UA3 Flashcards
Quel est le but de l’interprétation médicale
Caractériser l’origine physiopathologique d’une maladie (diagnostic)
Quels sont les 4 types de laboratoires (4 disciplines)
Biochimie
Hématologie
Microbiologie
Pathologie
Quel est la différence entre un signe et un symptôme
Un signe est ce que est observé par un médecin, incluant les résultats des analyses de laboratoires, alors qu’un symptôme est ce qui est observé par un patient
Les signes et symptômes combinés ensemble se nomment ____
Syndrome
On peut décortiquer l’exécution d’analyse en ____
Différents aspects
- Aspect pré-analytique
- Aspect analytique
- Aspect post-analytique
Qu’est-ce que l’aspect pré-analytique
C’est une classification des causes de la variabilité pré-analytique des résultats d’analyses de laboratoire, donc c’est avant l’exécution de l’analyse d’un biomarqueur sur un liquide biologique obtenu à partir d’un prélèvement
Quels sont les deux termes utilisés pour décrire la variabilité biologique
La variation biologique est donc une variation ____
- Variabilité intra-individuelle, qui fait que la même grandeur mesurée chez un sujet donné peut être soumise à des variations aléatoires
- La variabilité interindividuelle qui fait que cette même grandeur varie d’un individu à l’autre, et donc est imprévisible
Imprévisible
Dans les variabilités pré-analytique, avant le prélèvement, nommez les variations cycliques
La variation cyclique est donc une variation ____
- Ultradienne (Sécrétion épisodique; < 20h)
- Circadienne (1 jour)
- Infradienne(> 3 jours)
- Circanuelle (1 an plus ou moins 2 mois)
Prévisible
Quelles sont les variables relis au patient (Avant le prélèvement)
Exercice–> Modifie le taux de certains facteur ( Diminue fer, augmente LDH, Augmente CK, Augmente tropnine…)
Diète
Stress –> Stimulation des catécholamines et cortisol (fight or fligt)
Posture –> Augmentation des catécholamines, rénine et ADH
Alité –> Diminution des protéines et de l’albumine
Quelles sont les variabilités pendant le prélèvement (3)
Types d’échantillon
Contenant et additifs
technique de prélèvement
Nommez 3 Types d’échantillons
Sang
Urine ( fontaine d’information)
Liquides
Autres matrices telles les selles ou les expectorations
Le type d’échantillon tel le sang a 3 types d’échantillon, quels sont-ils ?
- Sang total = Présence d’un anticoagulant
- Plasma = Sang total en présence d’un anticoagulant
si centrifugé, alors il y a une fraction liquide ( plasma) et une fraction solide (cellules)
3. Sérum = sang total que l'on fait coaguler Centrifugation = fraction liquide (sérum sans les protéines de la coagulation) Fraction solide (Cellules et caillot)
Plasma utile pour les ___ ou les STAT; pas nécessaire d’attendre la coagulation
urgences
Variabilité pendant le prélèvement
Contenants et additifs
Nommez les anticoagulants
EDTA ( acide éthylènediaminetétraacétique)
Héparine de lithium
Citrate de sodium
Vrai ou Faux
Anticoagulants chélatent le calcium essentiel à la coagulation (formation du caillot)
VRAI
Nommez deux types de préservatifs, et deux types d’additifs
(préservatifs et additifs= importants dans la section contenant et additif de l’aspect pré-analytique, pendant le prélèvement)
Préservatif
- Fluorure de sodium (inhibiteur de la glycolyse)
- Hcl 6 N (préservatifs pour analyse urinaire)
Additifs
Gel séparateur
Activateur de la coagulation
Nommez les étapes de la technique de prélèvement
- Mettre des gants
2.Choisir une veine de gros calibre - Appliquer le garrot pour faire gonfler la veine en le serrant modérément (pour éviter les risques d’hémolyse)
(Note:Si la veine n’apparaît pas, demander au patient de serrer et de desserrer le poing, puis de le tenir fermé le moins longtemps possible (car risque d’hyperkaliémie)) - Désinfecter l’endroit de la ponction veineuse
- Tenir l’aiguille avec un angle de 30° et piquer à 1 cm au dessous de la saillie veineuse
- Desserrer le garrot (< 1 minute car risque d’hémolyse)
- Remplir les tubes adéquatement
- Assurer une bonne identification des tubes immédiatement
Vrai ou faux
La moitié des erreurs se produisent lors du choix de contenant et additifs
FAUX
La moitié des erreurs se produisent lors du prélèvement
Quelles sont les conséquences d’une hémolyse
L’hémolyse cause la destruction des globules rouges et donc, cause des interférences analytiques in vico et in vitro
Pré-analytiques
Quelles sont les variabilités après les prélèvement (3)
Transport
Prétraitement
Entreposage
Deux choses principales peuvent affecter le transport, quelles sont-elles ?
