Brainscape's Knowledge GenomeTM

Browse over 1 million classes created by top students, professors, publishers, and experts.


See full index

Biochemia > Struktura i metabolizm RNA > Flashcards

Struktura i metabolizm RNA Flashcards

1
Q

Jakie wiązanie występuje pomiędzy anomerycznym atomem węgla cząsteczki cukru a atomem azotu wchodzącego w skład zasady azotowej?

A

wiązanie N-glikozydowe

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Jakie wiązanie występuje pomiędzy resztą fosforanową a gr. OH przy węglu 5’ rybozy lub deoksyrybozy?

A

wiązanie estrowe

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Właściwości RNA

A
  • zasadniczo jednoniciowe struktury
  • tworzenie struktur ,,hairpin” - ,,spinki do włosów” - wypętlenia
  • odcinki dwuniciowej struktury RNA/RNA (antyrównoległość) przypominają A-DNA
  • asocjacja z białkami - rybonukleoproteiny (zasadnicza forma występowania komórkowych RNA)
  • charakterystyczna absorpcja przy 260 nm
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Jakie wiązania występują pomiędzy komplementarnymi zasadami azotowymi w kwasach nukleinowych?

A

wiązania wodorowe (A=T, GΞC)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Czym jest struktura ,,spinki do włosów”?

A

Jest to wzajemnie komplementarny fragment cząsteczki RNA stanowiący ramię składające się z nukleotydów, których zasady tworzą pary, połączony z petlą zbudowaną z nukleotydów o zasadach nie tworzących par.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Rodzaje RNA

A
  • rybosomalny RNA - rRNA
  • transportujący RNA - tRNA
  • informacyjny RNA - mRNA
  • heterogenny jądrowy RNA - hnRNA
  • mały jądrowy RNA - snRNA
  • mały cytoplazmatyczny RNA - scRNA
  • mitochondrialny RNA - mtRNA
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

W którym miejscu cząsteczki tRNA przyłączają się chemicznie aktywowane aminokwasy?

A

Na końcu CCA-3’

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Za pomocą jakiego wiązania aminokwasy przyłączane są do tRNA?

A

wiązania estrowego

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Jaką strukturę DNA przypomina dwuniciowa struktura RNA/RNA?

A

A-DNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Jaka konformacja cukru jest typowa dla B-DNA?

A

C-2’ endo

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Jaka konformacja cukru jest typowa dla A-DNA?

A

C-3’ endo

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Jaka konformacja cukru jest typowa dla RNA?

A

C-3’ endo

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Jakim procesem ulegają kwasy nukleinowe

A
  1. replikacja
  2. transkrypcja
  3. translacja
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Co zachodzi w fazie G1 cyklu komórkowego?

A

Komórka powiększa się i produkuje nowe białka

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Czym charakteryzuje się faza G0 cyklu komórkowego?

A

W fazie tej komórki:

  • tracą zdolność do podziału
  • podlegają specjalizacji
  • wykazują mniejsze tempo metabolizmu i mniejszą aktywność transkrypcyjną
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Czym jest punkt R w cyklu komórkowym?

A

Jest to punkt restrykcyjny - komórka decyduje czy nadal odpoczywać, czy wejść w cykl

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

W której fazie cyklu komórkowego dochodzi do replikacji DNA?

A

W fazie S

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Co dzieje się w fazie G2cyklu komórkowego?

A

Dochodzi do nasilenia syntezy białek, komórka przygotowuje się do mitozy

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

W jakiej fazie cyklu komórkowego komórka dzieli się (mitoza)?

A

W fazie M

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Jakie rodzaje RNA występują zarówno w komórkach prokariotycznych jak i eukariotycznych?

A
  • rRNA
  • tRNA
  • mRNA
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Rodzaje RNA charakterystyczne wyłącznie dla komórek eukariotycznych

A
  • heterogenny jądrowy RNA hnRNA
  • mały jądrowy RNA snRNA
  • mały cytoplazmatyczny RNA scRNA
  • mikro RNA miRNA
  • długi niekodujący RNA lncRNA
  • mitochondrialny RNA mtRNA

Wszystkie rodzaje RNA uczestniczą w procesie biosyntezy białek!

