Genética Microbiana Flashcards

1
Q

Qué factores aportan variabilidad y cuáles estabilidad?

A

Variabilidad: mutaciones, mecanismos de reparación propensos a error, transferencia de genes, recombinación
Estabilidad: enzimas de restricción, sistemas de corrección, rango de huesped de plasmidos

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2
Q

Diferencia entre genotipo y fenotipo y cómo se escriben

A

Genotipo: constitución precisa de GENES del microorganismo, el gen tiene nombre con minúscula ejemplo hisC
Fenotipo: conjunto de propiedades observables de un microorganismo, va con mayúscula, ejemplo una prototrofa a His es His+ y una auxotrofa es His-

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3
Q

Que tipo de mutaciones se pueden dar? Que efecto pueden tener?

A

Puntuales: sustituciones, microinserciones, microdeleciones
Pueden ser silenciosas, con cambio de sentido (cambia un aa y puede ser neutral o puede generar prot trunca) o sin sentido (generan la terminación prematura de la traducción)

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4
Q

Por qué pueden darse mutaciones espontáneas y cuál es la frecuencia?

A

La frecuencia es de 10-7 a 10-11. Pueden darse por errores de la polimerasa, mutagenos endógenos, o inserción de elementos transponibles
Tienen relevancia porque las bacterias se replican muy rápido, hay muchas mutaciones en 24 hs

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5
Q

Mutagenos químicos, efecto y ejemplos

A

-analogos de bases: generan transiciones sobre moléculas de adn en la replicación
Ej: 5-bromouracilo, 2-aminopurina
-agentes alquilantes: generan transiciones o deleciones
Ej: etilmetanosulfato, mostazas de nitrógeno, mitomicina, nitrosoguanidina
-agentes intercalantes: microinserciones y microdeleciones, alteran la recombinación.
Ej: bromuro de etidio
-compuestos que reaccionan con el adn: provocan errores en el apareamiento de bases
Ej: ácido nitroso, hidroxilamina

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6
Q

Mutagenos físicos, efecto y ejemplos

A

-radiacion ionizante: produce la ionización del agua y otras sustancias, genera radicales libres
Ejemplo: rayos x, rayos gamma, rayos cósmicos
-radiacion no ionizante: produce dimeros de timina, activa el sistema propenso a error sos. Luz uv

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7
Q

Mutagenos físicos, efecto y ejemplos

A

-radiacion ionizante: produce la ionización del agua y otras sustancias, genera radicales libres
Ejemplo: rayos x, rayos gamma, rayos cósmicos
-radiacion no ionizante: produce dimeros de timina, activa el sistema propenso a error sos. Luz uv

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8
Q

Ejemplos de mutagenos biológicos

A

Secuencias de insercion, transposones, fagos

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9
Q

Ejemplo de mutaciones positivas y cómo se da la selección

A

Una mutación positiva genera por ejemplo la resistencia a un antibiótico o a un fago. Facilita la selección porque se cultiva a todas las bacterias en tsa+el ab o fago al q es resistente. Solo crecen las mutadas, y luego para ver cómo es esa mutación hay que secuenciar

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10
Q

Qué es el retardo fenotipico?

A

Es el tiempo necesario para que la población se divida varias generaciones y se exprese la mutación, permitiendo la selección. La mutación no se expresa inmediatamente luego de agregar el mutageno

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11
Q

Ejemplo de mutaciones negativas y cómo es su selección

A

Ejemplo: mutaciones que generan auxotrofia para un factor de crecimiento.
Se agrega a la bacteria en tsb el mutageno, se espera el retardo fenotipico y luego se pasa a tsa. Se hace una réplica, y cada colonia que creció se pone en una placa con his y otra sin his. Se ve cuáles no crecieron en his y sí con his
Se puede hacer un enriquecimiento en un medio líquido sin histidina y con antibiótico para el q la bacteria es sensible. Como los antibióticos requieren que estén con actividad metabólica, sólo van a crecer las q son prototrofas y van a morir por el antibiótico, mientras que las auxotrofas seguirán viables por más tiempo. Luego se realiza la técnica

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12
Q

Sistemas de corrección de lesiones en el ADN

A

-Actividad correctora de la ADN polimerasa
-Fotorreactivación (fotoliasa)
-Reparación por escisión de nucleótidos (UvrAB, UvrC y UvrD)
-Reparación por escisión de bases (nucleasas especiales)
-Escisión post-replicativa (Mut)
-Sistema SOS (LexA activa a UvrA y UmuCD)

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13
Q

que es un revertante?

A

es un microorganismo que recupera su fenotipo original perdido por una mutación puntual, por una segunda mutacion llamada retromutación.

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14
Q

diferencia entre reversiones verdaderas y supresoras

A

las reversiones verdaderas restauran el genotipo salvaje y por ende se recupera el fenotipo. Las supresoras restauran el fenotipo pero por una segunda mutacion que no restaura el genotipo.

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15
Q

Qué es el Test de Ames? cual es su utilidad?

