Régulation Transcriptionelle (CC2) Flashcards
De quoi dépend l’expression d’un gène ? (2 facteurs)
Dépend du contexte chromatinien : accessibilité du promoteur, chromatine active ou inactive.
De la présence de TFs au niveau du promoteur.
A quoi sert l’analyse fonctionelle ?
Permet de mettre en évidence le produit de la transcription du gène : l’ARN.
Définir insulateur.
Région de l’ADN reconnue spécifiquement par un facteur qui définit un domaine dans la chromatine, en empêchant la propagation de l’hétérochromatine ou en isolant un enhancer.
Définir enhancer.
C’est une région de l’ADN reconnue spécifiquement par des TF et associé à des marques de chromatines caractéristiques. Il peut stimuler le promoteur indépendamment de sa position par rapport au gène.
De quoi est fonction l’expression de gènes ?
du taux des facteurs de la transcription dans la cellule et de l’équilibre entre activateur et répresseur.
Qu’est-ce que l’interactome ?
C’est lassociation de protéines avec l’ADN génomique.
Qu’est-ce que l’épigénome ?
C’est l’ensemble des modifications chimiques de la chromatine capable de moduler l’expression des gènes.
Qu’est-ce que le transcriptome ?
Le contenu en ARN d’une cellule.
Comment analyser l’interactome et l’épigénome ? Comment analyser le transcriptome ?
On utilisera CHIP pour l’interactome et l’épigénome. en revanche pour le transcriptose on va utiliser des puces à ARN.
On peut utiliser un séquencage pour les trois.
Qu’est-ce que l’on appelle les facteurs de transcription maîtres ?
C’est un petit nombre de TF plus abondants par rapport aux autres qui suffisent à mettre en place un programme d’expression de gènes spécifiques d’un type cellulaire
Qu’est-ce que des gènes de ménages ?
Ce sont les gènes opposés aux gènes spécifiques : ils sont exprimés dans tous les types cellulaires.
Définir gène spécifique.
Gène exprimés plus abondamment dans un type ou un nombre limité de types cellulaires.
Comment peut on induire une reprogrammation des cellules ?
On fait une augmentation artificielle du taux intra cellulaire de facteurs maitres.
Qu’est-ce que les modifications épigénétiques ?
Elles permettent d’obtenir des phénotypes différents alors que les cellules sont génétiquement identiques.
Quelles sont les trois catégories de modifications épigénétiques ?
Méthylation de l’ADN
Modification des histones
Remodelage de la chromatine ou positionnement des histones.
Est-ce que les modifications épigénétiques sont héritées entre les cellules ?
On suppose oui !
Quelles sont les marques caractéristiques de la chromatine inactive ou active ?
La présence de modifications covalentes des histones ou de l’ADN.
Comment peut on détecter les marques de la chromatine active ou inactive au niveau du génome ?
On utilise la technique de l’immunoprécipitation de la chromatine en présence d’anticorps spécifiques d’un type de modification.
Quelle extrémité d’un histone est flexible et accessible ?
L’extrémité N terminale.
Quels acides aminés peuvent être modifiés ?
KRYST.
Quelle est la nature des modifications des acides aminés ?
Acetylation Methylation Ubiquitination Phosphorylation Sumorylation ADPribosylation
Par quoi sont faites les modification des aa, et sont-elles réversibles ?
Elles sont mises en places par des enzymes et elles sont effectivement réversibles.
Pour une méthylation de Lysine : Quelle enzyme la produit, quelle enzyme l’efface, quelle protéine la lit ?
Produit : KMT
Efface : Lysine Demethylase
Lit : Protéine à Chromodomaine.
Pour une acetylation de Lysine : Quelle enzyme la produit, quelle enzyme l’efface, quelle protéine la lit ?
Produit : KAT
Efface : HDAC
Lit : Protéine à Bromodomaine.
Qu’indique une acetylation de lysine ?
Perte de charge + : chromatine se relâche, indique que le gène est actif.
Qu’est-ce qu’une HAT ?
histone acétyltransférase, qui acetyle les histones et donc active la transcription du gène.
A quoi sert lncRNA ?
Permet de recruter un complexe enzymatique qui méthyle les histones.
Pour une méthylation de cytosine : Quelle enzyme la produit, quelle enzyme l’efface, quel effet sur les gènes ?
Produit : DNMT
Efface : Déméthylase
Inhibe les gènes.
Décrire le mécanisme d’acton des IncRNA dans la régulation de l’expression des gènes.
1) Signal : indique els régions du chromosme à réprimer
2) Titrage d’un TF qui inhibe l’expression des gènes cibles.
3) Forme une cible pour les facteurs impliqués dans la modification de la chromatine.
C’est quoi LncARN ? Quel est un de ses rôles concrets chez les mammifères ?
C’est un ARN long et non codant.
Son rôle est par exemple d’inactiver l’un des chromosomes X dans les cellules femelle de mammifères.
