UA1 Flashcards
Définition: Un allèle
On nomme allèle une variante donnée à un gène
Les allèles d’un même gène occupent le même ___ sur une même chromosome
Locus (emplacement, même région)
Définition: Génotype
défini comme étant l’ensemble des constituants génétiques d’un organisme, qu’ils soient exprimés ou non (Définition plus large)
représente la constitution d’une paire d’allèles (Définition plus commune)
Qu’est-ce qu’un hétérozygote ?
Une paire d’allèles différents
Qu’est-ce qu’un homozygote ?
la paire d’allèles identiques
Définition: Haplotype
L’haplotype est formé de séquence d’ADN (d’allèles) situés sur un seul brin d’ADN, donc un seul chromosome.
–> Représente deux allèles qu’on aurait hérité d’un parent sur un chromosome (C’est l’ensemble des gènes présent sur un des chromosomes d’une paire)
Définition: Phénotype
Le phénotype est le trait observable chez une personne résultant de l’expression des allèles.
Ex: Couleur des yeux, des cheveux
Vrai ou faux
Le phénotype peut être influencer par les gênes, mais aussi par l’environnement
Vrai
Ex: poids = Composantes génétiques, mais aussi environnementales ( ce qu’on mange)
Vrai ou Faux
Les génotypes sont souvent plus faciles à observer que les phénotypes
Faux. C’est l’inverse (Phénotypes plus faciles à observer que génotypes)
Qu’est-ce qu’un proband (cas index)
C’est l’individu qui a porté à l’attention clinique la famille. (Le premier cas)
On porte une attention particulière, car en analyse statistique on veut pas fausser la sévérité de la mutation en se basant que sur les cas index
Nommez un synonyme d’hétérozygote
Délétère
Qu’est-ce qu’une transmission autosomique dominante
Lorsqu’une seule copie d’un allèle délétère (hétérozygote) est suffisante à l’expression du phénotype correspondant
Ex: Il y a une mutation transmise dans la famille où le père était porteur de l’allène A (Aa) qui transmet cette mutation (A) à deux de ces enfants
Mère: aa
Père: Aa
Mutation A
Suffisant pour transmettre aux enfants
Nommez un exemple d’une transmission autosomique dominante
Hypercholestérolémie familiale autosomique dominante
Mutations au gène du récepteur LDL (LDLR)
Qu’est-ce qu’une transmission autosomique récessive ?
Lorsque deux copies d’un allèle délétère (homozygote) sont nécessaires à l’expression du phénotype correspondant
Seulement les homozygotes de l’allèle délétère expriment le phénotype.
En d’autres mots: ça prend deux copies de l’allèle homozygote (délétère) qui sont affectées
Nommez un exemple d’une transmission autosomique récessive
Fibrose Kystique (maladie qui implique une mutation dans un canal ionique de chlorure dans les voies respiratoires et accumulation de mucus dans les voies respiratoires .. maladie qui est récessive car si on a un canal qui fonctionne bien: on échappe la maladie. Ça prend vraiment DEUX mutations (deux canaux) qui ne fonctionnent pas pour avoir la maladie)
Note: Un médicament existe si la mutation fait en sorte que le canal ne s’ouvre pas. Si la mutation fait en sorte qu’il n’y tout simplement pas de canaux (absence) et bien aucun médicament ne foncionne
Qu’est-ce qu’un trait récessif rare ?
Les enfants issus d’unions consanguines sont plus à risque d’être homozygotes pour des allèles qui sont rarement exprimés dans une population
Union –> Parents qui sont des cousins = La maladie n’apparaissait pas dans la famille, mais l’union a permis l’apparition des gênes récessifs
Qu’est-ce qu’une transmission mitochondriale ?
