Transcription - Dr. Rokeach (par: Elizabeth Romero) Flashcards
1
Q
c’est quoi le flux de l’information génétique?
A
2
Q
la transcription génère quoi? qui est synthétisé par quoi?
A
génère un polymère de ribonucléotides
qui est synthétisé par une ARN polymérase
3
Q
l’ARN polymérase synthétise dans quelle direction?
A
5’—>3’
4
Q
l’ARN est synthétisé sur quel brin, et ce dernier est lu dans quelle direction?
A
sur le brin matrice qui est lu de 3’ à 5’
5
Q
l’ARN transcrit à partir du brin matrice est complémentaire ou identique à celui-ci?
A
complémentaire (l’ARNt est identique au brin codant)
6
Q
L’ARN transcrit est la même séquence que quel brin? mais quelle est la différence avec celui-ci?
A
séquence du brin d’ADN codant mais avec des ribonucléotides au lieu de désoxyribonucléotides, et de U au lieu de T
7
Q
c’est quoi la différence entre la structure de l’ARN vs la structure de l’ADN?
A
8
Q
qu’est-ce qui fait que l’ARN a une structure secondaire et tertiaire?
A
l’interaction entre ses bases
9
Q
quel est l’élément particulier de structure secondaire de l’ARN?
correction: la structure tertiaire****
A
pseudoknot (quand 2 boucles se rencontrent
10
Q
à part le pseudoknot, qu’est-ce qui permet de tenir ensemble la structure secondaire et tertiaire de l’ARN?
A
appariement de bases par des ponts H
11
Q
la transcription se fait grâce à quelle protéine?
A
ARN polymérase
12
Q
Comment se fait le déroulement de l’ADN lors de la transcription?
A
déroulement de l’ADN au fur et à mesure de la synthèse d’ARN et au fur et à mesure que
l’ARN polymérase se déplace reformation de la double hélice en arrière
13
Q
c’est quoi un hétéroduplex?
A
courte région d’hélice hybride ADN/ARN formée transitoirement (~9 nuc.)
14
Q
c’est quoi les 4 caractéristiques des ARN polymérases?
A
- L’ARN polymérase synthétise l’ARN en copiant d’un brin matrice d’ADN
- Transcrit de 5’ à 3’ (brin matrice de l’ADN doit être lu de 3’ à 5’)
- Ne nécessite pas d’amorce
- Crée des liens phosphodiesters entre les nucléotides en son site actif
15
Q
Pourquoi l’ARN polymérase n’a pas besoin d’amorce?
A
peut être dû au fait que la transcription n’a pas à être aussi précise que la réplication d’ADN puisque les erreurs ont une durée de vie limitée correspondant à la durée de vie du transcrit
16
Q
Les cellules eucaryotes utilisent combien d’ARN polymérases
A
3
17
Q
V ou F, les ARN polymérases des eucaryotes produisent 1 seul type d’ARN
A
FAUX, ils produisent plusieurs types d’ARN
18
Q
quels sont les 4 types d’ARN des cellules eucaryotes?
A
- ARNm
- ARNr
- ARNt
- petits ARN
19
Q
à quoi servent les ARNm**?
A
codent pour des protéines: ARNnc ARN non-codants (miRNA, lncRNA)
20
Q
quelle ARN polymérase synthétise les ARNm**?
A
ARN polymérase II
21
Q
à quoi servent les ARNr**?
A
composent les ribosomes
22
Q
quelle ARN polymérase compose les ARNr**?
A
ARN polymérase I
23
Q
à quoi servent les ARNt**?
A
servent d’adaptateurs lors de la synthèse protéique
24
Q
quelle ARN polymérase synthétise les ARNt**?
A
ARN polymérase III
25
les **petits ARN** servent à quoi?
sont utilisés dans différents processus cellulaires (snRNA, snoRNA)
26
quelle est l'ARN polymérase qui synthétise les **petits ARN**?
ARN polymérase **III**
27
La polymérase nécessite quoi pour initier et terminer la transcription
des facteurs protéiques et des signaux dans l’ADN
28
où commence et où termine la transcription?
commence au **promoteur** et se termine au **terminateur**
29
c'est quoi le **promoteur**?
signal d’initiation de la transcription
30
c'est quoi le **terminateur**
Signal de terminaison de la transcription
et site de terminaison
31
quel est le facteur qui va sélectionner le promoteur du gène à transcrire chez les **procaryotes** pour initier la transcription?
facteur σ (sigma)
32
le facteur σ s'associe à quoi chez les **procaryotes**? pour former quoi?
à la **polymérase** pour former le _complexe d’initiation de la transcription_
33
décrivez de manière brève les 3 étapes de la transcription **procaryote**
1. **INITIATION**: Les facteurs sigma (σ) chez les procaryotes s’associent à la polymérase pour former le complexe d’initiation de la transcription et L’ARN polymérase est recrutée au niveau du promoteur
2. **ÉLONGATION**: Le facteur sigma (σ) est relâché
quelques 10 nucléotides après initiation de la transcription et donc l'ARN polymérase fait la synthèse
3. **TERMINAISON**: L’ARN polymérase est relâchée de l’ADN au niveau d’un signal de stop (arrêt de la transcription)
34
sur cette image, que représentent les chiffres? en comptant à partir de quoi?
les **positions des nucléotides** en comptant à partir du _premier nucléotide transcrit_
35
le premier nucléotide transcrit est désigné par quelle numérotation?
