNA en RNA?

Answer 1

1. DNA is dubbelstrengs, RNA is enkelstrengs, uracil in RNA ipv thymine in DNA, ribose in RNA ipv deoxyribose in DNA -> DNA is stabieler want bij ribose zitten er 2 OH-groepen op elkaar wat soms splitst

Question 2

2. Wat is de richting van een DNA of RNA streng?

Answer 2

2. Van 5’ naar 3’

Question 3

3. Hoe lopen de strengen in een dubbele helix?

Answer 3

3. Anti-parallel

Question 4

4. Wat zijn de complementaire basen?

Answer 4

4. Cytosine en Guanine en Adenine en Thymine (Uracil in RNA)

Question 5

5. Waar codeert een enkel gen voor?

Answer 5

5. Een eiwit

Question 6

6. Hoe heet de omzet van DNA naar RNA?

Answer 6

6. Transcriptie

Question 7

7. Hoe heet de omzet van RNA naar een eiwit?

Answer 7

7. Translatie

Question 8

8. Hoeveel chromosomen hebben we per cel?

Answer 8

8. 23

Question 9

9. Waar bestaat een chromosoom uit? Hoeveel hebben we daarvan?

Answer 9

9. 2 DNA-strengen, 2x23=46

Question 10

10. Hoeveel genen zitten er ongeveer op een DNA-molecuul?

Answer 10

10. 30 000

Question 11

11. Waarom heeft mRNA 3 mogelijke leesramen?

Answer 11

11. Omdat het aflezen per 3 basen gaat, je kan dus op 3 verschillende plekken beginnen waardoor de triplet codes anders worden en er andere aminozuren gemaakt worden

Question 12

12. Wat bepaalt het juiste leesraam van mRNA?

Answer 12

12. Eerste AUG na 5’-uiteinde. Het 5’uiteinde van het mRNA wordt herkend door de kleine subunit van het ribosoom. Het ribosoom bindt aan het mRNA en loopt het af totdat het een AUG codon tegenkomt. Dit is het startcodon, waar de een grote subunit zich voegt aan het kleine. Vanaf dat moment kan het ribosoom (80S) langs het mRNA lopen en de eiwitsynthese uitvoeren totdat het een stopcodon (UAA, UGA, UAG) tegenkomt. Deze zorgt ervoor dat er ipv een nieuw aminozuur water wordt toegevoegd aan de polypeptide, waardoor die loskomt van het tRNA. De ribosomen vallen weer uit elkaar.

Question 13

16. Hoe worden de nucleotiden afgelezen?

Answer 13

16. Per 3 basen = codon / triplet

Question 14

17. Waar staat een triplet voor?

Answer 14

17. Een aminozuur

Question 15

18. Waar bestaat een nucleotide uit?

Answer 15

18. Fosfaatgroep, deoxyribose, stikstofbase

Question 16

19. Waardoor wordt de genetische code gelezen? Hoe is dat opgebouwd?

Answer 16

19. Transfer RNA = tRNA, met aan 1 kant een triplet (anticodon) dat complimentair en antiparallel kan baseparen met het bijbehorende codon en aan de andere kant een bij het anticodon horend aminozuur

Question 17

20. Wat betekent ribo-?

Answer 17

20. Dat er RNA in zit

Question 18

21. Wat betekent peptide?

Answer 18

21. Dat er een eiwit in zit

Question 19

22. Wat gebeurt er op de kleine en wat gebeurt er op de grote subunit van een ribosoom?

Answer 19

22. Op de kleine subunit van het tRNA bindt het mRNA en daar vindt dus decodering plaats (anticodon van tRNA matcht met codon op mRNA), op de grote subunit vindt de eiwitsynthese plaats, waar de peptideketen van aminozuren aan elkaar binden en het 2e aminozuur loskomt van het tRNA

Question 20

23. Wat is een andere naam voor de kleine subunit? En de grote? En samen / het volledige ribosoom?

Answer 20

23. 40S subunit, 60S subunit, het actieve 80S deeltje

Question 21

24. Wat zijn haploïde geslachtscellen?

Answer 21

24. Een cel die van elk chromosoom 1 expemplaar heeft

Question 22

25. Welk soort cellen zijn haploïd? Met welk proces worden ze gevormd uit diploïde cellen?

Answer 22

25. Geslachtscellen, meiose

Question 23

26. Wat is altijd het eerste aminozuur in een polypeptideketen? Wat gebeurt hiermee?

Answer 23

26. Methionine, het wordt er vaak afgeknipt

Question 24

27. Waar is de vouwing van het aminozuurketen nodig? Om er een functioneel eiwit van te maken

Answer 24

27. Om er een functioneel eiwit van te maken

Question 25

28. Wat houden post-translationele modificaties in?

Answer 25

28. Na de synthese, bijv. de verwijdering of verandering van aminozuren in de aminozuurketen

Question 26

29. Wat is eiwitsortering?

Answer 26

29. De transport van eiwitten naar het juiste celcompartiment

Question 27

30. Wat is het verschil tussen DNA-polymerase en RNA-polymerase?

Answer 27

30. DNA-polymerase wordt gebruikt bij de DNA-replicatie, terwijl RNA-polymerase wordt bij transcriptie voor het vormen van een eiwit