A

es un ensayo bioquimico que permite estudiar el potencial mutagenico de compuestos quimicos. se utilizan cepas de salmonella typhimurium mutadas con auxotrofia para histidina (His-),para evaluar la capacidad de revertir la mutacion y generar prototrofia nuevamente

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16
Q

como es la composicion del medio minimo de Ames?

A

Agar, glucosa, agua, sales Vogel-Benner. Es un medio quimicamente definido. No puede aportar histidina o biotina.

17
Q

cuales son los mecanismos de transferencia horizontal de genes en bacterias?

A

-transformacion
-conjugacion
-transduccion

18
Q

en que se basa el mecanismo de transformacion?

A

la transformacion se da por la captacion de ADN desnudp por parte de una celula receptora. el adn debe estar libre, producto de la sis de otra celula

19
Q

como debe estar el receptor para que se de la transformacion?

A

debe estar en estado de competencia, ya sea natural o inducido. el estado de competencia natural se da en algunas especie que producen proteinas que permiten a la celula reconocer adn desnudo, ante estimulos dañinos como radiacion o antibioticos.
el estado de competencia inducido se genera alterando la membrana de las bacterias por alteracion de la permeabilidad o agregado de lps, seguido por CaCl2 y shock termico o electroshock

20
Q

que es el transformasoma?

A

es un complejo conformado por proteinas de union a adn simple cadena, endonucleasas y energia asociada a la membrana, responsable de unir el adn extracelular simple mientras degrada la otra hebra

21
Q

como puede terminarse la transformacion?

A

puede finalizar como una transformacion exitosa si se da recombinacion homologa con el adn del receptor, o puede darse transformacion no exitosa donde se degrada el adn ingresado por no ser compatible con el genoma receptor.

22
Q

como es la transduccion? que tipos hay?

A

es la transferencia de material genetico a traves de vectores virales (bacteriofagos o virus bacterianos) puede ser generalizada o especializada

23
Q

como es la transduccion especializada?

A

se puede transferir cualquier gen. En la infeccion de una primera bacteria, cuando se degrada el genoma las particulas virales pueden apropiarse de un fragmento del adn bacteriano. al infectar una segunda celula, ingresa ese adn de la primera celula infectada y puede tener recombinacion homologa con el adn de la 2da celula, puede tener replicacion autonoma como un plasmido o puede degradarse. Ej fago P1 y P22

24
Q

Como es la transduccion especializada?

A

solo se transfieren genes especificos dependiendo des sitio de union del genoma del fago. el virus primero no produce un ciclo litico sino que tiene una recombinacion con el adn bacteriano, y luego esa porcion especifica de la primer bacteria que se lleva puede recombinarse con una segunda bacteria infectada

25
Q

que es la conjugacion? como se da?

A

es una transferencia horizontal, directa, unidireccion y con polaridad del material genetico, en forma de plasmido que se transfiere de una bacteria a otra por el pili sexual. La celula donante se denomina masculina o F+ y la receptora femenina o F-.
Cuando ambas se unen por el pelo sexual, se sintetizan relaxasas que relajan la doble hebraa de adn del plasmido y orientan una hebra al pili. luego de transferirse se replica cada hebra en cada bacteria.

26
Q

que son los plasmidos conjugativos?

A

los plasmidos conjugativos o factores F son aquellos que tienen la region tra que permite la transferencia del plasmido, codifican para el pili sexual, las relaxasas y las proteinas que orientan la hebra. antes de la region tra tienen el OriT para asegurar que se replique en la segunda celula un plasmido conjugativo.

27
Q

que son los plasmidos movilizables?

A

son lo que presentan iguales regiones que los conjugativos pero sin tra, solo pueden transferirse a otra celula en conjunto con un plasmido conjugativo que le brinde el pili y las proteinas

28
Q

que son las celulas HFR?

A

son celulas bacterianas en las cuales el plasmido se inserta en el genoma cuando tienen una secuencia de insercion especifica homologa en ambos. si el plasmido es conjugativo, puede volver a transferirse pero lo hace conn una porcion del cromosoma de la primera celula aceptora–> HFR recombinante

29
Q

que son las celulas F`?

A

son celulas que tienen un plasmido formado por la mezcla de un plasmido original y el cromosoma bacteriano (se pierde una parte del cromosoma), es poco frecuente y se da cuando se escinde en un lugar equivocado del genoma bacteriano.

30
Q

como son las posibles combinaciones en la conjugacion y sus resultados?

A

-F+ x F- = puede dar 2F+ por replicacion autonoma, o Hfr por recombinacion sitio especifica
-Hfr x F- = Hfr + F- recombinado
-Fx F- = 2F

31
Q

que son los grupos de compatibilidad?

A

son grupos que separan los plasmidos segun si es posible que coexistan en una misma celula. si estan en el mismo grupo de incompatibilidad dos plasmidos no pueden coexistir en la misma celula porque tienen el mismo ori y el mismo locus par.