Epigenetik Flashcards
Kök hücreler
Totipotent (4. Bölünmeye kadar)
Politotent
Multipotent
Unipotent
Epigenetik
DNA dizisinde değişim olmaksızın, kromozomda/ DNA da stabil kalıtılabilir fentotipik değişimlerdir.
Epigenomik değişimlerin tümü DNA daki
Epigenetik kod farklı hücrelerde farklı fenotipleri koruyan epigenetik özellikler
Fosforilasyon
Ser, thr, tyr e
HDA geri dönüşümlü
Protein kınaz ve fosfatazlar tarafından
Nitrasilasyon
Histon deasitilazların sistein redüzünden NO grubu eklenmesi
Reprösörlerin ayrılmamasına neden olur.(-)
Ubikitinasyon
Lizin redüzüne bağlanır.
E1 E2 E3 enzimleri tarafından gerçekleştirirler. Proteozom yolağına sokar
Transkripsiyon gerçekleşir oluşan proteinlerin yıkımı!!
Sumolasyon
Sumo 1 2 3 prtleri ubukitin ile birleşip engeller
Kovalent olmayan histon modifikasyonlar
Histon takası ve kalıtımı Kromotin tamiri Nonkoding RNA etkileşimi Diğer ajanlarla etkileşim Uzak mesafe kromozom etkileşimleri Teratojenler heterokromotin ve histon modifikasyonlarını etkiler
DNA metilasyonu
CpG kümesinde sitozinin 5. Carbonunun metillenmesi (Gen kontrol mekanizması) DNA metiltransferaz Metil verici s-adenozil metiyonin (sam) Kalıtsaldır. CpG dışı metilasyonlar embriyonik kök hücrelerde gözlenir. X inaktivasyonu Genomik imriting (baskılama) Sporodit (kendiliğinden çıkan) kanserler
RNA interference (RNAi)
20-22nk çift zincirli kodlama yapmayan (antisens) RNA ların
mRNA yı parçalayarak veya engelleyerek yaptığı sessizleştirme
miRNA
İnsanlarda %60 etkili 22nk Her genden sentezlenebilir.(özgün) Pasha ve drosha Dicer Denatüre olup
Hem intron hem ekzondan sentezlenir.
miRNA geninden Transkribe olup saç tokası şekli oluşturur.
Drosha ve Dicer ile kesilir. 22nk çift iplikli olgun miRNA oluştururlar. RISC ile birleşince birbirlerinden ayrılırlar.
Bu komplex mRNA komplemente olur. Bloklayıp degrede eder
piRNA
Eşey hücrelerindeki tranpozabıl elementleri susturarak ekspresyonu düzenler. (Olumlu) (eşey hücresini korurlar)
siRNA da aynı görevli
IncRNA
Uzun kodlama yapmayan RNA lar
X inaktivasyonu (metile eder)(xıst bölgesi 100kb)
Bazıları kırmızı kan hüc. Gelişimini durdurur.
Aktivasyon yapabilir.
XIST inaktive yerden transkribe olur ve susturur.
TSIX aktiften olur.
piRNA
ncRNA (k. Kodlamayan) ve piwi etkileşimli RNA (piRNA)
Transpozabıl elementleri sustururlar.
Şaperon katlamaları
Doğru katlanmayan protein fonksiyon yapamaz. Translasyonel düzenleme
HSP70
Sonra HSP60
Prionlar
Kendini çoğaltan küçük proteinler.
Prot. Çökelmesine sebep olur.
Katlanınca amoyloid birikim olur(toksik etki)
Özellikle sinir hücrelerinde