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

Charakterystyka nici niematrycowej/kodującej

A

Nie bierze ona bezpośredniego udziału w transkrypcji, lecz stanowi strukturalne odzwierciedlenie pierwotnego transkryptu RNA, z wyjątkiem zasady pirymidynowej w nici kodującej - tyminy, dla której odpowiednikiem w transkrypcie (tj. syntezowanej cząsteczce RNA) jest zasada pirymidynowa - uracyl.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

Która z dwóch nici DNA jest transkrybowana?

A

nić matrycowa

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

Do której z dwóch nici DNA jest podobny transkrypt RNA?

A

do nici kodującej (zamiast tyminy ma uracyl)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Q

Sekwencje konsensusowe to region wiązania jakiego enzymu?

A

Polimerazy RNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
26
Q

Czym jest sekwencja TATA?

A

Jest to sekwencja DNA znajdująca się w wielu promotorach genów eukariotycznych, położona około -30 - -10 nukleotydów od miejsca startu transkrypcji. Do sekwencji TATA wiąże się białko TBP wchodzące w skład kompleksu preinicjacyjnego, który umożliwia polimerazie RNA rozpoznanie sekwencji promotora i rozpoczęcie transkrypcji. Po związaniu się TBP DNA ulega wygięciu.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
27
Q

Funkcja podjednostki α polimerazy RNA zależnej od DNA

A
  • interakcja z promotorem
  • inicjacja transkrypcji
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
28
Q

Funkcja podjendostki β polimerazy RNA zależnej od DNA

A

Inicjacja i elongacja transkrypcji

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
29
Q

Funkcja podjednostki β’ polimerazy RNA zależnej od DNA

A

wiązanie DNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
30
Q

Funkcja podjednostki δ polimerazy RNA zależnej od DNA

A

rozpoznawanie promotora

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
31
Q

Funkcja podjednostki ω polimerazy RNA zależnej od DNA

A

nieznana XD

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
32
Q

Etapy działania polimerazy RNA (DNA zależnej)

A
  1. Przeszukiwanie DNA
  2. Tworzenie kompleksu zamkniętego
  3. Tworzenie kompleksu otwartego
  4. Inicjacja
  5. Elongacja
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
33
Q

W którym momencie podjednostka δ oddysocjowuje od polimerazy RNA?

A

Gdy polimeraza RNA przesunie się poza promotor

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
34
Q

W jaki sposób powstaje ,,bąbel” transkrypcyjny?

A

Polimeraza RNA przyłączając się do matrycy DNA powoduje helikalne rozwinięcie podwójnej helisy (powstaje ,,bąbel” transkrypcyjny)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
35
Q

W jaki sposób może zachodzić terminacja transkrypcji u Prokaryota?

A
  • z udziałem czynnika białkowego
  • bez udziału czynnika białkowego
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
36
Q

Funkcja terminatora

A

Wyznacza on miejsce terminacji transkrypcji (sekwencja taka tworzy strukturę ,,spinki do włosów”

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
37
Q

W ukladzie terminatora oddziaływania silne występują na odcinku z przewagą jakich par?

A

G-C

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
38
Q

W układzie terminatora oddziaływania słabe występują na odcinku z przewagą jakich par?

A

A-U

39
Q

Elementy niezbędne dla przebiegu transkrypcji

A
  • matryca - dwuniciowy DNA
  • polimerazy RNA zależne od DNA - POL RNA (prokaryota); POL RNA I, II, III (eukaryota)
  • topoizomerazy
  • NTPS
  • Mg2+, Mn2+

Proces ,,kierowany” matrycą (DNA)

Produkt syntetyzowany w formie niedojrzałej funkcjonalnie (pre-RNA)

40
Q

Czym jest gen?

A

Jest to odcinek DNA lub dla niektórych wirusów RNA, w którym zapisana jest informacja o określonym produkcie.

41
Q

Jakie fragmenty w swojej strukturze zawiera gen?

