Brainscape's Knowledge GenomeTM

Browse over 1 million classes created by top students, professors, publishers, and experts.


See full index

Tıbbi Biyoloji > Replikasyon > Flashcards

Replikasyon Flashcards

1
Q

Endonükleaz ve ekzonükleaz

A

Ortadan nükleotit çıkarma

Baştan ve sondan çıkarma

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Komplementer

A

Tamamlayıcı

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Prokaryotlarda rep.

A

20 DNA A prt bağlanmasıyla başlar
Giraz ve helikaz olan DNA B ile devam eder.
Primeri DNA G sentezler.
Polimeraz 3 kesikli ve kesintisiz sentezi yapar.
Pol 1 Primer rnayı 5-3 ekzonükleaz aktivitesiyle çıkarıp yenisini yapar. Ligaz bağlar. 5’-3’ ve 3’-5’ ekzonükleaz aktivitesi sadece Pol 1de

Orjin 245bçliktir. 1 tanedir.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Prokaryot rep enzimleri

A

Pol 3 asıl sentezi yapan ve hata olduğunda 3’-5’ ekzonükleaz yapan.
Pol 1 primeri çıkarıp yerine sentez yapan ve iki yönlü ekzonükleaz aktivitesi
Pol 2-4-5 onarım ve tamirden sorumlu.

DNA G primer
DNA B helikaz
SSB (tek zincir stabil proteini)
Topo 1, Gyraz

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Ökaryot rep. Enzimleri

A

Polimeraz alfa -delta-epsilon. Mitokondride gama. Geriye kalanlar onarımda

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Baz kesip çıkarma

A

Deaminasyonla değişmiş baz spesific glikozilazıyla çıkarılır. Geriye kalan deoksiribofosfat (deoksiribozit) AP endonükleaz ile kesilip polimeraz 1 (ökaryotta beta) le doldurulur. Ligazla birleştirilir.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Oligoükleotit kesip çıkarma

A

Eksinükleazlar tarafından büyük parça iki taraftan kesilip helikaz ve polimeraz 1 (insanda epsilon) ve ligaz işiyle biter

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Yanlış eşleşme onarımı

A

Metillenmemiş yeni DNA üzerinde Mut S-L komplex üstüne H gelip metil adenin karşısından keser ve helikaz ve ekzonükleazlar tarafından kesilir Pol ve ligaz.
MSH 2ve 6 (MutS) tanır MLH1 ve PMS2 (MutL) , ,helikaz ve ekzonükleaz çıkarır.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Direkt onarım

A

Fotoaktivasyon insanda yok.

DNA alkilasyon onarımı DNA metiltransferaz içindeki sistein kalıntısının metili almasıyla olur.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Remodeling

A

Kromotin açılması

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Histon asetilasyonu

A

Lizine asetil eklenmesi + yükünü azaltır ve dnaya afinitesini de azaltmış olur.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Prokaryot ve ökaryot farkları

A 
Lagginin zincir uz. 2000/200
Ökaryotlarda enzim daha fazla
Orjin sayısı (1-30.000)
Enzim çeşitleri
Polimeraz snyde 1000nk/50nk
Çembersel DNAlarda Telomer sorunu yoktur.
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Replizom

A

Rep. çatalındaki tüm protein komplexi

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

3’-5’ ekzonükleaz aktivitesi

A

Delta epsilon gama

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

ARS (bağımsız replike olabilen diziler)

A

Ökaryotlsrda orjin. 11bç çekirdeği içine alan 100bç uzunluğundaki bölgeler.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Maya ARS elemanı

A

ACS (ars konsensüs dizisi)(sequence)

ACS ve B1e ORC(o. Tsnıma komplexi) bağlanır.
Sonra ek proteinler ve MCM helikaz getirilir

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

RFC VE PCNA

A

Kıskaç yükleyen ve kayan kıskaç

18
Q

Ökaryor rep. Önemli

A

Polimeraz a primeri sentezleyip daha sonra birkaç nük. Ekleyip lagging ipliği deltaya bırakır.

19
Q

Prokaryotlarda Primer uzk.

A

Pol 1 tarafından çıkarılır yerine sentez yapılır. Ligaz gelir birleştirir.

20
Q

Ökaryot Primer uzak.

A

RNazH primeri tanır. Ekzonükleazla birlikte çıkarır.

polimeraz ve ligaz tamamlar.

