Traduction - Messagers Flashcards
Donner 6 caractéristiques des messagers.
- 4 nucléotides A, G, C et U ;
- Séquence complémentaire et antiparallèle au brin matrice/transcrit ;
- Séquence identique au brin non transcrit de l’ADN (à part T en U) qui est toujours
donné en exemple ; - Synthèse de 5’ vers 3’ ;
- Véhicule l’information génétique ;
- Hétérogène en taille.
Ou se trouve l’information génétique des ARNm ?
Elle est portée par une succession de codons présents dans un ORF (encadrée par AUG et codon STOP).
Qu’est-ce qui se trouve de part et d’autre des ORF ?
On y trouve des séquences non codantes, 3’ UTR et 5’ UTR.
En quoi la 5’ UTR est importante pour les bactéries ?
Joue un rôle important dans la régulation des gènes.
Pour les ARNm BACTERIENS, quels sont les deux types de messagers que l’on retrouve et par quoi sont-ils différenciés.
Il y a les messagers polycystroniques, à plusieurs ORFs, et les messages monocystroniques.
Qu’est-ce qu’un cistron ?
Un agrume.
Non j’déconne, c’est le codon AUG.
Pour les ARNm BACTERIENS, comment sont-ils par rapport au gène ?
Ils sont colinéaires au gène.
qu’est-ce qui précède la 5’ UTR chez les bactéries ?
Une purine portant 3 phosphates.
Qu’est-ce la séquence Shine et Dalgarno ?
GGAGG : riche en purines, capable de s’apparier avec l’extrémité 3’ d’un ARNr 16S.
Pour les ARNm BACTERIENS, ou peut-on trouver les séquences Shine et Dalgarno ?
Entre chaque cistron !
Quelle est la durée de vie des ARNm bactériens ? Par quoi sont-ils dégradés ?
Quelques minutes seulement, dégradés par le Dégradosome.
De quoi est composé le dégradosome ?
Hélicases, endonucléases et exonucléases.
Pour les ARNm EUCARYOTES, quelle est la particularité de leur production ?
Ils sont d’abord synthétisés sous forme de pré-messagers, puis subissent une maturation.
Sous quelle forme se trouve-t-ils toujours dans la cellule ?
Toujours associés à des protéines, formant des mRNPs.
Qu’est-ce que m7G ?
Désigne la coiffe.
Avec quelles protéines se fixe l’ARNm dans le noyau ? Cytoplasme ?
Dans le noyau, Cap-Binding Protein se fixe sur m7G.
Dans le cytoplasme, c’est le complexe IF4 qui s’y fixe.
D’autres protéines interagissent avec l’ARNm au cours de l’épissage.
Pour les ARNm EUCARYOTES, quelle protéine se fixe sur le 3’-polyA ?
La protéine Poly-A Binding.
Rappel : quelle importance pour la coiffe / poly-A ?
Coiffe : importante pour l’initiation de la traduction.
PolyA : synthèse d’ADNc / banques de données.
Pour les ARNm EUCARYOTES, quelle est la stabilité des ARNm ? (levures, vertébrés)
Levures : 5 à 60 minutes.
Vertébrés : 20 minutes à 24h.
Quels sont les contrôles et dégradations effectués sur la qualité des ARNm ?
Controle NMD : vire les ARNm à codon STOP prématuré.
Contrôle par la séquence ARE, riche en “AU”
Dégradation par miARN et siARN.
Donner deux méthodes de dégradation des ARNm.
Déadénylation de la coiffe, ou déadénylation de la polyA entrainant dégradation par exonucléase.
Comment se fait la dégradation par contrôle NMD ?
Lorsque les ARNm sont matures, un complexe EJC se dépose sur les jonctions exon/exon, et est éliminé par le ribosome lorsqu’il fait son premier passage. Si codon stop prématuré, EJC reste et intéragit avec le ribosome pour faire un non-sens et être éliminé.
D’ou proviennent les siARN ?
Ils sont obtenus par maturation d’un ARN double brin coupé par un dicer (RNase) : leur séquence est complémentaire et antiparallèle à l’extrémité 3’ de l’ARNm a dégrader.