A

Fragmenty kodujące i niekodujące

42
Q

Przykłady fragmentów niekodujących w strukturze genu

A
  • promotor
  • intron
43
Q

Ile operonów kodujących rRNA i tRNA posiada genom E.coli?

A

7

44
Q

Co jest produktem informacji zawartej w genach?

A
  • polipepetydy
  • kwasy rybonukleinowe (tRNA, rRNA, miRNA, snRNA i inne)
45
Q

Etapy obróbki potranskrypcyjnej pre-RNA 30S

A
46
Q

Etapy obróbki potranskrypcyjnej pre-RNA 45S

A
47
Q

Jakie stałe sedymentacji mają podjednostki rybosomów prokariotycznych?

A

50S i 30S

48
Q

Z ilu białek zbudowana jest mniejsza podjednostka rybosomu prokariotycznego?

A

21

49
Q

Z ilu białek zbudowana jest większa podjednostka rybosomu prokariotycznego?

A

36 białek

50
Q

Jakie stałe sedymentacji mają podjednostki rybosomów eukariotycznych?

A

60S i 40S

51
Q

Z ilu białek zbudowana jest mniejsza podjednostka rybosomu eukariotycznego?

A

33

52
Q

Z ilu białek zbudowana jest większa podjednostka rybosomu eukariotycznego?

A

49

53
Q

Etapy obróbki potranskrypcyjnej tRNA

A
  1. Rozcinanie pierwotnego transkryptu pre-tRNA
  2. Dołączenie CCA-OH-3’
  3. Modyfikacje nukleotydów
  4. Usuwanie intronów (endonukleazy)
  5. Ligacja
54
Q

Co to za zasada?

A

tiourydyna

55
Q

Co to za zasada?

A

inozyna

56
Q

Co to zasada?

A

1-metyloguanozyna

57
Q

Co to za zasada?

A

rybotymidyna

58
Q

Co to za zasada?

A

pseudourydyna

59
Q

Co to za zasada?

A

dihydrourydyna

60
Q

Co jest inhibitorem polimerazy RNA II?

A

α-amanityna

61
Q

Co jest inhibitorem polimerazy RNA?

A

rifampicyna

62
Q

Co jest inhibitorem DNA?

A

aktynomycyna D

63
Q

Gdzie zlokalizowanna jest polimeraza RNA I u Eukaryota?

A

W jądrze i jąderku

64
Q

Jaki rodzaj RNA syntetyzuje polimeraza I?

A

pre-rRNA z wyjątkiem 5S rRNA

65
Q

Gdzie zlokalizowana jest polimeraza RNA II u Eukaryota?

A

w jądrze

66
Q

Jaki rodzaj RNA syntetyzuje polimeraza RNA II?

A

pre-mRNA (hnRNA)

67
Q

Gdzie zlokalizowana jest polimeraza RNA III u Eukaryota?

A

W jądrze

68
Q

Jaki rodzaj RNA syntetyzuje pomieraza RNA III?

A
  • pre-tRNA
  • 5S rRNA
  • snRNA
  • scRNA
69
Q

Gdzie u Eukaryota zlokalizowana jest polimeraza mitochondrialna?

A

w mitochondrium

70
Q

Jaki rodzaj RNA jest syntetyzowany przez polimerazę mitochondrialną?

A

mtRNA

71
Q

Czy w komórce bakterii zachodzi obróbka potranskrypcyjna?

A

nie

72
Q

Gdzie w komórce eukariotycznej zachodzi proces transkrypcji?

A

w jądrze

73
Q

Gdzie w komórce eukariotycznej zachodzi proces translacji?

A

w cytozplazmie

74
Q

Gdzie w komórce bakterii zachodzi proces transkrypcji a gdzie translacji?

A

Oba te procesy zachodzą w cytoplazmie

75
Q

Jak wygląda schemat organizacji promotorów u Eukaryota?

A
76
Q

Czynniki transkrypcyjne o jakim działaniu wyróżniamy?

A
  • ogólnym
  • swoistym
77
Q

Funkcja polimerazy RNA II

A

Transkrypcja genów białek

78
Q

Czym jest 5’UTR?

