Transcription chez les bactéries Flashcards
ARNm monocistronique vs ARNm polycistronique
ARNm monocistronique = information pour une protéine
ARNm polycistronique = information pour plusieurs protéines
La synthèse de tout les ARNs est catalysé par ___________________ appelé également _______________
- ARN polymérase
- Transcriptase
La transcriptase synthétise l’ARN dans le sens ___________ et se déplace le long du brin d’ADN dans le sens __________
synthétise ADN : 5’ vers 3’
Déplacement : 3’ vers 5’
est-ce que l’ARN polymérase demande une amorce ?
NON (mais ADN polymérase oui, réplication)
Comment est formée l’ARN polymérase ?
composée d’un noyau de plusieurs chaînes polypeptidiques (α2ββω) qui assure l’élongation et du facteur σ qui assure la reconnaissance du promoteur
Rôle des chaînes peptidiques de l’ARN polymérase : α
Assemblage de l’enzyme et interaction
non-spécifique avec le promoteur
Rôle des chaînes peptidiques de l’ARN polymérase : β
Site actif de l’enzyme pour la synthèse
de l’ARN
Rôle des chaînes peptidiques de l’ARN polymérase : ω
Stabilisation de l’enzyme et participation
à l’assemblage des sous-unités
Rôle des chaînes peptidiques de l’ARN polymérase : σ
facteur protéique nécessaire pour fixer
spécifiquement sur le promoteur
Quelles sont les deux étapes de la phase d’initiation chez les bactéries ?
1) Fixation de l’ARN polymérase sur le promoteur
2) L’enzyme sépare les 2 brins d’ADN
explique l’étape 1 de la phase d’initiation : Fixation de l’ARN polymérase sur le promoteur …
- Le facteur σ s’associe au noyau enzymatique (α
2 ββω) pour former l’holoenzyme. - Cette association conduit à la reconnaissance spécifique du promoteur et à la stabilisation de
l’enzyme sur le promoteur.
Qu’est-ce qui peut être identifier dans le promoteur ?
- boîte TATAAT (boîte de Pribnow) (position -10)
- Séquence riche en A et T en position -35
- Ces séquences ne sont pas identiques d’un promoteur à l’autre
L’intensité de la transcription d’un gène est en rapport direct …
avec l’affinité de la liaison de la polymérase avec l’ADN matrice
Qu’est-ce qu’un promoteur puissant ?
séquences consensus hautement conservées = ↑ taux de la transcription
Qu’est-ce qu’un promoteur faible ?
séquences concensus dégénés = ↓ taux de la transcription
Explique l’étape 2 (enzyme sépare les 2 brins d’ADN), de la phase d’initiation
- la séparation des 2 brins se produits dans une région riche en A et T, située (-10) par raaport au début de la transcription
- ÉTAPE LIMITANTE (demande beaucoup d’énergie)
- formation d’une bulle de transcription
- Initiation de la synthèse dans le sens 5’ vers 3’ et synthèse d’une courte séquence (9 nucléotides)
- la facteur σ se détache
En quoi consiste l’élongation de la transcription chez les bactéries ?
La libération du facteur σpermet à l’ARN
polymérase de se déplacer sur l’ADN matrice dans le sens 3’-5’ et de commencer l’élongation.
La vitesse de la transcription est variable en fonction des contraintes de structure de l’ADN et de l’ARN synthétisé.
Comment fonctionne l’ARN polymérase lors de la transcription
Lorsqu’elle avance, la polymérase dissocie les
brins devant la bulle de transcription et elle
réassocie les brins derrière la bulle de
transcription
L’ADN reste hybridé à l’ADN sur environ 8
nucléotides
Qu’est-ce qui marque la fin de l’élongation et le début de la transcription ?
L’élongation de la chaîne d’ARN se poursuit jusqu’à la rencontre du site de terminaison (terminateur).
Quand l’ARN polymérase croise le terminateur, que ce passe-t-il ?
L’ARN polymérase se dissocie de l’ADN et l’ARN nouvellement synthétisé
est libéré.
Quels sont les deux types de site de terminaison chez les bactéries ?
Terminateurs rho-indépendants
Terminateurs rho-dépendants
C’est quoi Terminateurs rho-dépendants
Protéine rho requise
c’est quoi Terminateurs rho-indépendants
- Pas de protéines externes requises
- Séquences de terminaison intrinsèques
la protéine rho est un …
hexamère
quelles sont les 2 activités que possède la protéines rho ?
- Possède activité hélicase
- Possède activité ATPase
Explique comment fonctionne la protéine rho quand la terminaison rho dépendante :
- Elle reconnait une région de l’ARN riche en C en amont du site de terminaison (rho utilisation site) et s’attache à l’ARN.
- Elle utilise l’énergie de l’hydrolyse de l’ATP pour migrer le long de l’ARN jusqu’à atteindre
l’ARN polymérase au niveau de la zone de terminaison. - Rho possède une activité hélicase et provoque la dissociation du complexe et la terminaison
de la transcription.
Explique comment fonctionne la terminaison rho-indépendante :
Structure en épingle à cheveux →
Entraîne l’arrêt de la polymérase.
La séquence riche en A (en U sur ARN) favorise la dissociation du complexe
et libération de l’ARN