- Le délai
(Commissionnaire, service de courrier, système de capsules envoyées par pneumatique) - Température
(Glacière, chaud et froid)
Note: Taxi en cas de transport urgent la nuit
Nommez un effet d’une mauvaise conservation des échantillons
Chez le nouveau-né la glycémie est plus basse, l’effet de la mauvaise conservation est importante (fausse hypoglycémie)
Glucose, à 25 degré = diminution de 0.6 mmol/L/heure
Gaz sanguins
pH (7,35-7,45) = À 25ºC, diminution de 0,03 / heure
pO2 (> 80 mmHg) =À 25ºC, diminution de 2 mmHg / heure
pCO2 (35-45 mmHg)=À 25ºC, augmentation de 1 mmHg / heure
Aspect- préanalytique
Quelles sont les variabilités possibles dans le prétraitement (après les prélèvements)
- Centrifugation (Vitesse (force) et température
2. Prétraitement: Séparation, aliquote, extraction, précipitation
Dans quels condition sont entreposer les échantillons à court terme
Température ambiante (20-24 degré)
Dans quels condition sont entreposer les échantillons à moyen terme
Refrégération ( 2-8 degré C)
Dans quels condition sont entreposer les échantillons à long terme
Congélation (-20, -30, -80 degré C)
En ce qui concerne l’aspect pré-analytique, il y a 3 variabilités (classifier)
nommez-les
- Avant le prélèvement
- Pendant le prélèvement
- Après le prélèvement
Vrai ou faux
En ce qui concerne l’aspect analytique, Pour chaque mesure, même si elle est soigneusement faite, il y a une erreur associée inhérente avec la mesure
VRAI
En quoi consiste l’erreur analytique ?
Exactitude
Précision
Personne ne peut toujours exactement mesurer la valeur vraie d’une quantité
Erreur = Différence entre la valeur obtenue et la valeur vraie
L’importance de l’erreur est due principalement à
- _____
- ____
L’importance de l’erreur est due à
- La précision de l’appareil de mesure
- Au calibrage approprié du dispositif
Vrai ou Faux
L’erreur analytique est identique à une erreur considérée comme une faute brute
FAUX
C’est différent d’une erreur ou d’une « faute » brute
Une faute est due à une application inexacte de l’appareil de mesure, telle que mal interpréterla mesure
Les pratiques soigneuses exercées au laboratoire devraient éliminer la plupart des fautes
Définiton de l’exactitude
L’exactitude d’une expérience est une mesure de la façon dont étroitement les résultats expérimentaux sont conformes à une valeur vraie ou admise
Définition de l’Inexactitude
Différence entre la valeur obtenue et la valeur vraie (+ ou -)
Exprimée en unité absolue ou en pourcentage
Définition Précision
La précision d’une expérience est une mesure de la fiabilité de l’expérience, ou comment l’expérience est reproductible
Définition imprécision
Écart-type ou coefficient de variation calculé à partir des résultats obtenus
Écart-type conserve les unités
CV exprimé en %
Nommez les deux types d’interférence analytiques possibles dans l’aspect analytique
- In vivo = Interférence par une substance ou un facteur pré-analytique qui modifie la concentration in vivo de l’analyse
- In vitro = Interférence par une substance qui perturbe la méthode analytique et qui donne un faux résultat
Donnez 3 exemples d’interférence in vivo
Tabagisme ( Augmente HbCO)
Médicament (La prise d’acétaminophène augmente les niveaux de l’enzyme aspartate aminotransférase (AST))
Drogue (L’alcoolisme augmente les niveaux de l’alanine aminotransférase (ALT) et de l’AST)
Diète ( Augmente glucose)
Menstruation ( diminue fer et hémoglobine)
Hémolyse (augmente potassium)
Donnez 3 exemples d’interférences in vitro
Spectrophotométriques (aspect; Hémolyse, Ictère, Lipémie)
Chimiques
Immunologiques
(Interférences des immunoessais, Anticorps hétérophiles et HAMA (human anti-mouse antibodies))
Chromatographiques
