ADN et structure? Flashcards
Le bloc de construction de l’ADN
dNTP: Désoxyribonucléotides triphosphate
Toutes les forces qui gardent l’ADN ensemble
Liaisons phosphodiesters (lient les désoxyribonucléotide), Liaisons hydrogènes (lient les bases azotés), et les forces d’empilements
Décrit la structure d’un dNTP
Base azoté sur le 1C, désoxyribo en 2C, liaisons phosphodiesters avec autre dNTP en 3C, groupement phosphate en 5’C.
R-O-R+O
Groupement esters
Liaisons Hydrogènes entre les Bases azotées
Adénine & Thymine: 2 Liaisons H
Guanine & Cytosine: 3 Liaisons H
Décrit les liaisons phosphodiesters
Liaisons covalentes avec les carbones C3’ et C5’ des 2 sucres voisins.
2 groupement esters formés
Structure des purines
Structures des pyrimidines
Règle de Chargaff
1: ADN a pourcentage égale de A&T et de G&C
2: Rapport de purines sur pyrimides est environ 1;1
Qu’est-ce qui permet la polymérisation des dNTP?
L’hydrolyse des groupements phosphate
Charge de l’ADN
Négative, charge négative sur un O des groupement phosphates. C’est l’aspect acide de l’acide désoxyribonucléique
Fonctions des nucléotides
(1) Source d’énergie chimique via groupement phosphate
(2) Association avec groupement pour former Coenzyme
(3) Mol. de signalisation intracellulaire ou second messager
3 particuliarités de la structure de l’ADN
(1) Complémentarité des brins
(2) Chaînes antiparallèles
(3) Hélicoïdales
Explique la complémentarité des brins
Brins d’ADN liés ensemble par les laisons H entre les BA:
(1) Couple compatible: A;T & G;C
(2) Liens H se forment que si orientation des nucléotides est antiparallèle
Même distance des couples de BA permet…
Propriété d’autocodage de l’ADN, dû au liaisons H (toutes équidistantes)
5’ à 3’ ou 3’ à 5’
5’ à 3’
Sillon majeur vs mineur
+ explique le concept de sillons
Formés à partir de l’angle entre les 2 liens glycosidique (liens qui lient les BA au sucre du nucléotide)
Le sillon majeu offre plus d’info que le sillon mineur.
Mineur: Dinstingue entre paires A;T(AHA) et C;G(ADA)
Majeurs: A;T(ADAM) T;A(MADA) C;G (HDAA) G;C (AADH)
A: Accepteurs du lien H
D: Donneur du lien H
H: Non polaire
M: Méthyl (non polaire)
ADN- A , B et Z
A: Hélice à droite, plus compacte, torsion des bases-> migration vers l’extérieur
Hélices ARN-ARN ou ARN-ADN
B: Classique
Z: Hélice à gauche, plus allngée, zigzag, unité de base en doublet (purine-pyrimidine)
Conc. élevé en Na-> surenroulement négativement de l’ADN(Z)
Dénaturation définition
Perte de la structure quaternaire, tertiaire ou secondaire présent ds la forme native de la mol.
Qu’est-ce qui peut causé la dénaturation?
Température ou changement de pH vient briser les liaisons H. sans briser les liaisons covalents. Le rétablissement vient recoller les brins d’ADN, c’est l’hybridation
La T° de dénaturation est-elle la même pour toutes les molécules d’ADN
Non, dépend des séquences de BA. T:A(2 lien H) sont plus facile à briser que C:G (3 lien H)
Qu’est-ce que permet la Sonde?
Permet d’identifier des séquences dans l’ADN
(V/F)Plus la T° de sonde et séquence sont diff., plus la sonde est spécifique
Faux
L’immunocytochimie
Utilisé en cytogénétique pour voie des gènes sur les chromosomes condensé ou dans le génome.
Utiliser pour voir séquences uniques ou à faible nombre de copie.
Visualisation directe de certaines séquences d’ADN
Étapes de l’hybridation sur membrane
(1) Sonde phosphorescente sur ADN coupé, par enzyme de restriction ou ARN
(2) Hybridation spécifique
(3) ARN: présence dans un tissu quelconque et quand dans le dev.
ADN; SI présence du gène
(4) Nbr de gènes dans l’organisme
Technique d’hybridation: Si on coupe le gène d’intérêt, qu’est-ce qu’on voit sur la membrane
Plusieurs bandes faibles (hybridation partielle de la sonde et de la séquence)
