th 13 gen ; 3eme cours

Question 1

PCR
1est une abréviation de quoi (QE+++)
2 role
3* necessite (6);
4décrire les étapes
5citer les étapes;
6* applications (+++)

Answer 1

1* reaction de polymerisation en chaine
2* obtenir un nbre elevée des sequences d’ADN
3* ADN genomique //Taq polymerase//DNTP //2amorces //MgCL2//tampon

4*decrire
1)denaturation de l’ADN à T= 93-96°C
2)hybridation des amorces à T=54-60°C
3)élongation du chaine d’ADN à T=72°C

5* citer
1)denaturation de l’ADN
2)hybridation des amorces
3)élongation du chaine d’ADN

*genotypage / sequençage / maldies hereditaire

Question 2

à propos des amorces , préciser ;
*localisation
*nbre de nucleotides
*sens ;
*conditions de fabrication;
*APPlications (++++)

Answer 2

*localisation ; en amont ou en aval de la region d’ADN à amplifier
*nbre de nucleotides ; 20
*sens ; tjrs de 5’–>3’
*conditions de fabrication;
- abscence de complementarite entre couple d’amorce
- de meme Temperature d’hybridation
*app; sequençage //PCR

Question 3

QE 2021 +++++++++ !!!!!!!
concernant les reactif de PCR preciser le role de chacune entre eux

Answer 3

*Taq polymerase ; meme role de l’ADN polymerase “ élongation d’une sequence
*tampon ; maintient un Ph stable et optimal à l’action de l’enz
*dNTP ; utiliser par l’enz por elonger les amorces
*amorces ; support sur le quel se fixe l’enz et contenu l’elongation
*MgCl2; cofacteur necessaire à l’action de l’enz

Question 4

+++++++ a repeter !!!!!
sothern blot (QE++++)
* role
*etapes;

Answer 4

*
- mise en evidence des polymorphismes RFLP
- determiner l’expression (presence) d’un seul gene dans l’echantillon

*1) digestion d’ADN par des enz de restriction
2)faire une electrophorese sur gel
3)transfert sur une membrane
4)hybridation avec une sonde (qui contient deja la brin complementaire
5) detection du signal par autoradiographie !!!

Question 5

QE 2021 !!!!!!++++++++++++++
sequençage de sanger
* role
*etapes;
* visualisation

Answer 5

*
*utilisation de ddNTP qui diffèrent des dNTP par
l’absence d’un groupement OH en position 3’.

+Cette modification empêche la formation de la liaison phosphodiester entre le ddNTP incorporé dans la chaîne et le nucléotide suivant.
+synthèse du brin d’ADN s’arrête.

• sous forme des pics de couleur

Question 6

puces à ADN;
* role
*etapes;
* APP (QE+++++)

Answer 6

*
1) extraction d’ARNm
2)transcription inverse d’ARNm en ADNc
3) marquage par fluorescence des fragements d’ADNc
4) Hybridation des fragements marqué avec les puces( contient déja les fragements que en recherche à faire la complementarité avec)

*
- analyse des transcriptomes(ensemble des ARNm dans le génome)
- classification tumorale

Question 7

pour chaque technique , preciser son role;
* sothern blot (QE ++++++++)
* puces à ADN
*PCR
*clonage
* sequençage
*genotypage
*electrophorese ;

Answer 7

• sothern blot;
  -determiner l’expression (presence) d’un seul gene dans l’echantillon
  - mise en evidence des polymorphismes RFLP
• puces à ADN;
  -determiner l’expression (presence) d’une groupe de gene dans l’echantillon
  - detection les =! types des ARNm dans le genome( “ transcriptome “) §!!!

*PCR ;
- amplification du sequence d’ADN
- obtenir un nbre elevée des sequences d’ADN

*clonage ;
- obtenir un nbre elevée des sequences d’ADN
- amplification du sequence d’ADN

• sequençage ;
  
  • determiner l’ordre des Nt
  • mise en evidence des polymorphismes SNP

*genotypage; suivre indirectement la transmission d’une allele de maladie à l’aide d’un marqueur

*electrophorese ; determiner taille de la sequence

Question 8

quel est la regle pour determiner le nbre de repetition (genotype)

Answer 8

nbre de repetition=
(taille de la bonde - partie cte)/(nbre de NT du motif repeter)

Rq:partie cte = taille bande modéle -partie variable

Question 9

clonage ;
* roles(3)

Answer 9

• augmenter nbre des fragements d’ADN
  *permet d’exprimer une information genetique
• permet d’amplifier une sequence d’ADN

Question 10

amplification de l’ADN se fait par 2 methode :

Answer 10

• clonage
  *PCR

Question 11

les données extraire de chaque type de carte (physique et genetique

Answer 11

*physique ; allignement lineaire des genes sur chr “bras court/brs long”
*genetique; position relative des genes sur chr “locus”

Question 12

les methodes utilisées pour faire chaque type de carte (physique et genetique)

Answer 12

*physique;
—- hybridation
—- dosage genetique (monosomie- trisomie)

• genetique ;
  —lod score
  — analyse de liaison par homozygothie mapping

Question 13

donner intervalle de lod score ;

Answer 13

Z> 3 —-> il ya une liaison
Z<-2 —->pas de liaison
-2<Z<3 —->hesitation “ il faut augmenter le nbre des familles ou de marqueurs “

Question 14

comment on determine le taux de recombinaison dans le cas ;
*d’un arbre
*d’une situation statiqtique

Answer 14

*d’un arbre
taux de recombinaison =
(nbre de recombinaison ) / nbre tot des descendants

*d’une situation statiqtique ; =R/(R+P)

—-> ce sont les meme , juste por te rememoriser ;)

Question 15

definir haplotypes et donner par quel methode on peut le trouver

Answer 15

haplotypes , est un groupe des genes sur des locis different mais tres proche sur un meme chr , à le tendance d’etre transmis tel quel est ;

—> homozygotie mapping

Question 16

decrire un marqueur (moleculaire) (QE+++)
*def
*utilisation

Answer 16

*def ;
sequence d’ADN qui differe d’in individu à un autre dans la population

• utilisation ; distinguer les =! formes alleliques à un locus donnée

Question 17

on etudie une proteine de synthese seulement pancreatique , peut on faire cette etudie sur L’ADNc du foie ou de GR

QE+++++

Answer 17

non, car cette pro est de synthese seulement pancreatique , donc leur ADN se trouve dans tous les cellules nuclees de l’organisme mais leur ARNm ne se trouve que dans les cellules pancreatique

N.B; l’ADNc est obtenue à parit de la transcriptase reverse apliquer à L’ARNm

Question 18

Citer une méthode ou technique permettant d’analyser le transcriptome

Answer 18

puces à ADN