UA 2 - Notions de base en biologie clinique Flashcards by hihock apothicaire

Pourquoi on demande des analyses ?

Contexte médical (Diagnostic, Pathologie, Monitoring, Dépistage)
Contexte d’une étude clinique (Médicaments)

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Quels sont les étapes (3) dans l’Exécution d’une analyse de laboratoire ?

Aspect pré-analytique
Aspect analytique
Aspect post-analytique

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Qu’est l’aspect pré-analytique ?

Classification des causes de variablité pré-analytique des résultats d’analyse
- avant (variations prévisibles/imprévisibles)
- pendant (types d’échantillon, contenants + additifs, technique prélèvement)
- après (transport, prétraitement, entreposage)

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Quelles sont les variations pré-analytique avant le prélèvement qui sont prévisibles ?

des variations cycliques
- ultradiennes (<20h)
- Circadienne (1j)
- Infradienne (>3j)
- Circannuelle (+/- 1an)

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L’hormone de coroissance est quelle type de variation cyclique ?

circadienne (un creux et un pic qui revient a chaque jour)
ultradienne (pics de sécrétions à travers la journée)

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Le cycle menstruel c quelle type de variation cyclique ?

variabilité infradienne (environ 1 moins donc >3j)

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Le métabolisme de la vit. D c quelle type de variation cyclique ?

circannuelle pcq ici au Canada, les mois d’été vs mois d’hiver sont différents

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Quels sont les variations avant prélèvement imprévisibles ? (aléatoires)

Ce sont des variations biologiques donc soit
- Intra-individuelles
- Interindividuelles

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Quels sont les variables reliées au patient avant le prélèvement ? Donne un example pour chacun

Exercice (course)
Diète (repas change les taux des stocks)
stress (moment difficile)
posture (debout vs couché)
etc.

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Quels sont les types d’échantillon prélevés ?

Sang
Urine
Salive
Autre liquides (Céphaloracidien, pleural, synobial, etc)
Autres matrces (selles, expectorations, etc)

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Quels sont les 3 types de échantillions qu’on peut utiliser par rapport le sang ? Fait la différence

Sang total (avec anticoagulant)
Plasma : Sang centrifugé avec anticoagulant → contient les protéines de la coagulation.
Sérum : Sang centrifugé après coagulation → sans protéines de coagulation.

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Quels sont les contenants et additifs durant le prélèvement ?

Anticoagulants (EDTA, héparine lithium, citrate sodium)
Préservatifs (NaF, HCl, etc.)
Additifs (Gel séparateur, activateur coagulation, etc)

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Quels sont les 4 plus grandes risques d’erreurs avec la technique de prélèvement qui peut varier les résultats ?

Désinfection inadéquate de l’Edroit de la ponction veineuse
Non desserrement du garrot & hémolyse conséquente
Remplissage des tubes inadéquat (non respect des volumes prédéterminés)
Mauvaise identification des tubes malgré code couleur

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Comment l’hémolyse varie-t-elle ? (↓ ↑)

↑ hémolyse :
- relâche du contenu intracellulaire des érythrocytes
- interférence analytique in vitro

↓ hémolyse :
- interférence analytique in vitro

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Comment est-ce que le transport va affecter le la variabilité pré-analytique après prélèvement

au niveau des
- Délais
- mauvaise conservation température

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Donne des examples de variations pendant le transport induits par métabolisme des cellules

pO2
pCO2
pH
cCa2+
cGlucose
cLactate

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Quels sont les variations dans le prétraitement possibles causant une différence dans les résultats des patients ?

Centrifugation (vitesse & température)
Prétraitement (séparation, aliquote, extraction, précipitation)

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Quels sont les 3 modes d’entreposage après prélèvement ?

Court terme (T ambiante)
Moyen terme (réfrigération)
Long terme (congélation)

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Quels types de variabilités existent dans l’aspect analytique ?

Erreur analytique (Exactitude/Précision)
Interférences analytiques

L’importance de l’erreur analytique est due à quel 2 critères ?

Précision de l’appareil de mesure
Calibrage approprié du dispositif/ appareil

Comment on exprime l’inexactitude (inaccuracy) ?

Écart entre valeur obtenue expérimentale & vraie
- unité absolue OU pourcentage

**si c a la bonne place

Comment on exprime l’imprécision ?

écart-type ou coefficient de variation calculé à partir des résultats obtenus
- CV exprimé en %
- Écart-type conserve ses unités

**variations entre les résultats

Comment exprime t on l’erreur analytique ?

