Translasyon Flashcards

1
Q

Svedeg birimi (S)

A

Ultrasantrifüjde bi molekülün büyüklüğüne göre çökme hızının ölçüsüdür.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

İntiation faktör (başlama)

A

IF 1-2-3

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Elongation

A

Uzama

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Termination and relase

A

Sonlanma ve bırakma

RF 1-2-3

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Dejenere yapı

A

1 aanın birden fazla kodona sahip olması.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Wooble (sendeleme) hipotezi

A
  1. Baz eşlesmesinde gevşek davranır.

61 taneden daha az tRNA vardır. Yaklaşık 50-55 tane

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Aminoasit aktivasyonu

A

AA+ATP = aminoaçil AMP
Aminoaçil tRNA sentetaz: (mg bağımlı) her aa için 1 tane
Aktifleşmiş complex AMİNOAÇİL - tRNA

tRNA daki ribozun 3. Csindeki OH ile aa Karboksil grubu arasında ester bağı oluşur. Su açığa çıkar.

20 tane sentetaz vardır!

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Metionin tRNAsı

A

2 çeşittir. İlk ve diğerleri

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

IF3

A

Alt birimlerin etkileşmesini engeller

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

IF 1

A

A bölgesine bağlanıp ilk aa nın p bölgesine girmesini sağlar.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Shine dalgarno

A

Prok.
Başlama kodonundan önce
30S ribozomun 16S rRNA su ile uyum.

mRNA da bulunur bu diziler

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

IF 2

A

N formilmetiyonin getirici

GTP harcanır.( Alt birimleri birleştirmek için)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

elF3

A

40s alt birime bağlanıp üst birim bağlanmasını engeller.

elF6 aynısını büyük alt birimde yapar

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

43 S komplex

A

elF2-GTP tRNAmet elF3 ve 40s alt birim

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

5’ şapkasını tanıyan

A

elF4F alt birimlerinden elF4E

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

elF4A

A

Helikaz

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Önemli kıvırma komplexi= kalite kontrol

A

PABp
elF4G (bağlantı kuran)
elF4E

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

elF 1

A

Taramayı kolaylaştırır

AUG BULANA KADAR

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

elF5B katılması

A

GTP hidroliziyle komplexin ayrılmasını sağlar.

Sonrasında büyük alt birim bağlanır

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

EF-Tu

A

A bölmesine AA getirir. GTP harcanır.

Ef - TS GTP dönüştüren

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Peptit bağı oluşumu

A

Büyük alt birimdeki peptidil transferaz tarafından
(Ribozim)(23S rRNA görevli)
P deki ester bağı çözünür. Amid bağı oluşur. (peptit bağı)
Pdekinin Karboksili A dakinin amini arasında

22
Q

EF-G

A

Translokasyonu GTP enerjisiyle sağlar. (Adan Pye kayma) 1 GTP harcanır

23
Q

Ökaryot notu

A

Ökaryor ribozomunda E bölmesi yoktur P bölmesinden direkt atılırlar.

24
Q

Pro. Sonlanması

A

Durdurucu kodon A bölmesine gelince sonlanma başlar.
RF 1 uaa uag
RF 2 uaa uga kodonlarını tanır.
Bağlanınca peptidil transferaz hidrolaz olup ester bağını keser.
Rf 3 kolaylaştırma yapar.
En son ribozom ayrışmasını RF A bölmesine bağlanıp gerçekleştirir.EF-G bölme E ye kadar kaydırıp 2GTP harcar.

25
Q

Ökaryot sonlanması

A

eRF1 tüm kodonları tanır.

eRF3 (GTPaz) ile sonlanmayı gerçekleştirir.

26
Q

Protein katlanma prtnleri

A
Isı şoku proteinleri (HSP , şaperonlar)
Hsp 70 (ko-translasyonel)
Hsp 60 (post-translasyonel) (kafes modeliyle)

Prokaryot ve Ökaryotlarda aynıdır.
ATP harcanarak iş yaparlar

27
Q

Prokaryotlarda başlangıç eş zamanlı

A

Sitoplazmada transkripsiyon devam ederken Translasyon da benzer bir hızla başlar.

28
Q

İlk bulunan aminoasitler

A

Phe (UUU)
Lys (AAA)
Pro (CCC)

Glisin (GGG) stabil değildi. İlk deneylerde bulunamadı

29
Q

tRNA

A

D loop
T loop
Antikodon loop
Ve 3’ ucunda CCA olmalı

30
Q

İnozin

A

İnozin hipoksantinin toutomerisi
Yukarda çift bağ O yerine OH var
C-A-U ile eşleşebiliyot tRNA da iken

31
Q

Ribozom

A

Bakterilerde =70s
30S (16S rRNA + 21 prt)
50S (23S + 5S + 34 prt)

Ökaryotlarda = 80s
40S (18S + 33prt)
60S (28S + 5.8S + 5S + 49prt)

Transkribe olan Pre rRNA ya dışardan proteinler gelip tutunur. Komplike şekilde Sitoplazmaya çıkarlar.
5S dışardan gelir. (kromozom 1)

32
Q

Monosistronik

A

Sadece farklı ekzon birleştirme varyasyonlarıyla çeşitlilik olur.

