Aminokwasy + białka Flashcards
Jakie są aminokwasy egzogenne?
Arginina Fenyloalanina Histydyna Leucyna Izoleucyna Lizyna Metionina Walina Tryptofan Treonina
Wymień aminokwasy ketogenne:
Leucyna
Lizyna
Wymień aminokwasy glukoketogenne:
Fenyloalanina Izoleucyna Treonina Tryptofan Tyrozyna
Wymień aminokwasy Glukogenne:
Alanina Asparagina Asparaginian Arginina Cysteina Glicyna Glutamina Glutaminian Histydyna Metionina Prolina Seryna Walina
Jakie są aminokwasy endogenne?
Alanina Asparagina Asparaginian Cysteina Glutamina Glutaminian Glicyna Prolina Seryna Tyrozyna
Alfa-ketomaślan powstaje z jakich aminokwasow?
Metionina
Treonina
Propionylo-CoA powstaje z jakich aminokwasow?
Walina
Izoleucyna
Jaki jest kluczowy enzym syntezy nukleotydów purynowych “de novo”? Produkt i substrat
Amidotransferaza PRPP
PRPP -> 5-fosforybozyloamina
Co daje zarówno azot jak i węgiel podczas syntezy puryn?
Glicyna
Co daje tylko azot podczas syntezy puryn?
- Asparaginian (1 azot)
- glutamina (2 azoty)
Co daje tylko węgiel podczas syntezy puryn?
- CO2 (1 węgiel)
- n10-formylotetrahydrofolian (2 węgle)
Co jest produktem syntezy nukleotydów purynowych de novo? (I jaka zasada)
IMP (inozynomonofosforan, monofosforan inozyny)
Zasada do hipoksantyna
Czego prekursorem jest IMP
Zarówno AMP jak i GMP
Z czego powstaje AMP? (Ciąg przemian)
IMP+Asparaginian | +GTP | syntetaza adenylobursztynianu | -GDP i Pi \/ Adenylo-bursztynian | | liaza adenylobursztynianu |- fumaran \/ AMP
Z czego powstaje GMP? (Ciąg przemian)
IMP | +NAD i H2O | dehydrogenaza IMP | -NADH i H+ \/ XMP (ksantozynomonofosforan) |+glutamina i ATP | syntetaza GMP |-glutaminian i ADP i Pi \/ GMP
Z czego powstaje PRPP (5’-fosforybozylo-1’pirofosforan)?
Reakcja
Rybozo-5-fosforan | +ATP | (Mg2+) | -AMP \/ PRPP (5'-fosforybozylo-1'pirofosforan)?
Na czym polega oszczędnościowa droga syntezy nukleotydow purynowych?
PRPP dostarcza ryboze
Jakie wyróżniamy enzymy drogi oszczędnościowej syntezy nukleotydów purynowych?
- Fosforybozylotransferaza adeninowa (APRT)
2. Fosforybozylotransferaza Hipoksantynowo-Guaninowa (HGPRT)
Jaką reakcje katalizuje Fosforybozylotransferaza adeninowa (APRT)?
Adenina + PRPP –> AMP + PPi
Jaką reakcje katalizuje Fosforybozylotransferaza Hipoksantynowo-Guaninowa (HGPRT)?
Dwie
Hipoksantyna + PRPP –> IMP + PPi
Guanina + PRPP –> GMP + PPi
Schorzenie lesch-nyhana to defekt?
Fosforybozylotransferazy Hipoksantynowo-Guaninowej (HGPRT)
Jaką reakcje katalizuje oksydaza ksantynowa?
Hipoksantyna -1-> ksantyna -2-> kwas moczowy
1 i 2!
Jakie kofaktory do oksydazy ksantynowej?
+ H2O i O2
- H2O2
W obu reakcjach
Czym spowodowana jest hiperurykemia?
- Zwiekszona synteza puryn
2. Zwiekszona degradacja puryn
Co to jest alloksantyna i co robi?
Powstający z allopurynolu związek który wiąże sie z centrum aktywnym OKSYDAZY KSANTYNOWEJ i hamuje jej aktywność
Co karbmoilofosforan daje do syntezy pirymidyn?
