Taxonomia Flashcards
diferencia entre clasificar e identificar
la clasificacion es la organizacion de organismos en grupos o taxones en funcion a semejanzas. identificar es determinar a que taxon pertenece un aisamiento particular
Caracteristicas fenotipicas clásicas tenidas en cuenta en la clasificacion
-morfologicas: forma, tamaño, morfologia de colonias, tincion, forma de endosporas, cilios y flagelos, ultraestructura
-fisiologicas y metabolicas: fuentes de C y N, fuente de energia, nutricion, producto de fermentacion, temperatura y pH optimo, sensibilidad a inhibidores y antibioticos, metabolitos secundarios
-ecologicas: preferencia de habitat, capacidad de causar enfermedad, concentracion osmotica
caracteristicas genotípicas tenidas en cuenta para la clasificacion
-en un mismo genero el contenido de GC puede variar hasta 10% y en la misma especie hasta 3%
-la hibridación DNA-DNA en una misma especie debe ser mayor al 70%
definicion de una espcie en microbiologia
grupo de cepas que comparten 70% o mas de homologia DNA-DNA, 98,5% o mas de identidad del 16SrDNA, y 5% o menos de diferencia de Tm
que es una cepa tipo?
es una cepa que da nombre a la especie y a la que se usa como referencia contra todas las cepas comparadas para determinar si son de la misma especie
las cepas tipos deben estar perfectamente caracterizadas feno y genotipicamente y depositadas en al menos 2 colecciones independientes
que analisis se hace con el 16S rDNA? que utilidad tiene?
este gen se usa en analisis filogenetico para identificar y describir nuevas especies. se obtiene por PCR y se secuencia
Para ser una nueva especie debe diferir mas del 3% con todas las especies descritas, y mas del 5% si es un nuevo genero.
Menos de 98,5% de similitud indica que no son de la misma especie, pero mas de similitud no necesariamente indica misma especie
como se relaciona la secuenciacion genomica con la identificacion?
la secuenciacion del genoma completo es cada vez mas usada para identificar. en una misma especie la identidad promedio de nucleotidos es de 95-96%
orden de criterios para la identificacion (laves dicotomicas)
cultivo puro–> caracteristicas del gram–> forma de la celula –> reaccion frente al oxigeno –> fermentacion de azucares y pruebas bioquimicas
Como se nombra una especie?
el nombre es binomial, conformado por el genero y el epiteto especifico. se puede agregar subespecie, que es lo mas profundo que hay en nomenclatura.
si no se conoce especie pero si genero, se usa sp.
