Transpozizi Flashcards
Définition de la recombinaison génique
Permet un échange génétique ou/et un réarrangement chromosomique
Type de recombinaison génique
1) Recombinaison homologue: échange d’ADN entre 2 ADN homologues, ordre des gènes conservés
- Durant méiose
- Réparation de la cassure bicaténaire (HR)
2) Transposition: Réarrangement d’ADN par déplacement de segment, ordre des gènes peut changer
- N’arrive pas dans notre day to day, c’est plus sur échelle évolutive
Transposons réplicatifs vs non réplicatifs
Réplicatifs: ils se copient, une reste où elle était et l’autre va s’insérer ailleurs
Non-réplicatifs: Une seule copie voyage dans le génome
3 classes de transposons
Transposons ADN : ne se répliquent pas
Rétrotransposons viraux: Produisent ARN pour se transcrire
Rétrotransposons non-viraux: Produisent ARN pour se transcrire
Contenu des transposons d’ADN
- 1 gènes codant une transposase
- +/- d’autres gènes qui régulent la transposition, fct utiles pour transpositions…)
- 2 sites de recombinaisons: répétitions inversés aux début et à la fin du transposons
- 2 répétitions directes: produits durant transposition (reste à l’emplacement du début, donc laisse une trace)
De quoi s’occupe la transposase?
Cette enzyme s’occupe de la transposition du transposon
Quels sites s’occupe de reconnaitre la transposase?
Les sites de recombinaisons
Explique le mécanisme de la transposition
C’est du copier coller
- Gène transposase est transcrit et traduit
- Transposase reconnaît et lie séquence inversées aux extrémités du transposons
- ADN est clivé par transposase et génère extrémité 3-OH sur le transposons
- Les 3-OH s’attaquent à l’ADN sur un nouveau site rx de transesterification
- Transposon s’insère à un nouveau site.
- Réparation d’ADN s’occupe du reste
Explique la transesterification
Le groupement OH du transposons attaque le groupement phosphate d’un nucléotide, ce qui va crée sur le brin attaqué une liaison avec le transposon et une extrémité 3’-OH libre.
Contenu des transposons viraux
- 1 gène codant une intégrase: insère transposons
- 1 gène codant une rétrotranscriptase: ADN pol qui utilise ARNm comme matrice et une RNAse H
- 2 LTR (sites de recombinaisons): répétitions U3 (contient promoteur), U5 (unique 5’) et sites R qui permettent saut d’amorce
- 2 répétitions directes: produit durant transposition
Mécanisme de la retrotransposition avec LTR
1) Gènes rétrotranscriptases et intégrase sont transcrit et traduit
2) ARNm du transposon est généré et intercepté par rétrotranscriptase
3) L’enzyme utilise cette ARNm comme matrice pour produire copie d’ADN
4) L’ADNc (copie) est reconnue par intégrase qui le clive pour généré bout 3’-OH
5) 3’-OH s’attaquent à l’ADN sur un nouveau site et il y a rx de transestérification
6) Transposon s’insère à un nouveau site
7) Réparation d’ADN s’occupe du reste, génère les répétitions directes.
Mécanisme de la régénération des LTR complet
ARNt comme amorce et dégrade ARN matrice au fur et à mesure, et fait sauter ses amorces.
Il y a perte de la région U3 d’un côté et de la région U5 de l’autre.
(voir animation) https://studium.umontreal.ca/pluginfile.php/6717329/mod_label/intro/Chapitre%204%20-%20LTR.mp4
Contenu des transposons non viraux (poly-A)
- Gènes codant prot (ORF1) pouvant se lier à l’ARN et une prot(ORF2) rétrotranscriptase et endonucléase
- Séquence 5’UTR: site ayant promoteur à son 1er nt
- Séquence 3’UTR: partie terminale riche en A:T
- 2 Répétitions directes: produit durant transposition
Mécanisme de la transposition poly-A
- Utilise mécanisme d’épissage inverse
- Rétrotranscription amorcée par séquence cible
1. Gènes ORF1 et ORF2 sont transcrit et traduit en ARNm
2. Prot traduites s’attachent à 3’ de leur propre ARNm
3. Le complexe ORF1/2-ARNm retourne au noyau
4. Se lie à site riche en T de l’ADN cible
5. Prot coupe l’ADN cible et laisse un 3’OH. Forment hybride ARN-ADN
6. Hybride est l’amorce pour la rétrotranscription
7. Transcription inverse de l’ARN vers ADNc et dégradation de l’ARN
8. Génération du 2e bout d’ADN et intégration du bout non attaché dans le génome
9. Production des répétitions directes par la réparation d’ADN
Comment les transposons sont sources de mutations?
- Duran l’intégration, peuvent venir interrompre gène ou régions régulatrices de l’ADN
- Peuvent devenir des introns
- Peuvent amener déplacement de d’autres éléments génomiques (Poly-A faible duplique plus que le transposons et l’amène avec lui)
