TEMA 2 Flashcards
Tipus de regulació génica
- Per la transcripció
- Modificacions post-transcripcionals
- La traducció
- Modificacions post-traduccionals
- Epigenètica
Com es fa la majoria de regulació gènica en un organisme?
La majoria de la regulació gènica en la formació d’un organisme és causada per la regulació per seqüències reguladores
que normalment estan en cis (en el cromosoma) → Regulatory HARDWIRING
Elements important per la regulació:
- Factors de transcripció
- Expressió gènica coordinada
Que tenen a veure l’espai i el temps amb els gens i el DNA?
El DNA es transcriu en RNA i l’RNA s’expressa tant en l’espai com en el temps.
Els gens es reutilitzen, tant en l’espai com en el temps:
- Un gen en el mateix òrgan s’expressa de manera diferent en el temps
- Un mateix gen en el mateix estadi, està expressat en diferents òrgans
Ex: gen BMP4 → S’expressa en diversos llocs de l’embrió. S’ocupa de la formació dels dits, ja que activa l’apoptosi cel·lular.
A que es deu la complexitat de l’organisme?
La complexitat de l’organisme és causada per la regulació del gens del genoma. (No tenim més gens que una mosca, però la nostra regulació és molt més complexa)
Què s’ha de duur a terme per tenir un organisme multicel?
Per tal que es pugui donar el desenvolupament d’un organisme multicel·lular, necessitem integrar un set de programes moleculars que operen a nivell de cada cèl·lula. També necessitem entendre: els patrons de divisió cel·lular, com es diversifiquen les cèl·lules, i els patrons d’expressió gènica.
Actors principals per descodificar el programa inserit en el DNA:
- Factors de transcripció
- Seqüències reguladores NO CODIFICANTS
Quines són les dif entre organismes?
el fet que la maquinaria cel es conservi vol dir que les dif entre els organismes son als programmes:
• en les seqüències d’expressió gènica característiques de cada organisme,
• Com aquestes s’organitzen en l’espai i el temps.
Què són els factors de transcripció?
Factors de transcripció → proteines que s’uneixen als enhancers, i regulen l’expressió dels gens downstream. Llegeixen les seq reguladores
On es troba la info per la regulació gènica?
La informació per iniciar i regular l’expressió gènica del desenvolupament es troba en les regions reguladores gèniques no-codificants. Per activar-los, necessitem l’activitat de proteïnes capaces de llegir i descodificar aquestes seqüències reguladores, ELS TF.
Les seqüències reguladores de l’ADN defineixen les marques moleculars reconegudes pel TF.
Què son les seq reguladores?
Contenen la informació que permet saber quan, on i durant quant de temps, un gen s’expressa en un territori determinat.
→ Claus per entendre com es regula l’expressió gènica en l’espai i temps.
1. Seqüències de DNA que estan al voltant de les regions codificants del gen, on s’uneixen els factors de transcripció
2. Actuen a distància (estan molt lluny de les regions codificants) → Ja que el DNA està plegat, i pot ser que acabi estant molt a prop.
3. Hi ha diverses regions independents regulades per diferents factors de transcripció, i que regulen l’expressió dels gens en diferents territoris
La combinatòria de les regions reguladores, el que fa és que es generen patrons espacials d’expressió únics de cada gen.
Ex: gen Shh → És un gen que està expressat en molts llocs diferents de l’embrió. Aquesta expressió en diferents territoris,
està regulada per diferents elements reguladors.
Avantatge seq reguladores
Si hi ha una mutació en un element regulador, no causa la mort de l’embrió, ja que
només afecta l’expressió en un territori. (ex: Si hi ha una mutació a la seqüència reguladora de l’expressió del gen a les mans → Causa polidactília)
Com seria l’estructura i el funcionament (mes o menys) de les regions reguladores?
La caracterització detallada de les regions reguladores de molts gens revela que estan
una combinació de mòduls curts, cadascun amb un conjunt específic d’instruccions per a l’expressió d’aquest gen particular.
Què és el pattern formation?
És un terme utilitzat per al procés de desenvolupament pel qual dominis de cels no especificades se’ls assignen estats reguladors, creant així camps de cèl·lules que donarà lloc a les diferents parts de l’estructura
Quina és la lògica del control de l’expressió gènica?
- El creixement i el desenvolupament embrionari passa de manera progressiva
(simple → complex), i està ordenat en l’espai i en el temps. - Modularidad dels elements reguladors cis, actuació independent de cada un d’ells, permetent el seu control independent en l’espai i en el temps
- Els perfils de regulació gènica són la suma de la combinació de tots els elements reguladors.
