Traducción Flashcards
Como es la lectura?
inicia desde el extremo 5’ hacia el extremo 3’ del ARNm, permitiendo el crecimiento de la cadena desde el residuo amino
terminal hacia el carboxilo terminal.
Componentes requeridos para la síntesis proteica
- ARNm
- ARNt
- Energía en forma de ATP y GTP
- Enzimas
- Factores proteicos
- AA
Cual es el codon de inicio bacteriano y eucariota
BACTERIAS:
1. 5’-AUG-3’
- 5’-GUG-3’
- A veces 5’-UUG-3’
EUCARIOTAS
1. 5’-AUG-3
Codones de terminación
- 5’-UAG-3’
- 5’-UGA-3’
- 5’-UAA-3’
ORFs eucariotas vs procariotas
E: un solo ORF (monocistrónicos)
P: dos o más ORF, por ende pueden codificar varias cadenas polipeptídicas (mRNA policistrónicos)
Como se llama el sitio de unión al ribosoma en procariotas vs eucariotas?
P: Secuencia Shine-Dalgamo
E: Secuencia Kozak
Cual es una modificacion que los eucariontes tienen para facilitar la traducción?
Capuchón 5’, ubicada en la punta del extremo 5’ del mRNA
Cuando el ribosoma se une a este mRNA modificado, comienza a desplazarse a lo largo del mRNA en dirección 5’—>3’, buscando el codón de inicio de la traducción = RASTREO
Dos características adicionales de eucariotas que promueve la traducción?
- Una purina 3 bases corriente arriba del codón de inicio y una guanina justo corriente abajo 5’ =
5’-G/ANNAUG/G-3’ - La presencia de una cola de poli-A en la punta del extremo 3’ del mRNA,
potencia el reclutamiento de factores de iniciación
Qué es el código genético?
un diccionario que identifica la correspondencia entre una secuencia de tres pares de bases con un AA en especifico.
Combinaciones de los 20 AA que conforman las proteínas
combinación de (4exp3) = 64 combinaciones
(tripletes)
+ 61 de los cuales codifican para aminoácidos
+ 3 corresponden a las
secuencias terminadoras.
4 características del código genético
- Se emplea en TODOS los organismos vivos.
- Es ESPECÍFICO, un codón (triplete) siempre codifica el mismo aa (secuencia de
codones conservada) - Es UNIVERSAL, se ha conservado y solo existen pequeñas diferencias en la forma de lectura
- NO SE SOBREPONE y es de LECTURA CONTINUA, ejemplo: ABCDEFGHIJKL es igual a ABC/DEF/GHI/JKL
Cual es la mutación?
Mutaciones que producen cambios de base únicos pero no producirán un
cambio en la secuencia de la proteína
Mutación sinónima o silente
Cual es la mutación?
mutaciones que producen una sustitución de aminoácidos
Mutación no sinónima o de sentido erróneo
Cual es la mutación?
provocan cambios que generen un triplete de
término
Mutación de pérdida de sentido o sin sentido
Cual es la mutación?
Repetición en tandém de tripletes
Mutaciones de triplete de repetición
Cuales son unas enfermedades de las mutaciones de triplete de repetición?
- Huntington = repetición de CAG-Glutamina
- síndrome de X frágil = repetición de CGG-arginina
- distrofia miotónica = repetición de CUG-leucina
Cual es la mutación?
Modifican la forma de eliminación de los intrones, generando proteína aberrantes.
Mutaciones del sitio de corte y empalme
Cual es la mutación?
Se generan por efecto de la adición o eliminación de nucleótidos
Mutaciones por desplazamiento de marco de lectura
Qué son los AA?
Elementos que se requieren para construir la proteína, se requieren en cantidades suficientes para elaborarla y estos se obtienen de la dieta
Qué es el ARN mensajero?
Molde (secuencia de nucleótidos) que se requiere para la síntesis de la proteína
Qué es el ARN de transferencia?
Son las moléculas ADAPTADORAS, se requiere una para cada tipo de aminoácido.
Características de ARNt
- al menos 50 en humanos
- estructura secundaria en
forma de trébol - Tallo aceptor, tres tallos-asas y una asa variable
Nombres de los tres tallos asas
- asa ϕU
- asa D
- asa anticodón
Tallo aceptor
el sitio de unión del aminoácido, se forma
por apareamiento entre los extremos 5’ y 3’ de la molécula de tRNA
asa ϕU
se llama así por la presencia característica de la base inusual ϕU en el
asa. La base modificada suele hallarse dentro de la secuencia 5’-TϕUCG-3’.
asa D
recibe su nombre por la presencia característica de dihidrouridinas.
asa anticodón
contiene el anticodón, el anticodón está delimitado en el extremo 3’ por una purina y en su extremo 5’ por un uracilo
asa variable
se sitúa entre el asa anticodón y el asa ϕtJ, su tamaño oscila entre 3 y 21 NC.