La transmission se passe toujours de la mère à TOUS les enfants : aucune exceptions
Si le père est atteint: PERSONNE ne l’aura (pas transmis)
Vrai ou faux
Les mitochondries d’un enfant proviennent (quasi)uniquement de sa mère
Expliquez
Vrai
le spermatozoïde est très petit, alors que l’oeuf est prêt a se developper en zygote et donc, dans l’oeuf il y a bcp de mitochondrie alors que dans le spermatozoïde il y en a juste 2 à 3 ce qui fait que la mutation du spermatozoïde ne se transmet pas a l’oeuf….
Vrai ou Faux
Il est impossible de retrouver des mutations dans l’ADN mitochondrial
Faux
Les cellules ont des centaines de mitochondries
Chaque mitochondrie a plusieurs copies d’un
chromosome circulaire
Ainsi, les mutations de l’ADN mitochondrial existe en GRAND nombre
Ex: Cardiomyopathie et neuropathie
Nommez une caractéristique des mutations mitochondriales, puis expliquez ce que c’est
Hétéroplasmie
La cellule où se produit une mutation mitochondriale distribue ces mitochondries au hasard dans les cellules filles
Les cellules filles peuvent ainsi recevoir un mélange de mitochondries: hétéroplasmie
C’est donc une mutation qui ne se fait pas à la naissance
–> les mitochondries se reproduisent avec une situation ou il y a une mutation severe… une mitochondrie avec une grande delession ( 14000 nucelotides) fait en sorte que la mitochondrie se reproduit plus rapidement: risque de maladie
Nommez la transmission qui correspond aux chromosomes sexuelles
Transmission liée à l’X
Vrai ou Faux
Les hommes ne transmettent leur chromose X qu’à leurs filles
VRAI
En ce qui concerne la transmission liée à l’X, on ne voit jamais de transmissions père-fils !!! Parce que le père transmet le chromosome Y donc la mutation de chromosome X ne se fait pas
La transmission liée à l’X donne une impression de saut de génération, pourquoi ? (selon la slide 29, anyway)
Car c’est seulement les hommes qui semblent être atteint
Quels sont les facteurs modificateurs d’hérédité
- Pénétrance incomplète
- Expressivité variable
- Âge d’apparition
- Patron d’inactivation du chromosome X
- Expression limitée par le sexe
- Mosaïsme
Facteurs modificateurs d’hérédité
Définition: Pénétrance
La pénétrance représente le pourcentage des individus avec un génotype donné qui ont aussi le phénotype associé
En d’autres mots : Quelles sont les probabilités que j’aille le cancer ? 100% ou 50% –> cette notion, c’est la penetrance: la proportion de mutation qui passe et donne la mutation…
Pénétrance= n individus
avec phénotype / n. individus avec génotype
Facteurs modificateurs d’hérédité
Définition: Expressivité variable
Ce sont des mutations a degrés variables
même mutation identiques qui va causé un différent niveau de mutation chez une personne ou a une autre
cette mutation est sujette a avoir une expressivité variable : vient jouer sur les notions de sévérité
Facteurs modificateurs d’hérédité
Définition: Âge d’apparition
Maladies à déclenchement tardif
Certaines tares génétiques ont une apparition phénotypique tardive chez les porteurs de la mutation
Inactivation du X
Un chromosome sur deux passe sous silence (Inactivation aléatoire d’un X)
Ce chromosome est gardé en mémoire et toutes les cellules qui descendent de ce chromosome seront également gardé en mémoire et seront eux aussi inactivés
(pas trop compris celle-là_
Facteurs modificateurs d’hérédité
Définition:Expression limitée par le sexe
Certaines maladies génétiques se présentent seulement chez l’un ou l’autre des sexes. Mais sont toutefois transmis par les deux sexes
Ex: mutation de puberté précoce chez les garçons. seulement chez les hommes ! les femmes peuvent transmettre la mutation, mais les femmes n’ont pas la maladie ….