Bakterilerde polisstronik. Zaman kazandırır.

33
Q

N formilmetiyonin

A

Amino grubundan formik asitle amid bağıyla bağlanmış metiyonin
Prokaryotlarda başlangıç kodonu

34
Q

Prokaryotlarda sonlanma

A

RF 1 UAA ve UAG yı tanır

RF2 UAA ve UGA yı tanır

RF3 yardımcı olur.

Bunlar A bölgesine uyarlar
Sonlanma sırasında 2GTP harcanır.

35
Q

Ökaryotlarda ilk tanınma

A

5’ ucunda prokaryotlardan farklı olarak Cap yapısı vardır

Kozak dizisi başlangıç kodon unun etrafında yer alır.

İlk aa metiyonindir ama çoğu zaman aminopeptidazlarla kesilir. Başka bir aa ile başlar protein genelde.

Ribozomlar 2 farklı yerdedir. Bu proteinin kaderini belirler.
ER de (disülfit bağı korunur)
36
Q

elF4E

A

Prokaryotlardan farklı olarak ilk başta 5’ uçtaki şapkayı tanır
40s alt üniteyi getirir.

37
Q

mRNA ilmiklenmesi

A

elF4E şapkayı (m7G) tanır
PABP (poli A bağlanan Prot.)
elF4G bunları bağlayıp ilmek yapan
Daha sonra elF2 aa getirir

Tanınmadan sonra elF5B GTP harcayarak komplexi dağıtır.

Başlangıçta GTP harcayan elF2 ve elF5B

38
Q

Scanning

A

Tarama
elF2 katılmış komplex AUG bulana kadar tarama yapıyor
Bulduktan sonra elF5B tarafından komplex dağılır.
Tarama enerji isteyen bir olaydır (ATP)

39
Q

Polizom

A

rRNA nın yarı ömrü bitene kadar sentez yapılır. 10-100 ribozomla
Yarı ömrü (poli A uzunluğu belirler)

40
Q

Protein yapılanması

A

Primer yapı ilk dizidir.

Çıkar çıkmaz aralarında H. Bağlarıyla sekonder yapı oluşur.alfa heliks ve beta tabakalar şeklinde.

Tersiyer yapı moleküller arası etkileşimler ve disülfit bağlarıyla oluşur. Bunlara domein denir. (etkileşimler domeinler arasında olur.)
Domein etkileşimleriyle özel katlantılar oluşturmuş, ayrıldığında yapısı bozulmayan segmentlerdir.

Quarterner yapı yan grup etkileşimleriyle olur. Birden fazla subunit etkileşmeyen R kalmayana kadar bir araya gelir.

41
Q

Protein katlanma hastalıkları

A

Kistik fibrozis
Alzheimer
Parkinson…
Ve yaşlanma (heterojen ve daha tolere edilebilir.)

(nörolojik ve kaslarda daha büyük sorun)

42
Q

Post-translasyonel modifikasyonlar

A

Fosforilasyon (ser-thr-try) (genelde aktifleştirme)

Glikozilasyon (Asn-Ser-Thr)

Ubikitinasyon (Lys)

Sumolasyon

Disülfit bağları (cys)

Asetilasyon

Lipidasyon

Metilasyon

Hidroksilasyon

Kesilme/kırılma (kesilince Aktifleşen proteinler var)

Metallerle komplex oluşturma (hemoglobin)

Karbonhidrat yan zincir vs takılabilir.

43
Q

Antibiyotikler bakteri

A

Tetracycline ( A bölgesine oturup bloklar)
Streptomycin (elengation basamağı bloke)
Chloramphenicol (peptidil transferaz bloke)
Mitokondriyi de etkilerler. Endosimbiyotik Hipotez kanıtlarından biri.

Puromcycin - Ökaryotlarda da var

44
Q

Ökaryot antibiyotiği

A

Cycloheximide (translokasyon blokasyonu)

45
Q

If 2 GTPsi ne zaman yıkılır.

A

Üst birim alt birime Bağlanınca yıkım gerçekleşir.

46
Q

eRF1a

A

EF-Tu görevini yapan Ökaryot enzimi

47
Q

RNA processing

A

Sadece Ökaryotlarda olur

48
Q

Fleksibite

A

Esneklik

wooble Hipotez

49
Q

Assembly

A

Proteinler nükleolusa girerek rRNA lara assembly olur.

Daha sonra beraber Ribozom oluşturup çıkarlar çekirdekten

50
Q

Translasyon sonlanması not

A

Durdurucu kodon tanınınca su molekülü peptidil transferaz aktivitesini değiştirerek peptit bağının yıkımını sağlar.