21
Q

Telomeraz

A

Komplementer RNA dizisi içerir. Telomer bölgesini uzatır.
Virüslerde ters transkriptaz
Somatik hücrelerde yokkk (eşey, Kök ve kanser hücrelerinde var)

Telomer bölge Rnaz H tarafından çıkarılan baştaki primerin
3-OH başlangıcı olmadığından polimeraz tarafından direkt sentezlenememesi sonucu oluşur.

22
Q

Proofreading

A

Replike sırasında 3’-5’ yönünde nük. çıkarılması

23
Q

PCR

DNA nın in vitro çoğaltılması

A 
Su
2 Primer (özgün DNA içerikli) (sadece bakılacak gen için) 
Taq polimeraz (sıcaklığa dayanıklı)
MgCl2
dNTP
Kalıp DNA

Sıcak değişikliğiyls 95°de Denatüre edilip primer bağlanması sağlanır.

24
Q

Canlıdan canlıya genetik madde aktarımı

A

Ökar. Rekombinasyon kros over bölgelerinde gerçekleşir

Prok. Transformasyon ,transfeksiyon, transdiksüyon

25
Q

Jel Elektroforezi

A

Pcrdan sonra DNA parmak izinin çıkarılması

Jel elektroforezi, saflaştırılmışnükleik asitveproteinlerinmolekül ağırlığı, miktarı ve alt tiplerinin saptanmasında yaygın olarak kullanılan moleküler bir inceleme yöntemidir.



Jel eletroforezi

Yöntemin avantajı; basit ve hızlı olmasının yanında diğer yöntemlerle yeterli düzeyde ayrılamayan nükleik asit parçacıklarının ayrılmasını sağlamasıdır.

En çok kullanılan jel elektroforezi yöntemleriagaroz jel elektroforezivepoliakrilamid jel elektroforezidir. Nükleik asitler için genellikle agaroz jel, proteinler için ise poliakrilamid jel elektroforezi kullanılmaktadır.

26
Q

Replikasyon için gerekli koşullar

A 
Remodeling
Kalıp DNA
Enzim
Nükleotitler (dATP...)
Mg
27
Q

Histon proteinleri

A

H1-2A-2B-3-4
Kğtlesi DNA nınkine eşittir.

Histon dışı proteinler rep. Ve transkripsiyonda görev alır. Sonradan yapıya katılır. (dinlenimde yapıda değil.)

28
Q

Helikaz

A

Hekzamerik proteindir

Çift zincirin açılmasını sağlar

29
Q

Replizom

A

Replikasyon çatalındaki proteinli yapıların hepsi

30
Q

Pol 4-5

A

Translezyon enzimlerdir

Hatayı görmezden gelip devam ederler. Daha sonra hatalı baz çıkarılır

31
Q

Yalnız polimeraz 1in

A

5’-3’ ekzonükleaz aktivitesi var

32
Q

Transformasyon

A

Bakterilerin ortamdan DNA moleküllerini alıp kendi yapısına katması

Transdüksiyon virüs(faj) aracılığıyla gen transferi

33
Q

Önemli!!!

A

Primer hem Kesintilide hem kesintisiz zincirin başında vardır.

Prokaryotlarda Replikasyon iki tarafa doğru da ilerler.

34
Q

DNA B

A

Helikaz

35
Q

DNA G

A

Primaz

36
Q

DNA A

A

Başlatıcı

37
Q

PCR

A

Başlangıçta DNA ısıtılarak (95°) Denatüre olması sağlanır. Ardından thermus aquaticustan alınan polimeraz (Taq polimeraz) ve onun öncesinde gene özgün bir çift DNA primeri takılır. Karışım biraz soğutulup sentezin yapılması sağlanır. İşlem için su, MgCl2, trifosfatlı Nükleotitler gerekir.

38
Q

Translezyon sentezi

A

Timin dimeri normal Replikasyonu bloklar
Ancak Pol 4-5 gibi polimerazlar geçici sentez yapıp bunları görmezden gelip devam ederek rep. Bitirir. Bu dimer daha sonradan çıkarılır.

39
Q

RFC

A

Kıskanç yükleyen protein tarafından PCNA ipliğe takılarak polimeraza yapışır ve stabilize ederek aktivitesini sağlar

40
Q

SSB

A

Ökaryotlarda RPA

Helikaz tarafından açılan zincirlere tutunup açık kalmasını sağlayan önemli proteinler

Tıbbi Biyoloji (10 decks)

Brainscape helps you reach your goals faster, through stronger study habits.
© 2024 Bold Learning Solutions. Terms and Conditions