Facteurs modificateurs d’hérédité
Définition: Mosaïsme
Apparition d’une mutation somatique lors de l’embryogenèse et transmission de cette mutation aux cellules-fille
(Durant la division cellulaire, ci l’une des cellules détient une mutation, elle le transmet lors de sa division et donc: mutation somatique)
Expliquez ce qu’est le mosaïsme germinal
–> Germinal signifie cellules reproductrices
Les enfants ont reçu un allèle autosomique dominant de leur père qui n’est pourtant pas atteint. Le père est porteur d’une mutation au gène responsable de cette maladie qui est présente dans ses cellules germinales (de reproduction) mais pas dans les cellules somatiques utilisées pour typer l’ADN du père (lymphocytes).
Ce phénomène est expliqué par l’apparition d’une mutation chez le père lors de l’embryogenèse de celui-ci.
Nommez deux caractéristiques des maladies génétiques
Elles peuvent être simples ou complexes
Définir ce qu’est la maladie génétique simple (mendélienne)
Ce sont des maladies rares, des mutations rares avec une forte pénétrance, mutations monogéniques et suffisantes
Définir ce qu’est la maladie complexe
Ce sont des maladies communes, variations génétiques communes à faible pénétrance et les mutations sont ni suffisantes ni nécessaire. Les facteurs environnementaux sont très importants
Nommez deux exemple de maladie génétique simple
Dystrophie musculaire, Fibrose kystique
Nommez deux exemples de maladie génétique complexe
Diabète de type 2, infarctus du myocarde
Quel est le but principal de l’étude génétique de traits complexe ?
Elle vise principalement à identifier les gènes contribuant à la maladie dans le but de mieux comprendre les mécanismes biologiques menant à l’apparition de la maladie
Mutations alléliques
Définir la mutation: Faux-Sens
qui remplace un codon spécifiant un acide aminé par un codon qui en spécifie un autre
(Change la cible des acides aminés)
Mutations alléliques
Définir la mutation:Non-sens
qui remplace un codon spécifiant un acide aminé par un codon d’arrêt
Mutations alléliques
Définir la mutation: Insertions et délétions
peuvent changer le patron de lecture des codons et causer des mutations décalantes.
Mutations alléliques
Définir la mutation:Décalantes
Changement du patron de lecture des codons.
insertion qui n’est pas un multiple de 3, on crée une mutation decalatente.. on va lire importe dans les acides aminés
Mutations alléliques
Définir la mutation: Inapparente, silencieuses
qui ne provoque aucune modification apparente au produit du gène.
Mutations alléliques
Définir la mutation: De régulation
affectant l’expression d’un ou plusieurs gènes, sans en altérer la partie codante.
(Régulation: ne change pas la protéine mais change la quantité de protéine qui va être produite et le moment que la protéine sera produit)
Mutations alléliques
Définir la mutation: d’épissage
causant une altération d’épissage génique (assemblage des exons).
La pharmacogénomique nous permet de ____
Personnaliser le traitement
on décide d’utiliser la génotique pour déterminer le marqueur de qui qui devrait avoir le traitement…au lieu de donner le médicament a toute la famille sans même savoir si la personne doit réellement recevoir le traitement.. le génotique permet de déterminer qui qui a potentiellement les chances d’avoir le gêne etc.
eviter d’exposer un medicament qui ne fonctionne pas a des gens egalement !
Nommez 3 médicaments qui nécessite un test OBLIGATOIRE avant usage
(On ne donne pas le médicament si la personne na pas la génetique)
HERCEPTIN
SELZENTRY
ZIAGEN
test recommandé
Coumadin
Plavix
La codéine est transformé en trois métabolites . Nommez le métabolite actif principal, puis nommez les deux métabolites ayant une activité similaire à la codéine
- Morphine (métabolite actif)
- Norcodéine
- Codéine-6-glucuronide
Nommez l’enzyme responsable
Codéine –> Morphine
CYP2D6
0-15% de la codéine est O-déméthylée par CYP2D6 en morphine, le métabolite le plus actif, avec une affinité au récepteur opioïde mu 200x plus grande que la codéine
Nommez l’enzyme responsable
Codéine –> Norcodéine
CYP3A4
10-15% de la codéine est N-déméthylé à la norcodeine par CYP3A4 (affinité au récepteur mu similaire à la codéine)
Nommez l’enzyme responsable
Codéine –> Codéine-6-glucuronide
Quel pourcentage
UGT2B7
50-70% de la codéine est convertie en codéine-6- glucuronide par UGT2B7 (affinité au récepteur mu similaire à la codéine)
Le métabolisme de la codéine se déroule principalement dans ____
le foie
Il existe différents types de mutations pour l’allèles de CYP2D6
Quels sont-ils ?