(Co-migration (impossible de séparer la substance interférente))
Aspect post-anlytique consiste surtout à obersver les résultats et les comparer aux valeurs de références
Expliquez dans vos mots ce que sont les valeurs de références
Les valeurs de référence visent à décrire les différentes valeurs que peuvent prendre les résultats des tests de biologie médicale chez les sujets en bonne santé d’un groupe d’individus définis (par exemple, classes d’âge, sexe)
Leur production et leur présentation font l’objet de recommandations internationales (IFCC - CLSI)
Elles sont présentées sous forme d’un intervalle de référence avec une limite inférieure et supérieure
Quelles sont les 3 différentes manières d’établir les valeurs de références
- Hard way
- Soft way
- No way
Qu’est-ce que le hard way
Sélection a priori d’individus sains selon des critères d’inclusion et d’exclusion
Détermine la concentration de l’analyte chez les individus sélectionnés (population normale)
Valeurs de référence = Moyenne ± 2 écart-types
Qu’est- ce que le soft way
Utiliser les résultats des patients déjà emmagasinés dans les bases de données du laboratoire (LIS) pour établir les valeurs de référence
Très peu de résultats sont anormaux même chez les malades
Le nombre de malades est faible en comparaison du nombre de sujets sains (poids relatif des résultats anormaux est très faible)
Qu’est-ce que le no way
Il n’y a pas de valeurs de références
Valeurs seuil consensus..(xénobiotiques ; se dit d’une valeur étrangère à l’organisme vivant)
Comment peut-on déterminer qu’une analyse est utile pour le diagnostic ?
En étudiant ses cractéristiques
Les caractéristiques d’une analyses sont de deux ordres
Quelles sont-elles ?
- Caractéristiques relevant exclusivement du test lui-même (caractéristiques intrinsèques)
- Caractéristiques relevant du test lui-même et de la population à qui il est appliqué (prévalence de la maladie dans la population considérée)
Nommez deux exemples de caractéristiques intrinsèques
La sensibilité (Se) et la spécificité (Sp)
–> « Combien de personnes vraiment atteintes de la maladie le test identifie-t-il?»_space;
Nommez deux exemples de caractéristiques qui dépendent de la population étudiée
La valeur prédictive positive (VPP) et la valeur prédictive négative (VPN)
Qu’est-ce que représente la sensibilité (Se)
La sensibilité représente la proportion de personnes vraiment atteintes de la maladie, dans la population ciblée, qui sont identifiées par le test de dépistage comme étant atteintes de la maladie (c’est-à-dire qu’elles ont des résultats élevés). La sensibilité indique la probabilité que le test diagnostiquera correctement un cas, ou la probabilité qu’un cas donné sera identifié par le test. Pour vous aider à vous rappeler ce terme, être sensible veut dire pouvoir réagir à quelque chose.
Vrai ou Faux
La sensibilité et la spécificité peuvent être considérées comme des propriétés variables d’un test diagnostiques
FAUX
La sensibilité et la spécificité peuvent être considérées comme des propriétés fixes d’un test diagnostiques
Vrai ou faux
La sensibilité et la spécificité sont calculées à partir du diagnostic même
VRAI
« Combien de personnes vraiment atteintes de la maladie le test identifie-t-il? »
Comment calcule-t-on la sensibilité
Se = (VP / VP + FN)
Qu’est-ce que représente la spécificité ?
La spécificité représente la proportion de personnes sans la maladie qui a des résultats peu élevés sur le test de dépistage : la probabilité que le test identifiera correctement une personne n’étant pas atteinte de la maladie.
Pour vous aider à vous rappeler ce terme, un test spécifique en est un qui ne détecte que la maladie en cause, ainsi il a une portée restreinte, ce qui explique le terme « spécifique ».
