Nükleik Asitler Ve Genetik Bilgi Flashcards
İmprinting (damgalama)
Ökaryotlarda CPG deki Cnin metillenmesi sonucu oluşan şey.
Aktive veya inaktive edebilir. Bakterilerde metillenme ekzonükleazları engelleyerek DNAlarını korumaya yarar.
Pürin ara maddeleri
Ksantin ve hipoksanti(adenininki)
NH2 çıkartıp çift bağ O takarak.
Nükleik asitin yapısı
Düz sıralı Primer yapı. Primer yapının düzenli tekrarlanması sekonder yapı. Katlanmalarla vs tersiyer yapı.
Yan grupları azotlu bazıları
Fosfor ve şekerler arası bağ ismi
3’-5’ fosfodiester bağı
Chargaff kuralları
Pürin=pirimidin vs
B-DNA
10 bç 360°dönmede
3.4Á bir aralık.
Çap 20Á
Tuzlu ve kuru yerlerde A-DNA ya dönüşür. İkisi de sağa dönümlü
A-DNA
Z DNA
Kısa ve şişman.11bç lik. Aralar daha dar.
Zigzag yapılı. Sola dönümlü. Uzun ve ince. 12bç
Tm
DNA nın yarısının denatüre olduğu erime sıcaklığı.
Süpersarmal yapı
Gen ekspresyonu için önemlidir.
Topoimerazlar tarafından düzenlenir.
Bakteriyel tip 2 olan tanımış (giraz)
Tekrarlanan bölgeler
Genellikle telomer ve sentromer bölümleri
Gen
Bir polipeptidin veya RNA gibi bir son ürünün Primer dizisini kodlayan DNA bölümü
UTR
Untranslated regions
RNA özellikleri
Kalıp olarak kullanılabilir (ters transkripsiyon)
Katalizör olarak kullanılır (ribozim)
Ribozomların yapısal bileşiği %60
mRNA
Ömürleri kısa. Kodon. Primer mRNA dan capping, poli a eklenmesi Splicing Splisozom (snRNA------->snRNP)
tRNA
Rnaz P ve D 3' ucuna CCA bağlanır. (Alıcı kol) karboksil + adenozinin OH'ı(ester bağı) (aminoaçil tRNA transletaz) Aşağıda antikodon kolu mRNAyı okur. Dihidroür. Ribotimidin Psöudoür (Değişken kol.)
rRNA
(28S + 5.8S + 5S + 49protein) 60s
(18S + 33prt) 40s += 80S
(23S + 5S + 34prt) 50S
(16S + 21prt) 30S. +=70S
Poli== polizom
Palindrom
Birbirinin tamamlayıcısı olan zincirler
H-DNA
T-A-T (hoogsteen eşleşmesi)
3lü yapı. RNA da da olur. C*GC üçlü baz eşleşmesi de gerçekleşir
Transfeksiyon
Transformasyon+transdiksüyon
İnsülin, viral aşılar (bakterilerle çoğaltılır.)
Kalsiyum fosfat Elektoporasyon Mikro enjeksiyon Katyonik lipozomlar Virüs aracılı gen transferi
Pürin ara ürünleri
Ksantin Guanin NH2 sinin çift bağ O olmasıyla
Hipoksantin adenin NH2sinin çift bağ olmasıyla
Pirimidin ara ürünü
Orotic asid
Urasilin 6. Karbpnuna COOH bağlanmasıyla oluşur.
Minor bazlar
major bazlara metil bağlanarak oluşur.
tRNA bulunabilir. Timin de bulunabilir.
Neden DNA da T var
Sitozin deaminasyonla U ya dönüşür. Geri tamir makenizması için önemli
Hem de T çok daha enerjik yapılı daha kararlı olmasını sağlar
Toutomerizasyon
Adenin ve sitozin amino dan imino grubuna dönüşebilir.
Guanin ve timin ketodan enol
Reaksiyona trifosfatlı şekilde girer.
Piro fosfat açığa çıkar.(PPi)
Pirofosfat ortofosfata hidrolizlenir.(Pi)
Enerji elde edilir
B form DNA
Sulu ortamda baskın 10çift nükleotit her dönüşte 34°A Sağa dönümlü 36° her baz dönüşü
Polindrom
Tek zincirli RNA ların eşleniği tamamlayıcısı
MAB oluşur. tRNA ve rRNA da bulunur.
Ökromotin ve heterokromotin
Heterokromotin yoğun olduğundan gen ekspirasyonuna genelde kapalıdır
Facultative açık olabilirken
Consititutive satellik ve sentromerik DNA dizlerinde bulunur
İnsan genom projesi HGP
DNA nın yaklaşık %1i protein kodlar
Mitokondri 37 gen
Tekrarlayan genler anne baba kontrolünde önemli
Major ve minör groove
Şeker baz arası glikozit bağları tam denk gelmediğinden oluşan küçük ve büyük olulklar
Lagging zincir
Kesintili zincir
Pentoz bağlantıları
Pirimidinlere 1.C Sİ 1. N atomundan bağlanır. (sağa doğru)
Pürinlere 1.Csi 9. N ATOMUNDAN bağlanır
cAMP, ATP, NAD ne türüdür.
Nükleotit.
RNA kendini eşleyebilir!!!
Serbest Nükleotitlerle komplemente olarak bağlanır.
Yeni iplik oluşabilir.
