Transcription chez les bactéries

Question 1

ARNm monocistronique vs ARNm polycistronique

Answer 1

ARNm monocistronique = information pour une protéine
ARNm polycistronique = information pour plusieurs protéines

Question 2

La synthèse de tout les ARNs est catalysé par ___________________ appelé également _______________

Answer 2

1. ARN polymérase
2. Transcriptase

Question 3

La transcriptase synthétise l’ARN dans le sens ___________ et se déplace le long du brin d’ADN dans le sens __________

Answer 3

synthétise ADN : 5’ vers 3’

Déplacement : 3’ vers 5’

Question 4

est-ce que l’ARN polymérase demande une amorce ?

Answer 4

NON (mais ADN polymérase oui, réplication)

Question 5

Comment est formée l’ARN polymérase ?

Answer 5

composée d’un noyau de plusieurs chaînes polypeptidiques (α2ββω) qui assure l’élongation et du facteur σ qui assure la reconnaissance du promoteur

Question 6

Rôle des chaînes peptidiques de l’ARN polymérase : α

Answer 6

Assemblage de l’enzyme et interaction
non-spécifique avec le promoteur

Question 7

Rôle des chaînes peptidiques de l’ARN polymérase : β

Answer 7

Site actif de l’enzyme pour la synthèse
de l’ARN

Question 8

Rôle des chaînes peptidiques de l’ARN polymérase : ω

Answer 8

Stabilisation de l’enzyme et participation
à l’assemblage des sous-unités

Question 9

Rôle des chaînes peptidiques de l’ARN polymérase : σ

Answer 9

facteur protéique nécessaire pour fixer
spécifiquement sur le promoteur

Question 10

Quelles sont les deux étapes de la phase d’initiation chez les bactéries ?

Answer 10

1) Fixation de l’ARN polymérase sur le promoteur
2) L’enzyme sépare les 2 brins d’ADN

Question 11

explique l’étape 1 de la phase d’initiation : Fixation de l’ARN polymérase sur le promoteur …

Answer 11

• Le facteur σ s’associe au noyau enzymatique (α
  2 ββω) pour former l’holoenzyme.
• Cette association conduit à la reconnaissance spécifique du promoteur et à la stabilisation de
  l’enzyme sur le promoteur.

Question 12

Qu’est-ce qui peut être identifier dans le promoteur ?

Answer 12

• boîte TATAAT (boîte de Pribnow) (position -10)
• Séquence riche en A et T en position -35
• Ces séquences ne sont pas identiques d’un promoteur à l’autre

Question 13

L’intensité de la transcription d’un gène est en rapport direct …

Answer 13

avec l’affinité de la liaison de la polymérase avec l’ADN matrice

Question 14

Qu’est-ce qu’un promoteur puissant ?

Answer 14

séquences consensus hautement conservées = ↑ taux de la transcription

Question 15

Qu’est-ce qu’un promoteur faible ?

Answer 15

séquences concensus dégénés = ↓ taux de la transcription

Question 16

Explique l’étape 2 (enzyme sépare les 2 brins d’ADN), de la phase d’initiation

Answer 16

• la séparation des 2 brins se produits dans une région riche en A et T, située (-10) par raaport au début de la transcription
• ÉTAPE LIMITANTE (demande beaucoup d’énergie)
• formation d’une bulle de transcription
• Initiation de la synthèse dans le sens 5’ vers 3’ et synthèse d’une courte séquence (9 nucléotides)
• la facteur σ se détache

Question 17

En quoi consiste l’élongation de la transcription chez les bactéries ?

Answer 17

La libération du facteur σpermet à l’ARN
polymérase de se déplacer sur l’ADN matrice dans le sens 3’-5’ et de commencer l’élongation.

La vitesse de la transcription est variable en fonction des contraintes de structure de l’ADN et de l’ARN synthétisé.

Question 18

Comment fonctionne l’ARN polymérase lors de la transcription

Answer 18

Lorsqu’elle avance, la polymérase dissocie les
brins devant la bulle de transcription et elle
réassocie les brins derrière la bulle de
transcription

L’ADN reste hybridé à l’ADN sur environ 8
nucléotides

Question 19

Qu’est-ce qui marque la fin de l’élongation et le début de la transcription ?

Answer 19

L’élongation de la chaîne d’ARN se poursuit jusqu’à la rencontre du site de terminaison (terminateur).

Question 20

Quand l’ARN polymérase croise le terminateur, que ce passe-t-il ?

Answer 20

L’ARN polymérase se dissocie de l’ADN et l’ARN nouvellement synthétisé
est libéré.

Question 21

Quels sont les deux types de site de terminaison chez les bactéries ?

Answer 21

Terminateurs rho-indépendants

Terminateurs rho-dépendants

Question 22

C’est quoi Terminateurs rho-dépendants

Answer 22

Protéine rho requise

Question 23

c’est quoi Terminateurs rho-indépendants

Answer 23

• Pas de protéines externes requises
• Séquences de terminaison intrinsèques

Question 24

la protéine rho est un …

Answer 24

hexamère

Question 25

quelles sont les 2 activités que possède la protéines rho ?

Answer 25

• Possède activité hélicase
• Possède activité ATPase

Question 26

Explique comment fonctionne la protéine rho quand la terminaison rho dépendante :

Answer 26

• Elle reconnait une région de l’ARN riche en C en amont du site de terminaison (rho utilisation site) et s’attache à l’ARN.
• Elle utilise l’énergie de l’hydrolyse de l’ATP pour migrer le long de l’ARN jusqu’à atteindre
  l’ARN polymérase au niveau de la zone de terminaison.
• Rho possède une activité hélicase et provoque la dissociation du complexe et la terminaison
  de la transcription.

Question 27

Explique comment fonctionne la terminaison rho-indépendante :

Answer 27

Structure en épingle à cheveux →
Entraîne l’arrêt de la polymérase.

La séquence riche en A (en U sur ARN) favorise la dissociation du complexe
et libération de l’ARN