N i C
Co Asparaginian daje do syntezy pirymidyn?
3xC
N
Gdzie powstaje karbmoilofosforan potrzebny do syntezy pirymidyn?
W cytozozolu
Gdzie powstaje karbmoilofosforan potrzebny do cyklu mocznikowego?
W miochondrium
Etapy syntezy pirymidyn:
Asparaginian + karbamoilofosforan -> karbamoiloasparaginian -> dihydroorotan -> orotan (+PRPP) -> OMP -> UMP
Jak zrobic z UMP UTP?
Dodać 2x ATP i powstanie 2x ADP
UMP + ATP -> UDP + ADP
UDP + ATP -> UTP + ADP
Z czego powstaje CTP?
Z UTP (przy udziale NH3 z glutaminy -> glutaminian) i powstaje CTP
Do czego degradowany jest uracyl?
Do Beta-alaniny
Do czego degradowana jest tymina?
Do beta-aminomaślanu
Jakie sa etapy tworzenia di- i trifosforanów purynowych i pirymidynowych?
- Powstawanie ATP
2. Wykorzystanie ATP do syntezy difosforanów nukleozydów
Powstawanie ATP (pierwszy etap tworzenia di- i trinukleotydow puryn i pirymidyn) + enzym
AMP + ATP -> 2ADP
ADP jest fosforylowane do ATP w trakcie glikolizy i oksydacyjnej fosforylacji
Kinaza adenylanowa
Wykorzystywanie ATP do syntezy difosforanów nukleozydów (Drugi etap tworzenia di- i trinukleotydow puryn i pirymidyn) + enzym
NMP + ATP NDP + ADP
UMP + ATP UDP + ADP
Kinaza monofosforanów nukleozydów
Powstawanie trifosforanów nukleozydów (drugi etap tworzenia di- i trinukleotydow puryn i pirymidyn) + enzym
NTP(donor) + NDP(akceptor) NDP (donor) + NTP(akceptor)
Kinaza difosforanów nukleozydów
Do czego swoistość wykazuje kinaza difosforanów nukleozydów?
Do reakcji a nie substratu (mogą to byc dowolne nukleozydy!)
Czy kinaza difosforanów nukleozydów działa ja ryboze i deoksyryboza?
Tak! Niezależnie która to z nich.
Działa na NTP jak i na dNTPs
Jako co są syntetyzowane rybonukleotydy i jakich problemów to nastręcza do syntezy DNA?
Puryny i pirymidyny syntetyzowane są jako rybonukleotydy(NTP), a do syntezy DNA potrzebne są deoksyrybonukleotydy(dNTP)
Co robi reduktaza rybonukleotydów?
Redukuje rybonukleotydy (NTP) do deoksyrybonukleotydów (dNTP)
Co jest potrzebne jako kofaktor dla reduktazy rybonukleotydów?
- tioredoksyna
- FADH2
- NADPH + H+
Jak przebiega redukcja rybonukleotydów?
HS- Tioredoksyna -SH
oddaje wodory reduktazie rybonukleotydów i staje się
Tioredoksyna
\S-S/
FADH2 oddaje jej wodory (przy udziale reduktazy tioredoksyny) i wraca ona do stanu
HS- Tioredoksyna -SH
NADPH ponownie redukuje FAD i powraca FADH2
Co jest efektorem allosterycznym dla reduktazy rybonukleotydów?
Substraty (ATP, dATP, dGTP, dTTP itd.)
Z czego powstaje dTMP?
dCTP lub dUTP
Jaką reakcje katalizuje dUTPaza?
dUTP -> dUMP
Jaka jest rola dUTPazy?
Zapobiega wprowadzaniu uracylu do DNA
Jaka reakcje katalizuje syntaza tymidylanowa?
dUMP -> dTMP
Dowodem na rzecz jakiej tezy jest istnienie syntazy tymidylanowej?
Argument na rzecz razy o ewolucyjnym pierwszeństwie RNA nad DNA
bo syntaza tymidylanowa jest enzymem w reakcji dUMP -> dTMP
A wiec uracyl był wcześniej a występuje on w RNA, a w DNA nie (w DNA zamiast uracylu występuje tymina)