Comment calcule-t-on la spécificité ?
SP = (VN / VN + FP)
Vrai ou faux
La spécificité du test représente la proportion de vrai positifs chez les non malades
FAUX
la proportion de vrais négatifs chez les non malades
Vrai ou faux
La sensibilité du test représente la proportion de vrais positifs chez les malades
Vrai
Ne connaissant pas le diagnostic, mais sachant que le résultat du test est positif, Comment nomme-t-on la probabilité que le patient soit atteint de la maladie?
On nomme cette probabilité la valeur prédictive positive
Elle représente la probabilité que le sujet soit réellement malade sachant que son test est positif
VPP: Fraction des résultats anormaux (+) qui sont dus à la maladie
Vrai ou faux
Les cliniciens s’intéressent principalement à la valeur prédictive positive (VPP) du test, plutôt qu’à sa sensibilité – c’est-à-dire, quelles sont les probabilités qu’un patient ayant un score positif soit atteint de la maladie?
Vrai
À titre informatif
La valeur prédictive positive dépend donc de la sensibilité de la méthode mais aussi des prévalences de la maladie et de S+ .
Le pouvoir prédictif positif est donc meilleur quand la maladie est fréquente et S+ rare.
De façon analogue, le pouvoir prédictif négatif est meilleur si la maladie est rare et S - fréquent.
Quel est la formule de VPP
Imaginez que vous êtes un médecin de famille et que la maladie est relativement rare chez vos patients. La probabilité pré-test que votre patient soit atteint de la maladie est faible, ce qui diminuera la valeur prédictive d’un résultat positif, même si le test en soi est relativement bon. Cependant, quand le même patient consulte à une clinique spécialisée à l’hôpital, où il y a déjà eu un triage important et qu’une proportion plus grande de tous les patients est atteinte de la maladie, la valeur prédictive du même test sera de beaucoup supérieure.
VPP= VP/(VP+FP) VPP = sensibilité * (Prévalence maladie/prévalence S+)
Sachant que le résultat du test est négatif, Comment nomme-t-on la probabilité que le patient ne soit pas atteint de la maladie?
Quel est la formule de cette prédiction?
On nomme cette prédiction la valeur prédictive négative (VPN)
Elle représente la probabilité que le sujet soit réellement indemne si son test est négatif
VPN: VPN: Fraction des résultats normaux (-) qui proviennent des sujets sains
VPN= VN/(VN+FN) VPN= Spécificité (1-prévalence maladie/1-prévalence s+)
(1 – VPN) est appelé taux de ____ et (1 – VPP) le taux de ____.
VPP: Fraction des résultats anormaux (+) qui sont dus à la maladie
fausse alarme
Fausse assurance
Vrai ou faux
Pour une même sensibilité et spécificité, lorsque la prévalence augmente la VPP augmente et la VPN diminue (effet moindre).
Vrai
Qu’est-ce qu’un rapport de vraisemblance
Ils sont des indices qui facilitent le calcul de la probabilité post test de maladie. Ils correspondent, pour un résultat d’examen donné, au rapport de la probabilité d’être malade sur la probabilité de ne pas l’être une fois que l’on connait le résultat du test. Il varie donc selon que le résultat de l’examen diagnostique est positif ou négatif
Le rapport de vraisemblance d’un test ____ est le rapport (Sensibilité/1-spécificité)
Positif
Le rapport de vraisemblance d’un test ____ est le rapport (1-Sensibilité/spécificité)
Négatif
Plus le rapport de vraisemblance d’un test est grand et plus le rapport de vraisemblance d’un test négatif est ___
Plus le test est utile cliniquement (voir le tableau).
Petit
Plus le rapport de vraisemblance d’un test ____est élevé, plus il nous permet de confirmer la maladie.
Plus le rapport de vraisemblance d’un test ___ est petit, plus il nous permet d’exclure la maladie.
positif
négatif
Ayant déjà une opinion diagnostique par la connaissance des signes et symptômes (probabilité pré-test d’être malade), quel est l’accroissement de la probabilité qu’une personne soit atteinte d’une maladie à la suite d’un test positif
En d’autres mots, quel rapport je vais choisir
Rapport de vraisemblance positif
Quel est l’accroissement de la probabilité qu’une personne ne soit pas atteinte d’une maladie à la suite d’un test négatif ?
