Tema 3 Flashcards
Definición de un gen
Una secuencia de nucleótidos que codifica un gen o proteína
¿El DNA es más grande que la célula que lo alberga? ¿Si sí, cómo lo contiene?
Sí, es muy largo. Lo alberga gracias a su superenrollamiento y su posterior asociación a proteínas
¿Qué determina la función de una proteína?
La estructura primaria/secuencia de aminoacidos
Características material genético de virus
Puede ser circular o lineal, RNA o DNA, cadena doble o sencilla.
Puede cambiar de circular a lineal en el ciclo replication y viceversa
Esta envuelto por una capsida proteica
¿Por qué el número de genes es menor en virus que en una célula?
Porque utilizan el genoma del huésped y lo único que hacen es reproducirse
Características del genoma bacteriano
Es de doble cadena y circular, y existen Plásmidos fuera del nucleoide:
Se intercambian fácilmente entre bacterias
Pueden albergar genes contra antibióticos y pueden adquirirlos al intercambiar mat. Genético
Características del genoma de eucariotas. Genoma Humano
Se organiza en cromosomas lineales y el número varía según la especie.
El humano tiene 46 cromosomas. 22 pares + cromosomas X e Y
La longitud de cada pareja de cromosomas puede variar
¿El tamsno del genoma y el número de genes está relacionado con la complejidad del organismo?
No, debido a que la mayoría del genoma no se transcribe ni se traduce a proteínas
Características de DNA en mitocondrias y colroplastos
DNA circular de doble cadena.
DNA mitocondrial
Codifica RNAt, RNAr y algunas proteínas propias, pero la mayoría son codificadas por genes nucleares
Proyecto Genoma Humano
Objetivo: Determinar la secuencia completa del genoma humano. Se creyó completado en 2003 pero faltaba un 8%. Se completó en 2021 y concluyó en que el genoma humano era idéntico en todos al 99,9%
Contiene millones de polimorfismos en el que difiere un solo nucleótido y esto es responsable de la diversidad genética
Tipos de secuencias en DNA humano
Secuencias únicas, repeticiones de secuencia simple, secuencias repetitivas largas(centrómeros y telomeros), trasposones e intrones.
Secuencias de repetición simple.
Se repiten un número distinto de veces en cada individuo, permiten realizar pruebas de paternidad o usarse en criminalistica. También se llaman DNA satelite
Secuencias unicas
Codifican proteínas (1,5%) -> Exones ¦ o RNA (11,6%)
Intrones
Secuencias que se transcriben pero no se traducen a aminoácidos. Se eliminan del transcrito primario y los Exones unidos entre sí Dan el transcrito maduro
¿Existen intrones en bacterias?
Sí, en el 25% de la bacterias. Son secuencias que codifican genes para RNAt. Muchos codifican RNA ctaliticos que permiten realizar la transcripción inversa
Trasposones
Son secuencias que pueden moverse a través del genoma, por medio de regiones repetidas complementarias al DNA diana en el que se va a insertar. Están presentes en todas las formas de vida y en virus, y constituyen el 50% del genoma.
Centrómeros
Sitios de unión de la proteína que une los cromosomas con los microtubulos del huso mitotico después e la replicación y antes de la división celular. Ayudan a la distribución equitativa del mat.genetico en las células hijas y tiene regiones ricas en A y T
Telomeros
Secuencias repetidas de: TG en el 5’ y CA en el 3’. No se replican como el DNA normal, se necesita la telomerasa presente en células germinales. Se acortan tras cada replicación y la célula entra en un período de senescencia. Una célula somática puede replicarse hasta 52 veces
¿Qué debe permitir el superenrollamiento?
Debe permitir el empaquetamiento del DNA e la célula y el acceso de las proteínas que deben leer la secuencia de nucleótidos
¿Cómo se produce el superenrollamiento?
Se produce cuando una hélice de DNA se enrolla sobre sí misma en procariotas y eucariotas
¿Cómo se llama al DNA si no está enrollado?
DNA relajado
Efecto de la replicación y la transcripción en el superenrollamiento
La separación de las hebras provoca una tensión adicional debido a la falta de libertad de rotación
¿Qué e el Lk?
Número de enlace topologico. Veces en las que dos cadenas se enrollan entre sí.
N°de pb/n° de pb por vuelta
¿Qué pasa con el Lk si cortamos el DNA?
Que no vale porque existe libertad de rotación
Superenrollamiento positivo y negativo. ¿Cuál tiene EL B - DNA?
Positivo hacia la derecha, negativo hacia la izquierda. El DNA tiene un superenrollamiento negativo
¿De qué depende el Lk?
De la torsión Tw (vueltas del DNA relajado) y el retorcimiento Wr (vueltas del superenrollamiento
Topoisomerasas
Enzimas que cambian el Lk rompiendo enlaces fosfodiéster. Tiene actividad endonucleasa y ligasa y son importantes en la replicación, transcripción y el empaquetamiento del DNA
Tips de topisomerasas
Tipo 1. Realizan un corte transitorio en una hebra, pasan la intacta entre el corte y vuelve a unir los extremos. Incrementos de 1.
Tipo y. Cortan las dos hebras de forma transitoria. Incrementos de 2
¿Qué produce la inhibición deg las Topoisomerasas?
Impide la replicación, transcripción y el empaquetamiento del DNA -> muerte celular
Inhibidores de Topoisomerasas en bacterias
Cumarinas. Afectan al tipo 2 impidiendo su unión con el ATP
Quinolonas. Impiden la religacion de los cortes. Mayor selectividad por Topoisomerasas bacterianas
Inhibidores de Topoisomerasas humanas
Camtoptecina. Atrapan el complejo DNA-enzima impidiendo la unión de los cortes
Adriamcina(Doxorrubicina). Afectan al tipo 2
¿Asociación con proteínas en virus, bacterias y eucariotas?
En virus se asocia con proteínas de la capsida
En bacterias con proteínas del nucleoide
En eucariotas con proteínas para formar la cromatina
Cromatina
Formadas por fibras de DNA, RNA, y proteínas. DNA se asocia íntimamente con histonas
Histonas
Proteínas sobre las que se enrolla el DNA. Sufren abundantes modificaciones post traducionales y afectan a la carga neta, las propiedades estructurales y la forma de la cromatina
En la Cromatina, ¿hay proteínas a parte de histonas)?
Sí, mantienen la estructura del cromosoma y regulan la expresión génica
Nucleosomas “Collar de perlas”
El DNA se enrolla sobre un octamero de histonas. Dos de cada tipo:H2A, H2B, H3, H4. El DNA envuelve el octamero en una superhelice levógira de tipo solenoide de 1, 67 vueltas. El DNA que une nucleosomas está asociado con histonas H1 y las colas amino terminales de las histonas confieren sitio de modificación covalente y contactos entre nucleosomas
Superenrollamiento negativo DNA en el nuclesoma
La hélice levógira del DNA alrededor de los nucleosomas induce un superenrollamiento negativo. Como no cambia el Lk, debe formará un superenrollamiento positivo para compensar en el DNA que hay entre nucleosomas peon las Topoisomerasas lo relajan. Así el DNA queda con un superenrollamiento negativo
Unión de las histonas al DNA
Es especialmente buena en regiones ricas en A y T (AA, AT, TT) que están separadas 10 bases, favoreciendo la curvatura del DNA alrededor de las histonas. Pares de GyC hacen el efecto contrario.