A

Jest to nieulegająca translacji część mRNA położona w kierunku 5’ od sekwencji kodującej

79
Q

Etapy dojrzewania eukariotycznego hnRNA do mRNA

A
  • tworzenie ,,czapeczki” (5’-capping) na końcu 5’ pierwotnego transkryptu (hnRNA)
  • poliadenylacja (polyA-tail) na końcu 3’ pierwotnego transkryptu (hnRNA)
  • suwanie intronów (splicing) z pierwotnego transkryptu (hnRNA)
80
Q

Jaka jest rola czapeczki (cap) w komórce?

A

Ochrona mRNA przed występującymi w komórce nukleazami

81
Q

Jakie sekwencje rozpoznaje endonukleaza podczas obróbki potranskrypcyjnej?

A

AAUAAA

82
Q

W jakim miejscu endonukleaza rozcina mRNA?

A

11-30 nukleotydów od sekwencji AAUAAA

83
Q

Jaki enzym przyłącza ,,ogonek” poli-A?

A

polimeraza poliadenylanowa

84
Q

Czym charakteryzuje się typ 1 obróbki potranskrypcyjnej?

A
  • selfsplicing - samowycinające się introny
  • udział kofaktora - guanozyny, GMP, GDP, GTP
85
Q

Czym charakteryzuje się typ 2 obróbki potranskrypcyjnej?

A
  • selfsplicing - samowycinające się introny
  • przebiga bez udziału kofaktora - niezbędna adenina intronu
86
Q

Czym charakteryzuje się typ 3 obróbki potranskrypcyjnej?

A
  • non-selfsplicing - niesamodzielnie wycinające się introny
  • niezbędna adenina intronu
87
Q

Jakie sekwencje znajdują się w miejscach ,,styków”?

A

sekwencje konserwatywne

88
Q

Sekwencja konserwatywna

A

EKSON 1 (3’)-(5’) INTRON (donorowe) i INTRON (3’)-(5’) EKSONN 2 (akceptorowe)

89
Q

Charakterystyka miRNA

A

Są to krótkie sekwencje 21-23 nukleotydów niekodującego RNA, które regulują ekspresje genów na poziomie posttranskrypcyjnym

90
Q

Gdzie zlokalizowane są geny kodujące miRNA?

A

W intronach, eksonach oraz odcinkach międzygenowych

91
Q

Funkcja miRNA

A
  • Regulacja ekspresji różnych genów w tym również ekspresję protoonkogenów i genów supresorowych => mogą działać jako onkogeny czy supresory.

Regulują 30% ekspresji genów u ssaków

1 miRNA = setki mRNAs

  • odgrywają role w powstawaniu i rozwoju nowotworu
92
Q

Lokalizacja w genomie miRNA loci

A
  1. W procesie transkrypcji powstaje (polycistronic primary transcripts) i następnie przez cięcie powstają miRNAs
  2. Międzygenowe odcinki ulegają transkrypcji jako niezależne jednostki
  3. Geny kodujące miRNA są zlokalizowane w intronach, eksonach i odcinkach międzygenowych
93
Q

RNA -> DNA

A
  1. Biosynteza białka przebiega bez DNA, ale wymaga RNA
  2. 1- i 2-niciowe RNA są nośnikami informacji genetycznej i ulegają replikacji
  3. RNA wykazują właściwości katalityczne
  4. Grupa 2’-OH w rybozie jest zaangażowana w wielu rekacjach w jakich uczestniczy RNA
  5. Purynowe i pirymidynowe kofaktory procesów metabolicznych (niezbędne do funkcjonowania organizmów we wszystkich formach życia) są rybonukleotydami
  6. Biosynteza dNTPs odbywa się poprzez redukcję NTPs
  7. Genom RNA nie podlega mechanizmom naprawczym charakterystycznym dla DNA
  8. Wiązanie fosfodiestrowe w DNA są odporne na hydrolizę alkaliczną
  9. DNA jest bardziej odporny na chemiczną degradację oraz działanie promieniowania UV

Biochemia (10 decks)

Brainscape helps you reach your goals faster, through stronger study habits.
© 2024 Bold Learning Solutions. Terms and Conditions