Quel rapport je vais choisir
Rapport de vraisemblance négatif
La formule pour le rapport de vraisemblance positif (« L+ ») tient compte à la fois de la ____ et de la ____
Sensibilité
Spécificité
L+= Se/(1-Sp)
Idéalement, L+= infini
Voir tableau slide 74 pour mieux comprendre
La formule : (1-sensibilité) /spécificité est la formule pour trouver ____
les valeurs inférieures à 0,2 environ sont utiles pour déterminer qu’une personne est atteinte/pas atteinte d’une maladie.
Le rapport de vraisemblance négatif L-
pas atteinte
Est-ce que la maladie est plus fréquente dans le groupe A ou dans le groupe B?
Pour trouver cette réponse, il faut utiliser la formule OR (Odss ratio) (voir slide 76 pour formule)
Indiquez l’interprétation des résultats sir le rapport donne
a) Proche de 1
b) Supérieur à 1
c) Bien supérieur à 1
d) Inférieur à 1
e) Proche de zéro
proche de 1 : la maladie est indépendante du groupe
supérieur à 1 : la maladie est plus fréquente dans le groupe A que dans le groupe B
bien supérieur à 1 : la maladie est beaucoup plus fréquente dans le groupe A que dans le groupe B
inférieur à 1 : la maladie est moins fréquente dans le groupe A que dans le groupe B
proche de zéro : la maladie est beaucoup moins fréquente dans le groupe A que dans le groupe B
Pour le dépistage, on recherche une analyse avec une haute ____
Sensibilité
Pour confirmer un diagnostic, on recherche une analyse avec une grande ____
Spétificité
Comment construire une courbe ROC
- On fixe une valeur seuil (Fig. I)
- On calcule la Se et Sp
- On place le point sur la courbe ROC
- On répète à partir d’une autre valeur seuil (Fig. II)
NOTE VOIR LES GRAPHIQUES POUR COURBES ROC
AIDE À LA COMPRÉHENSION….. SLIDE 87.
Pourquoi on demande des analyses ?
Dans un contexte médicale
Contexte médicale : Diagnostic = pour confirmer ou exclure
Pathologie: pour évaluer le degré
Traitement: Monitoring
Médecine préventive= dépistage
Pourquoi on demande des analyses ?
Dans un contexte d’une étude clinique
Criblage des sujets recrutés
Protection des sujets inclus
Médicaments –> efficacité, toxicité, innocuité, posologie, observance
Que signifie la courbe ROC
ROC: Receiver operating characteristic
Sur la courbe roc, l’axe de x représente ____
l’axe des y représente ____
L’axe de x: 1 – Sp (= fraction des FP = FP/(FP+VN)) (Donc, taux des FP)
L’axe des y: Se (= fraction des VP = VP/(VP+FN))(Donc, taux des VP)
Dans le caroube ROC, quelle est la valeur seuil optimal
le point de la courbe le plus éloigné de la diagonale représentant le test d’apport nul
l’air sous la courbe de ROC permet d’évaluer ___ d’un test. Le test est ____ ou non. Il permet aussi de comparer les _______ de plusieurs tests biologiques
l’intérêt diagnostique
informatif
performances diagnostiques
l’air sous la courbe ROC
Si AUROC donne 0.5, alors le test est ____
nul
Si l’AUROC donne 0,5≤ ASC < 0,7), alors, le test est ____
peu informatif
AUROC
(0,7≤ ASC < 0,9),les test est ___
(0,9≤ ASC < 1) = ____
(ASC = 1) = ____
moyennement informatifs
très informatifs
parfait
Que signifie le terme RCV
RCV= Reference change value
Que signifie le terme SCL:
Significant change limit
RCV (%) = ____
RCV (%) = 2,77.√(CVa2 + CVb2)
qu’est-ce que CVa et CVb
CVa = Coefficient de Variation analytique CVb = Coefficient de Variation biologique intra individuelle
SCL = 3.ETu
que signifie ETu
ETu = ET analytique usuel des 3-6 derniers mois