+1
36
L'**asymétrie du promoteur** (par exemple le fait que la séquence conservée à -35 est située en amont de la séquence à -10) sert à quoi?
oriente la polymérase et détermine la direction de la transcription
37
le **promoteur** est sur le brin matrice ou le brin codant?
brin **codant**
38
quelle est la séquence promoteur située à -10 chez les procaryotes? et elle est située où encore + précisément?
**TATAAT** située environ _10 paires de bases en amont du site d’initiation_ de la transcription
39
La séquence TATAAT (-10) sert à quoi?
sert de point de repère pour l’assemblage du
complexe d’initiation de la transcription
40
c'est quoi une **séquence consensus**?
c'est la **séquence idéale**: c'est ce qu'on retrouve pour la plupart dans chaque position de promoteur
41
+ la séquence est similaire à la **séquence consensus**, ...
**_plus grande_** sera l’**affinité du facteur σ** _et_ l’**efficacité de la transcription** (+ le promoteur va être fort donc + l'ARN polymérase va rester fixée)
42
comment appelle-t-on les courts motifs espacés colorés en vert sur la photo?
boîtes -10 et -35
43
Plusieurs facteurs σ bactériens reconnaissent une telle paire de courts motifs espacés, appelés boîtes -10 et -35 à cause de quoi?
de leur distance du site d’initiation de la transcription
44
La position de cette **séquence consensus** dicte quoi?
- le brin à utiliser
- le sens de la transcription
45
V ou F: les procaryotes possèdent 1 seul facteur σ
FAUX: Les procaryotes possèdent
typiquement plusieurs facteurs σ, chacun
ayant sa propre spécificité de séquence
46
Tous les facteur σ des procaryotes interagissent avec quoi et sont responsables de quoi?
interagissent avec l’**ARN polymérase** et sont
responsables de la **reconnaissance de la séquence
promotrice sur l’ADN**
47
décrivez les 7 étapes de la transcription **procaryote** + en détail
1) Le facteur sigma s’**associe à l’ARN
polymérase avant la transcription**. Ce complexe
ira se fixer sur le promoteur.
2) Le contact de l’ARN polymérase avec le
promoteur entraîne l’ouverture locale de la double
hélice d’ADN -\> **bulle de transcription**.
3) **Initiation** de la synthèse d’ARN à 50
ribonucléotides/seconde.
4-5) **Relâchement du facteur sigma** après la
synthèse d’une chaîne de ± 10 **ribonucléotides
ET Élongation**
6) **Rencontre du signal de terminaison** : il s’agit de la forme que prend l’ARN grâce aux appariements locaux(intramoléculaires).
Lorsque l’ARN se met sous cette forme, cela indique à l’ARN polymérase qu’elle doit être relâchée
7) **L’ARN polymérase se détache**, libérant l’ARN.
48
une fois que l'ARN polymérase se détache après la transcription **procaryote**, que peut-elle faire?
aller retrouver un facteur σ pour enclencher une nouvelle transcription
49
où se trouve le signal de terminaison de la
transcription encodée par l’ADN d'un procaryote?
À l’extrémité 3’ de l’ARN néo-synthétisée
50
La séquence d’ARN transcrite du signal de terminaison permet la formation de quoi?
d’une **tige-boucle** (hairpin, épingle à cheveux)
51
la formation d’une tige-boucle (hairpin, épingle à
cheveux) crée quoi et à quel niveau?
qui crée une **contrainte** au niveau du complexe de l’**ARN polymérase**: favorise le **détachement de l’ARN
polymérase**
52
c'est quoi la nature du **signal de terminaison** chez les _procaryotes_?
La **séquence en tige-boucle riche en G-C** suivi d’une **série de U** cause la terminaison de la transcription chez les procaryotes
53
lequel est + complexe: le promoteur eucaryote ou procaryote?
le promoteur **eucaryote** est beaucoup + complexe
54
qu'est-ce qui sert sert de point de repère pour l’assemblage du complexe d’initiation de la transcription chez les **eucaryotes**?
La **boîte TATA** située environ 25 paires de bases en amont du site d’initiation de la transcription
55
qu'est-ce qui se lie à la **boîte TATA** des _eucaryotes_?
Des **facteurs généraux de la transcription** reconnaissent et se lient à ces séquences
56
quelle est la protéine qui fait la transcription chez les **eucaryotes** (quelle ARN polymérase)?
ARN polymérase **II**
57
Des **facteurs généraux de transcription** (eucaryotes) s’associent à quoi? pour former quoi?