EA = Inexactitude + Imprécision

Quels sont les 2 types d’interférences analytiques ? Décrit les birèvement

In vivo : par substance/facteur pré-analytique qui modifie concentration in vivo de l’analyte
In vitro : par substance perturbant méthode analytique & donne faux résultat

Examples d'interférences in vivo ?

- Tabagisme - Médicaments - Drogues - Diète - Menstruations - Hémolyse - Etc.

Examples d'interférences in vitro ?

- Spectrophotométriques ** Hémolyse ** Ictère ** Lipémie - Chimiques - Immunologiques ** Interférences des immunoessais - Chromatographiques ** co-migration

le plasma prélevé est rouge; que indique cela ?

- cellules hémolysées

le plasma prélevé est jaune; que indique cela ?

- bon prélèvement trust

le plasma péleveé est jaune foncé; que indique cela ?

- ictère uh oh

Quels sont les 3 situations établissant des valeurs de référence en aspect post-analytique ?

- Hard way → volontaires sains pis tout; valeurs référence = moyenne ± 2 É-T - Soft way → base de données; 2 suppositions (peu résultats anormaux; #malades faible compared to #sujets sains) - No way → seuil consensus, absence de valeurs réfs.

Comment déterminer qu'une analyse est utilse pour le diagnostic ?

en étudiant ses caractéristiques 1- caractéristiques intrinsèques 2- prévalence de la maladie dans la popualtion considérée

Quels indices statistiques dépendent des caractéristiques intrinsèques

Sensibilité (Se) & Spécificité (Sp)

Quels indices statistiques dépendent aussi de la population étudiée ?

- VPP (valeur prédictive positive) - VPN (Valeur prédictive négative)

Conaissant le diagnostic, quelle formule à utiliser pour détermine combien de personnes vraiment atteintes de la maladie ?

Se (sensbilité) = VP/ (VP + FN) * la proportion de vrais positifs chez les malades

Connaissant le diagnostic, quelle formule à utiliser pour déterminer la probabilité que le test identifiera correctement une personne n'étant pas atteinte de la maladie ?

Sp = VN/ (VN + FP) * la proportion de vrais négatifs chez les non malades

Ne connaissant PAS le diagnostic, mais sachant que le résultat est positif, quelle formule à utiliser pour détermine la probabilité que le patient soit atteint de la maladie ?

VPP = VP/ (VP + FP) = sensibilité * (prévalence maladie/prévalence S+) *probabilité que le sujet soit réellement indemne si son test est négatif

Comment exprime-t-on le rapport de vraisemblance (likelihood ratio) ?

c le rapport de la probabilité d'être malade sur la probabilité de ne pas l'être une fois que je connais le résultat du test Rapport de vraisemblance **+**/**-** L+ = Se/ (1-Spécificité) → confirmer maladie L- = (1-Se)/ Spécificité → exclure maladie

Quelle formule va aider à déterminer si la maldie est plus fréquente dans le groupe A ou dans le groupe B ?

Probabilité qu'un évenement arrive dans le groupe A est p; q dans le groupe B Odds ratio (OR) = p(1-q) / q(1-p)

Interprétation de l'OR ?

≈ 1 : maladie indépendante du groupe >1 : maladie fréquente groupe A vs B >> 1 : malade bcp plus fréquente groupe A <1 : malade fréquente groupe B ≈ 0 : malade bcp plus fréquente groupe B

Quelle analyse diagnostique choisir pour un dépistage ? Pour confirmer un diagnostic ?

Dépistage = ↑ Se Confirmer diagnostic = ↑ Sp

Comment interpréter courbe ROC ?

courbe Sp vs Se dont le test parfait aurait AUC = 100% & le test inutile aurait AUC = 50%

4 étapes pour construire courbe ROC ?

- on fixe valeur seuil - on calcule Se & Sp - on place point sur courbe ROC - on répète avec toutes les valeurs

Interprétation des résultats : quelle est la valeur seuil optimale ?

Le point de la courbe le plus éloigné de la diagonale du test nul

Quel est l'intérêt d'évaluer la AUROC (AUC de la courbe ROC ?)

- Permet d'évaluer intérêt diagnostique d'un test - Permet de comparer les performances diagnostiques de plusieurs tests biologiques (AUC test A vs AUC test b)

Quels répères peut on utiliser pour déterminer si une différence significative (cliniquement) existe entre 2 résultats consécutifs ?

1- Jugement & expérience 2- RCV (reference change value) 3- SCL (Significant change limit)

Comment on calcule le RCV ?

RCV (%) = 2,77.√(CVa^2 + CVb^2) où CVa = analytique CVb = biologique intra individuelle puis on compare le pourcentage au changement observé

Que signifie SCL ?

Significant change limit; 3*É-Tu Si on dépasse cette valeur, le changement est significatif