La transcription chez les bactéries (CC1) Flashcards
Comment peut-on influencer le niveau de transcription d’un gène ?
Avec la fixation de protéines activatrices ou inhibitrices à proximité des promoteurs.
Qu’a montré les expériences DNase I chez les bactéries ?
Que le site de fixation des facteurs de transcription se fait sur la région -50 et +20.
Qu’a montré l’expérience d’interférence chez les bactéries ?
Que les points de contacts importants de fixation sont en -35 et -10 (TATAbox), héxamères (6 pb).
Certains éléments de séquence affectent la force du promoteur en…
Affectant la formation du complexe ouvert, ou fermé.
Quelles sont les deux formes de l’ARN polymérase bactérienne?
La forme Core enzyme, composée de 5 sous unités.
L’holoenzyme, formée de la core enzyme ainsi que du facteur de transcription sigma70.
Quelle est la particularité de l’holoenzyme ?
C’est la seule configuration de la polymérase qui permet d’initier la transcription.
Quelles sont les sous unités de la polymérase core ?
α2, ββ’, ω
A quoi servent les sous unités ββ’ de la polymérase ?
Ils sont impliqué dans la catalyse.
A quoi servent la sous unité σ70 de la polymérase ?
C’est elle qui gère la spécificité de reconnaissance au promoteur.
A quoi servent la sous unité α2 de la polymérase ?
Permet la formation de la core enzyme, se fixe sur l’élément UP du promoteur.
Est-ce que il n’existe qu’un seul facteur sigma ? Expliquer.
Non, il y en a plusieurs : mais le sigma est le plus abondant, les autres sont activés dans des conditions particulières.
Décrire la fixation de l’ARN polymérase sur l’ADN.
La core enzyme devient holoenzyme et se fixe sur le promoteur grâce à sigma, formant un complexe binaire (Holo/promoteur) fermé.
Le complexe s’ouvre (ainsi que l’ADN) et se transforme en complexe tertiaire avec la formation de la chaine d’ARN.
Qu’est-ce qui permet à l’ARN polymérase de se déplacer le long de la chaine d’ADN ?
La dissociation du facteur sigma.
Après fixation de l’ARN pol que se passe-t-il ?
9-10 nucléotides sont synthétisés sans que l’ARNpol bouge, la bulle de transcription se forme : si l’amorce ARN n’est pas assz longue : abortive. Sinon, phase d’élongation.
Que se passe-t-il lors de la phase d’élongation de l’ARN ?
Le facteur sigma se détache : la polymérase se déplace, élongant la séquence d’ARN.
Quelle est la fonction des topoisomérases ?
Supprime les super tours négatifs.
Quelle est la fonction des ADN gyrase ?
Introduit des supertours négatifs.
Que se forme-il au niveau de la bulle de transcription ?
Un hybride ARN/ADN de 8 paires de bases.
En quoi la région entre -10 et -35 est si importante ?
Elle permet de positionner correctement les boites sur la même phase de l’hélice.
Que se passe-t-il lorsque l’ARN pol arrive au niveau d’un terminateur ?
Elle doit se détacher de l’ADN, et l’hybride ADN/ARN doit se dissocier en rompant les liaisons H.
Combien de types de terminateurs y a-t-il chez les bactéries ? Les citer.
Il y a deux types de terminateurs :
- Terminaison intrisèque (sans facteur supplémentaire)
- Terminaison Rho-dépendante : nécessite le facteur Rho.
Qu’induit un terminateur ?
Un terminateur est transcrit en une structure en “tige boucle” suivie d’un poly U au niveau de l’ARN, arrêtant la transcription au niveau du polyU.
Les deux modèles de terminaisons utlisent le même principe : quel est-il ?
Un changement allostérique de l’ADN polymérase.
Au niveau de l’ADN comment est composé un terminateur ?
Il s’agit de deux régions répétées et inversées, riches en GC, suivies d’une succession de T.
Quand se l’arrêt de l’ARN polymérase dans le mécanisme intrinsèque de terminaison ? Qu’est-ce que l’arrêt permet ?
L’ARN polymérase s’arrête jsute après la structure poly U, permettant la formation de l’épingle à cheveu.
En quoi l’épingle à cheveux permet l’arrêt de la transcription ?
Elle envahit le centre catalytique de la polymérase, induisant la dissociation de l’hybride ARN ADN.
Pourquoi l’ARN pol se détache lors de la terminaison intrinsèque ?
La structure en épingle à cheveux provoque un changement allostérique de la configuration de l’enzyme, entrainant son décrochage.
Le facteur Rho est un …mère.
Hexamère.
Est-ce que la fonction ARN/ADN hélicase est-elle ATP dépendante ou non ?
Oui, ATP dépendante.
Comment fonctionne le facteur Rho? Quand est-ce qu’il se trouve attaché à l’ARN pol ?
Il est attaché à l’ARN polymérase depuis le début de la transcription. Quand l’ARN est suffisemment long, le Rho tire l’ARN et entraine un changement allostérique de la polymérase.