- Fonction augmentée - Duplication du gène (1x2, 2x2, *35x2)
- Allèles fonctionnels normaux ( qu’on nomme également l’allèle sauvage, la plus commune) (1, 2, 35*)
- Allèles à fonction réduite
(*9, *10, *17) - Allèle non-fonctionnels
( CYP2D63, CYP2d64 (la plus commune), CYP2D66, CYP2D65
CYP2D6*17 est commun dans les population avec origines ___
Africaines (20%)
CYP2D6*17 = activité réduite
CYP2D6*10 est commun en ___
Asie (40%)
CYP2D6*10 = Activité réduite
CYP2D6*4 est commun dans les populations d’origines___
Européennes (18%)
CYP2D6*2xn (plusieurs copies du gène) entraînant une augmentation d’activité est présent chez 10% des ___
Ce qui entraine à un ___ ou l’inverse s’il y a activation d’un pro- médicament
Éthiopiens et Arabes saoudiens
sous dosage
Vrai ou Faux
les fréquences alléliques ne varient pas selon les populations
FAUX, elles varient en conséquence des différentes populations
Nommez les allèles présents dans un métabolisateur ultra rapides (UM)
Plus de 2 copies du gène (portant des allèles fonctionnels)
Note: AVOIDE CODEINE USE DUE TO POTENTIAL FOR TOXICITY
Nommez les allèles présents pour un métabolisateur rapide (EM)
- Homozygotes sauvages
- Hétérozygotes pour un allèle non fonctionnel et un allèle
sauvage - Hétérozygote pour un allèle à fonction réduite et un allèle sauvage
Note: USE LABEL-RECOMMENDED AGE-OR WEIGHT- SPECIFIC DOSING
Nommez les allèles présents pour un métabolisateur intermédiaire (UM)
- Associent 2 allèles à fonction réduite
- Associent un allèle à fonction réduite et un allèle non-fonctionnel
Note: Note: USE LABEL-RECOMMENDED AGE-OR WEIGHT- SPECIFIC DOSING
IF NO RESPONSE, CONSIDER ALTERNATIVE ANALGESICS SUCH AS MORPHINE OR NANOPIOD
Nommez les allèles présents pour un métabolisateur lent (PM)
- Homozygotes pour des allèles non-fonctionnels
- Doubles hétérozygotes d’allèle non-fonctionnels
Note: AVOID CODEINE USE DUE TO LACK OF EFFICACY
Expression génique
ADN - transcription ARNm maturation de l'ARNm Sortie du noyau Traduction de l'ARN messager en protéine
ADN Situé dans le noyau qui est transcrit en ARNm qui va ensuite quitter le noyau dans le cytoplasme puis il pourra traduire son message
Quelles sont les régions spécifiques de l’ADN génomique impliquées dans la transcription ?
Promoteurs: Contrôle de l’initiation de la transcription
Activateurs (Enhancers): Impliqués dans la régulation à distance de la transcription
Nommez les 3 étapes de l’ARN messager
- Un G méthylé est ajouté en 5’ et constitue une coiffe qui protège l’ARN de la dégradation
- Une queue de poly A est ajoutée en 3’ : elle permet l’exportation de l’ARNm dans le cytosol et stabilise
- L’épissage de l’ARN
Nommez les 3 étapes de la traduction d’un ARN messager en protéines
l’initiation, l’élongation et la terminaison (la traduction continue jusqu’à une séquence- stop (UAG, UAA, ou UGA) sur l’ARNm)