Question 28

31. Wat is het probleem wat betreft het beschermen van RNA in eukaryoten?

Answer 28

31. Omdat het RNA de celkern uitmoet voordat het bezet van worden door ribosomen, wat in prokaryoten wel direct kan gebeuren omdat alles daar in 1 compartiment gebeurd, moet het RNA een tijdje beschermd worden tegen RNA-afbrekers en tegen vervalling door onstabiliteit

Question 29

32. Wat is RNA processing? Waarvoor helpt het ook?

Answer 29

32. Een reeks van processen in de celkern om de kwaliteit van RNA te controleren voordat het getransporteerd kan worden. Het helpt ook voor de bescherming van RNA in de periode voordat het getransleerd kan worden

Question 30

33. Wat is het eerste onderdeel van de RNA processing?

Answer 30

33. Capping (het 5’-uiteinde wordt beschermd tegen afbraak doordat er een 7-methylguanosine-base aangezet wordt op zijn kop en doordat ook de de eerste 2 nucleotiden in de keten worden gemethyleerd)

Question 31

34. Op welke manier beschermt de cap tegen afbraak van het RNA door RNase?

Answer 31

34. Het 5’-uiteinde wordt bedekt waardoor de RNaseniet bij het beginpunt kan komen van waar hij de afbraak zou kunnen beginnen (5’)

Question 32

35. Wat is het tweede deel van de RNA processing? Hoe helpt dit tegen afbraak?

Answer 32

35. Tailing (=het geven van een staart) van het 3’-uiteinde door er een poly (A) staart aan te zetten (250 A’s). Dit helpt tegen afbraak doordat RNase dat vanaf het 3’-uiteinde eerst langs heel veel ‘lege’ nucleotiden moet komen voordat het de essentiële informatie kan afbreken

Question 33

36. Waar zorgt een poly-A signaal voor?

Answer 33

36. 30 nucleotiden verder wordt een knip aangebracht waar het 3’-uiteinde ontstaat. Daar word vervolgens de poly (A) staart aangemaakt

Question 34

37. Welke 2 dingen komen altijd mee met RNA-polymerase?

Answer 34

37. Het splitsende enzym poly-A signaal en een RNase, wat ervoor zorgt dat de nog even groeiende RNA-streng die gevormd wordt nadat het deel ervoor al is afgeknipt door het poly-A signaal afebroken wordt

Question 35

38. Wanneer stopt het RNA-polymerase?

Answer 35

38. Dat weten we niet, het valt er ergens gewoon af, terwijl het RNase de RNA-keten die het RNA-polymerase maakt afbreekt

Question 36

39. Wat is het derde deel van RNA processing?

Answer 36

39. Splicing = uit het primaire transcript (het product van het RNA-polymerase) worden stukken uitgeknipt. Het mRNA bestaat dus vergeleken met het DNA uit dezelfde sequence maar dan met vele verwijderingen. De korte stukjes die worden gehouden en in het mRNA komen zijn exonen, de langere stukjes die verwijderd worden zijn intronen. De functie van intronen is een grote vraag, prokaryoten hebben ze niet

Question 37

40. Wat is het vaste begin en uiteinde van een intron?

Answer 37

40. GT en AG

Question 38

41. Hoe wordt het mRNA gecontroleerd op goede splicing?

Answer 38

41. Op de plekken waar exonen aan elkaar hechten blijven eiwitcomplexen die controleerbaar zijn

Question 39

42. Wat zijn de 3 kenmerken van een transleerbaar stuk mRNA?

Answer 39

42. Een cap, een poly (A) staart en de eiwitcomplexen (exon-junction complexen)

Question 40

43. Wat gebeurt er met de cap en de staart?

Answer 40

43. Die worden naar elkaar gebracht door eiwitten en gevormd tot een complex dat de kleine ribosoom-unit kan herkennen

Question 41

44. Wat gebeurt er met het exon junction complex als de translatie bezig is? Waar leidt dit toe?

Answer 41

44. Het eiwitcomplex wordt van het mRNA gegooid op het moment dat het ribosoom er langs komt voor de translatie. Er onstaat een eiwitcomplex-loos stuk mRNA, waardoor het cap-staart complex veranderd. Hierdoor wordt de cap nog sterker herkenbaar voor ribosomen en vindt er bulktranslatie plaats. Er komen heel veel kopieën van het RNA doordat er ribosoom na ribosoom komt.

Question 42

45. Hoe verhoudt zich het aantal exonen tot het aantal intronen?

Answer 42

45. 1 exon meer dan aantal intronen, want het RNA product begint en eindigt altijd met een exon

Question 43

46. Wat zijn de functies van de 5’-cap en de poly(A) staart?

Answer 43

46. Bescherming tegen afbraak door RNase, herkenning door kleine subunit ribosoom, stabilisering, kwaliteitscontrole voordat het getransporteerd en getransleerd kan worden, efficiëntie (bulktranslatie)

Question 44

47. Wat is complementair aan 5’-CCAGAGTT-3’?

Answer 44

47. 5’-AACTCTGG-3’, want complementair wordt gevormd van 3’ naar 5’ + complementaire basen