La transcription chez les bactéries (CC1)

Question 1

Comment peut-on influencer le niveau de transcription d’un gène ?

Answer 1

Avec la fixation de protéines activatrices ou inhibitrices à proximité des promoteurs.

Question 2

Qu’a montré les expériences DNase I chez les bactéries ?

Answer 2

Que le site de fixation des facteurs de transcription se fait sur la région -50 et +20.

Question 3

Qu’a montré l’expérience d’interférence chez les bactéries ?

Answer 3

Que les points de contacts importants de fixation sont en -35 et -10 (TATAbox), héxamères (6 pb).

Question 4

Certains éléments de séquence affectent la force du promoteur en…

Answer 4

Affectant la formation du complexe ouvert, ou fermé.

Question 5

Quelles sont les deux formes de l’ARN polymérase bactérienne?

Answer 5

La forme Core enzyme, composée de 5 sous unités.

L’holoenzyme, formée de la core enzyme ainsi que du facteur de transcription sigma70.

Question 6

Quelle est la particularité de l’holoenzyme ?

Answer 6

C’est la seule configuration de la polymérase qui permet d’initier la transcription.

Question 7

Quelles sont les sous unités de la polymérase core ?

Answer 7

α2, ββ’, ω

Question 8

A quoi servent les sous unités ββ’ de la polymérase ?

Answer 8

Ils sont impliqué dans la catalyse.

Question 9

A quoi servent la sous unité σ70 de la polymérase ?

Answer 9

C’est elle qui gère la spécificité de reconnaissance au promoteur.

Question 10

A quoi servent la sous unité α2 de la polymérase ?

Answer 10

Permet la formation de la core enzyme, se fixe sur l’élément UP du promoteur.

Question 11

Est-ce que il n’existe qu’un seul facteur sigma ? Expliquer.

Answer 11

Non, il y en a plusieurs : mais le sigma est le plus abondant, les autres sont activés dans des conditions particulières.

Question 12

Décrire la fixation de l’ARN polymérase sur l’ADN.

Answer 12

La core enzyme devient holoenzyme et se fixe sur le promoteur grâce à sigma, formant un complexe binaire (Holo/promoteur) fermé.
Le complexe s’ouvre (ainsi que l’ADN) et se transforme en complexe tertiaire avec la formation de la chaine d’ARN.

Question 13

Qu’est-ce qui permet à l’ARN polymérase de se déplacer le long de la chaine d’ADN ?

Answer 13

La dissociation du facteur sigma.

Question 14

Après fixation de l’ARN pol que se passe-t-il ?

Answer 14

9-10 nucléotides sont synthétisés sans que l’ARNpol bouge, la bulle de transcription se forme : si l’amorce ARN n’est pas assz longue : abortive. Sinon, phase d’élongation.

Question 15

Que se passe-t-il lors de la phase d’élongation de l’ARN ?

Answer 15

Le facteur sigma se détache : la polymérase se déplace, élongant la séquence d’ARN.

Question 16

Quelle est la fonction des topoisomérases ?

Answer 16

Supprime les super tours négatifs.

Question 17

Quelle est la fonction des ADN gyrase ?

Answer 17

Introduit des supertours négatifs.

Question 18

Que se forme-il au niveau de la bulle de transcription ?

Answer 18

Un hybride ARN/ADN de 8 paires de bases.

Question 19

En quoi la région entre -10 et -35 est si importante ?

Answer 19

Elle permet de positionner correctement les boites sur la même phase de l’hélice.

Question 20

Que se passe-t-il lorsque l’ARN pol arrive au niveau d’un terminateur ?

Answer 20

Elle doit se détacher de l’ADN, et l’hybride ADN/ARN doit se dissocier en rompant les liaisons H.

Question 21

Combien de types de terminateurs y a-t-il chez les bactéries ? Les citer.

Answer 21

Il y a deux types de terminateurs :

• Terminaison intrisèque (sans facteur supplémentaire)
• Terminaison Rho-dépendante : nécessite le facteur Rho.

Question 22

Qu’induit un terminateur ?

Answer 22

Un terminateur est transcrit en une structure en “tige boucle” suivie d’un poly U au niveau de l’ARN, arrêtant la transcription au niveau du polyU.

Question 23

Les deux modèles de terminaisons utlisent le même principe : quel est-il ?

Answer 23

Un changement allostérique de l’ADN polymérase.

Question 24

Au niveau de l’ADN comment est composé un terminateur ?

Answer 24

Il s’agit de deux régions répétées et inversées, riches en GC, suivies d’une succession de T.

Question 25

Quand se l’arrêt de l’ARN polymérase dans le mécanisme intrinsèque de terminaison ? Qu’est-ce que l’arrêt permet ?

Answer 25

L’ARN polymérase s’arrête jsute après la structure poly U, permettant la formation de l’épingle à cheveu.

Question 26

En quoi l’épingle à cheveux permet l’arrêt de la transcription ?

Answer 26

Elle envahit le centre catalytique de la polymérase, induisant la dissociation de l’hybride ARN ADN.

Question 27

Pourquoi l’ARN pol se détache lors de la terminaison intrinsèque ?

Answer 27

La structure en épingle à cheveux provoque un changement allostérique de la configuration de l’enzyme, entrainant son décrochage.

Question 28

Le facteur Rho est un …mère.

Answer 28

Hexamère.

Question 29

Est-ce que la fonction ARN/ADN hélicase est-elle ATP dépendante ou non ?

Answer 29

Oui, ATP dépendante.

Question 30

Comment fonctionne le facteur Rho? Quand est-ce qu’il se trouve attaché à l’ARN pol ?

Answer 30

Il est attaché à l’ARN polymérase depuis le début de la transcription. Quand l’ARN est suffisemment long, le Rho tire l’ARN et entraine un changement allostérique de la polymérase.