à l’**ARN polymérase II** pour former le _complexe d’initiation de la transcription_
58
c’est d’**abord** quoi qui s’associent à l’ADN du promoteur chez les _eucaryotes_ et cela permet quoi?
les **facteurs de transcription généraux** s'associent à l'ADN du promoteur (*et non le complexe d'initiation au complet dès le départ, contrairement aux procaryotes*), ce qui **permet à l’ARN
polymérase II de se lier**
59
le **promoteur** des _eucaryotes_ est caractérisé par quoi?
par la boîte TATA, qui se trouve à -25
60
les multiples **facteurs généraux de transcription** (« GTFs ») impliqués dans la transcription _eucaryote_ on peut les appeler comment aussi?
**TFII** pour transcription factors II
61
V ou F: l'**ARN polymérase** chez les _eucaryotes_ se fixe au niveau du promoteur et reconnaît le promoteur directement
Bien que l’ARN polymérase **se fixe au niveau du promoteur**, elle n’est **fixée à la boîte TATA que via les transcription factors** et ne **reconnaît _pas_ le promoteur directement**
62
quels sont les facteurs généraux d’initiation de la transcription chez les **eucaryotes**
- TFIID (avec TBP et TAF subunits)
- TFIIB
- TFIIF
- TFIIE
- TFIIH
63
quel est le rôle de la _sous-unité TBP_ de **TFIID**?
reconnaît la boîte TATA
64
quel est le rôle de la _sous-unité TAF_ de **TFIID**?
- reconnaît d'autres séquences d'ADN près du point de départ de la transcription
- régule la liaison de la TBP à l'ADN
65
c'est quoi le rôle de **TFIIB**?
- reconnaît l'élément BRE dans les promoteurs
- positionne de manière précise l'ARN polymérase au début du site de transcription
66
c'est quoi le rôle de **TFIIF**?
- stabilise les interactions de l'ARN polymérase avec TBP et TFIIB
- aide à attirer TFIIE et TFIIH
67
c'est quoi le rôle de TFIIE
attire et régule TFIIH
68
C'est quoi les 3 rôles de TFIIH?
- déroule l'ADN au point de départ de la transcription (séparation des 2 brins durant l'initiation)
- phosphoryle Ser5 de l'ARN polymérase CTD
- relâche l'ARN polymérase du promoteur
69
quelle est la toute première étape de la transcription chez les **eucaryotes**?
**Reconnaissance de la boite TATA (-25 ) par TFIID**
| (complexe composé de TBP, TATA Binding Protein)
70
que se passe-t-il lors de la transcription **eucaryote** après reconnaissance de la boite TATA (-25 ) par TFIID?
Recrutement de TFIIB par TFIID lié à l’ADN
71
que se passe-t-il lors de la transcription **eucaryote** _après recrutement de TFIIB par TFIID lié à l’ADN_?
Recrutement de l’ARN polymérase II + de facteurs généraux de transcription (TFIIF, TFIIE, TFIIH) et ils forment le **complexe d'initiation de la transcription**
## Footnote
*Ils sont recrutés sur l’ADN et favorisent ouverture de l’ADN pour permettre la transcription*
72
que se passe-t-il lors de la transcription **eucaryote** _après la formation du complexe d'initiation de la transcription_? cela favorise quoi?
**Phosphorylation de la queue C-terminale de l’ARN polymérase par la kinase TFIIH**, ce qui favorise le désengagement de la polymérase des protéines du complexe d’initiation, _cela donne le signal de départ_
73
que se passe-t-il lors de la transcription **eucaryote** _après phosphorylation de la queue C-terminale de l’ARN polymérase
par la kinase TFIIH_? cela annonce quoi?
L’action de **TFIIH** entraîne une séparation des deux
brins de l’ADN (c’est une **ouverture locale**) _et_ une
**phosphorylation d’une partie de l’ARN
polymérase**.
Cela annonce à l’ARN polymérase que
_tout est en place pour commencer la transcription_
74
Cette phosphorylation de l’ARN polymérase II (lors de la transcription chez les **eucaryotes**) entraîne la libération de quoi? qu'est-ce qui n'est pas libéré?
des **autres facteurs de transcription** (TFIIB, TFIIE, TFIIF et TFIIH) pour qu’elle puisse commencer l’élongation de la chaîne d’ARN
TFIID avec **TBP** n’est pas libéré
75
suite à la phosphorylation de l'ARN polymérase II qui libère les autres facteurs de transcription (lors de la transcription des **eucaryotes**), que se passe-t-il?
**Début de la synthèse de l’ARN** (une fois tous ces
facteurs libérés)
76
V ou F: Les ARN des eucaryotes sont **transcrits et modifiés** _simultanément_ dans le noyau
VRAI
77
La **terminaison** chez les _eucaryotes_ est couplée à quoi?
à la **polyadénylation** (à voir plus tard maturation des ARN)
78
Le **terminateur chez les eucaryotes** est une séquence dans le _pré-ARNm transcrit_ qui est aussi le signal de quoi?
de polyadénylation: AAUAAA
79
Chez les **eucaryotes**, que se passe-t-il au pré-ARNm et cela donne lieu à quoi?
le pré-ARNm est **clivé** et **polyadénylé** : et donc la _polymérase se détache_
