Traduction bactérienne Flashcards
Quel est le mécanisme élaboré nécessaire au bon démarrage de la traduction ?
Ce mécanisme assure l’association de
l’ARNm à la petite sous-unité (16S) et le positionnement du premier codon AUG du cadre de
lecture, appelé codon de démarrage, au site P.
Comment se fixent les facteurs IF-1 IF-2 et IF-3 ?
IF1 : se fixe sur A de 30S. Régule IF2 et 3.
IF2 : s’associe au GTP. Permet l’association des deux SU ribosomiques par une activité GTPase, régulant l’entrée de l’ARNt.
IF3 : empêche l’association des deux SU 30S et 50S.
Pourquoi est-ce que les facteurs IF1 et IF3 sont dit “de démarrage” ?
Parce que ils se fixent directement à la petite sous unité, empêchant la fixation prématurée et improductive de la grande sous unité.
Comment se fixe le ribosome sur l’ARNm ?
Reconnait la séquence Shine & Dalgarno et s’y fixe par appariement de bases complémentaires.
Que se passe-t-il en même temps que l’ARNm est fixé par le ribosome ?
Le premier ARNt, portant une N formyl métho entre dans le complexe avec un IF-2-GTP. L’ARNt se fixe à AUG et libère IF3, causant la grande SU qui s’associe avec la petite. GTP->GDP, libérant IF1 et IF3.
Pour quoi code le codon initiation AUG ?
Pour une N-formyl-methonine portée par l’ARNtf-met. IF-2 reconnait alors spécifiquement le complexe f-met-ARNtf-met et lentraineau niveau du site P.
Quelles sont les trois phases constituant l’élongation de la traduction ?
1) Positionnement de l’aa-ARNt.
2) Formation d’une liaison peptidique entre les AA
3) Translocation du ribosome.
Par quoi est assuré le positionnement correct de chaque nouvel ARN-t avant d’entamer l’élongation ?
Par un facteur d’élongation EF-Tu.
Que se passe-t-il jusqu’a ce que l’ARNt se trouve sur le site A ?
Il y a de nombreux échanges d’ARNt jusqu’a ce que le bon se retrouve sur le site A. Puis, EF-Tu se détache quand GDP s’attache à EF-Tu.
Le facteur EF-Tu est viré grâce à la fixation de GDP dessus qui le rend inefficace. Comment le récupérer ?
Via un facteur Ts de recyclage, qui possède une plus grand affinité et se fixe à la place du GDP. Puis, GTP chasse le TS.
Par quelle SU est catalysée la liaison peptidique ?
Par la SU 23S
Qu’est-ce que la translocation ?
La grande SU glisse sur la petite, puis la petite se déplace de 5’ vers 3’ : le ribosome se déplace de 3 nucléotides, et le codon suivant entre dans le site A.
Résumer la traduction dans l’ordre.
1) IF1 et 3 se fixent à la SU, initiation.
2) positionnement correct de l’aa-ARNt.
3) formation de la liaison peptidique par 23S
4) translocation sur codon suivant
5) facteur de libération : transfert sur H2O et libération.