Pasos de la catálisis del ARNt
- adenilación: ATP + aminoácido → aminoacil-AMP + PPi
- carga del ARNt: aminoacil-AMP + tRNA → aminoacil-tRNA + AMP
Cual es la primera regla de la hipotesis de bamboleo (wobble)?
Las bases 3ra y 2da del anticodón forman puentes de hidrógeno con
las bases 1ra y 2da del codón, lo que determina la especificidad de la
interacción codón/anticodón.
Cual es la segunda regla de la hipotesis de bamboleo (wobble)?
La primera base del anticodón puede orientarse o girarse de formas
ligeramente distintas (bamboleo o fluctuación), para interaccionar con distintas bases en la posición tercera del codón.
En qué parte ocurre la hipótesis de bamboleo?
entre la tercera base del codón y la primera base del anticodón
Subunidades del ribosoma
Mayor: 60S
Menor: 40S
RNA que constituyen el nucleo estructural de los ribosomas eucarioticos
- rRNA 5S
rRNA maduros - 28S
- 18S
- 5.8S
Como se nommbran los RNAr y las proteinas?
RANr = Con su coeficiente de sedimentación (valores S - Svedberg)
Proteinas = con números precedidos por L (large) o S (small), según pertenezcan a la subunidad mayor o menor.
Ubicación de proteínas
el citosol, matriz mitocondrial y RE, donde pueden estar en forma libre o discreta pero generalmente se observan como hileras agrupadas sobre un RNAm y en este caso son llamados polisomas/poliribosomas.
Rol de subunidad mayor vs menor
Mayor: se encarga de la formación de enlaces peptídicos
Menor: se encarga de leer la emparejar adecuadamente las bases del codón (ARNm) y el anticodón (ARNt)
Sitios A, P y E del ribosoma
Sitio A: Lugar donde se unirá el RNAt que llega según lo determine el codón
Sitio P: Lugar ocupado por el peptidil RNAt, permite cargar la cadena polipeptídica
en crecimiento.
Sitio E: Lugar que ocupa el RNAt vació que esta por salir del ribosoma.
Qué son los factores protéicos?
proteínas necesarias para realizar las diferentes etapas de la traducción: inicio, elongación, terminación, con funciones ya sean catalíticas o estabilizadoras
Energía necesaria para agregar AA a cadena polipeptídica
- 4 enlaces de alta energía (ATP) = 2 usados por la sintetasa de aminoacil-ARNt, otro para eliminación de PPi y otro para la hidrólisis de PPi por la pirofosfatasa
- 2 GTP = uno para la unión del aminoacil-ARN-t al sitio A y otro para el paso de translocación (sitio A-sitio P).
Qué constituye la activación de AA?
realizado por la sintetasa de aminoacil-ARNt, generando un aminoacil ARNt cargado con su aminoácido especifico.
Pasos del inicio procariota
- Reconocimiento del codón de inicio AUG.
- Formación del complejo traduccional.
- Formación del primer enlace peptídico.
- Unión de la subunidad menor del ribosoma al ARNm con la asistencia de los factores de iniciación - IF (3 en procariotas y al menos 12 en eucariotas).
Cuantos IFs se usan en el inico en procariotas
3
1. IF1
2. IF2
3. IF3
Rol del IF1
impide que los tRNA se unan a la porción de la subunidad menor que se convertirá en parte del sitio A
Rol del IF2
+ GTPasa que interacciona con tres componentes fundamentales de la maquinaria de iniciación: la subunidad menor, el
IF1 y el tRNA iniciador cargado
+ facilita la asociación del fMet-tRNA con la subunidad menor e impide que otros tRNA cargados se asocien con ella
Rol del IF3
Se une a la subunidad menor y la bloquea contra su reasociación con la
subunidad mayor o contra la unión a tRNA cargados
En que constituye el ultimo paso de la iniciación?
la asociación de la subunidad mayor para
crear el complejo de iniciación 70S
Pasos del inicio eucarióta
- tRNA iniciador se une primero a la subunidad menor del ribosoma antes de asociarse con el mRNA.
- Un conjunto de factores auxiliares diferentes ayuda a reconocer el mRNA
- La subunidad menor del ribosoma, junto con el tRNA iniciador, examina el mRNA para encontrar la primera secuencia AUG (este proceso se llama rastreo).
- La subunidad mayor del ribosoma se une después de que el tRNA iniciador se aparea con el codón de inicio.
Qué factores de inicio se unen a la subunidad menor del ribosoma
elFI, elFIA, eIF5
estos impiden tanto la unión de la subunidad mayor como la fijación del tRNA al sitio A.
rol del elF2
acompaña al tRNA
iniciador a la subunidad menor. Al igual que el IF2, el eIF2 solo se une al tRNA
iniciador en el estado unido a GTP.
