Tema 9 Flashcards
¿Cuales son los procesos que participan en la regulación de la expresión genica? ¿Y el mas importante?
Iniciacion de la transcripcion (+ importante), proceso de post transcripcion, la estabilidad del RNAm, la traduccion, la modificacion de proteinas, su degradacion y el transporte.
¿De que depende la regulacion de la transcripcion?
De la eficacia de uniones DNA-proteina y entre proteinas
¿Que son los genes constitutivos?
Genes que se requieren en todo momento y se exprean en un nivel constante
¿Que son los genes regulados?
Genes en los que el nivel de expresión varía segun las necesidades del organismo. Puedes ser inducibles o reprimidos
¿Como se regula el inicio de la transcripcion?
Se regula la union entre la RNA pol y el promotor del DNA mediante factores de transcripcion que se unen a secuencias reguladoras y pueden ser activadores o represores.
¿Cuáles son las secuencias reguladoras en el promotor?
Las secuencias TATA que se unen al factor sigma de la RNA pol y los elementos UP de algunos promotores (subunidades alfa)
¿Cómo se regula la transcripción en bacterias?
El uso del factor sigma, que reconoce distintas clases de promotores y permite la expresión de colecciones de genes, y el uso de factores generales de transcripcion, que permiten la expresion de genes especificos y se puede alterar su afinidad con el DNA mediante modificaciones post traduccion o union de efectores
¿Efectores?
Moleculas pequeñas que se unen a factores de transcripcion provocando un cambio conformacional y alterando su union a secuencias reguladoras. Pueden ser activadores o represores.
Represores.
Reducen las interaccion promotor-RNA pol o bloquean las pol directamente. Se unen a operadores del DNA que en bacterias estan cerca de el sitio de inicio pero en eucariotas pueden estar alejados y se llaman sileciadores. SOn muy frecuentes en bacterias.
Regulacion negativa
Implica represores. Hay dos formas:
- El efector se une al represor que aumenta su afinidad con el DNA y detiene la transcripcion.
- El efector se une al represor que induce su separacion del DNA y se induce la transcripción
REgulacion positiva
Implica los activadores y aumentan la actividad de la RNA pol. Dos formas:
- El activador esta unido al DNA y se esta haciendo la transcripcion, cuando el efector se une al activador, este se disocia del DNA y se inhibe la transcripcion.
- El activador se une al efector y se realiza la transcripcion. Cuando el efector se disocia, el activador tambien lo hace y detiene la transcripcion
¿Como puede un activador unido a un potenciador alejado del promotor, facilitar la transcripcion?
Debido a que existen reguladores arquitectonicos que crean estructuras tipo lazo y aproximan el potenciador al promotor, y su interaccion esta mediada por un coactivador.
¿Que son los corrguladores?
Son proteinas que no se unen al DNA directamente sino que se une a factores de transcripcion y pueden ser coactivadores o correpresores
Puentes de hidrogeno entre DNA y proteinas
Se producen en el surco mayor porque hay suficiente espacio. La Gln y Asn se pueden unir a la adenina y la Arg se puede unir a la guanina
Dominios de proteinas de union al DNA
Helice-giro-helice, dedos de cin, cremallera de leucinas
¿Que es un operon?
Es un grupo de genes que comparten promotor y secuencias reguladoras. Se da en bacterias ya que tienen RNAm policostronico
Operon lac
Codifica genes para el metabolismo de la lactosa y esta sujeto a regulacion negativa:
Beta galactosidasa. Hidroliza lactosa
Galactosido permeasa. Transporta lactosa a la celula
Tiogalactosido transacetilasa.
Gen lacL
Codifica el represor lac. Tiene su propio promotor y su transcripcion es independiente de las enzimas que regulan el represor. Puede unirse a tres operadores pero frecuentemente se une al mas cercano al promotor, previniendo la union de la RNA pol al promotor. Tambien puede unirse a un operador secundario y el DNA forma un lazo entre el O1 y el secundario,reduciendo la transcripcion pero sin inhibirla por completo
¿Qué es la alolactosa?
Es un isomero cuya reaccion de isomerizacio es catalizada por la beta galactosidasa y que provoca la disociacion del represor del operador a concentraciones altas igual que hace la lactosa.
¿Qué otro mecanismo de regulacion existe en el operon lac?
regulacion por represion por catabolito, en este caso la glucosa (control positivo)
¿Qué pasa si abunda la glucosa (operon lac)?
Los genes del operon lac se encuentran reprimidos
¿Qué sucede si falta glucosa (operon lac)?
La proteinas CRP unida a AMPc se une cerca del promotor, estimula la transcripcion y el DNA se enrolla alrededor de este complejo, formando el complejo abierto para la transcripcion. Este no puede formarse sin la union de CRP-AMPc, que se asocia cuando no esta el represor Lac. El AMPc solo se sintetiza si la concentracion de glucosa es baja.
¿Qué sucede si falta lactosa (operon lac)?
Si no hay lactosa disponible, independientemente de cual sea la concentracion de glucosa. Los genes permaneceran reprimidos. No comenzara la transcripcion incluso si el CRP-AMPc esta unido
¿Que pasa si abunda lactosa (operon lac)?
La transcripcion dependera de los niveles de glucosa. EL represor se disocia pero la transcripcion se estimulara solo con aumento de AMPc.